Plasmodium sp. gorilla clade G2: 39740726
Help
Entry
39740726 CDS
T10353
Symbol
PADL01_0609100
Name
(RefSeq) transcription elongation factor SPT5, putative
KO
K15172
transcription elongation factor SPT5
Organism
plag Plasmodium sp. gorilla clade G2
Pathway
plag03250
Viral life cycle - HIV-1
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
plag00001
]
09120 Genetic Information Processing
09125 Information processing in viruses
03250 Viral life cycle - HIV-1
39740726 (PADL01_0609100)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03021 Transcription machinery [BR:
plag03021
]
39740726 (PADL01_0609100)
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
plag03019
]
39740726 (PADL01_0609100)
Transcription machinery [BR:
plag03021
]
Eukaryotic type
RNA polymerase II system
Other transcription-related factors
Transcription elongation factors
39740726 (PADL01_0609100)
RNA polymerase I system
39740726 (PADL01_0609100)
Messenger RNA biogenesis [BR:
plag03019
]
Eukaryotic type
mRNA processing factors
3' end processing
DRB sensitivity inducing factor (DSIF) complex
39740726 (PADL01_0609100)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Spt5-NGN
KOW
KOW4_SPT5
KOW2_Spt5
KOWx_SPT5
KOW5_SPT5
SH3_KIN17_C
NADH_Oxid_Nqo15
DUF6897
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
39740726
NCBI-ProteinID:
XP_028537257
PlasmoDB:
PADL01_0609100
UniProt:
A0A2P9BV98
LinkDB
All DBs
Position
6:complement(365291..369118)
Genome browser
AA seq
1275 aa
AA seq
DB search
MTENEKEQNFTKSIFSDDESDIDKENVKNKKRKNDDNKQHNEDSNDDISESNVKKLEISR
KRKKISNTKININTNKEGQEDNEHNHFDDNDEEEEHEEEEEEAGEEIEGREEEGDGDGDG
DGDGDDDDDDDEDDEDDEEGEEEDYEDENLLYDNSSYNNNKDVNESGSKKRRTGKNKYLS
TFLDTEAQVGDDDEEEEYESSYIDEFEEAKRLEKKKLYEQKLKSGTNHLAQAINKLSKRY
ENEKEVKEDDILTEGETLTDGEILVDDYSDERRERIQTIDSPKMWLIKLFKNNVERNLAI
GIYHKYMKLKDNDFNIKGIYVSDNLKGYIYIEADSLYMLKKFLLGFKFINLNEISIVPIQ
ELTSIFTMCHSKINIPKVNEYVRIKRGLYLNDIGQIYEIHEKGIYAIVRLIPRITYEHFM
NAKKNKYYNQKSSLNKLTSIIDKNNKSNSYYFNDKLDMNRSSNFSKYPNDDMLLNGDMTN
DYMSNDYMSNEYASNGYVSNGYASNEYLSYAYASNEEMGNDYMNDDYLINGNDEESLKKK
NKQKKAKDYLDEALQLRKKKKERPFQKLFDRDEIERIGGVIETGPYPRTIKYQNNIFEEN
GYILKKMNIKYLITENANITLTEIREFNKNNGVTGEKASLGITKSFINKNSLHLFKKDER
VKILKGELCNLIGTITAVNDNVLTINPDNLAKQFKFLPTDVTKYFIEGDNVTVINGLHKG
KSGLISLIDYKENVALIFSPALNTELRCSIQDLSLSINNSEGLGGVHTLNGFSVGDLIEL
NDRQIGVITYIDKNKHIRVLTNNNTTLHTTISSITSKRSAVGQVGRDENNNILQSKDNIQ
IVRGAHRNKIAVIMYIWKNKIFGKINKKIEDNGFVVLECQNCSLVGNPMEKKKIMTNNNL
FRSNTNYIRRNNNFNSFIGKTVKILTGVYKGLLADVIDAERDEFTLLLKIKPKTVRQKRI
ECAISDSYKDQNVHEENDEIEIQNKNKLKPLQMFQLSDQKKNKFNDSFYNPREKKSFDKI
PPKNFSIDSTNNHRNYYNYGDKWSYANNNNNNNMNANVYTSPYKYNHNDRHNHHDNKYNH
HENRYNHHDNKYNNNHYEEDYIKKKHSTNNFRDSTYNLKHEEHKNYVTPIGEENKKNYNK
HETKKEYNNNIIPNKINNNDQKEESHIWLHIDIMVKVITPGPFYNEIGKIIDVIKKNAYT
ILKIQTDKTTFNIVSDAVVPLKPQKKNDHILIFDKGEEIEGTVQDIKINEVQANTTSGIF
TCHLKNTFLYKNYIP
NT seq
3828 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgactgagaatgaaaaagaacaaaatttcactaaaagcatttttagtgacgacgaaagt
gatattgacaaagaaaatgttaaaaataaaaaaagaaaaaacgatgataataaacaacat
aatgaggatagtaatgatgatataagtgaatctaatgtaaaaaaattagaaatatcaagg
aaaagaaaaaaaataagtaatacaaaaataaatataaatacaaataaggaagggcaagaa
gataatgaacataaccattttgatgataatgatgaggaggaggaacatgaagaagaagaa
gaagaagctggtgaagaaattgaaggacgtgaagaagaaggtgatggtgatggtgatggt
gatggtgatggtgatgacgatgatgatgatgatgaagatgatgaagatgacgaggagggc
gaagaagaagattatgaagatgaaaatttattatacgataatagtagttataataataat
aaagatgtgaatgaaagtggatcaaaaaaaagaagaacagggaaaaataaatatttatca
