Pigmentibacter sp. JX0631: QEJ31_02535
Help
Entry
QEJ31_02535 CDS
T08995
Name
(GenBank) TcdA/TcdB catalytic glycosyltransferase domain-containing protein
Organism
pij
Pigmentibacter sp. JX0631
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TcdA_TcdB
Peptidase_C80
Gly_transf_sug
HemolysinCabind
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WGL60478
UniProt:
A0AA95GAQ1
LinkDB
All DBs
Position
complement(598466..604141)
Genome browser
AA seq
1891 aa
AA seq
DB search
MKKKLILIQKLSLSALVCFSLNSCGGRKQNIESDGDSKKINSNYGLYEKNQNLTVNVFSS
LYLNGLERIINEMNPADINKIKEVLKKFSESENIDNSEKKYFLIHELLKKIPEPRFIGEN
KEYLKKYEALLDNLEKYYLKTATPVPKILHFVWLGGPLGETQKEYVKIWAKLNPDYKVKI
WYDSEHLFTHETNKKIKEFLDYSLVEFKNDDKYQNIFSDKYIALQNDLFEKLAKLRQKKQ
TGNYDLERLNYIEKILYKKSKINNNLIEERKDKFNLDSKKMKEEFSNIEFEDLKNVKYKW
DLLDIYDQELLLRGNFAAAGDSARAELLRKFGGVYADIDVLPAIKPLNNFIEQYDKINGD
DRASRRFRGLSLAYCEQIFNHFKFLTPTRKVDNKYKNGVLKSIDYDGNLTTIEKSKFKTA
IRSNLLALKELKNIENIFVKLGDVNIRIGEFKAAEDSNSFIASHPKTSSTDWLEDIKSNI
LRNYAKLNSFDINNPKGFFEFDKEYIKVTEKKKYKLPHKFSESDVDYYIQGYRKDSLLPD
YRITVKTSGPGVFAQTQENLFPEFISERGSFYKNKVVKIATEFSLKNNKFTNATEEDVNS
SWATKSKSRDYDTFGLRKVILPVSSEENILNAADLIHKKKMAEFKKTSLVKLDSLHLTDI
ETSEFEKVNFYLVGHAEKDNDSVKIGNLSAKELADKMLDFSEKNKNHLIDYIDIISCNPT
NDLNDTKNLVSYTQELMENLQKLGIPIDIVSIRKSTIKIDENGNELSKSKLGLYEYANDS
DKIYVIKKGNNEYLTINTSNIVDLIEPNNLKKLNHFNGVFKTLLSKKTQELGEFNDVLNK
IKDYYNKVNIDRRDSTSSVKFSLNSSESSLNLNSSDSDEERKNSITKSSILLTDGDNKPY
KKLAKYSFKGIDSLTSVTNKYNIFMTLLNTPKTLKNITTSFQQGMVLDGIRESTNFTVNN
ADLVLDLIKFSKGNSFWIQHSKAFNNMSRTQVGFNLASAGLDIWQAVDLYKAASSTQDHN
QKIDFIVNGSLTTARAASSIGTAILLPLSAKSGPIGAAIGYTIMFSQGTYNAVRTSQELR
RIGFKEEDITVKSMLSFFGQYDKSEDPAYITRIETIKLKNEVIPNILKEKNKEFFSSLGK
KHENIHFFFKKMIYPDLDLYLPYTFEYTITGCGYGVCASNKTPGRRLDNETHLCLSNNMY
FNRNHSSSNNLLNIHINAVNTNQHLLEKKFAGIPSVPRNNYYSQASENYTNNTIPCPSPS
TSKYMIEESANLTNEEQAMLASVSLSKQANLYFLGYGDQGKHGNMIHTIIADQGSNNLYN
IHPSTYMLHIIGGEKDDIFEFYDLLKSEDPEKGFIDGGFGIDTISFEGIKNNNVTISLDN
KIKSIGLPDFKNIENVMGSHGSDKIYGNDLNNYLYGNIGSDEIDGGSGDDILLPGEGFDI
LTGGEGSDQYIISKKDLSIDNSQFKSINNYDSSMEQKMDLLILDIKNLVSHKNENNLEIG
YFENLKFNKVVNIKDYFLGENYQHLIIKDLSGNQYYGQNGKLYSENSDYSKLDTVIFKDL
SNINLSEENEKVDLIDNVKNVIGTNFNNDIIGNNFDNLLIGNGGYDKIWGKNGNDTISIE
MNSNRKNDDSDELLHESFLNIFGYYSRSELNGGEGNDNYILNFSKLDSYENEFHVVIDNF
DPNKNIDNLIINDLDFEIKSVNFSKILSDDLNINESLKIEFQDSKKKKYHIYIKKFFQSL
EYQHLQIQFGASMVLSVNEINSIINTLTDENKNYTLFLDDEINLDQLKENKYYFIDSEKI
DYNIYSLNYILNSKDYKFKFAKFQQNLILSIINVKDINNYSIFYIKDFFNNKIIFKNLKL
EMNSKIIFSEDDFQKYTSELLDGEIQEFEIK
NT seq
5676 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgaaaaaaaaattaatattgattcaaaaattatctttatcagctttggtttgcttttct
ttaaatagttgtggtggaaggaaacaaaatatcgagagtgacggagattcaaaaaaaata
aattcaaattatggattgtatgaaaaaaatcaaaatctaacggtaaatgttttttctagt
ttgtatctaaatggtttagagcgaattataaatgaaatgaatcctgcagatattaataag
ataaaggaagttttaaaaaaattttctgaatctgaaaacattgacaatagtgagaaaaaa
