Psychromonas ingrahamii: Ping_1684
Help
Entry
Ping_1684 CDS
T00450
Symbol
pfaA
Name
(GenBank) polyunsaturated fatty acid synthase PfaA
Organism
pin
Psychromonas ingrahamii
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ketoacyl-synt
PP-binding
Ketoacyl-synt_C
KR
Acyl_transf_1
KAsynt_C_assoc
adh_short
PKS_DH_N
adh_short_C2
PS-DH
DHR-2_Lobe_C
3Beta_HSD
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABM03476
UniProt:
A1SVG1
LinkDB
All DBs
Position
2043053..2051038
Genome browser
AA seq
2661 aa
AA seq
DB search
MSTEQSPNNHDMAEEEQLSSRMQECPIAIVGMSSVFAESKNLDQFWDNIVESVNGIRDIP
EDRWAIDDYYSADKKAADKTYCKRGGFLPEIDFDPMEFGLPPNLLELTDITQLMSLVVAR
DVLADAGISDENSYDRDKIGITLGVGGGQKHISPLTSRLQGPVLDKVLKASGVDAADRNM
IIEKFKKAYIPWEENSFPGMLGNVIAGRIANRFDFGGTNCVVDAACASSLAAIKMAVSDL
LEYRSEMMITGGVCCDNSPFMYMSFSKTPAFTDGQNIRPFDDQSNGMMIGEGVGMIALKR
LADAERDGDKIYSVIKGIGSSSDGRYKSIYAPSPAGQVKALKRAYADAGFDPLTCGLIEA
HGTGTKAGDAAEFAGLSALFSENNAQKQHIALGSVKSQIGHTKAAAGTAGIIKASLALYH
KVLPATINVEQPNKNLDIDNSPLYINSETRPWMPRADAIKRRAGISSFGFGGTNFHIVLE
EYQSKQSGQYRLNEVPQTIVISAADKEALQQSLTTWRTKLAVTNDLQAYAFNALVVENPL
STPQQKLARCGFVAKNAQQALQLIEQIIKEFSLNDAPAWSTPTGIYYRESGLKTQGKVVA
LFSGQGSQYVNMGRDLSCNFPSILDTHALMDTQFSDNGLPQLSKVTYPIPAFTAEKRAAQ
EESLRLTQHAQPAIGAFSAGLYKTFLQAGFKADFTAGHSFGELTALWAAGVLSEHDYMLL
ARSRGQAMAAPEDENFDAGTMIAVIGDPAQVALEIKPLAGLSIANYNANNQVVVAGPTSE
VGVAFEQLKEKGYKVIQLPVSAAFHTALVGHAQKPFADVIDRVEFKSPSIPVFSNGSAVA
HSTQPEVIKASLKKHILEPVHFNDEIDNLYAAGGRLFIEFGPKNGLTGLVDNILKDKSDV
TTIAVNANPKKSADLQLRLAAVEMAVLGVQLNNIDPYNGLQRPTIPAKKSPLAMKLSGAA
YVSEKTKKVFTDALNDGQKINTQPANTEQSRGIEKQLPVEKEVIVEKEVIVEKIVEKIVY
LNPDGTAFDHQAVNMASVNMPPDNSTALVASIEQSVGQVVQHQAQLLSVHEEYLQGPKEY
AKTFQAVLASHAGAAQLPESLDKTLTMYHDFQSETLRVHEAYLNHQTENMQQMLTAAPMT
ESADLSAAVQQNVAVNSVAAIKAVKPATSAPVQQNKTKVATPAVSTPVPTAAIDLNEIQN
VMLAVVADKTGYPVEMLELGMDMEADLGIDSIKRVEILGAVQDQISDLPELNPEALTELR
TLGEIVDYMQAQAPVAGRENNNVPLDNIASLDNNVPEIDLSAIRTVMLDVVADKTGYPVE
MLELGMDMESDLGIDSIKRVEILGAVQDEISDLPELNPEALTELRTLGEIVDYMQAQAPA
ASIVATENESEQAKTQNSQSALLPIDLTHIMLAVVADKTGYPVEMLELGMDMESDLGIDS
IKRVEILGAVQDQVSDLPELNPEALAELRTLGEIVDYMQSQAASIVATENESEQVKTQNS
QSAPLPIDLTHIMLAVVADKTGYPVEMLELGMDMEADLGIDSIKRVEILGAVQDEISDLP
ELNPEALAELRTLGEIVDYMQSQAPAASIVATENETEQETQLKIQDSQPAASVTALLDIK
NIMLDVVADKTGYPVEMLELGMDMEADLGIDSIKRVEILGAVQDKVSDLPELNPEALAEL
RTLGEIVTYMQSQAAPLNNAVPIVPVLGSAPVDLTLIETVMLDVVADKTGYPVEMLELGM
