Paenibacillus kyungheensis: PQ456_12505
Help
Entry
PQ456_12505 CDS
T08956
Name
(GenBank) S-layer homology domain-containing protein
Organism
pka
Paenibacillus kyungheensis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
fn3
SLH
Ig_DSCAM-DSCAML_C
GH85_C
DUF7743
DUF4992
Big_3_3
Peptidase_C25_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WCT54030
UniProt:
A0AAX3LWP2
LinkDB
All DBs
Position
complement(2939402..2944120)
Genome browser
AA seq
1572 aa
AA seq
DB search
MKIRVLLLLFVFTITTLLFPYRGILINEVQAASVVIDSGSQTYKTTTHKIEDYGFSVGFK
KKIYDGSKDYMIRLHYRLPSGAPTLANRIYAKLDSTIFFDTKVIGAYNGYIDVPIPDTGV
NKAYEAITMLVDLNGSAKTGDSELKYEVFYEDITAPTKPVINGVPSTWTTSALINIDGSN
DASGIARYMYRIDNKEYIEYKNPFLAPDGQHTIETYAVDMNGLQSEHVTVTSFVDNTPPT
SPILNGGGDQWYSNNVNIDIRSGTDSQSGINRTEYYLSGATSTSWQNGNGATISNEGITI
IHARTIDNVGNISQEVERTIKIDRIQPDLTITEQKIDSSTLRLTAKATDASSGIKSITLP
NGSIVNSDTATFDTKINGRYTFIATDQMGLTTTQTKNISNLDETPPTINITYSKSYAKSI
TIQIYAEDNDTGVKEIVLPDGSIIRSNQAETIIEENGTYLFKAIDIAGNVTEQNIIISTI
DTQQPTIDIFYSDVPQQELTFKITTSDKESGIDFVTLPDGTRVHNTDAEYTVHTNGQYTF
KVTDKAGNDHLQSIEVQHIDQVKPQIQVDVNGSTWTDQPITILISYQDLDSGLDKNKLYY
KLTQTENNPENWNIAEKDQQPLTITEEGEWYLHAMAVDQAGNKQLFTSKKYQLQRQPEIP
NLKVKGISSEEIQLNWELSTGASITDGYTYYIRNQETGKTFQVEYPENSIIDKDLKGGEI
YHYTIQVQNHVGSSEKSKSISGYTLPEAPTHVLVERLERDYDKALLTISPVQSASAYQIQ
AINANNQQVDVDTTVTGNVYQQISGLKPYTFYTIVVTAINPSGNGLPYHVSYLSLPSAPT
GFRFLQMTENSILLDWNTVAKSTYTTSSVQEDTYYSLKRSETYIYQGPYQRFIDSGLSSG
SAFNYAIAAGNTTGWSNFSYLSNIWTLPSVVGRLEQVDAHSHSVALNWQAVRGATGYRIV
IENVGEYNISDDLTNFEVKGLEPGFTYRATITPYNTSGYGSSKEILITTLPESMFNESVI
IKDITESNAVIEIKPIEGATKYRLEIDGKEYIIPEGDFQIPSLTGSTYYNYSITSGNSAG
WTQPLIGTLLTSPSAPSDVKLTDVTDQSLSFHWNQLDNVDTYTIYDENKKEIKTTAEEQA
VITNLNAGEIYNFYISATNQNGTSSLNKFTYRTLPESTTQDTNKVRISNITVDSVDLKWN
IIKGADQYQLYDNTDHLVYETTQNTAHLDKLSSATSYEGWYIVPLNTAGKGKKLDVLSFE
TLPSNQFKVIDSDATRSTVTLKIEHFLVKEHLVIELNNKIVFRGLTDTFTQDTLKADQSY
VFKIWSENSKKQASTPISITIRTKKEKEKNKKIIESTNEKELQQTDLLDEIVAVPEKNDY
LSTNNDQEFEDIDSIFSKSQIQELHQMGIIEGVSKTHFEPEREVTRAEFMALIVRGQKYI
NKETSSINTTKKIVFDDIDWSAWYIPELKEAIHYNYVKGFSKKVFAPTLTVNREQASKMI
VNAVIGNIEDSIDVDQFEFSDAAYISKWATGSIQKGYQKGIILGYPNHSFQPKNNLTRAE
AAMLLYRMIESK
NT seq
4719 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaataagagttttattgttactttttgtatttactattactacattactatttcct
tatagaggcatattaataaatgaggtacaagctgcttcagtagtaatagattcgggttcg
caaacttataaaacaacaactcataaaattgaagactatggattttcagttggtttcaag
