Plasmodium adleri: 39740553
Help
Entry
39740553 CDS
T10353
Symbol
PADL01_0523800
Name
(RefSeq) ubiquitin fusion degradation protein UFD1, putative
KO
K14016
ubiquitin fusion degradation protein 1
Organism
plag Plasmodium adleri
Pathway
plag04141
Protein processing in endoplasmic reticulum
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
plag00001
]
09120 Genetic Information Processing
09123 Folding, sorting and degradation
04141 Protein processing in endoplasmic reticulum
39740553 (PADL01_0523800)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03009 Ribosome biogenesis [BR:
plag03009
]
39740553 (PADL01_0523800)
Ribosome biogenesis [BR:
plag03009
]
Eukaryotic type
Pre-60S particles
Ribosome quality control proteins
39740553 (PADL01_0523800)
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
UFD1_N2
UFD1_N1
TRAFD1-XIAF1_ZnF
Znf_XAF1_N
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
39740553
NCBI-ProteinID:
XP_028537092
PlasmoDB:
PADL01_0523800
LinkDB
All DBs
Position
5:complement(<921906..>924677)
Genome browser
AA seq
710 aa
AA seq
DB search
MDDDFVRALNKFNSKFCFSNKKNSLNEVLQNKKNDKGEDINCNKLKKDLELQYIHSSNNK
ICQKFLTLPLNKKSDKLKDHSDKVILPVSILKTLEKGNYKNEVEFPYTFSIKNVQNNYIT
HACVLEFSSNEGIIFVSDNIKQNLGLDKPQSSSIARVLITYCILSKCDFIKLDSLNDNIN
DIKYMKNLLENELSLNYSTLTLGDYIHINHLKFYISELEPDNAVSLINTDINVDICERTN
IDEYKNVKTIGDHKDIYEIIKIDIPINNTIQKGMNKYKFIINNNILDLLKKGKIELVINL
ESTMKLNCLNLFISFSPLDSVSEVIHHLYIDDCNTDPIVINREIIKSILKIHFSCLMKDE
QCNTNNDNHDNNHDDYKDVHNTYNSTSSDHLENDKIEIQNYDDSFLEYIFEHFFPHIIYI
GVHNYMDTLVEYNICLKLNEEKNMNTKKDDNNNKCVNGPLFINNNNINLLRNISMITPDR
ENIKSDDEYIRCDNCLKDILKYNIHMHKIHCIKNFIVCNICKKVLKKNEKENHIHCDICN
EGLYLNEKEKHEFIWHTQIKCVCNKILYRKQFIFHQNLFCPKKIIYCTYCNIFTQSNINI
YNEEFILATFFDIYDNVKTNNTTINKSIKYYYNILFTYFHFFFKYIKNTEHEKYCGSKSI
NCTICKKIIYRNHYLLHLNTIHHFNKTESFKIINENVDYSQLMNDTKHKS
NT seq
2133 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggatgatgactttgttagagctcttaataaattcaattccaaattttgtttcagtaat
aaaaaaaattcactgaatgaagttcttcagaacaaaaagaatgataaaggagaggatata
aattgtaataaattaaaaaaggatttagaattacaatatattcatagttctaataataaa
atatgtcagaaatttttaactctaccactaaacaaaaaatcggataaactaaaagaccac
tcagataaagttatactaccagtgtctattctgaaaaccttagaaaaaggcaactacaag
aatgaagtagaatttccatatacatttagtattaagaacgtacaaaataattatattaca
catgcatgtgttttagaatttagttcgaatgaaggaataatctttgtttcagataatata
aaacaaaatctaggattagataaacctcaaagtagtagtatagcgcgtgttttaataaca
tattgtatactatctaaatgtgattttataaaattagattctttaaacgataatattaat
gatataaaatatatgaaaaatttattagaaaatgaattaagtctaaattatagtacttta
actttaggagattatatacatattaatcatcttaaattttatataagtgaactagaacct
gataatgctgtttctttaataaatacagatattaatgttgatatatgcgaaagaacaaat
attgatgaatataaaaatgttaaaactattggcgatcataaagatatatatgaaattatt
aaaattgatatacctataaataatactattcagaaaggtatgaataaatataaatttatt
attaataataatatattagatttattgaaaaaaggtaaaattgaactagttattaattta
gaatcaactatgaagttgaattgtttaaatttatttatatcattttcacctctagattca
gtatcagaagtcattcatcatttatatattgatgattgtaatactgatccaattgtaata
aatagagagatcatcaaaagtattttaaaaatacacttttcctgtttaatgaaagacgaa
caatgtaatacaaataatgataatcatgataataatcatgatgattataaagatgtgcat
aatacatacaatagtacctctagtgatcatcttgagaatgataaaatagaaatacaaaat
tatgatgattcctttttagaatacatatttgaacatttcttcccacatataatatatata
ggcgtacataattacatggatacacttgtagaatataatatatgcttaaaattaaatgaa
gaaaaaaatatgaatacaaaaaaggatgacaataacaataaatgtgttaatggaccatta
tttattaataataataatattaatttgttgagaaatataagtatgatcacaccagataga
gaaaatataaagagtgatgatgaatatattagatgtgataattgtcttaaagatatatta
aaatataatatacatatgcataaaattcattgtataaagaatttcattgtgtgtaatata
tgtaaaaaagtgttaaaaaaaaatgagaaagaaaatcatatacattgtgatatatgtaat
gaaggattatatttaaatgaaaaagaaaaacatgaatttatatggcatactcaaataaaa
tgtgtatgtaataaaattttatatcgtaaacaatttatttttcatcaaaatttattttgt
ccaaaaaaaattatatattgtacttattgtaatatttttactcaatcaaatattaatata
tataatgaagaatttattttagctaccttttttgatatatatgataatgtcaaaacaaat
aatactacaataaataaatctatcaaatattattacaatatattatttacatattttcat
ttcttttttaaatatattaaaaatacagaacatgaaaagtattgtggatcaaaatctatt
aactgtactatttgtaaaaaaattatttatagaaatcattaccttttacatttaaataca
attcatcattttaataaaacggagtcctttaaaattataaatgaaaacgttgattatagc
caattaatgaatgacacaaaacataaatcataa
DBGET
integrated database retrieval system