Pediococcus inopinatus: PI20285_08935
Help
Entry
PI20285_08935 CDS
T05337
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
pio
Pediococcus inopinatus
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MBG
Bact_lectin
IPI_T4
MucBP
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AVL00755
LinkDB
All DBs
Position
complement(1792560..1795523)
Genome browser
AA seq
987 aa
AA seq
DB search
MKADTNSNASSETISIDSAANTSSDASITDQASSSSTADVNKSGPSSETSIVDASSASAV
NSGETSNAATNSEEKVSSSSASTKATSVASGTNSSQSSSMVSSAVSSVDSSATSGSSTEG
SAEGKTISTSEATNSNATSASKVNESTTTNSDALATLKNKLPADSVVTTKKDGTVVIALA
VGADETAVKALVAKANLNLPVVIEAKDANVVVPNLNNVTNINKAGEKYTGTSSTVAQDFT
AAGTATVPTGSGYSSLTTKAQNESGYLVLDNQLNFSSDFSISGTIYLGDNVSNAADGLTF
VFSPGNPSSLGTASTGGNLGLGGLPNSFGLALDEHYNSGTYGDFDNAGAILGNPYLTAAT
ISWRTTDSTGKLNPNTRQGQGNIFGYGNVSAIDKTSQVVAMNNNMIDGKAHAFSISYNAT
TGVLTISIPDNDNQNQIYKPTGATSATVWTRTLTAAQKVGMSLSIAASTGDDFNAFGVQI
NNYSYTKATASVNYQEVDSSGKILPGTTSHSILGNIGDTIQVFADQASANAAITAGTATA
ELSVVAPKVPGYVFQGPVSSTVMVGSSNVNLVYNKQTAAVTVHYQDYAGNTISKDATLTG
SYGDAKINGTTTTNPAVPTIAGYTFTATDSKNLPATVVNFTALDANGNVFATDVDGKTIT
SITLYYKTNATVTLSGTETEVYTGVQQTPKATNYKITLPTGVTYALKDSDIQLASGGINV
GSYNVKLSPTGLSNITTAIGTNYAITFGTATGSFIIKAADTKVTLSGTETEMYNGAQQTP
KASNFKITLPTGVTYTLKDSDVQVASGGINIGTYNVVLSTTGKAAIQNAITAATGTNYNA
ATFEAANGTTFTITKAPLTATISSGTKAYDGAATVTTPTVAYTVLSGSMVAPTIAWDAND
FEYLAADGTTVVSTPINAGSYTVQLSAVGQAKLTAAQATNGAAQNYTITPANGTYVVTAA
TATVNLDGSKRFLIQVHDRFQISVTIP
NT seq
2964 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgaaggctgatactaattcaaacgcttcaagtgaaacaatctcaattgatagtgcggca
aatacttcttctgacgcgagtattacagatcaagcatcgtcctcttctactgctgatgta
aataaaagtggaccaagtagtgaaactagtatagttgatgcttcatctgcaagtgcagtt
aattctggtgaaacgtctaatgcagcgacaaattctgaggaaaaggtgtcttcttcatct
gccagcacaaaggcaacttcagtggcatctgggaccaattctagtcaaagttcaagtatg
gtgagtagtgctgtttcgtctgtagatagctctgccacaagtggttcaagtacagaagga
tccgctgaaggtaaaactattagcacaagcgaggctaccaattctaatgcgaccagtgca
tcaaaggttaatgaatcaacaacgaccaactcagatgcattagcaaccctaaaaaataaa
ttgccagcggactccgttgttacaactaaaaaagatgggacggtggtgatcgcgcttgct
gttggggctgatgaaacggccgttaaagcattagttgccaaggctaatttgaatttgccg
gtagtaattgaagctaaagatgcgaacgttgttgttcctaatttaaataatgtgacaaat
attaataaggctggggaaaagtatactggcacgtctagtacagtcgcacaagattttaca
gcggccggaacagctactgtaccaaccggaagtggttattcaagtttaaccacgaaagca
cagaatgaatctggttatttagtactagacaatcaacttaattttagttctgactttagt
atttcagggacaatctatcttggagacaatgtcagtaatgcagccgatggtctgaccttt
gtatttagcccaggtaacccgtcctcactgggaactgccagtactggtgggaaccttggc
ttaggtggcttacctaattcatttgggttagctcttgacgaacattataatagtggcact
tacggcgactttgataacgcaggcgccatattaggaaacccttatttgacagccgcaact
atctcgtggcgcacaaccgatagtacggggaagttgaaccctaacaccagacagggacaa
ggaaatatttttggctatggaaacgttagcgcaattgataagacgtctcaagtagtggca
atgaataataacatgatcgatggaaaagcacatgcattttccatttcatataatgccaca
actggcgtattaacaatttctattccggataatgataatcagaatcaaatttataaacca
accggcgccactagtgcaaccgtttggacgcgcacattgacggctgcacaaaaagtaggt
atgtcattgtcgattgccgcatccaccggagatgactttaatgcttttggcgttcagatt
aataattatagctatactaaagcaactgcatcggtaaattatcaagaagtcgacagttca
ggcaaaattttacctggaacgactagtcactcaattcttggtaatatcggggacaccatc
caagtatttgcggatcaagcgagtgctaatgctgcaatcacagcaggaacagcaactgca
gaattatccgtggtggcaccaaaagtccctggatatgttttccaaggcccagtatccagc
accgttatggttggctcttcaaatgtgaacttagtttataacaagcaaacagcggcagtt
acggtacattatcaagattatgctggcaacaccatttcaaaggatgcaacgctgacgggc
tcttacggcgatgcaaaaattaatggtacaacaactactaatccagctgttccaacgatc
gccggatatacgtttactgcaacagattcaaagaaccttccagcaacggtggttaatttt
accgcactggatgccaatggtaacgtgtttgcaaccgatgtagatggtaagactattact
tcaattacgctttactataaaaccaacgccacagtgaccctgagtggtactgaaaccgag
gtttatactggtgtccaacaaacaccaaaggcgactaactacaaaattactttaccaact
ggtgtcacatatgctttgaaggatagcgacattcaattagcaagcggtggtattaatgtt
ggctcatataatgttaaattaagtccaactggcttgagtaatattacgactgccattggg
actaactacgcgataactttcggcacggctactggttcatttatcatcaaagcagcggac
accaaggtcactttgagtggcactgaaacagaaatgtacaatggcgcacaacaaacacct
aaggcaagtaactttaagattaccttaccaaccggcgtcacatatactttaaaagatagt
gatgttcaggtggctagcggtggcattaatattggtacgtataatgttgtattgagtacg
actggtaaagcggcgattcagaacgcaattacagctgcaactgggacaaactataatgca
gctacttttgaagcagccaatgggacaacttttacaattacaaaagcaccgcttactgca
acgattagttccggtacaaaagcttatgatggtgcagcaacagtcacgacaccaactgta
gcctatacggttctctctggtagtatggttgcacccacaattgcatgggacgctaatgat
tttgagtatctagcggctgatggcacaacggtggtatccacgccaattaatgcgggatca
tacacggttcaattgagcgcagtaggccaagctaaactgacagcggcgcaagctacaaat
ggcgctgcacaaaactatacgattacaccagccaatggaacttatgtagtgacggcagcg
actgcaacggttaacttagatggtagcaaacggtttcttatacaggttcacgacagattc
caaatttcggtaactataccgtga
DBGET
integrated database retrieval system
