KEGG   Plasmodium sp. gorilla clade G2: 39740398
Entry
39740398          CDS       T10353                                 
Symbol
PADL01_0508200
Name
(RefSeq) RNA polymerase I
  KO
K02999  DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1 [EC:2.7.7.6]
Organism
plag  Plasmodium sp. gorilla clade G2
Pathway
plag03020  RNA polymerase
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:plag00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09121 Transcription
   03020 RNA polymerase
    39740398 (PADL01_0508200)
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03021 Transcription machinery [BR:plag03021]
    39740398 (PADL01_0508200)
Enzymes [BR:plag01000]
 2. Transferases
  2.7  Transferring phosphorus-containing groups
   2.7.7  Nucleotidyltransferases
    2.7.7.6  DNA-directed RNA polymerase
     39740398 (PADL01_0508200)
Transcription machinery [BR:plag03021]
 Eukaryotic type
  RNA polymerase I system
   RNA polymerase I
    Core subunits
     39740398 (PADL01_0508200)
SSDB
Motif
Pfam: RNA_pol_Rpb1_5 RNA_pol_Rpb1_2 RNA_pol_Rpb1_3 RNA_pol_Rpb1_1 RNA_pol_Rpb1_4
Other DBs
NCBI-GeneID: 39740398
NCBI-ProteinID: XP_028536940
PlasmoDB: PADL01_0508200
UniProt: A0A2P9BSP8
LinkDB
Position
5:complement(312334..321266)
AA seq 2888 aa
MYDINKAICAEIKSAELDVLNSGELRRISMGKYENEKYEYEKTHKSGVVTKMYYDPKYGT
IDHNQICSVCFERHENCTGHIGHIEFVLPLFNPLFYKELQELLNLICYHCYNFCCSEDVI
FLLKHIFQLKSLNHIESTNKIKYKKNCDYEYIIDQVEKLYKKICKDSDISLEDIVEAIYD
DYDNVYEDKDGSFDEHMDLLNSLEKEKDDKNEKNDNNNIDMDDNNNNNNNNNNNSSNNNN
YFSDNLVDLVPTEEIYEEETDAPASDENKEKKPDYNKLKERIKKYKFDPNKLAFQSNYNY
EEYLILSKTIKLHMKKSSKCCFCKFQRNISAKVSQRRDTINFIGVHTNNPFFKKYMPKKK
QKKNNKDDKDDKDDKDDQDDQDDIDYQDDIDDLENINNVDDIDYVDDADNIHHINDDEKQ
LNSFKEKNENNKLMIKRESKKSEYNNNINDESIKIEDDNNEMDDKQIDMEESMGYENSFN
ELSTHNISNDKIKKSSTFTDMVNHYNKTQPIKEKCTIRLFSFQVIDILKKIFENNNKDII
NLLYPFTKRDGYKKFFLYDMGVSGNRFRSQSKGIHVRTKITNTLCRFNNFIKLCINAKKK
VDFDYLLEHNKKDLKLYKDMFSVFSLKMKYKFNHNIMDDDTDITKMDFLKYYTLVYNNKS
AYINILFSTLQLGVNTFYDSTLTEKVNNKHLKNISIRQILDKKEGILRKNIMGKRVNNCA
RTVISPDTFIETNQIGMPLEFAKVLTIDEYITQNNFTYIKKLIQNGPNIYPGALSYRDSN
GRVFKLSHKYEDRLKVIEKIEKINFQTENSYVLHRHARDGDVVIMNRQPTLHKFSIMAHY
LKIFEKEKVFRLNYVNCSSYNADFDGDEMNLHLLQTPLARAEATHLMNCDFLFTSFKDGS
PLRGLAQDFILGGLHLTSLETFLNYDEYCNLLQCSLNSLISQKNSFFIKKRKNNSINTNN
NNNNNNNNNNNCRSSSSSSVMKNMKNSQYDINNNESNSDCNKKMSIIKTNQSIEDNGKIL
SGVSTDEGRNNSIYDLQINNLMKPQDIDILKETNNVEQFNGNVLKITNYNYLDPYAIILN
RTNFTIITEEPAILYPKKLWTGKQLITSILKTVIDKVAIETYNKYNDNEFMNTYKGINYI
AKAKTSPDLWSFDPLKENEVIIKNSELLQGVLDKLHFGASSNSLVHLCHELFGPKTSAVM
LDCFGRLFINFLQLRGTSLSLYDFILNKNAKKEKRLIKKRISFTGFYLQNLFVYSIANSV
NADITDMNSYTKKKMNTGNQRKKLILNKMYDLYEKQNELINNNFIEKQNDINKMKTKHLK
