Pseudomonas imrae: OQ460_04205
Help
Entry
OQ460_04205 CDS
T11325
Name
(GenBank) BapA/Bap/LapF family large adhesin
Organism
pim Pseudomonas imrae
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Other DBs
NCBI-ProteinID:
XLY94102
LinkDB
All DBs
Position
766958..772957
Genome browser
AA seq
1999 aa
AA seq
DB search
MENITIVDKATGTTAEYAFGDVILKETGIVKLPFGPESVQSFQQSGQNLVVTLKSGETIT
IQNFFVVGADGATSQLVMTNADGTLLLGNYSSPYSGFTFKEISSLDDLAGAVILAENSTP
SWVLWGLGLLGVGIAAAALDGGGGGGGGGNGAAPGAATDLSVSADGLSVLGKGQPGTTVH
IRNADGLVVGTGKVGADGTFKIDLNAPHTNGETLKVVLTDSAGNSSPPATVVAGDTTAPD
APTNLVVNENGTTVTGKGEPGSTVTIKDADGNVIGTGKVGTDGTFQVTLNPPQINGETLK
VTLTDAKGNESLPGTVVAIDIDDTDADADADADADADADADADADADADADADADADADA
DADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADA
DADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADA
DADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADA
DADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADA
DADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADA
DADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADA
DADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADA
DADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADA
DADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADA
DADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADA
DADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADA
DADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADA
DADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADA
DADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADA
DADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADA
DADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADLEATDDVAT
AELTVTPVTTQTALDDMRVFTLLGVGGIQLGVPSLAQEFTVDAGSTGTLNLSFSQADLLS
VLGGGFTGKLEVSDGAGGWTPIDQASGGSGLLDLLGLFGSGTTAQIEGLAAGEYRFTLTL
DPNLVSIGASATAGLSVDNESLTDFIVEPGADVEGNVITDPGFNGQPDSTGPLGDATVQV
EVDGVFVDAGTTVGTVLQGLYGELTIFANGDYSYTPNGDVASIGQVDSFAYQLVTAAGGV
ASANLYIRIDSNDTTIVWSPTDPSAPGVVDVVATDDIGAAQVDIDNLVETQSLTGIVYSP
PLLFGNGQGTGESFVVAADATAELEISRSFSGIGLLPTTTINLQKLIDGTWTTQQTTTTE
THTFTGLDAGEYRVISTTGALASVGSVTVNQTLVTTHLTEFVTGAAVAATGNVLELSDLS
PADSLGSTLTVLTVLSNGDYVIPGQNGAVVQGLYGTLTLHADGAYTYTPTPGLALENVGQ
VDKFTYKLTTPGGQEDTADLYIRIDSPDRDLVWDDANPGSPATEGAGFAAASFMVDPAGD
DSAGSEGSTDSGSEHPVVADGTDFTHVDGGAGADGLLWEGGDAAINLGDLIGTANGVQSI
DLNNVSAVDLTLSLEDLVSITGSASDYLMIQGDDQDSVHLTGDWSAGATQVENGLEYVIY
TSQEDQAHQLWVQSGISVV
NT seq
6000 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaaaatataacaattgtcgataaagcaacgggaacgacggcagaatatgctttcggt
gacgtcatcctgaaagaaacagggattgtgaaattgccgttcggtcctgaaagcgtgcag
tcttttcagcagtccgggcaaaacctggtggtcactctcaagtctggagaaaccatcacc
attcaaaacttttttgtagttggcgctgacggtgcgaccagccagctggtcatgacgaac
gccgacggaacgttgttgttgggcaactattcatcgccttactcgggctttacgttcaaa
gagatttcctcactcgacgatctggccggggctgtgatactggcagaaaactcgaccccg
agctgggtactctggggtctggggcttctcggcgtgggcattgcggctgccgcacttgac
