Pigmentibacter sp. JX0631: QEJ31_02325
Help
Entry
QEJ31_02325 CDS
T08995
Name
(GenBank) efflux RND transporter permease subunit
KO
K07788
multidrug efflux pump
Organism
pij
Pigmentibacter sp. JX0631
Pathway
pij02020
Two-component system
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pij00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
02020 Two-component system
QEJ31_02325
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
pij02000
]
QEJ31_02325
Transporters [BR:
pij02000
]
Other transporters
Electrochemical potential-driven transporters [TC:
2
]
QEJ31_02325
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
ACR_tran
SecD_SecF_C
MMPL
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WGL60440
LinkDB
All DBs
Position
547320..550439
Genome browser
AA seq
1039 aa
AA seq
DB search
MINISDPFIKRPIATTLIMCAVFLVGILAYKLIPVAALPEVDYPTIQVKTLYPGASSIVV
TSSITAPLEKQFGQMSGLKLMTSSSGDGLSLINLQFDLAMNLDIAVQEVQAAINTSSNLL
PQDIPSPPIYYKVNPADTPIMTLSFTSDTYTLPEIHELIETRYVPKLSEIPGVGLVTING
GQKPAIRIQVNPTAIAGYNLNIDDIRNAILASNVNLAKGNIDGNRVSFTINANDQLLDIN
SYKNLIVSYRNNSPIYLKDLANIESSSENIRLAAWKNLTPALILNIQKQPTSNVIDVVNR
IEKLLPILQVNIPKDIKIEILNDRTQSIRNSVSDAQFELFLAVILVVLIIYVFLNDLKTT
LIPSVCVPLSLIGTFSVMYMLNFSLNNLTIMALTIATGFVVDDAIVMIENISRYVELGET
KINAALKGSAQIGFTIISLTVSLIAVLIPLLFMGDIIGRLFREFSITLAVSILISAFISL
TLTPMLCRFFINDNHIKKDNKLNKFLKSMIDKLIFNYSITLKIILNNQKTVLLISILTFF
ATIMQYYFIPKNFFPQQDISLIQGITESSESISFTNMLEKQKLIVNEILQDEAVLNVSSY
IGVDGNNYSINNGRLLIRLKDNELRKEKINTIIERIQNSVQKIKDISLYMQAVQDINIDN
RVSKTQYQFSLSSPSLTEVDKWTKILVSELTHSENLKDINHDLQNNGLQLKIEIDRNSAA
RFGITTNMIDTALYNAFGQRQISTIYTQSNQYHVILEVNPSLDINANNILNKIFILSNNK
ISIPLSAFTKVSYDTEPLVINKQEQFPVATISFNLISGHSLEQAVNDIEEAKLKINLPKS
IETRFEGATQSFQNSLKNQIYLIIAAIIVVYIILGILYESYIHPITIISTLPSAGMGALF
SLQLTKQNFDIISLIGIILLIGIVKKNAIMMIDFALELERKEKKKPIEAIYEACLLRFRP
ILMTTLAALLSAIPLAFGTGMGSELRRPLGISIIGGLIVSQLLTLYTTPVIYLFFSKLFS
EKKKNIIQKESNLSFREDH
NT seq
3120 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatcaatatttcagatccatttataaaacgacctattgcaactacacttattatgtgt
gcagtttttttagtaggtatattagcttataaattaattccagttgctgctttacctgaa
gttgattatcctactatccaagttaaaactttatatccaggtgcaagttccattgttgtt
acctcgtcaattacagcaccacttgagaaacaatttggacaaatgagtggactaaaatta
atgacatcttccagtggagatggattatctttaattaaccttcaatttgatttggcaatg
aatttagatattgctgttcaagaagttcaagcagcgataaacacaagctcaaacttattg
ccacaagatatcccaagtccaccaatttactataaagtgaatcctgcagatacacctatt
atgaccctatcatttacctcagacacttatactctaccagaaatacatgaacttattgaa
acaagatacgtaccaaaattatcagaaattcctggtgttggacttgtaacaataaatgga
gggcaaaaaccagcaattcgtattcaagtaaatcctacagcaatagcaggatacaattta
aatattgatgatattagaaatgctatattagcttcaaacgttaatttagcaaaaggaaac
