Paenibacillus konkukensis: SK3146_00389
Help
Entry
SK3146_00389 CDS
T09860
Name
(GenBank) Collagen triple helix repeat (20 copies)
Organism
pkp
Paenibacillus konkukensis
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Collagen
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UQZ81233
UniProt:
A0ABY4RGC5
LinkDB
All DBs
Position
complement(470242..473301)
Genome browser
AA seq
1019 aa
AA seq
DB search
MTTQLENRIINSSFEAGLASWTAVNTGLSPISKEGLSSAELLGGNFASSLQQNVAASPGE
GLYFSVSLAKSMPGESPAISILVDYLDAAFNLASSAVVFTIPQGYFTDFKVVDWNVFEGV
TTEAPLNTAYAQLTITRAPLTGASGILVDEVVLMAAVSTGAIGATGATGATGATGVTGAT
GATGATGETGVTGATGVTGASGATGAVGSTGVTGATGATGAMGATGAAGVTGATGATGAT
GATGAAGATGATGATGVTGVTGETGTTGAAGVTGATGATGETGAAGETGATGAIGATGAT
GVTGETGATGVTGAIGATGATGVTGETGATGVTGATGATGAMGATGATGKTGTTGATGAT
GATGATGETGATGATGATGATGATGETGTTGAAGVTGATGATGATGVTGATGATGAMGAT
GATGETGTTGAAGATGATGATGATGATGATGETGTTGATGVTGETGTTGAAGVTGATGAT
GATGATGETGATGVTGATGAAGVTGATGATGITGATGAIGVTGATGTTGATGATGVTGAT
GATGVTGATGVTGATGATGETGSTGATGATGAAGATGATGATGVTGAMGETGATGVTGET
GVTGATGATGATGVAGATGATGATGATGATGATGAAGATGATGATGETGATGVAGATGAT
GVTGVTGATGATGATGATGATGVTGATGETGATGATGATGAAGATGETGVMGATGETGAT
GAAGETGATGATGATGATGVTGAAGATGATGVTGVTGATGVAGVTGETGSTGVTGATGAT
GATGATGATGVTGATGSTGVTGATGTIGATGATGVTGVTGETGTTGATGVTGATGAAGVT
GATGATGTTGATGATGPTVTQQGFSAFISTATISASGQLAGWTVASPYYNTSGFDPASGN
FTVPGTGTYSIKATINYSTSAAISASLGSGVNPGFIVRRTSATATNLISGLFPLLNVNVA
LVLTLRAILGNGTITLAGDVQLNAGDVINLYYDSGGLTVAINLGGVNSGGIVFSVHRLS
NT seq
3060 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacgactcaactggaaaatagaatcataaacagcagctttgaggcggggttggcatca
tggaccgccgtgaacaccggtttaagcccgattagcaaagaagggctaagcagcgcggag
ctgctgggcggaaattttgcctcgtctctccagcagaacgttgcagccagtccgggcgag
ggcttatacttttcggtcagcctcgccaagtcgatgcctggggaaagtccggctatttcc
atattggtggattatttggacgccgcttttaacttggcaagctccgccgtcgtttttaca
attccccaaggttatttcacggatttcaaagtcgttgactggaatgtgttcgaaggagtg
acaacggaagcgcctttaaatacagcatatgcgcaactgacgatcacgcgggctccgtta
acgggagcgagcggaattcttgtagatgaagttgtgctgatggctgctgtcagcacaggt
gcaataggtgcaacgggggcgacaggagcgacgggtgcgacgggcgtcacgggggcgact
ggggcaacaggagccacaggtgaaacgggagttactggagcaacgggagtaacaggagcg
tcaggtgcaacgggggccgtgggatcgacaggagtgacaggtgccacgggtgcaacaggc
gcaatgggtgcgacaggtgccgcgggagtgacgggggctaccggagcgacaggcgcaacg
ggagcgacaggtgcagcaggagccacaggggctaccggagcgacaggcgtcacaggagtg