tattttttaattcatgaattacttaaaaaaattcctgaaccaagatttattggcgaaaat
aaagaatatttaaaaaaatatgaagccttgcttgataatcttgaaaaatattatctaaaa
actgcaacacctgtgcctaaaattttacactttgtatggcttggtggtccgttaggagaa
actcaaaaagaatatgtaaaaatttgggcaaaactaaatccagattataaagtcaaaata
tggtatgactctgagcatttatttacccatgaaaccaataaaaaaattaaagaatttctt
gattattcattagtagagtttaaaaatgatgataaatatcaaaatattttttctgataag
tatattgctttacagaatgatctatttgaaaaacttgcaaaattgagacaaaaaaagcaa
acaggaaattatgatttagaaaggttaaattacattgaaaaaattctttataaaaagagc
aaaataaataataatctaattgaagaaagaaaagataaatttaatttagatagcaaaaaa
atgaaagaagaattttctaatattgaatttgaggatttaaaaaatgttaaatataaatgg
gatttgttagatatctatgatcaagagctgcttttaagaggaaattttgcagcagctgga
gacagtgcaagagcagaattacttagaaagtttggtggagtttatgctgatattgatgtt
cttccagcaataaaacctttaaataattttatagaacagtatgataaaataaatggagat
gatagggcttctcgacgctttagaggtctttctttagcatattgcgaacaaatatttaat
cattttaaatttttaactcctacaagaaaagtggataacaaatataaaaatggtgtttta
aaatcaattgactacgacggaaatttaacaactattgaaaaatctaaatttaaaacagct
attcgaagtaatttacttgctctaaaagaattaaaaaatattgagaatatatttgtaaaa
ttaggagatgtaaatatcagaataggagaatttaaagcagccgaagattcaaatagtttt
atagcatcacatcctaaaactagtagcactgattggctagaagatataaaaagtaacatt
ttacggaattatgcaaaattgaattcttttgatattaataatccaaaaggattttttgaa
tttgacaaagaatatatcaaagttacagaaaagaaaaaatataaacttcctcataaattt
tctgaatctgatgttgattactatattcaaggatatagaaaagattctttactgcctgat
tatagaattacagtaaaaacatcaggacctggggtttttgcccagacgcaagaaaattta
tttccagagtttatttcagaaagaggaagtttttataaaaataaagtagttaaaatagct
actgaattttcattgaaaaataataaatttacaaatgctacagaagaagatgtaaattct
tcttgggcaactaaaagtaaatcaagagactatgatacttttggattaagaaaagttatt
ttacctgtttctagtgaggaaaatatattaaatgcagcagatcttatccataagaagaaa
atggctgagtttaaaaaaacctctcttgtaaaattagatagtttacatttgacagatatt
gaaactagtgaatttgaaaaagttaatttttatttagttggtcatgcagaaaaagataat
gattcagttaaaattgggaatttatcagcaaaagaattagctgataaaatgcttgatttc
agtgaaaaaaataaaaatcatttgattgattacattgacataattagttgtaatcctact
aatgatttaaatgataccaaaaatttagtttcctatacacaagaattaatggaaaattta
caaaaattaggaattcctatagacatagtaagtattagaaaaagtactattaaaattgac
gaaaatggcaatgaactttcaaaaagcaaattgggtttgtacgaatatgctaatgatagt
gataagatatatgttataaaaaaaggaaataatgaatatctaacaataaatacttcaaat
attgttgatttaattgaaccaaacaatttaaaaaaattaaatcactttaatggtgttttt
aaaactttgctaagtaaaaaaactcaagaattaggtgagtttaatgatgttctaaataaa
attaaagactactataataaagtaaacatagatcggagagactctactagtagtgttaaa
tttagcttaaatagttctgaatcttcattaaatttaaatagtagtgactcagatgaagaa
agaaaaaattctattactaaatcttctattttgctcacagatggtgataataaaccatat
aaaaaactcgctaaatattctttcaagggtattgatagtttaactagtgtaacaaataaa
tacaatatttttatgactttgttgaatactccaaaaaccttgaaaaatataactacatcg
tttcaacaaggtatggtgttagatggaattagagaaagtacaaattttactgtaaataat
gcagacttagttttggatttgattaaattttcaaagggaaattcgttttggattcagcat
tcaaaggcatttaataatatgagcagaacacaagttggatttaatttagcatcagctgga
