Providencia lanzhouensis: ACIH2S_04095
Help
Entry
ACIH2S_04095 CDS
T11188
Name
(GenBank) Ig-like domain-containing protein
Organism
plaz Providencia lanzhouensis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Big_9
Cadherin_4
Cadherin_5
Big_13
HYR
Big_6
CshA_repeat
Big_1
Invasin_D3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
XTS07782
LinkDB
All DBs
Position
905333..911896
Genome browser
AA seq
2187 aa
AA seq
DB search
MSIKKISIKVNNSKETIEQYSVTGGENGAGQLKQPLHINAQKDVNYLLIDESTQFAPENI
AVKRVDKNLVIAFEGGDVESPDLIIENYFAENGAIGYQEGDANLIIGQYENGQYFPYVPE
SAVKADAISQLADGQAAGQAIGGDALPPLWAFNPWWLAALVPLIGIPAVAISGGGGGGGH
SKVVDHAPIAGDDSAHAKHNTPVTIHVTANDSDVDGDLNPNSIRIVKEGSKGTVTIGKDG
KIIYTPNKGEYGVDTITYVVKDRAGHESNVATITVKIDAAPEAKDDSAATKESKPVTIDM
ENNYSDKDGDVDHSSLAIKTNGGKGFAKFVNGKLVYQPNKGEVGTDTITYTVTDKNGNVS
EDATITINIDAPPVANDDSAKANKATPVELDVLDNDTDLDGDIDPTTLEVVGEPTKGTVK
VVDGKLVYTANPDATGQDTITYLVKDKNGNVSNKATVTIDITEPPVANEDKADTRHNTPV
EIDVTANDTDLDGDLDKNSVVITQPGTKGTVTIGEDGKLIYTPNPGATGTDTITYTVKDK
NGNVSNEATVTINIDAPPVAGNDVADTRHNTPVEIDITANDTDLNGDLDKNSVVITQPGS
KGTVTIGEDGKLIFTPNPGATGTDTITYTVKDKNGNVSNEATVTINIDAPPVAVDDTAAT
KESVPVTIDVLANDTDLDKDIDPSTLVIKTNGSKGTATIVDGKLVYTPHAGEVGTDTITY
TVTDKNGNVSNEATVTINIDAPPVAVDDTAATKESVPVTIDVLVNDTDLDKDIDPSTLVI
KTNGSKGTATIVDGKLVYTPNAGEVGTDTITYQVFDKNGNVSNEATVTINIDAPPVAVDD
TAATKESVPVTIDVLANDTDLDKDIDPSTLVIKTNGSKGTATIVDGKLVYTPHAGEVGTD
TITYQVFDKNGNVSNEATVTINIDAPPVANDDSAKANKATPVELDVLDNDTDLDGDIDPT
TLEVVGEPTKGTVKVVDGKLVYTANPDATGQDTITYLVKDKNGNVSNKATVTIDITEPPV
ANEDKADTRHNTPVEIDVTANDTDLDGDLDKNSVVITQPGTKGTVTIGEDGKLIYTPNPG
ATGTDTITYTVKDKNGNVSNEATVTINIDAPPVAGNDVADTRHNTPVEIDITANDTDLNG
DLDKNSVVITQPGSKGTVTIGEDGKLIFTPNPGATGTDTITYTVKDKNGNVSNEATVTIN
IDAPPVAVDDTAATKESVPVTIDVLANDTDLDKDIDPSTLVIKTNGSKGTATIVDGKLVY
TPNTGEVGTDTITYQVFDKNGNVSNEATVTINIDAPPVAVDDTAATKESVPVTIDVLAND
TDLDKDIDPSTLVIKTNGSKGTATIVDGKLVYTPNAGEVGTDTITYQVFDKNGNVSNEAT
VTVDIDAAPVAVDDSAKANKATPVEIDVLGNDTDLDNDIDPNTLAVVEQPSQGTVSIVNG
KLVYTPNADAKGTDTITYTVKDANGNVSNKATVTIVINEPPVAGDDHGQTKQGVPTIIDV
LINDKDPDGELDKSTLHIEKNGSKGTATFDADGKLIYTPKPGATGQDTITYTVKDKDGSI
SNTATVTIDITPTQTTPTEVFEKGLRTDGTAGDKSPVTVHGVIELSNPTDKPTTPSDIKI
IEPTTKLTSGGEPISWESTDNGFVGKTPNGKEVISVKVTDTPTADGSTKVNYEVNLKGLV
DHPAGKDSLNIDFGVKNGTDEVKTEIVVHDDKPEASNVELSVEPPVENTFYANLIISLDL
SSSMGRDDSGIQGGNTASGMKTRYDAALDSIDSVLSSYEERLNSANAGEVRVSINGFAKQ
