Pseudoalteromonas issachenkonii: PI2015_3044
Help
Entry
PI2015_3044 CDS
T04164
Name
(GenBank) helicase
Organism
pia
Pseudoalteromonas issachenkonii
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
SNF2-rel_dom
Helicase_C
ResIII
DEAD
AAA_22
ERCC3_RAD25_C
SAM_KSR1_N
SWIM
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ALQ56298
LinkDB
All DBs
Position
II:2803..5949
Genome browser
AA seq
1048 aa
AA seq
DB search
MSANLSKNDLMAIFEEIKNEQATQFPLSERFIKKLFKPAVLAKGKSYYKNGQISWLEHNA
DFSVVDSTVQGDKGIAFNQRIEISKLPTGYSVDTHCTCNVKTKCRHLAAILLKLKIEHSG
EYGEDYFINDWFSELSALKNTDQAQPSQVLLFVLDIENNKVFLTPKIANYDKNNNYALGR
NLTEQQLNSFVTPSDLLESDFRLYSWIRSQNAVGNIELKGQWGFNALQQLLATDRLFLQR
SRVPIKAQPGLPLNFVWEKQKEVTQLKIHLDQIPNWALIKTTPPIYLDLDKYKLGRIRTP
LSADEIAHLQTIPALHDTNFDRIYKQLADNFGVGVIPHPTNTPSTPVKSLSNAILKVSMS
GSVMAISLSFKYKNKNYLAGTAPAKLINSAFENTVTNELVNLGFDFCKGGLHSEFIFSQE
SAIHLHWLVHEVLPSFKQRGWQVSMSKVNVADTKSQISLHVNRAAGHQMHSKVMLNDTKV
ATLLNVNNKLYESLNRQSELFYYYPVGRQFGVIDKAAFNLLIEFKLRFEFIKTRDEFNIP
LSYLPELVQHTAINVELHDPSLERYLDELNNDALLSPNTAIHGLHDSVVLREYQQEGVAW
LNFLKRNQLGGILADDMGLGKTLQVIAYLASSYNTPQAGPTLIVCPTSLVSNWQNEITKF
AKSLKVTTIFGAHRNDSLQHLAQAQCILTTYPLLKRDIAYYSPLYFENIILDEAQYIKND
TAQVSRLVKRLNADFKLCLSGTPIENNLFELKSLLDFAMPSLLGSQAHFKQHFQGPIERE
SNIERAEQLKALIMPFILRRTKAQVAQELPQKTELIKEFEFEPKQKDMYQGITRALEEKL
IDLFAEQGVQKSKLAFLEALLKLRQICCHPKLIEPETEAASAKLEWLSSHLPLMLSLGRK
VIIFSQFTSALDLIAERLNELNINFSMLTGQTRHRDKVIDEFTSGNTSVFLISLKAGGTG
LNLTQADTVIHFDPWWNPAVEKQATDRAYRIGQTNPVFVYKLIMANSIEQKVFQMQQDKQ
ALVDALFTEKSMSFTQFDEQQMLSLIKS
NT seq
3147 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtctgctaacttatcaaaaaatgatttaatggctatttttgaagaaattaaaaatgag
caggctacccagtttcctctttctgagcgattcataaaaaaattatttaaacccgcggtg
ttggccaaaggaaaatcgtactataaaaacggccaaatcagttggttagaacataatgca
gatttttctgtggttgactctacggtgcaaggtgataaaggaatcgcgttcaaccaacgt
attgagatcagtaaattaccaactggttattcggtcgatacccactgtacctgtaatgtt
aaaactaaatgccgccatttggccgctattttgttaaagcttaaaattgagcattctggt
gagtacggtgaagattattttattaatgattggtttagtgaactaagcgcacttaaaaac
accgaccaagctcaaccctcgcaagtattactgtttgtattagatatagaaaacaacaaa
gtatttttaacccctaaaattgccaactacgataaaaataataattatgcacttgggcga
aatttaactgagcaacagcttaatagttttgtaacccctagcgatttgctcgaaagtgat
tttagattatatagctggatccgatcgcaaaatgcggtcggtaatattgagcttaaaggg
caatggggatttaatgccctgcagcaattacttgccacagaccgattatttttacaacgc
tctcgagtacctattaaagcgcaacctggtttacctcttaactttgtttgggaaaaacaa
aaagaggtaacccagttaaaaattcacttggatcaaattcctaattgggcgttaattaaa