DMEADLGIDSIKRVEILGAVQDEISSLPELNPEALAELRTLGNIVDYMVNLTGTSQADVI
KSAEPVDSVEPVASFEPAPSATVVIKHLNVIEKIAMDVNGENLLLVDDGQGCAVRLADKL
SKLGWSVTVIKPSWVNSDSDKTFSKKVNVFELNALNEQEINTILDTQSVWTSVVYLHPKT
TITAIEYPQASKQGLMLAFLLAKLSDLAAPQNNIKTRASFVVLTRQGGAFGVEDNELESD
LVQTGLTGLVKTISHEWPGVFCRAVDLASQLSADKVANIIVDELNDKNVKPVEVGFNHNG
RLTLVAEKTDSYTLQSGSSIDQDSVFLVSGGGRGVTAECVIRLAKEYKSKFILLGRSDYK
SDQPRWAIGINDQAALKKAAMQALQAKGKKPTPASISALVGSILSNREIKQTLALIDDAG
GIGEYICADVTDSNAVLNALTPITSLWGEVSGIIHGAGVLADNFIEQKTVVEFEAVYNTK
IEGLLSLLACCQQDKLKQLVLFSSAAGFYGNPGQSDYAIANDILNKTAYRFKALHPAAQV
LSFNWGPWDGGMVTPELKKMFKDLGVYIIPLAAGAELLLNELAADSNRCPQILVGNDMGG
QLPEDDVLDEKVLEDHVLKDDILEGKVLEDTSVKKPLVSRLAKRFLAANNPFLADHKIGE
NQVLPTVCAIAWMVEAAAVSYPDFVYQGLKNYQLFKGIVFDGKQASDYFIDLNTVEKKPG
GLAIEVKISGEKSDGSLNFHYAATLLMSKENQAAPLYSSELPDLVLSKQENADALYQDGT
LFHGSSLQGIQSLLECDAKGLLLSCLIPESVKSKQGEFDLQENNIFANDLVYQALLIWAR
KQLGLGSLPGSTLSWIVYGEVKVNQAFYLKLSVREQQANKVVADIILIDRDKQILAEISG
AEVTCSASLNKLFKLAVEVDG
NT seq
7986 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtctacagagcaaagcccgaacaaccacgatatggcagaagaagagcagttaagttca
cgcatgcaggaatgtcctatcgcgattgttggtatgtcttcggtgtttgcagagagcaaa
aatcttgaccaattttgggataacattgttgagtcagtgaacggcattcgggatataccg
gaagatcgttgggcgattgatgattattattctgccgataaaaaagcggcggataaaacc
tactgcaaacgcggcggttttttacctgaaattgattttgatccgatggaatttggtttg
ccgcccaatttgttagaactgaccgatattacccagttgatgtctttggtggttgcgcgc
gatgtactggccgatgccggcatctccgatgaaaacagttatgatcgtgataaaattgga
atcactctgggggttggcggaggtcagaaacatatctcgcctttaacctcccgtctgcag
ggcccagtgttagataaggtattaaaagcatcgggtgtggatgcagccgatcgtaatatg
atcattgaaaaattcaaaaaagcctatattccctgggaagaaaattcattcccgggtatg
ttgggcaatgttattgctggacgtattgccaaccgtttcgattttggtggtactaactgt
gtggttgatgctgcctgcgcaagctccttagcggcgattaaaatggcggtctcagattta
cttgagtatcgttcggaaatgatgatcacgggcggggtctgttgtgataactcccccttt
atgtatatgtcattctcaaaaacccccgcttttaccgatggacaaaatattcgtcccttt
gatgaccagtccaacggcatgatgattggtgaaggtgtgggcatgattgcactgaaacgt
ttagccgatgccgagcgagatggcgataaaatttattctgttattaaaggcataggcagt
tcatccgacggtcgttacaaatctatttatgcgccaagtcctgcggggcaagtaaaagcg
cttaaacgtgcgtatgctgatgccggttttgatcccttaacctgcggtttgattgaagcg
catggtaccggcacaaaggcgggagatgccgctgagtttgccggtttaagtgcgctcttt
agtgaaaacaatgcgcaaaaacaacatatcgccttaggatcggttaaatcacaaattggc
catactaaagccgcggccggcactgcggggataattaaagcgtctttagcgctttaccat
