Pseudoalteromonas issachenkonii: PI2015_3100
Help
Entry
PI2015_3100 CDS
T04164
Name
(GenBank) exonuclease SbcD
KO
K03546
DNA repair protein SbcC/Rad50
Organism
pia
Pseudoalteromonas issachenkonii
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pia00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
pia03400
]
PI2015_3100
DNA repair and recombination proteins [BR:
pia03400
]
Prokaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
HR (homologous recombination)
RecBC pathway proteins
PI2015_3100
Archaeal homologous recombinant proteins
PI2015_3100
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
AAA_23
SbcC_Walker_B
SMC_N
AAA_29
AAA_21
ABC_tran
AAA_22
AAA_16
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ALQ56351
LinkDB
All DBs
Position
II:complement(62917..66567)
Genome browser
AA seq
1216 aa
AA seq
DB search
MKITAVRIHNLASIADAEIDFLASPLKDAGLFAITGDTGAGKSTVLDAICLALYTKTARL
KGDKGNLIDFNGDNIKLNDARNLLRRGKWEGYAEVDFSGQDQQLYRARYSIQRTHKKVTG
KLKVAEHTLHSLPDETLIADKSGTLKAIENKIGLTFEQFSRAVLLAQHEFAAFLKATGDE
RAQLLECLTGTDKFSRIGQRIFERNKAIKDKFELLTASLASYTLLSDDELSEKQQTLADL
KQQIEHTKTTLATTEQSVNWYKQAHSLELALKNAQQNEQQAHAALNAVKAQTEQAKQAQS
ALEIKDNRQRCESLTAQNSQLNTQIKQLNELDHNAQITEQAGNVKKQQNELDTAKQQKLT
AEPLIAKARELDSRLAIYNQTIKSLTQQSTKEQQQLSDLQQQLQQNKISAEQATTQITGH
QHWLNEQSQLKPLATDWNYFHHSFKQFFNTQTQLKTTQQQAQAHAEQQTILTAKLSEQNK
QLEQAEQTLTTQQQSLNKLNQQHAQFNIEQCDSKLKNIDYLKDQRTRYKQFNQELKHTVQ
QQRDVAEKLSHSEHTKTTLLTHLTSKEQALKHAEQALNQARLRASEHVEHLRAQLVPNES
CAVCGATEHPFASNQSQPFTNLITDFENAYNNEKQQHQDAQTQLHQHQTQHAVLVAEHAQ
YSQAISEAQAKMLEIKNTMQAAKTELNELTVEQLDETYKQLSEQKTQYFSAQKQLSNLQE
TVNQLQSTVKKEQATQQQLNTQHVELSNQQSQLNNKCDELATQSEALIKELNLHFEHSDF
WHALQAGSLTLSDLAQQVEQYQQIQAQLEQSQKQFDSANVQLQQLTPLITKAEQRINTLN
EELTQTQQQHNNTQQQRLALFDNQTISADDYQAKLSAQLEHCQNQLSASQQAHDSAVKQR
DEHAITLKNLEHRLADNHQELVMLETRYNDWFKEFNILHGDISHEQVTFLLTISNDDIKT
QLKQGEQLSQAVVDASAALKQQQQANEQHQQNNQPTQSEAQLIEQQNHLNTQQTQLQNSL
LTINTAIEQHNQNAKALEGKQAELSQLKQQVDQWHLLNKVLGDATGKTMRNLAQTQTLKI
LLHYANSHLKTLNKRYELTAIAESLDIAIIDRDMADEQRSVNTLSGGESFLVSLALALGL
ASLSSNKVQINSLFVDEGFGTLDSETLSIAMDALDSLQAQGRKVGVISHVSEMSERVATQ
IHVAKKPGGYSTINVI
NT seq
3651 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaataacggctgttcgtattcataatttagcctccattgccgatgccgaaatcgac
tttttagcttcaccactcaaagacgcaggcctctttgccattacaggtgacaccggcgca
ggtaaaagcaccgtactcgatgccatctgcttagcgctttatacaaaaactgcgcgtttg
aaaggcgataaaggtaacctaattgattttaatggcgataacattaagcttaacgatgcc
cgcaatttattgcgccgtggcaaatgggaagggtacgccgaagtagattttagtggccaa
gaccaacaactttacagagcacgttatagtattcaacgtacacataaaaaagtaaccggc
aaacttaaagtggccgaacatactttacatagcctacccgatgaaaccttaattgctgac
aaaagtggcaccttaaaagccatagaaaataaaataggtttaacctttgagcagttctcg
cgtgcggtgttactagcacaacatgagtttgccgcctttttaaaagccactggcgatgag
cgcgcgcagcttttagagtgcctgactggcaccgataaatttagtcgaatagggcagcgt
atatttgagcgcaacaaagctattaaagataaatttgaattactaacggcaagtttagcc
agttatacgttattgtctgacgatgagctgagtgaaaaacaacaaacgctggctgattta
aaacaacaaattgaacacactaaaacaactttagcaacgacagagcaaagcgttaattgg