ggtggtggcggcggaggtggtggtggcaatggcgcggcaccgggtgctgcgactgactta
tcggtcagtgccgacggcctgagcgtcctgggtaaaggacagccaggtaccacggtgcat
atcagaaacgccgatggcctcgtggtcggtaccggcaaagtcggtgctgacggtactttc
aagatcgacctgaatgcaccccataccaacggcgagaccctgaaagttgtcctcacggac
tccgccggcaattcatcgccccccgccacagttgttgccggtgatacgaccgcgcctgac
gcgccgaccaatctggttgtcaacgaaaacgggaccacggtcaccggcaagggtgagcct
ggttctacggtgacgatcaaggatgccgacggcaacgtgatcggcaccggtaaagtcggt
actgacggtaccttccaggtcacactgaatccgcctcagatcaatggcgaaacgctaaaa
gtgacattgacggacgccaaggggaacgaatccctgccgggtacggtagttgccatcgac
attgatgatactgacgccgacgccgacgccgacgccgatgccgatgccgatgctgacgct
gacgctgacgctgacgccgacgccgacgccgatgctgacgctgacgcggatgccgatgcc
gatgccgatgctgatgctgacgccgacgccgacgccgacgccgacgccgacgcggatgct
gatgctgatgccgacgcggatgctgatgctgatgctgatgctgatgccgatgccgatgcc
gatgccgatgccgatgcagatgcagatgctgacgccgatgccgatgccgacgccgacgca
gatgctgacgcggatgccgatgccgatgccgatgccgatgctgatgctgatgctgatgcc
gacgcggatgctgatgctgatgctgatgccgacgcggatgctgatgctgatgccgacgca
gatgctgacgccgatgccgatgccgatgccgatgccgatgccgatgcggatgcggatgcg
gatgccgacgcagatgctgatgccgatgccgatgccgatgccgatgccgacgcggatgcc
gatgcggatgccgacgccgatgccgatgccgatgctgacgccgacgcggatgctgatgcc
gacgcagatgctgatgccgatgccgatgccgatgctgatgctgatgccgatgccgatgcc
gatgccgatgccgatgccgatgccgatgccgatgctgacgccgacgcggatgctgatgcc
gacgcagatgctgacgccgatgccgatgccgacgccgatgccgatgcggatgccgatgcg
gatgcggatgccgacgccgatgctgacgccgacgccgacgccgacgccgatgccgacgcc
gatgccgacgccgatgccgatgccgacgccgatgccgacgccgatgccgacgccgatgcc
gacgccgatgccgacgccgatgccgacgccgatgccgacgccgatgccgacgccgatgcc
gacgctgacgcggatgccgatgctgacgcggatgctgatgctgatgctgatgctgatgcc
gacgcagatgctgacgccgacgctgacgcggatgccgatgccgatgccgacgcagatgct
gacgcggatgcggatgcggatgcggatgccgatgctgatgctgatgctgatgctgatgct
gatgccgatgccgatgccgatgcggatgcggatgcggatgctgacgcggatgccgatgcc
gatgctgacgccgacgccgacgccgacgccgacgccgacgccgacgccgacgccgacgcg
gatgctgatgccgacgcagatgctgacgccgatgccgatgccgacgccgatgcggatgct
gacgctgatgccgatgccgatgccgatgccgatgccgatgctgacgccgacgccgacgcc
gacgccgacgcggatgctgatgccgacgcagatgctgacgccgatgccgatgccgacgcc
gatgccgacgcggatgctgatgctgatgccgacgcggatgctgatgctgatgctgatgct
gatgccgacgcggatgctgatgctgatgccgacgcagatgctgacgccgatgccgatgcc
gatgccgatgccgatgccgatgccgatgccgatgcggatgcggatgccgacgcagatgct
gatgccgatgccgatgccgatgccgacgcggatgccgatgcggatgccgacgccgatgcc
gatgccgatgctgacgccgacgcggatgctgatgccgacgcagatgctgacgccgatgcc
gatgccgatgccgatgccgatgctgatgctgatgctgatgccgatgccgatgccgatgcc
gatgccgatgctgacgccgacgcggatgctgatgccgatgcggatgccgatgcggatgcc
gatgccgatgcggatgccgatgcggatgccgatgccgatgcggatgccgacgccgatgct
gacgccgacgccgacgccgatgccgacgccgatgccgacgccgatgcggatgccgatgcc
gatgccgacgctgacgcggatgccgatgctgacgcggatgctgatgctgatgctgatgcc
gacgcagatgctgacgccgacgccgacgccgacgccgacgctgacgcggatgccgatgcc
gacgcagatgctgacgcggatgcggatgcggatgccgatgctgatgctgatgctgatgct
gatgctgatgccgatgccgacgcggatgccgatgccgatgctgacgccgacgccgacgcc
gacgccgacgcggatgctgatgccgacgcagatgctgacgccgatgccgacgccgatgct