aaagtgctgccggcaacgattaatgtggagcagccgaataaaaacctggatattgataat
agccctctgtatatcaatagtgaaacccggccctggatgccgcgtgccgatgcgattaag
cgtcgtgccgggatcagttcctttggttttggtggtactaattttcatatcgtccttgaa
gaataccaaagcaagcaaagcggccaataccgtttaaatgaagtaccgcaaacgattgtt
atcagcgcggcagacaaagaagctctacaacaaagtttaaccacctggcgcactaaactt
gcggtgaccaatgatttacaggcctatgcatttaatgctttagtggttgaaaatccatta
tcaacaccgcagcagaagctcgcacgttgcggctttgtggctaaaaatgcgcagcaagca
ctgcaattaattgaacagataataaaagaattttccctgaatgacgcgcccgcatggtct
acaccaacgggcatctattaccgcgaaagcgggcttaaaacacaagggaaagtggttgcg
ctgttctcagggcaaggttctcaatatgttaatatggggcgtgatttaagctgcaacttc
ccctcaatattagacactcatgctttgatggatacccagtttagtgataatggtttaccg
cagttatctaaagtgacttatccgattcctgcctttacggctgaaaaacgtgctgcacag
gaagaaagcttacgcttaacccagcacgcccaacctgcgattggtgcttttagcgcagga
ctatataaaaccttcctgcaggctggctttaaagctgattttactgcaggtcatagtttc
ggtgaattaaccgctttatgggccgcgggcgtgttatctgagcatgattatatgctactt
gcccgcagccggggtcaggcaatggctgcgcccgaggatgaaaactttgatgccggtact
atgatcgccgtgatcggtgatcctgcgcaggtagcgctggagattaaaccgcttgctggt
ctttcaattgcgaattataacgctaataatcaagtggttgtggcaggtccaaccagcgag
gtaggcgttgcttttgagcagcttaaagaaaaaggctacaaagtgatacagctgcctgtt
tctgcagcttttcatacagcattggtaggacacgcacaaaagccctttgctgatgttatc
gaccgtgttgaatttaaatcgccctctattcctgtcttttccaatggcagtgcagtagcc
cattcaacacaacctgaggtgatcaaggccagcctgaaaaaacatattttagaaccggtt
cattttaatgatgaaattgataatttatatgccgctggtgggcgactctttattgaattt
ggtcctaaaaatggcttaacaggcttagttgataatatccttaaggataaatccgatgtg
actactattgcggtcaacgctaatcctaaaaaatcagctgatttgcaactgcgtttagcc
gccgttgaaatggctgtgttaggggtgcagttgaataatattgacccctataacgggtta
caacgtcccacaattcccgctaaaaaatcacctctggcaatgaaattatccggtgctgct
tatgtgagtgaaaaaactaaaaaagtgtttacggatgctttaaatgatggtcaaaaaatc
aatactcaaccagccaatactgagcaaagcaggggcattgaaaagcagctgcccgttgag
aaagaggtgattgttgagaaagaggtgattgttgaaaaaattgtggagaaaattgtctac
ctcaatcccgatggtacggcctttgatcatcaagctgtcaatatggccagcgtcaatatg
ccgcctgacaatagcaccgcgttagttgcctctattgaacaaagtgtcggccaggttgtg
cagcatcaagcacaactattaagtgtgcatgaagagtatctgcagggcccgaaagagtac
gcaaaaacatttcaggcagtattagcctctcacgcgggtgcggcgcaattgcctgagagt
ttggacaaaacattaacgatgtaccatgactttcagtctgaaacattacgcgttcacgaa
gcctatttaaatcatcagactgagaatatgcagcagatgttaacggctgcgcccatgacg
gaatctgccgacctatctgctgccgtccaacagaacgttgctgttaacagtgttgcggcc
atcaaagcggtaaaacctgcaacctctgcgccagtccaacagaataaaaccaaggttgct