ASAIGGAPGYPMDQPYWCTISEAKQIIEGLRGAQTLRPDWHVIGVDTNYDAALQQVISIF
QKTSSSGMEPIDAKDINGKLDNTLFVITDGIPNYGNQSNSQDPVAGNGIAPTSPNGFVPG
SPNTDIGEDSWKAFLTEKGIRSVAIGIGQDMLNSVGGKTGEEFIQPIAFDGQKGQNNDAN
DVIVLKDMSSLGNILSKYVPNENTIESSFSKANDGKETLSFGADGMKSISIEVDGHTYKY
DPKTKGITSDNLDKSMWVDFGQGELAVKTDAGGLLSISLGEKNFGHLTYRPGATRPTGME
KETFTLTLTDNDGTNGKSSISVDISKLKESGNTGLNDTDLTALKLFSPESAMELHGVDTD
VNATSSHSTGFMNSSLDALQETQSAII
NT seq
6564 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtctattaaaaaaatatcaattaaagttaataatagcaaagagacgattgagcaatat
tctgttactggtggggaaaacggtgcaggacaattaaaacaaccactgcatattaatgca
caaaaagatgtaaattatttattaattgatgaaagtacacaattcgcaccagaaaacatt
gcggttaagcgtgttgataaaaatcttgtcatcgcatttgaaggcggcgatgtagaaagt
cctgatttaattatcgaaaattactttgctgagaatggcgccattggttatcaagaaggc
gatgcaaacctcattattggtcaatatgaaaatggccaatacttcccatacgttccggaa
agtgcagtaaaagcagatgcaatcagccagttagctgacggtcaagcggctggacaagct
attggtggcgatgcattacctccattgtgggcatttaacccatggtggttagctgcactg
gttcctcttattggtattcctgctgtggcaatcagtggcggcggtggtggtggcggtcac
tctaaagttgtcgaccatgcacctatcgcgggtgatgactctgcacatgcaaaacataat
actcctgttactatccatgttactgcgaatgacagtgatgttgatggcgacttaaatcca
aactctattcgtattgttaaagaaggttctaaaggaaccgtgacaatcggtaaagatgga
aagattatctatacaccaaataaaggtgaatatggcgttgataccatcacttatgtggtg
aaagatcgtgcaggtcatgagtcgaatgttgctaccatcactgtaaaaattgacgcggct
ccagaagcgaaagacgattctgcagcaaccaaagaatctaaacctgtcaccatcgatatg
gaaaataactactccgataaagacggggatgttgaccatagctctttagcgattaaaacc
aatggtggcaaaggtttcgcgaagtttgttaatggtaagttagtgtaccagccgaataaa
ggcgaagtgggtactgacaccatcacttataccgtgacagataaaaacggcaacgtctct
gaagatgcgacgatcaccatcaacatcgatgcgccaccagtagcgaacgacgactcagct
aaagccaacaaggcaacgccagttgaattagatgttttggataatgataccgatctcgac
ggtgatattgatccaacgacattagaggttgtgggtgaaccaaccaaaggcaccgtcaaa
gttgttgacggtaagctggtgtacaccgcgaacccagatgccacgggtcaagatacgatt
acgtatctggtcaaagataaaaatggcaacgtgtctaataaagcgactgtgaccattgat
atcactgagccgccagttgccaatgaagataaagccgatactcgccacaataccccagtt
gaaattgatgtcacagcgaacgatactgacctcgacggtgatttagataaaaacagcgta
gtgatcactcagccgggcaccaaaggcaccgtgaccatcggcgaagatggcaagctgatc
tataccccaaatccaggggcaacgggcacagacaccatcacttataccgtgaaagataag
aacggtaacgtctccaacgaagcaacggtgactattaacattgatgcgccaccagtggca
ggcaatgatgttgccgatacgcgccacaatacgcccgttgaaatcgatatcaccgcgaac
gataccgatcttaatggtgatctggacaaaaacagcgtagtgatcacccagccgggcagt