NDSDIIIKDDNVLSISENSYLFALLNKELQNIIFHILNEIQFCDDKVSSLNKDKNKNKIS
NISNKYNKHDNVVNLDHETNSNSSLYSCVQYVLNKDLFNIYEKYLNGKNEEANKHIFYNN
SQIEETNNHFLNSITNKLYKALKEPTFFNSTSFTIKKITKIIEKVLTFLKAARCNKRLKI
YIIFELFQNKNIMKYFPSLVTYINSFDYDVSNDQIIKNVINNIYFKEEDESHLSSINNMN
VQDNCNKDLKIKCEQQNNEFGDNEKIKKKRKFGEEKSIQEIKKYKLKKFLHFYGELHKKW
NYEGGYNIDEKDIMNTHNDNNSDNNNNSDNYNDNNHNSDNYNDNNNLFKRSAVKNEIMTN
INPTSNDVYDEKIIRNCLVSSLPSFTLNDEITNLSYNGKHQYYEDYLCSKKKDEEDLNFK
YYNMDDVFYKMEYLIHNYFYLKRCDFDNLIDSLFQPYLCRVSSGTNNLINMNNLMNKFLN
NGFSNMIFTGAKGSKVNYSMICGMLDQQYLEGKRVPRMRSGKTLPSFHRYDYGARSCGLI
TDCFLEGLRPQEYFFHCMSGREGLIDTAVKTAKSGYIQRCLIKCMESVILHYDGTVRNED
NSIIQFLYGEDGIDPSKTAYLDLSKDLLHNYHLSFSKYLNNNIHSKILNNQELFLKHEKD
NNIENNEEPLISKYNPYTYIGSVSDKFNNKLNNTLLWNDLNFTEYEKLPINFDTLSSSLL
KSKYYNSLCNPGESIGILVAQSFGEPATQMTLNTFHLAGTENVTMGIPRLKEIFLTSKLT
SKPMIYVPIKLQVDNLKNDPNKMKNYITNIADKILSSYQSIFLTDVIYGIGVDRKIILKE
NQNEQKHTINLSDIMNNENIINNNNEQQMNTDNTELTKINNVLKNCNINFDMKKEWNYEI
IIQFENLYHFCNINKHLTISFILYKVVNALLNSVLNKVHETFVFHNLININSLNHEYYDE
LYDFISKKMSEEFNFNMDKYEYKDDEDQINAKLKFMAKENERYESKRGANNNISGEYQNA
SHNMPSHMEDDSPTKSYNDISNKENMSAYDLEKGNDGDRDHDDMSDIELKDNSEKNSNSD
QASKNGDSDTEEEEEDDGLKSEKDKEEDEKEYDEEGESDTSSKIDSDNNSDNNIDSDNNS
DSDNNSDNNNDSDNNSELQMMRSNKKEIIDINNKDKCLTNRNSSNESKISECSNTRGSTV
NYFSSETSATHHILIDEETSDIFHSLKDKKINNTKLNNINDNKNMSSTTVSSSLSSSSLS
TPLNKKNNEYDEHINDIHFIEKNKFEEEMDNKEEYITKSFTKLSYDYKNNINLIISSDDD
EENIEQNEEGQKIKKNEQRYVKNIIDKIKSSLLCFIKNIHFSPVTWILKLDIGWDINFFP
YPIDFLNHIKSEINKEVLFKVKDLNNPKILKGKDITHSGAEYELQIEGKNIYKLYNIKDK
YIDKTKLYCNDIYAIVKTYGIEAGRLCITKELKKVFDAYGIQIDFRHLSFISDFMTHTGD
LKAFNRHGLGYFRNVFHKMSFECATNFLIQGCIHNSIDYLSTASSSLFFGKHIKVGTNLA
DIVTCIDK
NT seq 8667 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgtatgatataaataaggcaatatgtgctgagataaagagtgcggagcttgatgtatta
aacagtggtgagttgagaagaatatcaatgggtaaatatgaaaatgaaaaatatgaatat
gagaaaactcataaaagtggagttgttacaaaaatgtattatgaccctaaatatggtacc
attgatcataaccaaatatgttcagtttgttttgaaagacatgagaattgtactggtcat
attggtcatattgaatttgttcttccattatttaatccattattttataaagaattacaa
gaattattaaatttgatttgttatcattgttataatttttgttgttctgaggatgtgata
tttttattaaaacatatcttccaattgaaatcgttaaatcatattgaaagtactaataaa
ataaaatacaaaaaaaattgtgattatgaatatataattgatcaagtggagaaattatat
aaaaaaatatgcaaagattcggatatatctttagaagacatcgttgaggctatatatgat
gattatgataatgtttatgaggacaaggatggaagttttgatgagcacatggatcttttg
aattctctggaaaaggaaaaagatgataaaaatgaaaaaaatgataataataatatagat
atggatgataataataataataataataataataataataacagtagtaataataacaat
tattttagtgacaatcttgtcgacttagtcccaactgaagaaatttatgaagaagaaaca
gacgcaccagctagtgatgagaacaaagaaaagaaacctgattataacaaattaaaagaa
agaattaaaaaatataaatttgatccaaataaattagcatttcaatcaaattataattat
gaagaatatttaatattaagtaaaactattaaacttcatatgaaaaaaagtagtaaatgt
