Psychromonas ingrahamii: Ping_1914
Help
Entry
Ping_1914 CDS
T00450
Name
(GenBank) hypothetical protein DUF490
KO
K09800
translocation and assembly module TamB
Organism
pin
Psychromonas ingrahamii
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pin00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
pin02000
]
Ping_1914
Transporters [BR:
pin02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
Ping_1914
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TamB
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABM03686
UniProt:
A1SW21
LinkDB
All DBs
Position
complement(2336735..2340721)
Genome browser
AA seq
1328 aa
AA seq
DB search
MSMKLKIELICRKTFLTLLLLIIFTVASVTSILLTHSGTNLAIKLATKFEPRLAVTIDSG
SFFLNPHYSNISWKSDSFSISFSKLEYAFDWSCAFTKICVEKLHTDDMVIVLDLDKVTPP
TEAEIKALADNPFTSLQLPISIDIQSLILNNSSFILPDRLSVASKRWEIQAQGFKDNITV
FNSITEGLVIDLPSSKDEIIPDKTVAATETSNSIALNSLPALVSEQNLPEISSFFNLDIK
NIQISDFKLTQGDKQPIVSINSVQSVLRFFYNKLEVDQFSLDMPNADLELIGEVNFTGKY
PLAVQLTGSIKDLKYLQPNSLLNGQHFILKSSGDFSNLKTDLQLTDKITAQMKLDVNLLA
DNLPYSISLDWQKSGWPFDGKSSYFSPKGQFSSQGKLNDYQLRLQADYELENMPGGKVDL
KAAGDLQNLNVNNLKINTLNGLLKLTGALDWSKKITWQGQLDIEDIDLKQFKTEYTGQFN
GKLKQYVAIELNENKAPGWLVSIPEMAITGQFLNRPFAINGAINGNDKEGLMLKNVDLHN
ADNQIIINGKLAQKNDLTVAINIKDLSHALLNSSGVIKGRVNIQGPMDAIKISSDLQADA
LHYETSSLNSLKLNGQLLLSKQQPKATLVVQAKKIDVADQLIESIDINVKNTGHSAQGEN
HQIDLEVVSDILSSDMRIQLKQSGDKWLTAVSAAVLNFHKQKLTLDTPFDVVIEKQDVQL
TAHCWTASSNSIKNNGKLCLKKLNIGKNNNIILQIDSYLLAGLDEILPEKISFDGAVSAN
ADISWQGNDKPAGDIKIYSTDMKIKLHLATDDKNIVEYPVDTFVINVLSDQKKIDFSANL
SSKNLLDAQLKGQLKNNTNNPNIEASVDFNVLNFTPFSVLIPEIEKLSGMLNANLSVNGA
IKNPLVNGEIHVKDTSIKAVGAPIQLHDLNTLIKINNQSATLEGYFDTNGRDPASKDNNK
IFKFINKTVSLVDTSLKFVTSPLHKNKTITKEDIEKGKSYISGEFDWQDKFKGKVNLYGN
QMVINDYSKIYLLVSPNLELTFDQNINLTGDVVVDQGKITVKELPAGAVSTSKDIVVVDI
KQKPNATDLPIMMNLTLDLGEKLKIEAFGLDTLVTGALLMRKRLNKDFTVHGDLKLVDGS
YRALGQQLVLQNSRIIFQGIPESPYISIEAIRDPNKIEDDVIAGVRVSGTPDKLELVIFS
DPSMSQQDALAYITRGKSITNSLNSQEDNQFTNMLINFGAGQTSEVMGDFGNKVGISDLS
LTSSGEGDGQTVGVSGYIAPNLELSYGVGVFDSFTIFSIRYELFERFFIEASNGLNQAVD
VFYKWDNE
NT seq
3987 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtatgaagttaaaaatagagctgatatgtagaaaaacttttttaactttattgtta
ttaattatatttactgtcgccagtgtaacgtcaattttattgacacattctggtactaat
cttgctattaaactggcaaccaaatttgaaccgcgtcttgcagtcacaattgattcaggt
agtttttttttgaatccccattattctaatatcagttggaaatctgattctttttcaatt
tctttttctaaattagaatacgcatttgattggtcatgtgcttttacaaaaatttgtgtc
gaaaagctacataccgatgatatggttattgttttagatttagacaaagtgacgccgccg
acagaagctgaaattaaagcactggcggataatccttttacctcgctgcaattgccaatc
tcaatagatattcaatctcttattttaaacaatagctcttttatactgcctgacagatta
tctgttgccagcaaacgttgggaaatccaggcacaaggttttaaagataatattaccgtt
ttcaattcaatcacagaggggctggtgattgatttacccagcagtaaagatgaaataata
cccgataaaacagtggcagcaacagaaacaagcaattcaatcgcattaaactcattgccg
gcattggtaagtgaacaaaatttaccagagatatcatccttttttaatttagatattaaa
aacatccaaatttcagactttaaattaacccaaggtgacaagcaacctatcgtttcgata
aactcggtgcagtcagtattaagatttttttacaataaattagaagtagatcaattcagc
cttgatatgccgaatgcggatctggaattaattggagaagtaaattttaccggtaaatat
ccattagcggttcaattaactggcagcattaaagatcttaaatacctacagccgaactct
ctcctcaacgggcagcattttatcttaaaaagcagtggcgacttttctaatttaaaaaca