ttagatatttggcaagctgttgacttatataaagctgccagtagcactcaagatcataat
caaaaaatagattttattgtaaatggcagtttaacaactgctagagctgcaagctcaatt
ggtactgcaattttgttacctttgtcagccaagtcaggacctataggtgcagcaataggg
tacacaataatgttttctcaaggcacatataatgctgtacgaacttcacaagaactaaga
agaattggttttaaagaagaagatatcactgttaaatcaatgttaagtttttttggtcaa
tatgataaatcagaagatccagcttacattacaagaatagagactattaaacttaaaaat
gaagtaattcctaatattctaaaagagaaaaataaagagtttttttcttcgctaggaaaa
aaacatgaaaatattcacttttttttcaaaaaaatgatctatcctgatttagatttatac
ttgccctatacttttgagtatacaattactggttgtggatatggagtttgtgcttcaaat
aaaactccaggaagaagacttgataacgaaactcatttatgtctttcaaataatatgtat
tttaatagaaatcattctagttccaataatttactaaatattcatattaatgctgtaaat
acgaatcagcatttactagaaaaaaaatttgcaggtattccttctgttccaagaaataat
tactactctcaggcaagtgaaaattacacaaataatacgataccgtgccctagcccttca
actagcaaatatatgattgaagaaagtgcaaatttaacaaatgaagagcaagcaatgctg
gcaagcgtgtcattaagcaaacaagctaatttgtattttcttggctatggtgatcaagga
aaacatggtaatatgattcatactattattgcagatcaaggcagcaataatttatataat
atccatccctcaacttatatgctgcatataataggaggagagaaagatgatatatttgaa
ttttatgatttattaaaatcagaggatcctgaaaaaggttttattgatggtggcttcggg
atagatactatcagtttcgaaggaattaaaaataacaatgtaacaatatctttagacaat
aaaataaaatctataggccttcctgattttaagaatattgaaaatgttatgggaagccat
gggagtgataaaatttatggaaatgatttaaataattatctgtatggtaacattggtagt
gatgaaatagatggtggttcaggagatgatatcttattacctggtgaaggttttgatatt
cttacaggaggcgagggttcagatcaatacattatttctaaaaaagatctttctatagat
aattctcaatttaaaagtattaataattatgattcctctatggaacaaaaaatggatcta
cttattttagatattaaaaatttagtatcacataagaatgaaaataatttagaaattgga
tattttgaaaatttaaaatttaataaagtagttaatataaaagattattttttaggagaa
aattatcaacatttaattattaaagatttatcaggaaatcagtactatggacaaaatggg
aaactgtattctgaaaattctgactatagtaagttagatactgttatatttaaagatctt
agcaatataaatttatcagaggaaaacgaaaaagtagatctaattgataatgtaaaaaat
gttattgggactaattttaataatgatattattggtaataattttgacaatttattaatt
ggaaatggtggatacgataagatttggggaaaaaatggaaacgacacaatatctattgag
atgaattcaaatagaaaaaatgatgattcggatgaactattgcatgagtcatttttaaat
atttttggttattactcaagatcagaattaaatggtggtgaaggaaatgataattatata
ttaaatttttcaaagcttgattcctatgaaaatgaatttcatgttgtaattgataacttt
gatccaaataaaaatattgataacctaataattaatgatcttgattttgaaattaagagt
gtaaatttctcaaaaatattatcggacgacttaaatattaatgaatcattaaaaattgaa
tttcaagattctaaaaagaagaaataccacatttatataaaaaaatttttccaatcttta
gaatatcaacatttacagatacaatttggggctagtatggttttatctgtaaatgaaatt
aatagtattataaatactttaactgatgaaaataaaaattatacattatttttagatgat
gaaataaatttagatcaattaaaagaaaataagtactactttatagattctgaaaaaatt
gattataatatatactccttaaattatattcttaattcaaaagattataaatttaaattt
gcaaaatttcaacaaaacttgattttgagtataattaatgtaaaagatataaataattac
tctattttttatattaaagatttttttaataataaaattatttttaaaaatttaaaattg
gaaatgaattcgaagattatattttctgaagatgattttcaaaaatatacttccgagctt
ttagatggtgaaattcaggaatttgaaattaaatga
DBGET
integrated database retrieval system