Paenibacillus kyungheensis: PQ456_03360
Help
Entry
PQ456_03360 CDS
T08956
Name
(GenBank) pre-toxin TG domain-containing protein
Organism
pka
Paenibacillus kyungheensis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RHS_repeat
PT-TG
DUF6531
NSP2_gammaCoV
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WCT56576
UniProt:
A0AAX3M352
LinkDB
All DBs
Position
755390..763951
Genome browser
AA seq
2853 aa
AA seq
DB search
MKNKYVRLAFLVVVLLAIFVGFKMHSASAATGVYSLGSGQSVDITHGYSTSATVYVTGNN
YDYVKYLSNGDVSLYDTKTAYAPITLAINQKLRLTNNSPSPLTIDMKSKTFTVLTTAGQA
LSRFNLLPGNSVFVQNLNPDYSQPIDIGGINANIHYGADGELSSPTFTRKKAKGSETVAK
NGSMIVTNRDTVAYDVVAPAFPINFLGSTEPADFRYNVPIGGSFQATNQLSKPFYVYIDN
GGTYEFTLYNEDGSVSSTGTTKTVTKYVGAGETLIVTNVDGPSMLVSGAYGAFYTTTQVE
PPMITKTLAPGKSIKVLNNSGDTMKLLTDNGDKGFQIAEYKSNGAVDSYDILNTSASYIM
GIGNYVVITNPAYNGQAIKIKIPKVNSVISDSTNPALLEQNISPGNSVEVKNVSPTKTGL
FVTGEFDYALYDSAGINDYAPNVGSSHVYPDPGERVAITNTSKGNVTMSINGPYEAFVAT
ARTQPVTFNRVLNVGETLKTINTSNYSFYITASGQHHYAVYKKENNKVDDFDNPIVSARH
LISKDEKIITTNSGNQAMTVSGPYDAFDISSRAEPALYKGYLNAGQSVKLTNTSPAMFSM
YTDGMYDQASYRADDTLRSLDHDRVAKSLPFYNGERVTLTNSGSSQLVVLSPYDVTTAQS
SSDPALIVKQLAINQSAEFINKDKSNEMVYFTGKHDLMDYDTADQPNSYYRGTATTYRSV
DPNQRLAVMNTDVKTIDAYAAFELFTGKDRINPVTFKKTLSTKQSLDFTNKTSKTFFVYP
TGTYDFAEYQAGQSIDMGKNETSSTKSIPTSNRMSITNTISTDLTVEGPYDAFTIQARTN
PALVEYSLAPRQSVEAEYTGVKSGQIRLTVDYDSALFTNNVLNVYSRNHISSTAQIVENG
ERLAVQNMAEINGLMYGAYDTFKVTSRTNPVTFQKVLNTDESVDITNTQPAKSFNVYLNA
VDNIYDYVKRDANGGIDAVARAATSGVELLEHGERIAITAPTAHSVMIEGSYDALKIANR
TNPALVKKALAPGQSLEATNIDSIPSQLTIEQIYDMATYDSTGALKQYSFGLSGTPRQTL
DPNAKIAIQNSDDMYNVVYGPFESFKFVDRSNPVTFIKTLSTNDSMAFEQNALNQMFLYF
NGNPYDYAQYKANKEVREYGWGVLSSQAMTKGDRIVVAASGTANVTVQGSYDAYKIATVS
GKPVTIKTLEIGESYSIRNISPGSFFVKLAGNHSYQLYNANGTLTTSSTGTTASYHAVPA
SSRLVVTNVDVAPITVYAPTEAIKVTQGDDLLVKTLTMDQTMKATNTSSSSATLSVDGKY
DVAVYDASGKPVNVDRKSTGNSVSVPAGGYAILTGQQADNTLVNGNKDNFNFEDQVNPAL
SLYTLAPNALVKATNVHDHARTLNVGSKFSYWTEQGEEQTGSGTVNIGAGNTTVIRNTGT
TTYELYSPYGSFQMEATTTIPVPVPPVVNPSVGTIDPADYDQQTYYADPVDTSTGAQIIN
KTMMVAHGTVDIPFQAQYYALLQGNGGLGKGWSHNFEIRLSKNNTTGQMTVYWNAFRTNN
FTLNSDKATYTPVERAIRNDQLQKNANGTYTLTRYDGTHYIFAANGTLQSMGERGGITMT
MQYDNAGKLLSVTEPTSGAKLVLTYNAIGKVATVADQAGRTSTFTYDDTGRLITLTDPGS
HKTTYTYNKNNQILTGSLDGKLVFSNAYDGKGRILRQNDGITAHQPTTFAYSNADGMLTT
TITDRNGDIQKRVHNINYQLVEVQDGNNGKTSYTYDAQGNRTSITNALGQTAKFEYDSKG
NLTKNTDPSGLSMTLTYDAKGNLLKATGPDGNSITSTYDANSRLLSTTDTEGYKVSYEYN
DKGMLTAATDPRGGKTIYSYNGYKLDTVTASTGEMMKVGYDAAGRMTTQSDAEGNLSQAV
YNDNDQLITMIDPLKNKVSYTYDRQDNLASVTDARGNTTSYSYDANGQLTSVRNALGGTL