gatttacagcttaccgataaaataacagcccaaatgaaattagatgtaaatttattagcc
gataatttaccttacagtataagccttgattggcaaaaatcaggttggccttttgatggg
aaatcttcgtatttttcaccaaaagggcagttcagcagccagggaaaattaaatgattat
caactcagattacaagctgattatgaattagaaaatatgcccggaggaaaagtcgattta
aaggcggcaggggatttacaaaatttaaatgtaaataatttgaaaataaatactcttaac
ggattattaaaattaaccggtgctctcgactggtcaaaaaaaatcacctggcaggggcaa
ttagatattgaagatattgatttaaaacaattcaaaacagaatacacaggccaatttaac
ggaaaattaaaacaatatgttgctattgagttaaacgaaaataaagcgccaggctggtta
gtctctattccagaaatggctattacaggtcaatttttaaaccgtccctttgctattaat
ggtgctattaatggcaacgataaagaaggattaatgttaaaaaatgttgacctgcataat
gctgacaaccaaattattatcaatggaaaactagcacaaaaaaatgatttaactgtcgcc
attaatattaaagatctaagccatgcgttacttaacagcagcggtgttatcaaggggaga
gttaacattcagggcccgatggacgccattaaaatcagctctgatttacaagcggatgcg
ctccactatgaaacatcctccctcaactcattaaagcttaatgggcaacttctgctctca
aaacaacagcccaaagccacactcgttgtacaggccaaaaaaatagatgttgccgaccag
cttattgagagtattgatattaacgtcaaaaatactggccacagtgcgcaaggtgaaaat
catcagattgaccttgaggtagtcagtgacattctctccagtgatatgcggatacaatta
aaacagagtggcgataaatggttaacagcagtaagtgcggctgttttaaattttcacaaa
caaaaattgacacttgatactccctttgatgtcgttattgaaaaacaagatgtgcaactg
acggcacattgctggacggcttcgagcaacagcatcaaaaataatggtaagttatgcctg
aaaaaattaaatataggtaaaaataataatattatattacagatagactcctatcttctg
gctggccttgatgaaatattacctgaaaaaataagctttgatggtgcagtttcggcgaat
gccgatataagttggcaaggaaatgataagccagccggtgatataaaaatctattctacc
gatatgaaaataaaactgcaccttgcaaccgatgataaaaatattgttgagtatccggtt
gatacctttgttataaatgtcctttccgaccagaaaaaaatagatttctcagccaatcta
tcatcaaaaaatttactcgatgcgcagctaaaaggtcaattaaaaaataataccaataac
ccgaatatagaagcgagtgtcgactttaatgtgttaaattttacgcctttcagcgtactt
atacccgagattgaaaaattatctggcatgttaaacgcaaatttaagcgtaaacggtgcc
attaaaaatccgcttgttaatggtgaaattcatgtaaaagatacctcaatcaaagcggta
ggggctccaatccaattacatgatttaaacactctaattaaaatcaataaccaatctgcc
accttagaaggttattttgatactaatggccgagatcccgcaagcaaagacaacaacaag
atattcaaatttatcaataaaacagtcagtcttgttgatacatcgcttaagtttgtaacc
tcgccactgcataaaaataaaaccataacaaaggaggatatagaaaagggcaagtcatac
attagcggtgagtttgactggcaagataagtttaagggtaaagttaatttatatggaaat
cagatggttataaatgattattctaaaatatatctactggtgagtccaaatttggaattg
acatttgatcaaaatattaatttaaccggggatgttgttgttgatcaaggaaaaataacc
gtaaaagagttaccagcaggagctgtttcaacctcaaaagatattgtggttgttgatatc
aaacagaaacctaatgcaactgacttgccgataatgatgaatttaaccctagatcttgga
gaaaaactaaaaattgaagcttttggtttggatacattagtaaccggtgctttattaatg
aggaaacgattaaataaagatttcaccgtacatggtgacttaaagcttgtggatggtagt
tatcgcgcattaggtcaacaattagtattacaaaatagcagaataatattccagggaatt
cctgaatctccctatatttcaattgaagctattcgtgatccaaataaaatagaagatgat
gttatagcgggtgtgcgagtaagcggtacaccggataaacttgaacttgttatcttctct
gaccccagtatgtctcagcaggatgctttagcctatataacacgaggaaaatcaataaca
aacagtcttaacagccaggaagataatcaatttactaatatgcttattaattttggggca
gggcaaacgtctgaagtaatgggggatttcggtaataaagttggtataagtgatttatcc
cttacttcaagtggtgaaggtgatggacagactgtgggggtgagtggctatattgcccca
aatttggagctcagttatggagttggcgtatttgatagttttacaatattttcaattcgt
tacgaattatttgaacgcttttttattgaagcatcaaatggcttaaatcaagctgttgat
gttttttataaatgggataacgaataa
DBGET
integrated database retrieval system