Pseudoalteromonas issachenkonii: PI2015_3280
Help
Entry
PI2015_3280 CDS
T04164
Name
(GenBank) YD repeat-containing protein
Organism
pia
Pseudoalteromonas issachenkonii
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RHS_repeat
DUF6531
RHS
PPL5
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ALQ56526
LinkDB
All DBs
Position
II:290938..295416
Genome browser
AA seq
1492 aa
AA seq
DB search
MQSNTVVLQGISYPICLVAGKGSAPSGFFAVAANTPESAKSQIAQVGSALTSDAAKRLDV
INLLNLAGISCSRGASARETASVLTQALVADKISCYHQKAKSAIQVSDNTNSGAAGKKPS
SKSSSTASGKSASQAPAKNSGGASNNTPSEEPITKQECRSDPVSMLSGEEILPLIDFTLA
GSKQLIWRRLYRSSHADVCSVMGNGWRHDFMVQLTEHYLPPPKVGPKQKGTYWLEYQDEH
GAKHRFEKVKPGQSSYQLSSNLALHYQTNGKQVLVTPDDQHLTFKAGENSWLLEKVINEK
GQSIGFYYDAKERLHRVEVNKARGCILKYNPQGLLANISAYRTGDNNKPVLLTPLLAQYD
YDENKNLVRATNQQGETEHYGYNAANLLTKRTRASGFSHHFEWDSYSSSAKCIKQWGDNN
TYTYQFEYNLDAGETTCIDSRGHKEHFVHNAQGKLVKHTDPNGNVWHYRYNAQGQKITEI
KPDSSEIKYSYTPYGQLESITQPDGSVTKFAYNQLGQRVLTTLPDGQTITRKYSVAGLLQ
SETFGDGRTVLYSYDKFGQLTQHINKDGQVTKFVWNEQGELLAKHHNDELIRYSYDSLGR
VNATINNAGLLTQYKYNEHGQLAQTIAFDEKDPENKQHQYFSYDDAGRLISSQNSKGDTT
EQHFEGLSQPHCVIQPDGSALHLTYDKERNLTAIERSDGHVYRISYDANENPTQVTGFDG
TLQQYKYDACNRLTSVTQSDKRHVKIERDKLGRVIAQHASLATDTHIVNNANYYSYNLQG
KITRAHNAQSTLKQQFDKGGRLLHAEQVHNQQQAHTLKYSYDDYGRRQSLTLPDSSTLKY
SYNKFGQLSAIHLEQANSTAVELAALSYDSQGNIQTQQFGNDVTLTQHFDVFNRLTQQQL
THPAQALFDTCTYNYDSVNQLIARKEEGVSSHNINFEYNSLGQLIQQNLVSSENKKTTQY
QWDSFGNPVSQSKIKNNELSEQQATQHNDESDAINKVDSNQSANTNNALHSEYNDLSAAT
AASDLSDNDDVITGITDADRLTHFGDSDFHYDEFGNQIRETGKGIKTRREYNAFNQLSCF
NNNGTLTQYDYDPLGRRIAKHTEQGKIDYIWDNDQLIGEYQHGEYTWYINLPNQFHPVAL
IKKGEVFYYHLDQLNTPRFVTNNKVEVVWENQADVYGYEESEAESGTNKESSFTQPIRFQ
GQYLDEESGLHYNRYRYYSPKQQRFINQDPIGLVGGINHYQYAPNPVNWFDPFGLLCKEG
VKKLSKMIGDIVDTATKAKILKIAEDSSPADARTGNIKVTRPNGENRLEHEYSIESMDVD
NGKITLTREVGDKVIETTMSIEQFVGGHVIDGKVVNEEWSRETGTLTENELKLNKATKKA
GSKRTVYSLPVTLKENVDTRDEEMVERDKHKAKASPEETQRYNDQIPKINNESAKIGEKA
ADAAIKTQYPGYTRIHPTSLDSSTSVKGNFDMVYENADGDVIIVEAKGAVAH
NT seq
4479 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcaaagtaataccgttgttttacaaggaataagttatccaatttgcctcgtcgctggt
aaaggttcagcgccgtcgggtttttttgctgtagcagctaacacgcctgaaagtgccaaa
agtcaaattgcgcaagtcggcagtgcgcttactagcgacgccgctaaacgtttagacgtt
attaacttgcttaaccttgcaggaataagctgttcgcgcggtgcgtcagcccgtgaaacc
gcgagtgtattaacccaagctttggttgcagataaaattagttgttatcaccaaaaagct
aagtcggccattcaggtaagcgataacaccaatagcggcgcagcaggtaaaaagccaagt
agtaagagcagttcaacagcctcaggtaaaagtgcctctcaagcgccggctaaaaacagt
ggcggtgcaagtaataataccccaagtgaagaacctatcactaaacaagagtgccgctct
gatccggtttctatgctctcaggtgaagaaatactgccgcttattgacttcaccttagca
ggcagcaaacaattaatttggcgacgcctataccgttcatcgcatgcggatgtatgcagt
gtaatgggtaatggttggcgacatgactttatggtgcagttaactgagcattacttaccg
ccacctaaagtaggcccaaaacaaaaaggcacctattggttagaataccaagatgagcat
ggcgctaaacaccgttttgaaaaagtaaaaccggggcaatcgagctatcagctaagcagt
aatttggctttgcattaccaaactaatggtaagcaagtattggtaaccccagatgatcag
catcttacgtttaaagctggcgaaaactcatggttgctcgaaaaagttattaacgaaaaa
ggccaaagtattggtttttattacgatgcgaaagagcgcttgcatcgcgttgaggtaaat
aaagcgcgtggctgtattttaaaatataacccgcaagggttgctggcaaacatttcggct
tatcgtacaggtgataacaacaagccagtattactaacgccgttacttgcgcaatatgat
tatgatgaaaacaaaaacctcgttcgcgcgaccaatcaacaaggtgaaacagagcattat
ggctataacgccgctaacttattaactaagcgtactcgtgccagtggttttagccatcat
tttgaatgggacagttactcatcgagtgctaagtgtataaaacaatggggcgataacaac