SITYDSEGNMTAVTDPLGRKSSFTYDAAGRLMTETNAAGATVKYAYDKLGRPIEAYDALN
HKMYTVEYDTAGNPVKMTDALGYTYTSTYNDLNQLTQSVDPLKRTTTYGYDRKNQLTSVK
DAIQGSTSQTIDAFSQITQMVDANGNRAKYQYDLLGRLTAEQDEAGGNHSYTYNNVGLLG
SDTDKNGRHSQYSYDAAGNLSQFTDEAGSVSYDYDANGNITSVKGSNGEVLVRNYDPLNR
VESFTNGDGQTISYSYDAAGQLTALTYPDGKKVAYTYHANGRLSTVTDWAGRQTSYTYDA
NSRLLSTTRPDGTKEVRTYDAAGQVLTLKDLQADGTVLYEYNYTYDQVGQVTNEDGGEIT
TDLTGVTSDVYGPGLSPSLEDVMIQSEGLPQTTDNVSSDVQTDVYTQPSSVTADVYGTGD
MTMTYSADNRLATVNGEAVKYDAEGNMLVGPLAGQMQNYTFDARNRLVEAGGVQYGYDNE
NHRTSVTVNGTTTKYVINPEAVLSQVLMETDASGKPTAWYVYGNGLIGRQDANGAYQSYH
YDRRGSTIALTDAKGQLTDTYSYGTYGESLGHEGTTEQPFQYNGRDGVMTDPNGLYQMRA
RYYNPEIKRFVNRDVLSGSIDDGLTMNRYAYVNGNPISYIDPFGLSADSDEMLKTVGSFL
ADAVPGLGTLKGLQEIFTGVNYVTGDQLSVADRVANGGGVLLSWVPGGKIAGKALTKGAI
DGGSWVIARVAKTPGKYLESPAEINGMLNIGARGKPIEGTYNIDIDPKSQGVHYGDATQL
TNIKTGSQNKIIIENPYGYDPLNSEILRVLSKDGEIIITGSRSNMKKILRQLEEKGLQVK
GERRDVANDGTYLTTDGEIIKSEFLDQYIFVRK
NT seq
8562 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaataaatatgtacggttggcctttcttgttgttgtcttattggctatctttgta
ggttttaaaatgcattctgcttctgcggcaacaggtgtatattcacttggctcagggcaa
agtgtagacattacgcatggttattctacttccgcaacagtatatgttacaggtaataat
tacgattatgtaaaatatttatccaatggagatgtatctctgtatgatactaaaacagca
tatgctcctattactttggcaattaatcagaaactacgtttaactaataattcaccctca
ccattaactatagatatgaagagtaaaacattcacagtattaacgactgctggacaagct
ttaagtcgatttaatttattaccaggtaacagtgttttcgtacaaaatttgaatccagat
tattcacagccgattgatattggtggaattaatgccaatattcattatggagcagacgga
gaattatcatctcctacatttacacgtaaaaaagctaaaggttcagaaactgtagcgaaa
aatggatcaatgattgtaacaaatcgtgacacagtagcatatgatgttgttgctcctgca
tttcctattaattttttgggttctactgaaccagcagattttcgttataacgttcctatt
ggtggatcgtttcaagcaacaaaccaactaagtaagcctttttatgtctatattgacaat
ggagggacttacgaattcacattgtacaacgaagatggttctgtaagttcaacaggtaca
accaaaacagtgaccaagtatgttggtgctggtgagacattgattgtgaccaatgtcgat
gggccttctatgctagtcagtggagcatatggagcattctataccacgactcaagttgaa
ccgccgatgataaccaaaacattagcacccggcaaaagtattaaagtgctcaacaactct
ggcgataccatgaaactgttaactgataacggagataaaggtttccagattgccgagtac
aagtccaatggggctgtagatagttatgatattttaaatacaagtgctagctacattatg
ggaattggtaactatgttgttattaccaaccctgcttacaatggacaagcgattaaaatt
aaaattcctaaagtgaattcagtgatatccgattcaactaatcctgctttactggaacag
aatatctctccaggtaattcggtagaagtgaagaacgtatctcctaccaaaacaggtttg
tttgtgacaggtgaatttgactatgctctatatgatagtgcgggtattaatgattatgca
cctaacgtaggatcttcacatgtataccctgatccaggtgaaagagtagcaataaccaac
acaagcaaaggcaatgttacgatgagtatcaacgggccttatgaagcatttgtagcgact