tgtttttgtaaatttcaaagaaatataagtgctaaggtatcacaaagaagagataccata
aattttataggagtacacacaaataatcctttttttaaaaaatatatgccaaagaagaaa
caaaaaaagaataacaaagatgataaagatgataaagatgataaagatgatcaagatgat
caagacgatatagattatcaagacgatatagatgacttggaaaatataaataatgttgac
gatatagattatgttgatgatgcagacaacatacatcatattaatgatgatgaaaagcaa
ttgaatagttttaaagagaaaaatgaaaataataaattgatgataaaaagagaaagtaaa
aaaagtgaatataacaataatattaatgatgaatcaataaaaatagaagatgataataat
gaaatggatgataaacaaattgatatggaagaaagtatgggatatgaaaattcttttaat
gaattatcaacacataatatttcgaatgataaaataaaaaaaagttcgacctttacagat
atggtaaatcattataataaaacacaacctattaaagaaaaatgtactatacgtttattt
agttttcaagttatagatatattaaaaaaaatatttgaaaataataataaagatattatt
aatttattatatccatttactaaaagagatggttataagaaattttttttatatgatatg
ggtgtaagtggaaacagatttagaagtcaatctaaaggtatacatgttcgaacgaagata
acaaatacattgtgtcgatttaataattttattaagctatgtataaatgcaaagaaaaag
gttgattttgattatttattagaacataataagaaagatttaaaattatataaagatatg
ttttctgttttttctttaaaaatgaaatataaatttaatcataatataatggatgatgat
acagatataacaaagatggattttttaaaatattatacattagtttataataataaaagt
gcatatataaatatattatttagcacattacaattaggtgttaatacattttatgattct
actttaacagaaaaagttaataataaacatttaaaaaatataagtataagacaaatatta
gataaaaaagaaggaatcttaagaaaaaatataatggggaaaagagttaataattgcgca
agaactgttatatctccagatacatttattgaaacaaatcaaataggtatgcctttagag
tttgcaaaggtattaactatagatgaatatataacacaaaataattttacttatataaaa
aagttaatacaaaatggaccaaatatatatccaggtgcccttagttatagagattcaaat
ggtagagtatttaaattatcacataaatatgaagatagattaaaagtaattgaaaaaata
gaaaaaattaattttcaaacagaaaatagttatgtacttcataggcatgcacgtgatgga
gatgtagttataatgaatagacaacctacattacataaattttctattatggctcattat
ttaaaaatatttgagaaagaaaaggtttttagattaaattatgttaattgtagttcttat
aatgcagattttgatggtgatgaaatgaatttacatttattacaaacaccattagcaaga
gctgaagcaactcatttaatgaattgtgattttttatttacaagttttaaagatggatct
cctcttagaggtttagctcaggattttattcttggtggtttacatttgacatctttagaa
acatttttgaattatgatgaatattgtaatttattgcagtgttcattgaactctttgata
tctcaaaaaaattcattttttattaaaaaaaggaaaaataacagcatcaacacgaacaat
aataataataataataataataataataataattgtaggagtagtagtagtagtagtgtt
atgaaaaatatgaagaattcacaatatgatattaataataatgagagtaattctgattgt
aataaaaagatgagtattataaaaacaaaccaatctattgaagataatgggaaaatatta
agtggtgtatcaactgatgaaggaagaaataattctatatatgatttacaaataaataat
ttaatgaaaccacaagatatagatattttaaaagaaacaaataatgttgaacaatttaat
ggtaatgttttaaaaataacgaattataattatctagatccatatgctattatattaaac
agaacaaattttactattattacagaagaaccagcaattttatatccaaaaaaattatgg
acaggaaaacaattaataacaagtattttaaaaacagtaattgataaggttgctatagag
acatataataaatataatgataatgaatttatgaatacatataaaggaattaattatata
gctaaagcaaaaacatcaccagatttatggtcctttgatccattgaaagaaaatgaagtt
attataaaaaattcagaattactacaaggagtattagataaattacattttggtgccagt