acctatacgtatcagtttgaatataatttagacgctggtgaaacaacctgtatagactcg
cgtgggcataaagaacactttgtacataacgcgcaaggtaagttagttaagcacaccgat
cctaatggtaatgtttggcactaccgctataacgcacaaggccaaaaaataacggaaata
aagccagacagcagtgaaataaaatacagttataccccttacggtcagttagaatcaata
acgcagccagatggcagtgtcactaaatttgcttacaaccaattgggtcagcgtgtatta
accacattgcctgatggtcaaacaataacccgtaaatacagtgtggcgggtttgctgcaa
agtgaaacctttggcgacggtcgcactgtactttacagctatgacaaatttggccagcta
acccaacacataaataaagatggtcaagtcactaaatttgtatggaacgaacaaggtgag
ctattagcaaaacaccataacgatgagcttattcgttacagttacgacagtttaggccgt
gtaaatgccaccattaataacgcaggtttgttgactcaatataagtacaatgagcacggt
cagcttgcgcaaactattgcctttgacgaaaaagaccctgaaaacaaacagcatcaatat
tttagttatgatgatgcagggcggttaattagctcgcaaaacagtaagggtgataccacc
gagcaacactttgaagggctaagccagccacattgtgttattcagcccgatggcagcgca
ctgcatttaacttacgacaaagagcgcaacctaaccgctatcgaacgtagcgacggccat
gtataccgcataagctatgacgctaacgaaaacccaacgcaagtaactggattcgatggc
acgttacagcaatataaatacgatgcttgcaatcggttaacctcggtgacacaaagtgat
aaacgccatgtaaaaatagagcgtgataaattagggcgcgtgattgcgcagcatgcaagt
ttggcaaccgatactcacatcgttaataacgccaactactatagctataacttgcaaggt
aaaattacccgtgcgcataatgcacaatcaaccttaaagcagcagtttgataaaggcggg
cggttactgcatgctgagcaagtacataatcagcaacaagcgcacaccttaaaatacagt
tacgacgactacggcagaaggcaatcactgaccttgccagattcaagtacgcttaaatat
agctacaataaattcggccagctaagtgctattcacttagagcaagccaatagcacggct
gttgaacttgcagcgcttagctatgacagtcaaggcaatattcaaactcaacaatttggt
aatgatgtaacccttacccaacattttgatgtatttaaccgcttaacacagcagcagtta
actcatcctgcgcaagcactatttgatacctgtacgtacaattacgacagcgtaaaccag
ttgattgcgcgaaaagaggaaggcgttagtagccataatattaattttgagtacaacagc
cttggccagttaattcaacaaaatctagtaagttctgagaacaaaaaaactacccaatac
cagtgggatagctttggtaacccagttagccagtcaaaaattaaaaataacgagttatcc
gaacaacaagctactcagcacaatgatgagagtgatgccatcaataaggttgatagcaac
cagtcagctaacacaaataacgcgcttcatagtgagtataacgatttaagtgcagcaacc
gcagctagtgatttaagtgataatgatgatgttattacaggcatcaccgacgccgaccgt
ttaacccactttggcgacagcgactttcattatgatgaatttggtaaccaaattcgcgaa
accggtaaaggtataaaaacccgccgcgaatacaatgcatttaatcagctaagttgcttt
aacaacaacggcacgcttacccaatacgattacgacccactggggcgtcgtattgccaag
cataccgagcagggtaaaattgactacatttgggataacgaccagttaattggcgaatac
caacatggggaatatacctggtatatcaacctaccaaaccaatttcacccggtcgcgcta
attaaaaaaggtgaggtgttctactaccacctagaccaactgaataccccacgttttgtt
accaataacaaagtagaagtggtatgggaaaaccaagccgatgtgtatggttatgaagag
tcagaagccgagtctggcactaacaaagaaagtagcttcactcagcctatacgctttcag
ggtcagtatttagatgaagagagcggcctacattacaaccgctaccgctactacagcccc
aaacaacagcgctttataaaccaagatccaattggtttggtgggtggtataaaccactat
caatatgcaccgaatccggttaattggtttgatccttttgggttattgtgtaaagagggt
gtgaaaaagctttctaagatgataggcgacatcgttgatacagcaacaaaagccaaaata
ttaaaaattgctgaagacagttctccagcagatgccagaacgggtaatattaaagtaaca
agacctaatggtgaaaacagacttgagcatgaatacagtatcgaatctatggatgttgat
aacggtaaaattactttaacacgagaagtaggcgataaagtgattgaaactacgatgagc
attgaacagtttgttggtgggcatgttattgatggcaaagtggtaaatgaagaatggtct
cgtgaaacaggaacgttgactgagaatgagttaaaacttaacaaagcaactaaaaaggca
ggcagtaaacggactgtttattctcttcctgtaacgttgaaagagaatgtagatactcgt
gatgaggaaatggtcgaacgagataaacacaaggcaaaagcttcaccagaagaaacacaa
cgttataacgaccaaataccaaagattaacaatgaatcagccaaaattggcgaaaaggct
gctgatgcagcgattaaaacacaataccctggttatactcgtattcatccaacgagctta
gatagttctacatcggtaaagggtaactttgatatggtttatgaaaatgctgatggtgat
gtcattattgttgaagccaagggggcagtagcccattag
DBGET
integrated database retrieval system