aaaaaaatctatgatggaagtaaagattatatgattcggcttcattatcgtttaccttca
ggtgcacctacacttgctaatcgtatctatgctaaactggatagcactattttttttgat
acaaaagtaataggagcttataatggatacatagatgtgccaatccctgatactggagtt
aataaagcttatgaggcaataactatgttagtagatttaaacggatcagcgaaaactggg
gatagtgagctaaagtatgaagttttttatgaagatataactgctccaacaaagcctgtt
attaatggtgtaccttctacttggacaacttcagctttaattaatatagatggaagtaat
gatgctagtggtatcgcaagatatatgtatcgaatagataataaagaatacattgaatat
aaaaatccttttttagctcctgatggacaacatacaattgaaacctatgcagtagatatg
aatggattacagagtgaacacgttacagttactagctttgtagataatactcctccaaca
tcacctattttaaatggaggtggagatcagtggtattcaaacaatgtgaatatagatatt
agatctggtaccgattcacaatcaggaataaatcgaacagaatattatttatctggagcg
acttctacatcatggcaaaacggaaatggtgcaactatttctaatgaaggaataactatt
attcatgctagaacgatagataatgtaggaaatattagccaagaagtagagcgtactatc
aaaattgatcgcattcagcctgatctaacaattacggaacaaaaaatagattcatctaca
ttacgcttgactgcaaaagccactgatgcatcttctggaatcaaaagtattactttacct
aatggatctatagttaattcagatactgctacgtttgatactaaaatcaatgggagatat
acatttatagcaactgatcaaatgggtttaacaacaacacaaaccaaaaacatttcaaat
ttagatgaaactccacctactataaacatcacttattctaaatcgtatgctaaatctatt
actattcaaatctatgcagaagataatgacacaggtgtaaaagaaattgtgcttcctgat
ggatcaatcatacgatctaatcaagcagaaacgataatcgaagagaatggtacttatttg
tttaaagctattgatattgcagggaacgtaacagaacagaatattattatttctacaatc
gatacacaacagcccactatcgatatattttattcagatgtacctcaacaagaacttaca
tttaaaattacaacaagtgataaagaatctggaattgattttgttactttacctgatggt
acaagagtacataatacagatgcagagtatactgtacatacgaatggccaatatacgttt
aaagttacagacaaagcaggtaatgatcatttacaatcaatcgaagttcaacatatcgat
caagtcaaaccacaaatccaagtggatgtaaatggatctacatggacagatcagcctatt
actattcttatttcatatcaggatttagattcaggtttggacaaaaacaaactatattat
aaactcactcaaacagaaaataatccagaaaattggaatatcgccgaaaaagatcaacaa
cctctaacaattacggaagagggagaatggtatttgcatgcgatggcagtagatcaagcg
ggtaataaacaattatttacatccaaaaaatatcagttacagagacaaccagaaatacct
aatttaaaagtaaaagggatttcttcagaagaaattcaactgaattgggaattatcaact
ggtgcttctattacagacggatatacttattatattcgtaatcaagaaactggaaaaact
tttcaagtagaatatccagaaaactctattattgataaagacttaaaaggtggagaaata
taccactatactattcaagtacaaaatcatgtaggatcgagtgaaaaaagtaaatcgata
agtgggtatactttacctgaagctcctactcatgttttagtagaaagactagaaagagat
tatgacaaagcactattgactatatcgccagtacaatctgcttctgcttatcagattcaa
gctattaatgcaaataatcaacaagtagatgtggatactacagttacaggaaatgtatat
cagcaaatctctggattaaaaccgtatactttctatactatagttgtaacagctatcaat