tcaaatagtttagttcatttatgtcatgaattatttggacccaaaactagtgctgttatg
ttagattgttttggaagattatttataaattttttacaacttcgagggactagtttaagt
ttatatgattttatattgaataaaaatgcaaagaaagaaaaacgtcttattaaaaaaaga
atatcttttactggtttttatttacaaaatttatttgtttattctatagcaaattctgta
aatgctgatattactgatatgaattcttatacaaaaaaaaaaatgaatacagggaatcaa
agaaaaaaattaatacttaataaaatgtatgatttatatgaaaaacaaaatgaacttata
aataataattttattgagaaacaaaatgatataaacaaaatgaaaacaaaacatttaaaa
aatgatagtgatataattattaaagatgataatgttttatctatatcagaaaattcttat
ttatttgccttgttaaataaagaattacaaaatattatattccacatattaaatgaaata
caattttgtgatgataaggtttcttcattaaataaagacaaaaacaaaaataaaatttcc
aacatttctaataaatataataaacatgataatgttgttaatctagatcatgaaacaaat
tctaattcttctttatactcatgtgttcaatatgttcttaataaagatctttttaatata
tatgaaaaatatttaaatggaaaaaatgaagaagcaaataaacatatattttataataat
tctcaaatagaggaaacaaataatcatttcttaaattctataacaaacaaattatataaa
gctttaaaagaacctacattttttaattccactagttttactataaaaaaaattacaaag
attattgaaaaagtacttacctttttgaaagcagctagatgtaacaagagattgaaaatt
tatattatatttgaattatttcaaaataaaaatattatgaaatatttcccctctttagtt
acttatataaatagttttgattatgatgtaagtaatgaccaaattattaaaaatgttata
aataatatatattttaaagaagaagatgaatcacacttatcatctataaataatatgaat
gtgcaagataattgtaataaagatctaaaaattaaatgtgaacaacaaaataatgaattt
ggagataacgaaaaaataaaaaagaaaagaaaatttggtgaagaaaaaagcattcaagag
ataaaaaaatataagttgaaaaaatttcttcatttttatggtgaattacataaaaaatgg
aattatgaaggaggatataatattgacgagaaggatattatgaatacccataatgataat
aatagtgataataataataatagtgataattataatgataataatcataatagtgataat
tataatgataataataatttatttaaaagaagtgctgttaaaaatgaaataatgacaaat
ataaatcctacaagtaatgatgtatatgatgaaaagattataagaaattgtttagtgtca
agtttaccttcttttactttaaatgatgaaataactaatttatcatataatggaaaacat
caatattatgaagattatttatgttctaaaaaaaaagatgaagaagatttaaattttaaa
tattataatatggatgatgtattttataaaatggaatatttaatacataattatttttat
ttaaaaagatgtgattttgataatttaattgattcattatttcaaccttatttatgtcga
gtatcttctggaacaaataatttaattaatatgaataatttaatgaataaatttttaaat
aatggttttagtaatatgatttttacaggtgctaaaggtagtaaagttaattattctatg
atttgtggtatgttagatcaacaatatttagaaggtaaacgagtacctagaatgagatct
ggaaagacattaccaagttttcatagatatgattatggagctcgatcatgtggtttaatt
actgattgttttttagaaggtttaagaccacaagaatatttttttcattgtatgtctgga
agagaaggtttaatagatacagctgtgaaaactgccaaatcaggttatattcaaagatgt
ttaattaaatgtatggaatcagttatattacattatgatgggactgtaagaaatgaagat
aattccattattcaatttttatatggtgaagatggtattgatccatcaaaaactgcatat
ttagatttatcaaaagatttattacataattatcatttatcatttagtaaatatttaaat
aataatattcatagtaaaatattgaataatcaagaattatttttaaaacatgaaaaagat
aataatatagaaaataatgaagaaccattaattagtaaatataatccatatacatatatt
ggtagtgtatcagataaattcaataataaattaaataatacattattatggaatgattta
aattttacagaatatgaaaaattaccaataaattttgatacattatcatcatctctttta