gctcgtacacagccagtgacatttaatcgtgtactgaatgtaggcgaaacgttaaaaacg
atcaatacgtctaactattcattttatattacggcaagtggacaacaccattatgctgtc
tacaaaaaagagaacaacaaagtggatgattttgataatccaatcgtaagtgcaagacat
ctaattagtaaagatgagaaaataatcaccaccaatagtggtaatcaagcgatgacggta
tctggtccttatgatgcatttgatatcagtagtcgcgccgaacctgctctgtacaaagga
tatcttaatgcagggcaaagtgtgaaattaacaaacaccagtccggcgatgttcagtatg
tatacagatggtatgtatgatcaagcgagttatcgtgcagatgacacattacgctcacta
gaccatgaccgtgtcgccaagtcactccctttttataatggagaacgagtgacactaacg
aattctggaagtagtcagcttgtggtgttgagtccgtatgatgtaacaacagctcaatcg
agtagcgatcctgcactaattgtgaaacaattagcgatcaatcagagtgccgagtttatc
aacaaagataaatcaaacgaaatggtttattttacaggtaaacatgacttgatggattat
gataccgcagatcagcctaacagctattatcgtggtacagcgacaacatatcgttctgta
gatcctaatcagcgcttagctgttatgaacacagatgtcaaaacaatagatgcgtacgcc
gcatttgaattatttacagggaaagatcgtatcaatccagtaacctttaagaaaacatta
tctacaaaacaaagtctggattttacgaataaaacaagcaaaacattctttgtctatcca
acaggaacatacgattttgcagagtatcaagcagggcaatctatagatatgggcaaaaat
gagacaagttctaccaaaagtatccctacatctaatagaatgtcgattacaaatacgatc
tctaccgatctcacagtagaaggcccttatgatgcttttactattcaagcacgtacgaat
cctgctctagtagaatatagtctagctccacgtcaaagtgtagaagcagaatacacagga
gtaaaatcaggacaaatacgtctgaccgttgattatgattcagccttatttaccaataac
gtattaaatgtatatagccgcaaccatatcagttctactgcacaaatagtagagaatggt
gaacgtctagctgtgcaaaatatggctgagatcaatggattgatgtatggagcatatgac
acattcaaagtcacttcacgtaccaatccagttacattccagaaggtactgaataccgat
gagagtgtagatattaccaatacacaacctgcgaagtcatttaacgtgtatctcaacgct
gtagataatatctacgattatgtcaaacgagatgcaaacggtggaattgatgcagtagca
cgagcagcaacaagcggagttgaacttctagagcatggagagcgtattgcgattacagca
ccaacagcacattcagtaatgattgaaggttcttatgatgcacttaagatcgcgaaccgt
acgaatcccgctttggtgaaaaaagcactagcaccaggtcaaagtctagaagcgaccaat
atagacagtattccttctcaattaacgattgagcaaatctatgatatggcgacttatgac
agtacaggagctttaaaacaatatagttttggattaagtggaacacctagacaaacgtta
gatcctaacgccaaaatagcgattcaaaatagtgatgacatgtacaatgtggtctatggt
cctttcgaatcgtttaagttcgtcgaccgaagcaatccagtcacatttatcaaaacgtta
tctacgaatgattctatggcgtttgaacaaaatgcactaaatcaaatgtttttatatttc
aatgggaatccttatgattacgcacagtacaaagcgaataaagaagtgcgtgagtatggt
tggggagtactttcttcacaagcgatgaccaaaggagatcgtattgttgttgcagcatca
ggtacagctaacgtaacggttcaaggttcgtacgatgcatacaaaatcgcaacagtgagc
ggtaaaccggtaacgatcaaaacgcttgaaatcggtgaaagctattcaatccgtaatatt
tcaccaggaagctttttcgtcaaattagcaggtaatcatagttatcaactgtacaatgcg
aatggcacattaaccacttcgagtacaggaacaacagctagttatcatgctgttcctgct
tcatcacgtctggtagtgactaatgtcgatgtagcaccgattacagtctatgcaccaact