acctttttagatacagaagcacaagttggagatgatgatgaagaagaagaatatgaaagt
tcatacattgatgaatttgaagaagctaaaagattagaaaagaaaaaattatatgaacaa
aaattaaaaagtggaacaaatcatttagcacaagcaattaataaattatctaaaagatat
gaaaatgaaaaagaagttaaagaagatgatatattaacagaaggagaaacattaacagat
ggtgaaatattagtagatgattattctgatgaaagaagagaacgaatacaaacaattgac
agtccgaaaatgtggttaataaaattatttaaaaataatgtagaaagaaatttagctata
ggaatttatcataaatatatgaaattaaaagataatgattttaatattaaaggtatatat
gtatctgataatttaaaaggttatatatatatagaagcagatagtttatatatgttaaaa
aaatttttattaggattcaaatttattaatcttaatgaaatatctattgtgccaatacaa
gaattgacttctatatttactatgtgtcattcaaaaattaatataccaaaagttaatgaa
tatgttagaataaaaagaggattatatttaaatgatattggacaaatatatgaaattcat
gaaaaaggtatatatgctattgttcgattaataccacgaattacatatgaacattttatg
aatgcaaaaaaaaataaatattataatcagaaatcatctttaaataaattaacatctata
attgataaaaataataaaagtaattcttattattttaatgataaattagatatgaataga
agttctaatttttcaaaatatccaaatgatgatatgttattaaatggagatatgacaaat
gattatatgtcaaatgattatatgtcaaatgaatatgcatcaaatgggtatgtatcaaat
ggatatgcttccaatgaatatttatcttatgcttatgcatctaatgaagaaatgggaaat
gattatatgaatgacgattatttaataaatggaaatgatgaagaaagtttaaaaaaaaaa
aacaaacaaaaaaaagcaaaagattatttagatgaagcattacaattaagaaagaaaaaa
aaagaaagaccatttcaaaaattatttgatagagatgaaattgaacgtattggtggtgtt
attgaaacgggtccttatccaagaactattaaatatcaaaataatatttttgaagaaaat
ggttatatattaaaaaaaatgaatattaaatatcttattacagaaaatgcaaatatcact
ttaaccgaaataagagaatttaataaaaataatggtgtgacaggtgaaaaagctagttta
ggtattaccaaatcttttataaataaaaattctctacatttatttaaaaaagatgaaaga
gtcaaaattttaaaaggagaattatgtaatttaataggtaccataactgcagttaatgat
aatgttttaactataaatcctgataatttagcaaaacaatttaaattcttacctactgat
gtaaccaaatattttattgaaggagataatgtaacagttattaatggtttacataaagga
aaaagtggcttaatttcacttatagattataaagaaaatgttgcactcatattttctcca
gctttaaatactgaattaagatgttctatacaagatttatctctatctattaataatagt
gaaggtttaggaggagtgcatactctgaatggattttcagtaggtgatttaattgagtta
aatgatagacagataggtgtcataacatatattgataagaataaacatatacgtgtatta
acaaataataatacaacattacatacaaccataagttctataacatcaaaacgttcagct
gtaggacaagtaggaagagatgaaaataataatatacttcaatcaaaagataatatacaa
atagtacgtggggcacatagaaacaaaatagcagtaattatgtatatatggaaaaataaa
atttttggtaaaataaataaaaaaattgaagataatggttttgttgttttagaatgtcaa
aattgttctttagtaggaaatccaatggaaaaaaaaaaaattatgacaaataataatttg
tttagaagtaatacaaattatataagaagaaataataatttcaattcttttattgggaaa
acagtaaaaatattaacaggtgtatataaaggcttattagcagatgttatagatgctgaa
agagatgaatttacattattattaaaaattaaacctaaaactgtaagacaaaaaagaata
gaatgtgctatatcagattcatataaagatcaaaatgtacatgaagaaaatgatgaaatc
gaaatacaaaataaaaataaattaaaaccattacaaatgtttcaattgtcagatcaaaaa
aaaaataaattcaatgattctttttataatccaagagaaaaaaaaagttttgataaaata
cctcctaaaaatttttcaatagatagtacaaataatcatagaaattattataattatgga
gataaatggagttatgcaaataataataataataataatatgaatgcaaatgtatataca
tctccttataagtataatcataatgataggcataatcatcatgataataaatataatcat
catgagaatagatataaccatcatgataataaatataataataatcattatgaagaggat
tatattaagaaaaaacatagcaccaataattttagggattcaacatataatttaaaacac
gaagagcataaaaattatgtaacccctattggtgaagaaaataaaaagaattataataaa
cacgaaacgaaaaaagaatataataataatataataccaaataaaataaataacaatgat
caaaaagaagaaagtcatatatggttacatatagatattatggtaaaggtcataacacca
ggaccattttataatgaaataggtaaaattattgatgttataaaaaaaaatgcatatact
attttaaaaatacaaactgataaaacaacatttaatatagtatccgatgcagtcgttcct
ttaaaacctcagaaaaaaaatgatcatattttgatttttgataaaggagaggaaattgaa
ggaacagttcaagatattaaaattaatgaggttcaggctaatactacttctggaatcttt
acatgtcatttaaaaaatacttttttatataaaaattatataccataa
DBGET
integrated database retrieval system
