Pseudoalteromonas issachenkonii: PI2015_3208
Help
Entry
PI2015_3208 CDS
T04164
Name
(GenBank) GTPase Der
KO
K03977
GTPase
Organism
pia
Pseudoalteromonas issachenkonii
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pia00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03009 Ribosome biogenesis [BR:
pia03009
]
PI2015_3208
Ribosome biogenesis [BR:
pia03009
]
Prokaryotic type
GTPases
PI2015_3208
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MMR_HSR1
FeoB_N
KH_dom-like
GTP_EFTU
Dynamin_N
AIG1
RsgA_GTPase
cobW
AAA_22
Roc
AAA_24
ABC_tran
SRP54
Ras
TniB
SRPRB
NOG1
RHD3_GTPase
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ALQ56455
LinkDB
All DBs
Position
II:complement(209200..210669)
Genome browser
AA seq
489 aa
AA seq
DB search
MLPVIALVGRPNVGKSTLFNRLTRTRDALVADFPGLTRDRKYGQANYDGFEFIVVDTGGI
DGSEEGIETEMADQSLLAIEEADIVLFLVDARVGMTVADQAIANHLRKQEKKCFVVANKT
DGIDADSNCAEFYQLSLGEVHHIAAAHGRGITLLLEQTLQPVIAELAALDEDVADDDEEL
IDLYQEGEEDDTDHQAFADKPVKLAIIGRPNVGKSTLTNRILGEDRVIVYDMPGTTRDSI
YIPMTRNDKEYILIDTAGVRKRKKVSDVVEKFSVIKTLQAIEDCNVVLLVVDARDGISDQ
DLSLLGFALNSGRSLVIAVNKWDGLDNYVKDRIKTELDRRLGFIDFARLHFISALHGTGV
GHLFESVDEAYESATKRISTAMLRRIMDMAQADHQPPLVRGRRVKLKYAHAGGYNPPRIV
IHGNQVHDLPDSYKRYLMNYYRKALKIMGTPIKIEFREGDNPFAGRTNKVTLSQKRKIRA
FSKENRNKS
NT seq
1470 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcttcccgtgatcgctcttgtagggcgacccaatgtgggcaaatccacattatttaac
cgtttaacacgtactcgtgatgcactcgttgccgactttcctggcttaacgcgtgataga
aaatatggccaagcaaattacgatggctttgaatttatcgtggtagatacgggcggtatt
gatggctcagaagaaggtatcgaaaccgaaatggctgatcagtcattactagccattgaa
gaagcggatattgttttatttttagttgatgctcgcgtaggtatgacagtggctgaccaa
gctattgctaaccacttacgtaagcaagagaaaaagtgctttgtggtagccaataaaaca
gacggcattgatgctgactcgaactgtgctgagttttatcaactttcactcggtgaagtt
catcatatcgctgccgctcatggtcgtggtattactttactgcttgagcaaacacttcag
ccagttattgctgaacttgccgcacttgatgaagatgtagccgatgacgatgaagaactt
atcgacttatatcaagaaggtgaagaagatgacacagatcaccaagcgtttgccgacaag
ccggtaaagctggctattattggtcgtcctaacgttggtaagtcaaccctgactaaccgt
atactgggtgaagatcgcgttattgtatacgatatgccaggtacaacgcgcgactctatc
tatattccgatgacccgtaatgataaagaatatattcttatcgatacagccggtgtgcgt
aaacgcaaaaaagtaagtgacgtggttgagaagttctcagtcattaaaacactacaagca
atcgaagattgtaacgtggtgctattagtggttgatgcccgcgatggtatttcagatcaa
gatttaagcttattaggctttgcccttaactcagggcgctcattggtaattgccgtgaac
aagtgggatggcctagacaactacgttaaagatcgtattaaaactgagcttgatcgtcgt
ttgggctttattgattttgcccgcttgcactttatctctgcgctacatggtacgggtgtt
ggtcatttatttgaatcagttgacgaagcgtatgagtcggcaactaaacgtataagcacc
gctatgctgcgtcgtattatggacatggcacaagcggatcaccagccgccacttgttcgc
ggtcgtcgtgttaagcttaaatatgcgcatgctgggggttataatccgccgcgtatcgtc
attcatggtaaccaagttcatgatttacctgatagctacaaacgctacctaatgaactac
taccgtaaagcacttaagattatgggtacgccaatcaaaattgaatttagagaaggcgat
aacccatttgcagggcgtactaataaagtaaccctgtcgcaaaaacgtaaaattcgtgcg
tttagtaaagaaaaccgcaataagtcataa
DBGET
integrated database retrieval system