gaagcgatcaaagtcacacaaggtgatgatctgttagtcaaaacattgactatggatcag
acgatgaaagctactaatacatcaagtagttcagctacattatctgtagatggtaaatac
gatgtggctgtatacgatgcttcaggcaaacctgtaaatgttgatcgcaagtcaaccggt
aattcggtatctgttccagcaggtggttatgcgattcttacagggcaacaagctgacaat
acactggtgaatggaaataaagacaattttaattttgaagatcaagtgaatcctgcacta
tcgctgtatacattagcaccgaatgcgctggtcaaagcaaccaatgtacatgatcatgca
cgtacgcttaatgtaggtagtaagttcagttactggacagagcaaggagaagaacagaca
ggttcaggtactgttaatatcggagcgggtaatacgactgttattcgtaatacaggaaca
acgacgtatgaattgtacagcccatacggatcgttccaaatggaagctacaacaacgatt
ccagttcctgttccacctgtagtaaatccttctgtcggtacgatcgatccagccgattat
gatcaacagacgtattatgctgatccagtcgatacttctacaggagcacaaatcattaac
aaaacgatgatggtggctcatggaactgtagatattcctttccaagctcagtactatgcg
cttttacaaggcaatggtgggttgggtaaaggatggagtcataactttgaaatacgtttg
agtaaaaacaatacaacaggtcagatgaccgtgtattggaatgctttccgcacaaataac
tttacgctcaatagcgacaaagcaacctatacacctgtagaacgtgcaatccgtaatgac
caattgcaaaaaaatgcaaatggcacatacaccttgacgcgttacgatggaacgcattat
attttcgctgctaacggaacgctgcaatcaatgggtgaacgtggcggaattacgatgacg
atgcagtacgataatgcaggtaagttactatctgtgactgaacctaccagtggagcgaag
ttagtcttaacgtataacgctatcggtaaagtagcgactgttgcagatcaagcgggtcgt
acatctacgtttacttatgacgatactggtcgattgattacactaacagacccgggtagt
cacaagacgacgtatacgtataataagaacaatcaaattttgacaggttcactagatggc
aagcttgtattctcaaatgcttatgatggcaaaggcagaatactacgtcaaaatgatgga
atcacagctcatcaaccaacaacatttgcttatagtaatgcagacggaatgctcaccacg
acgattacagatcgcaacggtgatattcaaaaacgtgtgcataatatcaattatcaattg
gttgaagtgcaagatgggaataatggcaaaacaagttatacctatgatgctcaaggtaat
cgtacaagtattacgaatgcgctaggtcagacagcgaagttcgaatacgatagcaaagga
aatttgaccaaaaataccgatccatccggtctatcgatgacattgacttatgatgcgaaa
gggaacttgctcaaagcaacagggcctgatggcaatagtattacaagcacgtatgatgcc
aatagtcgcctactcagtacaaccgataccgaaggttataaagtatcgtatgagtacaat
gacaaaggcatgctaaccgctgcaaccgatccacgtggtggcaaaacgatctatagctac
aatggatacaagttagatacagtcactgcttctacaggcgagatgatgaaagtaggttat
gatgccgcaggtcgcatgaccacgcaaagcgatgcagaaggcaacctttcacaagctgta
tataatgataatgatcaattaatcactatgattgatccgctcaaaaataaagtaagttac
acctatgatcgtcaagacaatctagcaagtgtcactgatgcacgtggcaacactacaagc
tacagttatgatgccaatgggcagttaacatcggttcgtaatgcactgggtggtacactc
tcgatcacttatgatagcgaaggcaatatgaccgctgtcactgatccacttggtcgtaag
agttcatttacgtatgatgcagctggtcgcctaatgacagagacaaatgccgcaggcgct
actgtaaaatatgcatacgacaagctaggtcgtccgattgaagcctatgatgcactcaat
cacaaaatgtatacagtagagtacgataccgcaggtaatccggtcaaaatgacagatgcg
ctagggtatacgtacacaagcacgtacaacgatttgaatcagttaacacaatcagtcgat