gatgctgacgctgatgccgatgccgatgccgatgccgatgctgacgccgacgccgacgcc
gacgccgacgcggatgctgatgccgacgcagatgctgacgccgatgccgatgccgatgcc
gacgccgatgccgacgctgatgccgatgccgatgccgatgccgatgcggatgccgacgcc
gatgcggatgctgacgctgacgctgatgccgacgccgacgctgatgctgatgccgatgcc
gatgccgatgccgatgccgatgcggatgcggatgccgatgcggatgctgacgctgatgcc
gacgccgacgccgacgccgacgccgacgccgatgcggatgcggatgctgacgccgatgcc
gatgccgatgccgatgccgatgccgacgcggatgctgatgccgatgccgatgccgacgcc
gacgccgacgccgatgctgatgccgacgctgatgccgacgcggatgcggatgcggacgcc
gacgcggatgctgatgctgatgctgatgctgatgctgatgctgatgccgatgccgatgcc
gatgctgacgcggatgccgatgccgatgctgacgccgacgccgacgccgacgccgacgcc
gacgccgatgctgatgccgacgcggatgctgatgctgatgccgatgccgatgccgatgcc
gacgcggatgctgatgccgatgcggacgccgacctagaagcaaccgacgacgtcgccact
gcagaactaaccgtcactcccgtcactacgcagacagcgctggacgacatgcgcgtattc
acgttgctgggagtaggtggtatccagctcggggtgccttcgctggcgcaggaattcacg
gtggatgctggaagcaccgggacgttgaacctgtccttcagtcaggcagatctgctgtct
gtcctgggcggcggctttaccgggaagcttgaagtcagcgatggagctggcggctggact
cctatcgaccaggccagcggcggttcgggcctgctcgatctgctggggctgttcggttcg
ggtactaccgcgcaaatcgaaggcctggccgcaggtgagtatcgcttcacgctcaccctc
gaccctaacctggtatcgattggcgccagtgcaacagccggcttgagtgtcgataacgaa
agcctgaccgacttcattgtcgagcccggcgctgacgttgaaggtaacgtcatcaccgat
ccaggcttcaatgggcagccggactccacggggcctctgggtgatgcgacggtgcaggta
gaagtcgacggcgtgtttgtcgatgcaggcaccacggtcggtacggtcctgcaagggctg
tacggtgagctgacgatctttgccaatggcgattacagctacacgccaaatggcgatgtg
gcgagcattggccaggtcgatagcttcgcgtatcaactggtgacggcggcaggcggtgtg
gcttcggccaacctgtacatccgcatagacagcaacgatacgacgattgtctggagccct
accgatccgtcggcaccgggtgtcgtggatgttgttgccacggatgatatcggcgctgca
caggtcgatatcgataacctggtcgaaacgcaaagcctgacgggaatcgtctactcgccg
ccattgctcttcggtaatggtcaggggacgggtgagagctttgtggtggctgccgacgcg
acggcagagctggagattagccgcagcttctcaggtatcggcttgctgcctacgacgacg
atcaacctgcagaaactgatcgacggtacctggaccacgcagcaaaccacgaccacggaa
actcataccttcactgggctggatgcgggtgagtatcgagtgatatcgacgactggcgcg
cttgcatcggtcgggagtgtgacggtcaaccagacgttggtcactacccacctgacggag
ttcgtcacgggtgctgcagttgccgcaacgggcaacgtccttgagctcagcgatctatcg
ccagcagacagcctcggctcgacgctgaccgtactgacggtgctgagcaatggggactat
gtcataccgggccagaatggagcggttgtccaggggctctatggcacgctgacgttgcat
gcggacggtgcttacacctacacgccaaccccagggctggcgctggagaacgtcggccag
gtggataaattcacctataaactcaccacaccaggcggtcaggaggacaccgctgatctg
tacatccgcatcgactcaccagaccgcgacctggtctgggacgacgccaaccctggctca
cctgccactgagggcgccggtttcgccgccgccagcttcatggtggatccggctggtgat
gacagtgcgggctctgaaggcagcacagacagtggcagcgaacaccctgtggtggccgac
ggcactgacttcacccacgtcgatggtggcgcgggtgcagatgggttgttgtgggagggt
ggtgatgcagccatcaacctgggcgacctgatcggtactgccaatggtgtgcagagcatt
gacctgaacaacgtcagcgcggttgacctgacgttgagcctggaggacctggtatccatt
acaggctccgcgtcggattacttgatgatccagggcgacgatcaggacagtgtccatctg
acaggcgactggtccgccggtgcgacccaggtagaaaacggtctggagtacgtgatctac
acaagccaggaagatcaagcccatcagctgtgggtacaaagcggcatcagcgtggtttaa
DBGET
integrated database retrieval system