acgggcgaaaccgggactacaggtgccgcgggagtgacgggtgcaacaggagccacaggt
gaaacgggagccgcaggcgaaacaggagctacgggtgcgattggggcaacaggagcgaca
ggagtcacgggtgaaacgggagcgacaggtgtcacgggtgcgattggggcaacaggagcg
acaggagtcacgggtgaaacgggagcgacaggtgtcacgggtgcaactggggcaacagga
gcgatgggagccacgggggctacgggcaaaacaggtacaacaggagccacaggagcaacg
ggagcgacaggagctacgggtgaaactggagcaacaggagctacgggcgcaacgggagcc
acgggtgcgaccggcgaaaccggaaccacaggtgccgcgggagtgacgggtgcaacagga
gccacaggcgcaacaggtgtcacgggtgcaactggggcaacaggagcgatgggagccacg
ggggctacgggcgaaacaggtacaacaggagccgcaggagcaacgggagcaacaggagct
acgggcgcaacgggagccacgggtgcgaccggcgaaaccggaaccacaggtgcaacggga
gtgacgggcgaaaccgggaccacaggtgccgcgggagtgacgggtgcaacaggagccaca
ggagccacaggagcgacaggcgaaacaggagccacaggtgtcacgggggccacaggagcg
gcaggcgtcacaggagccacgggtgcgacaggtatcacgggtgcaacaggagccataggc
gtcacgggtgcaacaggtacaacgggagcgacaggagctacgggcgtcacgggtgcaact
ggggcaacaggcgtaacgggagcgaccggtgttacgggtgcaacaggtgcgacgggcgaa
accgggtcaacaggcgcaacgggagcgacaggtgcagcgggagccacaggggctaccgga
gcgacaggcgtcacaggagccatgggagaaaccggggccacaggtgtaacaggtgaaacg
ggagttactggagcaaccggggcaacaggagcgacaggcgtcgcaggtgcaactggggca
acaggagctacgggcgccacaggtgcaactggggcaacaggagccgcaggcgcaacggga
gcgacaggagctacgggtgaaactggagcaacaggagtagcaggcgcaacaggagctacg
ggcgtcacaggagtgacgggtgcaacaggagcgacgggtgcgacaggtgcgacgggagct
acaggtgtcacgggtgcgacgggcgaaaccggagccacaggtgcaacaggagccacgggg
gctgcgggagcgacaggtgaaacgggagtcatgggggctacgggtgaaacaggagcaaca
ggagctgcaggcgaaacaggagcgacgggtgcgacgggggcaacaggagccacaggcgta
acaggagccgcaggcgcaacgggagcgaccggtgttacgggtgtcacgggagcgacaggc
gtcgcgggagtgacgggcgaaaccgggtcaacaggcgtcacgggtgccactggggcaaca
ggtgcaacgggagcgacaggagctacgggcgtcacaggtgccaccgggtcaacaggcgtg
acaggtgcaacgggcacaataggggctaccggagcgacaggcgtcacaggagtgacgggc
gaaaccgggaccacaggtgcaacgggagtgacgggtgcaacaggtgccgcgggagttacg
ggtgccaccggggcaacaggtacaacgggagcgacgggcgccacagggcctacagttacg
cagcaaggcttctccgcatttatttcaacagcgaccatttccgccagcgggcagctcgcg
ggatggacggtcgcttctccctattacaatacaagcggatttgatccagcgtccggtaat
tttacagtgcctggcacaggcacctattctattaaagccaccattaattattccacatca
gcggcgatttcggcatcgctcggctccggagtgaatcccgggtttattgtacggaggaca
tcggccacggcaacgaatctgataagcgggcttttcccgctgctgaatgtcaacgttgcg
ctggtgcttactctaagagccattttgggaaatggaacgattacattggctggagacgta
cagctcaatgcgggtgatgtcatcaatctttactatgatagcggaggattgacggttgca
attaatttgggcggcgtcaacagcgggggaatcgtattctccgtccacagattatcttaa
DBGET
integrated database retrieval system