actcctgccgtctcgactccagtgccaacagctgccattgatttaaatgaaattcaaaat
gtgatgcttgctgtagtcgccgataaaaccggttatcccgttgaaatgctcgaacttggc
atggacatggaagcggatttaggtatagattcgattaaacgggtagaaattttaggcgca
gtgcaggatcagataagcgacttgccggaattaaatccggaagcgctcactgagctgcgc
actttgggtgaaatagttgactatatgcaggcacaggcgccggttgcaggacgtgagaat
aataatgtgcctctcgataatattgcatcacttgacaataatgtccctgagattgattta
tccgctattcggactgtgatgctggatgtggttgccgataaaaccggttatcctgttgaa
atgctcgaacttggcatggacatggagtcggatttaggcatagattcaattaagcgggtg
gaaattttaggcgcggtgcaggatgagataagcgacttgccggaattaaatccggaagcg
ctcactgagctgcgcactttgggtgaaatagttgactatatgcaggcacaggcgccggca
gcttctatcgttgcaacagagaatgaaagcgagcaggcaaaaacacagaacagccaatct
gcactcttacccattgatctgacgcatattatgctggcagtggttgccgataaaaccggt
tatcccgttgaaatgctcgaacttggcatggacatggagtcggatttaggcatagattcg
attaaacgggtagagattttaggtgcggtgcaggatcaagttagcgacttgccagaatta
aatccggaagcactcgctgagctgcgcactttgggtgaaatagttgactatatgcagtca
caggcagcttctattgttgcaacagaaaatgaaagcgagcaggtaaaaacacagaacagc
caatctgcacccttacccattgatctgacccatattatgctggcagtggttgccgataaa
accggttatcccgttgaaatgctcgaacttggcatggacatggaagcggatttaggcata
gattcgattaaacgggtagaaattttaggcgcagtgcaggatgagataagtgacttgcca
gaattaaacccggaagcgctcgctgagctgcgcactttgggtgaaattgttgactatatg
caatcgcaggcgccggcggcttctattgttgcaacagagaatgaaaccgagcaggaaaca
cagttaaaaatacaggatagccagccagctgcgtcagtaacagctctgttggatattaaa
aatataatgctggatgtggtggcagataaaaccggttatcccgttgaaatgctcgaactt
ggcatggatatggaagcggatttaggcatagattcgattaagcgggtggaaattttaggt
gcggtgcaggataaagttagcgacttgccggaattaaatccggaagccttagccgagctg
cgcaccttaggtgaaattgtgacttatatgcagtcgcaggcagcgcctctgaataatgcc
gtgcctattgttccggtgctggggtcagcgcctgttgatttaaccctgattgaaacagtt
atgcttgacgtggttgccgataaaaccggttatcccgttgagatgctcgaacttggcatg
gacatggaagcggatttaggcatagattcgattaaacgggtggaaattctaggcgcggtg
caggatgagataagctcgctgccggaattaaatccagaagcactcgctgagctgcgcact
ttgggcaacattgttgattatatggtcaatctcacgggcacgagccaggctgacgtcata
aagtctgctgagccggttgattcagttgaaccggtggcaagtttcgaacccgcgccaagt
gcaactgtagtgataaagcaccttaatgtgattgaaaaaatcgccatggatgtcaacggt
gaaaatcttttattagtggatgacggtcaaggttgtgcagtccgtttggccgataaatta
agcaagctgggttggtctgtgactgttatcaaaccaagctgggtaaactccgatagcgat
aaaacattttctaagaaggttaatgtttttgaattaaatgcgcttaatgagcaggaaata
aacacgattttagacacccaatctgtttggacaagtgttgtttatctgcatcctaaaacc
