Plasmodium sp. gorilla clade G2: 39743780
Help
Entry
39743780 CDS
T10353
Symbol
PADL01_1353400
Name
(RefSeq) large subunit rRNA methyltransferase, putative
KO
K14857
AdoMet-dependent rRNA methyltransferase SPB1 [EC:2.1.1.-]
Organism
plag Plasmodium sp. gorilla clade G2
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
plag00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03009 Ribosome biogenesis [BR:
plag03009
]
39743780 (PADL01_1353400)
Ribosome biogenesis [BR:
plag03009
]
Eukaryotic type
Pre-60S particles
Other pre-60S particles
39743780 (PADL01_1353400)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
FtsJ
Spb1_C
DUF3381
DUF1616
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
39743780
NCBI-ProteinID:
XP_028540211
PlasmoDB:
PADL01_1353400
UniProt:
A0A2P9CC03
LinkDB
All DBs
Position
13:complement(2033452..2036662)
Genome browser
AA seq
1028 aa
AA seq
DB search
MGKKKKVGKERIDKYYKLAKTAGYRARSAFKLIQIAQRFNIFKNANILIDLCAAPGGWLQ
VAYKNMSKQSTIIGVDLVPIRKIDDNVITIKSDITTSDCIKKIKNIIKMDKADVILNDGA
PNVGTTYSYDSFNQNVLVLNSIKIAYIFLKKKGIFITKVFRNEEYISLIWVLEKLFGDVK
HMKPRSSREISSEIYLVGLNFLGKKVDKKLFDYTYIFSEQFKKDSNKVSILETPQESYFD
NNENDFSDDESNDDKKAGEKIDKKKKKGLSTILKEKKKKNRQGYDIGDDYRATDICTFIK
SDNYVDLLIKNNKFTFDKNYKNSTDPMVKTIYECIHNNECTTKEIFLLCNDLKVLGKSDL
YHLIKWRYKIKKSVQNETAKKKNNLDSDNHDEEQTMQEFSDMKDSSQIDDINTIVDKNLS
ENELDNTSDEATENDEKDQVDEIDEFSAYIEKKNKKEQKKKEKKLKKELEKKKKSNKGHQ
LDYDENEIHFNKDILKLLNKQKFEDHLKILNNTQKDDLEIENYDDTASETENVEHILQLK
NSNLDKLEYLVDLDYEKQKMKEKKLNEEKSNEKLTRRKRAMDFKNEELMKIQRMMELKNE
QLLMEKKLKEYLSDDDDDEDEDEDDDEDDDDDEDDDNDEDDKEKKQQQQKNKRDDHQYDN
TNLNNDNDVDSLETAQDIFKENKHIKSMVDKIIRLRRSVKNEEEKSNVKHFFDQNIFSNI
FSQLDEEDMNAEYESVIRNQKNVPKKDDSDNDSSISNDDNESIKELDENNLPKIPLPDKL
AKKEKKKKLKEKYGNNEVKMKNSSFSIVKTDENAQNLNNYFSNLVKDEDELAFIKCIGEK
LIHKKSRMDLIDDSFNRYSYMEDEANLPDWFLEEEKKYRRPVIPIDKKILDQYKGKINKI
TKMPIKKVIEAKMRNKKREITKMKKLEAKIGKIEKNEDDPFLKQKAITNLLKKNKSDKKR
DKSYVVCTGKGSKMTKKKKNKKGKTMVKYVDKRLKKDKKAKKRIEKKRNNKSRNKYSKSK
PFKFRKKF
NT seq
3087 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggggaagaaaaaaaaagtcggtaaggagagaattgataaatattacaagctagccaaa
acagcaggataccgtgctagatcggcttttaagttaattcaaatagctcaaaggtttaac
attttcaaaaatgcaaatatattgattgatttatgtgctgctcctggtgggtggttacaa
gtagcatataaaaacatgagtaaacaaagtactatcattggtgtggatttagtacctatt
agaaaaatagatgataacgttataacaataaagagtgatattacaacaagtgattgtatt
aagaaaataaagaatatcataaaaatggataaggcagatgttatattaaatgatggtgct
ccaaatgtaggtacaacatattcttatgatagttttaatcaaaatgtgttagttcttaat
agtattaaaatagcttatattttcttaaagaagaaaggtatatttattacaaaggttttt
cgaaatgaagagtacatatctttaatttgggttttagaaaaattatttggtgatgtaaaa
catatgaaaccaagaagtagtagagaaatatcgtctgaaatttatttagttggtcttaat