ccattaaaacgcacaaccacttatggatatgatcgtaaaaaccaattaacatcagtcaaa
gatgcgattcaaggcagtacatcgcagacgattgatgcgtttagccagattactcaaatg
gtcgatgccaacggtaatcgcgccaaatatcagtacgatctgcttggacgtctgactgca
gagcaagacgaagcaggaggcaaccatagctacacgtacaacaatgtaggattgctaggt
agcgataccgataaaaatggtcgtcacagtcaatatagctatgatgccgcagggaacttg
agccaatttaccgatgaagcaggcagtgtatcgtacgactacgatgctaatggcaatatc
acttcggttaaaggtagcaatggtgaagtactggttcgtaactacgacccattgaaccgc
gtcgaatcgttcactaacggagatggacagaccatttcgtatagttacgatgccgcagga
caattaacagcacttacgtatccagatggcaaaaaagtagcatatacgtaccatgccaac
ggtcgattgtcgacagtaacagactgggcaggacgtcaaacatcttatacgtatgatgcg
aatagtcgcttgttatcgacaacccgtccagatggaacgaaagaagttcgtacgtatgat
gccgcaggacaagtattaacgttgaaagacctgcaagcggatggaacggtattgtacgaa
tacaattacacctacgatcaagtaggacaagtgacgaatgaagacggtggcgaaatcacc
actgatctgactggcgttacttcagatgtctatggtcctggattatcaccatcacttgaa
gatgtgatgattcaaagcgaaggattgccacaaaccacagacaatgtatcatcagatgtt
caaaccgatgtatacacacagccatccagtgtaaccgcagatgtctatggcacaggcgat
atgacgatgacctatagtgcagacaatcgtctggctactgtcaatggcgaagctgtgaaa
tacgatgccgaagggaatatgctagtcggcccacttgctggacaaatgcaaaactatacc
tttgatgcacgtaaccgtctggtagaagccggtggggtacaatacggatacgataacgaa
aatcaccgtacttctgtaactgttaacggaacaacaacgaagtatgtgattaatcccgaa
gctgtgttgtctcaagtactgatggaaaccgatgcatcaggcaaaccgacagcatggtat
gtgtacggtaacggcttaattggacgccaagacgcaaacggagcgtaccaaagctaccac
tacgaccgtcgcggaagtacaatagcgttaacggatgccaaaggacaactgaccgatacg
tacagctacggcacctacggagaatctttaggacacgaaggtaccaccgagcaaccgttc
caatacaacggacgcgatggagtcatgaccgatccgaacgggttgtaccagatgcgagca
aggtactacaacccagagatcaaacgctttgtgaatcgagatgtcctgagtggcagtatt
gacgatggactgacgatgaaccgctatgcgtatgtgaatgggaacccgatttcgtatatt
gatccgtttggattgagtgcggatagtgacgagatgttgaaaacggttggcagtttctta
gcagatgctgtgccaggattaggtacacttaaaggactgcaagaaatatttaccggagtc
aactatgtgacaggagatcaattatcagttgcagatcgagtagccaatggaggaggagtt
cttttaagttgggtacctggaggcaaaattgcagggaaagccctaactaaaggagctatt
gatggcggtagttgggttatagctagagtggctaaaacacctggtaaatatttagaatca
cctgctgagataaatggaatgttaaatattggtgcaagaggaaagcctatagagggaaca
tacaatattgatatagatcctaaatctcaaggtgttcattatggagatgcgactcagctt
actaatataaaaacaggaagtcagaacaaaataattatagaaaacccttatgggtatgat
ccattaaactctgaaatactaagggttttatctaaagatggtgaaattataattaccgga
tcacgttccaatatgaaaaaaatattaagacaattagaggagaaaggattacaagtaaaa
ggagaacgacgtgatgttgccaatgatggtacttatttaacaacagatggagaaataatc
aaatcggaatttttagatcaatatatatttgttagaaagtga
DBGET
integrated database retrieval system