aaatcaaaatattataattctttatgtaatccaggtgaatctataggtatattagtagct
caatcatttggtgagccagctacacaaatgacattgaatacttttcatttagctggtaca
gaaaatgttactatgggtattccaagattaaaagaaatttttttaacatcaaaattgact
tctaaacctatgatttatgttcctataaaattacaagttgataatttaaaaaatgatcct
aataaaatgaaaaattatattacaaatattgcagataaaatcttaagtagttatcaaagt
atttttttaacagatgttatttatggtattggtgttgataggaaaattatattaaaagaa
aatcaaaatgaacaaaaacatactattaatttatcagatattatgaataatgaaaatata
ataaataataataatgaacaacaaatgaatacagataatactgagctaaccaaaattaat
aatgttttaaaaaattgtaatattaattttgatatgaaaaaagaatggaattatgaaatt
attattcaatttgaaaatttatatcatttctgtaatattaataaacatctaacaatatca
tttatactttataaagtagtaaatgccttattaaattccgtcttaaataaggttcatgaa
acttttgtatttcataatttaataaacattaattctttaaatcatgaatattatgatgag
ttatatgacttcataagtaaaaaaatgtcagaagaatttaattttaatatggataaatat
gaatataaagatgatgaagatcaaataaatgctaagttaaaatttatggcaaaagaaaat
gaacgttatgaatccaaaagaggagcaaataataatatatcaggtgaatatcaaaatgct
tcacataatatgcctagccatatggaagatgattctcccacgaaatcttataatgatatt
tcaaataaagaaaatatgtctgcttatgaccttgaaaaaggaaatgatggggatcgtgac
cacgatgatatgtctgatatcgagttgaaggataattctgaaaaaaattccaacagtgat
caagcttcaaaaaacggtgatagtgatactgaagaggaggaagaagatgatggattaaag
tcagagaaggataaagaagaggatgaaaaggaatatgacgaggagggagaaagtgacaca
agtagtaagattgatagtgataataatagtgataataatattgatagtgataataatagt
gatagtgataataatagtgataataacaatgatagtgataataatagtgaattacaaatg
atgaggtccaataaaaaagaaattatagatataaataataaagataaatgtttgactaat
agaaattctagtaatgaatcaaaaatatcagaatgctccaatacacgaggaagtactgta
aattatttttcatcagaaactagtgctacacatcatatattaatagatgaagaaacatca
gatatttttcatagtttgaaagataaaaaaataaataatactaaattaaataatattaat
gataataaaaatatgtcatcaacgacggtttcatcttctttatcatcatcatcattatca
acaccattaaataaaaaaaataatgaatatgatgaacatataaatgatattcattttata
gaaaaaaataaatttgaagaagaaatggataataaagaagaatatattactaaatcattt
acaaaattatcatatgattataaaaataatattaatttaataatatcgtcagatgatgat
gaagaaaatattgaacaaaatgaagaaggacaaaaaataaaaaaaaatgaacaaagatat
gttaaaaatattattgataaaataaaaagtagtttactttgttttattaaaaatatacat
ttctcacctgtaacatggatattaaaattagatataggatgggatattaatttttttcca
tatcctatcgatttcttaaatcatataaaatcagaaataaataaagaagttttattcaaa
gtaaaagatttaaataatccaaaaattttaaagggtaaagatattactcatagtggagca
gaatatgaattacaaattgaaggaaaaaatatttataaattgtataatattaaagataaa
tatatcgataaaacaaaattatattgtaatgatatttatgctattgttaaaacatatggt
atcgaagcaggaagattatgtataactaaggaattaaaaaaagttttcgatgcttatgga
atacaaattgattttaggcatttgtcatttataagtgatttcatgacacatacaggcgat
ttaaaagcttttaacagacacggcttgggatatttccgtaatgtttttcataaaatgagt
tttgaatgtgctacgaactttttaatacaaggatgtatacacaattcaattgattactta
tcaacggcatcaagtagcttattttttggtaaacatataaaagtaggtacaaatttagcg
gatattgtaacatgcatagataaataa

DBGET integrated database retrieval system