tataagcaagcgcatagcttggagctggcattaaaaaatgctcagcaaaacgagcaacaa
gcacatgccgcacttaatgctgttaaagcgcaaactgagcaagcaaaacaagcgcaaagt
gcgcttgaaattaaagataaccgccagcgctgtgaaagcttaacagcgcaaaatagccag
ttaaatacacaaataaaacaattaaacgagcttgatcacaacgcgcagatcaccgagcaa
gcaggtaacgttaaaaaacagcaaaacgaattagatacagcaaaacaacaaaagctaacg
gcagagcctctgattgcaaaagcacgagagctcgacagccgattagcaatatataaccaa
actataaaaagtctgactcaacaaagcaccaaagagcagcaacaattaagtgatttacaa
cagcagctacaacaaaacaaaataagtgcagagcaagccacaactcaaatcacagggcat
cagcactggttgaacgagcagagtcaattaaagccattggcaactgattggaactatttt
catcatagttttaagcagttttttaatactcagacacaactaaaaacaacccagcagcaa
gctcaggctcacgcagagcaacaaacaatactcacagcaaaacttagcgagcaaaataaa
caactcgaacaagcagagcaaacgcttacaacgcagcagcaaagcctaaataagctaaac
cagcagcacgctcaatttaacattgaacaatgcgacagtaagcttaaaaacattgattat
ttaaaagatcagcgcacacgctataagcagtttaaccaagaattaaaacacacggtgcaa
cagcaacgtgatgtggcagaaaagctcagccacagtgaacacactaaaactacgctgctt
acgcatttaaccagcaaagagcaggcacttaaacacgcagagcaagcgcttaatcaagcg
aggcttcgtgccagtgagcatgttgagcatttacgcgcacaactggttccaaatgagtcg
tgtgccgtttgtggggctacagagcacccgttcgcgagcaatcaaagccaaccttttaca
aacctaataaccgactttgaaaatgcatataataacgaaaagcagcaacaccaagatgct
caaacacagcttcatcagcaccaaacacaacacgcggttttggtggcagagcatgctcag
tacagccaagccattagtgaagcacaagccaaaatgctggaaattaaaaataccatgcaa
gcggctaaaaccgagcttaatgagttaacagttgagcagcttgatgaaacttataagcaa
ttaagtgaacaaaaaacacagtatttttcggcgcaaaaacagctcagtaatttgcaagaa
actgttaaccagctgcaaagcacagttaaaaaagaacaagcgacacagcaacaattaaat
acacagcatgttgagctgagcaatcagcaatctcagcttaataacaaatgcgatgaacta
gcaactcaaagcgaagcgcttataaaagagctcaatttacattttgaacacagtgatttt
tggcacgcattgcaagcaggatcgttaacgcttagcgatttagctcagcaggtagaacaa
taccagcaaatccaagcacagcttgagcaaagtcaaaaacaattcgacagcgccaatgta
cagttacaacaactaacaccgcttataaccaaagcagagcagcgaattaacacgctcaat
gaagaattaactcaaacacagcaacagcacaataatacgcagcaacagcgcttagcctta
tttgataaccaaactattagcgccgatgactaccaagctaaactgtcagcacagctagag
cactgccaaaaccaattaagtgccagccaacaagcacacgacagtgccgtaaaacagcgc
gatgaacacgccatcacgcttaaaaaccttgagcatcgtctggcagataaccaccaagag
ttagtgatgcttgaaacgcgttacaacgactggtttaaagaatttaacatccttcatggc
gatatcagtcatgagcaagtcacatttttactaactatcagcaacgacgatattaaaact
cagttaaaacaaggcgagcaactatcgcaagcagtcgttgatgccagtgccgccttaaag
caacagcaacaagctaatgaacagcatcaacaaaataatcagccaacgcaaagcgaagca
cagctaattgagcaacaaaaccacttaaatacccagcaaacacaattgcaaaatagctta
ctcaccatcaacaccgcgattgagcagcacaaccaaaatgcaaaagcgcttgagggcaaa
caagctgaactgagccagctcaagcaacaggttgaccaatggcatttacttaataaagta
ctaggtgatgccacaggtaaaacaatgcgtaatttagcgcaaacacaaacactcaaaata
ttgctgcattatgctaatagccatttaaaaacccttaacaagcgttatgagctcactgca
attgctgagtcacttgatatagccattatcgaccgcgatatggccgatgaacaacgctcg
gtcaatacgctatctggcggtgaatcgtttttagtgtcgttggcattagcactgggactt
gcctcactatcttcgaacaaagtgcaaattaactcgttatttgttgacgagggctttgga
acactagatagtgaaacactcagtattgccatggacgcgctagattcattgcaagcgcaa
ggtagaaaggtcggtgtaatttcacatgtaagtgaaatgagcgaacgcgttgctacgcaa
attcatgtcgctaaaaaaccgggtggatactccaccataaacgtaatttag
DBGET
integrated database retrieval system