attgatggtaacagagtatctttcaccatcaatgcaaatgatcaattactcgatataaat
tcttacaaaaatttgatagtgtcatacagaaataattctccaatttatttaaaagattta
gctaatatagaaagttcgtcagaaaatatacgtctggcagcatggaaaaacttaacacca
gcacttatcttaaatattcaaaaacaacccacatccaatgttattgatgtggtaaataga
atagaaaaacttctgccaattttacaagtgaatattccgaaagatattaaaattgaaatt
ttaaatgatcggactcaatctataagaaattctgttagcgacgctcaatttgaacttttt
cttgctgtaattttagttgttctaattatttacgtttttttaaatgatcttaaaacaact
ctaattccaagcgtttgtgtaccattatcactaattggtaccttttcagtaatgtatatg
ctaaattttagcttaaataatttaactattatggctcttactatagccacaggttttgtt
gtcgatgatgctatagtaatgattgaaaatatttcacgatatgttgaattaggagaaaca
aagataaatgcagctttgaaaggttccgcccaaataggatttacaataatatctcttact
gtttcattaattgcagttttaatacctttgctatttatgggtgatatcattggtagatta
tttcgtgaattttctattacattggctgtttcaatacttatatcagcgtttatatctctt
acattaactcctatgctttgccgtttctttatcaatgataatcatattaaaaaagataac
aagttaaataaatttcttaaatcaatgattgataaattgatatttaattactctattact
ttaaaaataatattaaataatcaaaaaactgtattattaatatctatattaacttttttt
gcaacaataatgcaatactattttatcccaaaaaactttttccctcaacaagatatttca
ttaattcaaggaataaccgaatcttctgaaagtatctcatttacaaatatgcttgaaaaa
caaaaacttattgttaatgaaattttacaagacgaagctgtattaaatgtttcttcttat
attggagttgatggcaataattattcaattaataatggaagattacttattcgattaaaa
gacaatgaattaagaaaagaaaaaataaatacaataattgaaaggatacaaaatagtgtt
caaaaaataaaagatatttctttatatatgcaagctgttcaagatattaatattgacaat
cgggttagtaaaactcaatatcaatttagtctatcatcaccatctcttactgaggttgat
aaatggacaaaaatacttgtaagtgaattaactcattctgaaaatttaaaagatatcaac
catgatttacaaaataatggtttacaactaaaaatagaaattgatagaaattctgctgca
cgtttcggaataacaacaaatatgatcgatacagctttatataatgcatttggacaaaga
caaatttcaacaatatatactcaatctaaccaatatcatgtcattttagaagttaatcct
tctttagacattaatgcaaacaatatattaaataaaatatttattttatcgaataataag
ataagtattccattatctgcttttacaaaagtgagttatgatacagaaccacttgtaatt
aataaacaagaacagtttcctgttgcaactatatctttcaatttaatttcaggtcattcg
cttgaacaagctgttaatgatattgaagaagcaaaattaaaaattaatttacccaaaagt
atagaaacaagatttgaaggagctacacaaagttttcaaaattctttaaaaaatcaaatt
tacttaattatagccgctattattgttgtttatattattttaggaatattgtatgaaagt
tatattcatccgattactattatttccacactgccttctgcaggaatgggagctttgttc
tccttacaattaactaaacaaaattttgatattatttcgctaataggtattattttgtta
atagggattgtgaaaaaaaatgcaataatgatgattgattttgcattagaattagaaaga
aaagaaaagaagaaaccaatagaagctatttatgaagcctgtttattaagatttagacca
atactaatgactactttagctgcattattaagtgctattccattagctttcggaacagga
atgggatcagaattaagacgaccattaggtatttctattattggaggacttattgtaagt
caattactaactctttatacaacacctgttatatacttatttttctctaaattattttct
gaaaaaaagaaaaatataattcagaaagaatctaatttatcttttcgtgaggatcattaa
DBGET
integrated database retrieval system