ccatctggtaatggacttccttatcatgtatcttatctatctctacctagtgcacctaca
ggttttagatttttacaaatgacagagaatagtattttacttgattggaatacagtagct
aaatctacctatactacgtcatcggttcaagaagatacatattattctttaaaaagaagc
gagacgtatatttatcaaggtccttatcaacggtttatagatagtggcttaagttcggga
agtgcttttaattatgctattgcagctggaaatacaacaggttggagtaacttttcgtat
ttgagtaatatttggacgttgccttcagttgtaggcagactagaacaagttgatgctcat
tcacattcagtcgctttaaactggcaagccgtaagaggagcaactggttatcgtattgtg
atagaaaatgtgggagaatacaatatctcagatgatttaactaactttgaggttaaaggg
ctagagcctggattcacataccgtgctacgattacaccctataatacaagcggatatggt
tcttctaaagaaatattaataaccactcttcctgagagtatgtttaatgagagtgtaatt
attaaagacataacagaaagtaatgcagtgatcgaaataaagccgattgaaggagcaact
aaatatcgactcgaaattgatggaaaagaatatattattccagagggcgattttcagatt
ccgtctttaacaggatctacttattataattattctattacatcaggcaattcagcaggc
tggacacaaccattaataggaacattattaactagcccttctgctcctagtgatgtaaaa
ctaactgatgtaaccgatcaaagtctatcgttccattggaatcaacttgataatgtggat
acgtatacaatttatgatgagaataaaaaagaaattaaaactactgctgaagagcaagct
gtaataacgaatttaaacgctggtgaaatttataatttctatatatcagcaactaaccaa
aatggaacaagttcattgaataaatttacttatcgtactttaccagaaagcactacacaa
gatacaaataaagttcgaatttctaatattactgttgattctgtcgatctaaaatggaat
atcattaagggcgcagaccaatatcagttatatgataatactgatcatttagtatatgaa
acaactcagaatactgcccatcttgataaattatcttcagcaacttcatatgaaggttgg
tatattgtgcctctaaatactgctggcaaaggcaaaaaattagatgttctttcttttgaa
acacttccttctaatcagtttaaagttattgattcagatgctactagatcaactgttact
ctaaaaatagaacattttttagtcaaagaacatttagttattgaactcaataataaaata
gtatttcgaggattaacagatacatttacacaagatacattgaaagcagatcaatcgtat
gtttttaaaatctggtcagaaaatagtaaaaaacaagcatcaacacctatttcaataact
attcgaactaaaaaagaaaaagaaaaaaataagaagattattgagagtacaaatgaaaaa
gaacttcaacaaaccgatcttcttgatgaaatagttgcagttcctgagaaaaatgattat
ttatcaacaaataatgatcaagaatttgaagatattgattctatatttagtaaatctcaa
attcaggaattacatcagatgggaataatagaaggagttagtaaaactcattttgaacct
gaaagagaagtgactcgtgctgaatttatggctttaattgtcagaggacaaaaatatatt
aacaaagaaacgtcttcaatcaatacaactaaaaaaatagtatttgatgatattgattgg
agcgcatggtatattccagaattaaaagaagctattcattataattatgtcaaaggattt
agtaaaaaggtgtttgcacctacgctaactgttaatcgagaacaagcttctaagatgatt
gttaatgctgtcataggcaatatcgaagactctattgatgtagaccaatttgaatttagt
gatgctgcttatatctcaaaatgggctacgggctctatacaaaaaggatatcaaaaaggg
attattttaggttatcccaatcattcttttcagcctaaaaataatctaactcgtgcagaa
gcggccatgttgttatatcgaatgatcgaaagcaaataa
DBGET
integrated database retrieval system