tttttaggtaaaaaggtagataaaaaattatttgactatacatatatttttagtgaacaa
tttaagaaggattcaaataaagtaagcatattggaaacaccacaagaatcttattttgat
aataatgaaaatgattttagtgatgatgaaagtaatgatgataaaaaggctggagaaaaa
attgacaaaaaaaagaaaaaaggactttctactattttaaaagaaaagaaaaaaaaaaat
agacaaggttatgatattggtgatgattatagagctacagatatatgtaccttcataaaa
agtgataattatgttgatttattaataaaaaataataaatttacatttgataaaaattac
aagaattctacagatcctatggttaaaactatatatgaatgtatacataataatgaatgt
acaacaaaagaaatatttctgctttgtaatgatttaaaagtattaggtaaatctgattta
tatcatttaatcaaatggagatataaaattaaaaagagcgttcaaaatgaaactgcaaaa
aaaaaaaataatttagatagtgataatcatgatgaggagcaaactatgcaagaattttcc
gatatgaaagactcctcacaaatagatgatatcaatacaattgttgataaaaatttatca
gagaatgaattagataatacttcagatgaagctacagaaaacgatgaaaaagatcaagtt
gatgaaatagatgaattttctgcatatattgaaaaaaaaaataaaaaagaacaaaaaaaa
aaagaaaaaaaattaaaaaaagaacttgaaaaaaaaaagaaaagtaataaaggtcatcaa
ttagattatgatgaaaatgaaatacattttaataaggatatacttaaattgcttaataaa
caaaaatttgaagatcatctaaaaattttaaataatacccagaaggatgatctagaaatt
gaaaattatgacgatacggcaagtgaaacagaaaacgttgaacatatattacagctaaaa
aactcaaatttagacaaattagaatatttggtagatttagattatgaaaaacaaaaaatg
aaagaaaaaaagttaaacgaagaaaagagtaatgaaaaattgaccagaaggaaaagagcc
atggactttaagaatgaagaacttatgaaaatacaaagaatgatggaattgaaaaatgaa
caactgttgatggaaaaaaaacttaaggaatatttaagcgatgatgacgatgatgaggat
gaagatgaggatgacgatgaggatgacgacgatgatgaagatgacgataatgacgaagat
gataaagaaaaaaaacaacaacaacaaaaaaataaacgtgatgatcaccaatatgataat
acaaatttgaacaatgataacgatgttgattctttagaaactgctcaagatatattcaaa
gaaaataagcatatcaaaagcatggttgataaaattattcgtttaagaaggagtgttaaa
aatgaagaagaaaaatcaaatgttaagcatttctttgatcaaaatatattttccaatata
tttagtcaattagatgaagaagatatgaatgcagaatatgaaagtgttattagaaatcaa
aagaatgtaccaaagaaggatgattcagataatgatagttcaatttctaatgatgataat
gaaagcataaaagaattggatgaaaataatttaccgaaaatacctttaccggacaaacta
gccaaaaaagaaaaaaaaaaaaaattaaaagaaaaatatggaaataatgaagtaaaaatg
aaaaattcttccttctctatagtaaaaacagatgaaaatgcacaaaatcttaataattat
ttttctaatttagttaaggatgaagatgaactagcttttattaaatgtataggagaaaag
ttgattcataaaaaaagtagaatggatcttatagatgattcatttaatagatattcatat
atggaagatgaagctaatttacctgattggttcttggaagaagaaaaaaaatacagaaga
cctgttattccaattgataagaaaatattagatcaatataaaggaaaaattaataaaata
acaaaaatgcctattaaaaaagttattgaggcaaaaatgagaaataaaaaaagagaaata
acaaaaatgaaaaaacttgaagcgaaaattggaaaaattgaaaaaaatgaagatgatcca
ttccttaaacaaaaggctataacaaatttattgaagaaaaataaatcagataaaaaaaga
gataaatcttatgtcgtctgtactggaaaaggatccaaaatgacaaaaaagaaaaagaac
aaaaaaggtaaaactatggttaaatatgtagataaaagactaaaaaaagataaaaaggct
aaaaagagaatagagaaaaaaagaaacaataaatcaagaaataaatattctaaatcgaaa
ccatttaaatttagaaaaaaattttaa
DBGET
integrated database retrieval system