acaacgccgcctatctacttagatttagataaatataaattaggccgtattcgtacgccc
ctcagtgctgatgaaattgcgcacttacaaactataccggcgctgcacgatacaaacttt
gaccgaatttataagcagcttgctgataactttggtgtaggtgttattccccaccctact
aatacaccaagcacgcctgttaagtcgttgagtaatgccatacttaaagtcagcatgtcg
ggctcagtaatggctatttcgttatcgtttaagtataaaaataaaaactatttagcgggc
accgcgcctgcaaagttaattaatagcgccttcgaaaacaccgttaccaatgagttagtc
aacttaggcttcgatttttgtaaagggggtttacacagcgagtttatttttagtcaggaa
tcggctattcacttacattggctagttcacgaggtactgcccagctttaaacaacgcggt
tggcaagtatcaatgagcaaagttaatgttgctgatactaaaagccaaatctcattgcat
gtaaacagagctgcaggtcatcaaatgcatagtaaagtaatgctaaacgataccaaagta
gccaccctattaaatgtaaataataaactgtatgaatcgttaaaccgtcaaagtgaatta
ttttattactaccctgttggccgtcaatttggggttattgataaagcagcgtttaattta
ttaattgagtttaaactgcgatttgaatttattaaaacccgtgacgaatttaacattccg
ctttcatacttacctgaattagttcagcacacagctattaatgtagagctacatgacccg
tcactagagcgttaccttgatgaactaaataacgatgcactgctatcacctaacactgcc
attcatggcttacacgattctgtagtattaagagagtatcagcaagaaggcgtggcttgg
cttaactttttaaagcgtaatcagttaggtgggattttagcggatgatatgggcttgggt
aaaacgttacaagtgattgcctacttagcaagctcatacaatacaccgcaagcagggcct
acgcttattgtgtgccctacaagtttagtgagtaattggcaaaacgaaattaccaagttc
gcaaaaagcttaaaagtgaccactatttttggtgcacaccgaaatgattcgttgcagcat
ttggcacaagctcagtgtattttaaccacgtatccgctattaaaacgtgacattgcttat
tactcaccgctgtattttgaaaacattattcttgatgaagcccagtatattaaaaacgat
accgcacaagtttcgcggttggtaaaacgtttaaatgccgactttaagctttgtttaagt
ggcaccccaattgaaaacaatttatttgaattaaagtcattgctcgactttgctatgcct
tcgctattaggttcacaggcgcactttaagcagcattttcaaggccctattgaacgcgaa
agcaatattgaacgtgcagagcaactaaaagcgttaattatgccgtttattttgcgccgt
actaaagcccaagtggctcaagagctgccgcaaaaaaccgaacttataaaagagtttgag
tttgaacctaaacaaaaagatatgtaccaaggtataacccgtgcgcttgaagagaaactc
attgatttatttgccgagcaaggcgtacaaaaaagtaaactcgcttttttagaagcttta
ttaaagttacgccaaatttgttgtcatcctaaactcattgaacctgaaactgaggcagcc
agtgctaaattagaatggttatcgagtcacttacctttaatgcttagccttggccgtaaa
gtgattatatttagccagtttacctctgcccttgatttaattgccgagcgtttaaatgag
ctaaatattaattttagtatgctaactgggcaaacgcgtcatcgcgataaagtaatagac
gaattcaccagtggtaacacttccgtgtttttaattagcttaaaagccggtggtacaggg
cttaatttaacccaagccgacaccgttattcattttgatccatggtggaacccagccgtt
gaaaaacaagccaccgatcgtgcttatcgaattgggcaaacaaacccagtgtttgtttat
aaactaattatggctaactctattgaacaaaaagtatttcaaatgcagcaagataagcaa
gcgcttgtagatgcattatttaccgaaaaatcaatgagttttacccagtttgacgaacaa
caaatgctgtctttaattaaaagctaa
DBGET
integrated database retrieval system
