Plasmodium sp. gorilla clade G2: 39740455
Help
Entry
39740455 CDS
T10353
Symbol
PADL01_0514000
Name
(RefSeq) RNA-binding protein, putative
KO
K27398
pre-mRNA-splicing factor CWC2
Organism
plag Plasmodium sp. gorilla clade G2
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
plag00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03041 Spliceosome [BR:
plag03041
]
39740455 (PADL01_0514000)
Spliceosome [BR:
plag03041
]
Complex B
Other components
Prp19-related factors
39740455 (PADL01_0514000)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Torus
RRM_1
zf-CCCH_4
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
39740455
NCBI-ProteinID:
XP_028536994
PlasmoDB:
PADL01_0514000
LinkDB
All DBs
Position
5:complement(535436..537835)
Genome browser
AA seq
799 aa
AA seq
DB search
MSLKRFFNFLDDDNKTKKKINTNKNEVDDDKIINDETKYKEEDEQEKGEHEKEAELQKEE
KKGGKRRGRKKQTDDKKNDHNDESENHKIDQESQPALNQIEEEKKDNDNKKKRGRKSKKD
IDINKGDINKNDINKGDTNKDDINKGDTNNDDVKNNISNNKEKTDDDNNLNNNIKDKENN
NEDNNLNNNIKDKENNSDDKNLNNNIKDKENNSEDNNLNNNIKDKENNNEDKNCKKIHSP
NQILSNTPPPPIGNPPTGIQNISHNLPPVPPNLPPPPIPPTPPSPPAPPGQLHQSNYPSQ
YYNMYNNMSVENYMGYPYYYSQYYNVAPHQSTSISIDPNKDKQLNNNNNSNSNNNNNINN
VVDGGRVKNDLLSTTNNYDKDINTDENNKNMSIYGNNISNYYMNNPINNYYNMYNYNYMT
GMNNVNTINPMTYNYYYDGIGMYDNNKMVDENVFNYCSILDKSIELMKKSDKVKEILKTP
ARLQITQEELNKIEYTEGNEQYNIWFGKYVTDRYDKSVKGSSTPRFVAKYKCNPTKDSGY
TKADKSYTSKQYFCIYFARGCCAYGHNCLYKHRIPNENDELEFEASVDIFGREKFNTFKD
DMTGVGSFNNDCRTLFIGSIFINNINQVPIIEKILYEEFLPFGNIEYVRYIPNKNIAFIQ
FTNRVNAEFAKIAMSDQPIENYSTALTIKWAFEFKNQTHNVIQYYNNPYIYGNTNQVISS
TWENYIMQQQYGNHPMYTNMNHMYNNTNIYPIDNNNINSNSNSALANASLSEHQKKINDR
SANLNNSLNKIDQMFDIQN
NT seq
2400 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagcttgaaaaggttttttaattttctagacgatgataataaaacaaaaaagaaaatt
aacactaataagaatgaagtcgatgacgataaaataattaacgatgaaacaaaatataag
gaggaagatgaacaagaaaaaggagaacacgagaaagaagcagaattgcaaaaggaggaa
aaaaaaggtggaaaaagaagaggtcgaaaaaaacaaacagatgacaaaaaaaatgatcat
aatgatgaaagtgaaaatcataaaattgatcaagaatctcaaccagcattaaaccaaata
gaagaagaaaaaaaagataacgataataaaaaaaaaagaggaagaaaaagtaaaaaggat
attgatataaataaaggtgatataaataagaatgatataaataaaggtgataccaataaa
gatgatataaataaaggtgataccaataatgatgatgtaaaaaataatatttcaaataat
aaagaaaaaacagatgatgataacaatttaaataataatataaaggataaagaaaataat
aatgaagataacaatttaaataataatataaaggataaagaaaataatagtgatgataaa
aatttaaataataatataaaggataaagaaaataatagtgaggataacaatttaaataat
aatataaaagataaagaaaataataatgaggataaaaattgtaaaaaaatccattctcct
aatcaaatattatcaaatacacctcctccacctattggaaaccctccaacaggtatacaa
aatatttcacataatttgccacctgtgcccccaaatttaccacctcctcctatacctcct
acacctccttctcctcctgctcctccaggacaactacatcaatcaaattatccttctcaa
tattataatatgtataataatatgagtgttgaaaattatatggggtatccatactactat
agtcaatattataacgtggctcctcatcagagcacttccataagcatcgatccaaataaa
gataaacaacttaataataataataatagtaatagtaataataataataatatcaataat
gtggttgatggtggtagggtaaaaaacgatttgttgtcgacaacaaataattacgataaa
gatataaatacagatgaaaataataagaatatgtcaatatatggaaataacatttcaaat
tattatatgaataatcctataaataattactataatatgtataattataattatatgact
ggaatgaataatgtaaatactataaatccaatgacatataattattattatgatggtata
ggtatgtatgacaataacaaaatggtagatgaaaatgtttttaattattgttctatatta
gataaaagtatagaattaatgaaaaaaagtgataaggttaaagagatattaaaaacacca
gcacgtttacaaataacacaagaagaattaaataaaatagaatatacagaaggtaatgaa
caatataatatatggtttggaaaatatgtaactgatagatatgataaaagtgtcaagggt
agtagtactccaagatttgtagcaaaatataaatgtaatccaacaaaagattcaggatat
accaaggcagataaatcatatacaagtaaacaatatttttgtatatattttgcaagagga
tgttgtgcatatggtcataactgtttatataaacatagaataccaaatgaaaatgatgaa
cttgaatttgaagcttctgtagatatttttggtagagaaaaatttaatacatttaaagat
gatatgacaggagtaggatcatttaataatgattgtagaacattatttataggaagtata
tttattaataatataaatcaagtacctattattgaaaaaattttatatgaagaattttta
ccattcggaaatatagaatatgtaagatatatacctaataaaaatatagcctttattcaa
tttactaatagagtaaatgctgaatttgctaaaatagctatgtcagatcaacctatagaa
aattattcaacagctttaactataaaatgggcatttgaatttaaaaaccaaacacataat
gtaatacaatattataataatccatatatatatggaaatacaaatcaagttatatcttca
acatgggaaaattatatcatgcaacaacaatatggtaatcatccaatgtatacaaatatg
aatcatatgtataataatacaaatatatatcccatagataataataatattaatagtaat
agcaatagtgctcttgcaaatgcctctttatctgaacaccaaaagaagatcaacgacaga
tcagcaaatttgaataacagcttaaataaaatcgatcaaatgttcgacatacaaaattaa
DBGET
integrated database retrieval system