actatcactgctattgaatatccgcaggcaagcaaacaggggttaatgctggcattttta
ttagccaaactgtcagatttggcagcaccgcaaaacaatattaaaacccgagcatcattt
gttgtattaacccgccagggtggggcttttggggtggaagataatgaacttgaatctgac
cttgtgcagacgggacttaccgggctggttaaaactatttctcatgaatggcctggggta
ttttgtcgtgccgttgatctggccagtcaattgtctgccgataaagttgctaatattatt
gtggatgagttaaatgataaaaatgttaaacccgtagaagtgggttttaaccataatggc
cgtttaacgctagtggctgaaaaaacagacagttacactctgcaatccggcagcagtata
gatcaagattcagtgtttttagtcagtggcggcggccgaggggtgaccgctgagtgtgtt
atccgtttagcaaaggagtataaatctaagtttattcttttggggcgttctgattacaaa
agtgatcaaccccgctgggcaatcggaatcaatgatcaagctgcgcttaaaaaagcggct
atgcaggcattgcaggccaagggtaaaaaacccacgcccgcctccatttcagcattggtt
ggctcaatactcagcaatcgtgaaatcaaacaaaccttggcgttaatagatgatgccggt
ggtattggcgaatatatttgcgcggatgtcaccgattcaaatgcggtgttgaatgcgcta
acaccgatcacctctctctggggagaggttagcgggattattcatggtgcgggtgtgttg
gccgataactttatcgagcaaaaaacagtcgtggaatttgaggcagtttataacactaag
atagagggcttgttatccttgttagcttgttgccagcaggacaaacttaagcaacttgtt
ttattctcatcggcggccggtttttatggtaatcccgggcagtctgattatgccattgcc
aacgatattttaaacaaaacggcttatcgttttaaagccctgcacccggcagcccaggta
ctgagttttaactgggggccctgggatggaggcatggtgacacctgaactgaaaaaaatg
tttaaggatcttggggtttatattattcctttagcagccggggctgagttattacttaat
gaactggctgccgatagtaatcgttgtccgcaaattttggtgggcaacgatatgggcggg
caattaccagaagatgatgttttagatgagaaagttttagaggaccatgttttaaaggac
gatatattagaggggaaagtattagaggatacaagcgtaaaaaagccattagttagtcgc
ttagcaaaaagatttttagcggctaacaatccttttttggctgatcataagataggtgaa
aatcaggtactgccaactgtctgtgccattgcctggatggtcgaagccgcagctgttagc
tatccagattttgtctaccaggggcttaaaaattatcaactttttaaaggaattgtcttt
gatggtaaacaggccagcgattattttattgatcttaatactgtggaaaaaaaaccgggt
ggtttagccattgaggttaaaatatccggtgaaaaatccgatggcagtctgaattttcat
tatgcggctaccttattaatgagcaaagaaaatcaagccgcgccgctgtacagttctgaa
ctgcctgatttagtcttaagtaaacaagaaaatgccgatgcactttatcaggatggcacc
ttatttcacgggagcagtttgcaggggatacaatccctgctggaatgcgatgctaagggt
ttattgttaagttgcttaattcctgaatcagtaaaaagcaaacagggtgaatttgatctg
caggaaaacaatattttcgccaatgatttagtctaccaggcgttattaatttgggcgcgt
aaacagttaggtttgggcagtttacccggcagtacattatcctggattgtctatggtgaa
gttaaggttaatcaagccttttatttaaagctctcggtgcgtgagcagcaggcaaataaa
gtcgttgccgatattattctgattgatcgagataaacagattctggcagagatatcgggc
gctgaagtcacctgcagtgccagtttaaacaaattgtttaaactggccgttgaagttgat
ggctga
DBGET
integrated database retrieval system