aaaggcacggtcaccatcggtgaagatggcaagctgatcttcaccccaaatccaggggca
acgggtaccgacaccatcacttataccgtgaaagataaaaacggtaatgtctccaacgaa
gcgacggtaactatcaatatcgatgcaccgccagtagcagttgatgatacagcggccacc
aaagaatcggtgccggtgaccattgacgtgttagccaacgacaccgatttagacaaagat
atcgacccaagcacgctggtgatcaagaccaatggcagcaaaggcaccgccactattgtc
gacggcaagttggtttataccccacatgcgggtgaagtgggtaccgacaccatcacttat
accgtgacagataagaacggtaacgtctccaacgaagcgacggtaactatcaatatcgat
gcaccgccagtagcagttgatgatacagcggccaccaaagaatcggtgccggtgaccatt
gacgtgttggtcaatgacaccgatttagacaaagatatcgacccaagcacgctggtgatc
aaaaccaatggcagcaaaggcaccgctaccatcgttgatggcaagttggtttataccccg
aatgcgggtgaagtgggcacggataccatcacgtaccaagtgttcgataagaacggtaat
gtctccaatgaagcgacggtaactatcaatatcgatgcaccaccagtagcagttgatgat
acagcggcgaccaaagaatccgtgccggtgaccattgacgtgttagccaacgacaccgat
ttagacaaagacatcgacccaagcacgctggtgatcaagaccaatggcagcaaagggacg
gcaactattgtcgacggcaagttggtttataccccacatgcgggtgaagtgggcacggat
accatcacgtaccaagtgtttgataaaaacggcaacgtgtcgaatgaagcgacggtaacc
atcaacatcgatgcgccaccagtagcgaacgacgactcagctaaagccaacaaggcaacg
ccagttgaattagatgttttggataatgataccgatctcgacggtgatattgatccaacg
acattagaggttgtgggtgaaccaaccaaaggcaccgtcaaagttgttgacggtaagctg
gtgtacaccgcgaacccagatgccacgggtcaagatacgattacgtatctggtcaaagat
aaaaatggcaacgtgtctaataaagcgactgtgaccattgatatcactgagccgccagtt
gccaatgaagataaagccgatactcgccacaataccccagttgaaattgatgtcacagcg
aacgatactgacctcgacggtgatttagataaaaacagcgtagtgatcactcagccgggc
accaaaggcaccgtgaccatcggcgaagatggcaagctgatctataccccaaatccaggg
gcaacgggcacagacaccatcacttataccgtgaaagataagaacggtaacgtctccaac
gaagcaacggtgactattaacattgatgcgccaccagtggcaggcaatgatgttgccgat
acgcgccacaatacgcccgttgaaatcgatatcaccgcgaacgataccgatcttaatggt
gatctggacaaaaacagcgtagtgatcacccagccgggcagtaaaggcacggtcaccatc
ggtgaagatggcaagctgatcttcaccccaaatccaggggcaacgggcacagacaccatc
acttataccgtgaaagataagaacggtaacgtgtcgaatgaagcgacggtaactatcaat
atcgatgcaccgccagtggcagttgatgatacagcggcgaccaaagaatcggtgccggtg
accattgacgtgttagccaacgacaccgatttagacaaagacatcgacccaagtacgctg
gtgatcaagaccaatggcagcaaaggcaccgccactatcgtcgacggcaagttggtttat
accccaaatacgggtgaagtgggcacggataccatcacgtaccaagtgtttgataaaaac
ggcaacgtgtcgaatgaagcgacggtaactatcaatatcgatgcaccaccagtagcagtt
gatgatacagcggcgaccaaagaatcggtgccggtgaccattgacgtgttagccaacgac
accgatttagacaaagacatcgacccaagcacgctggtgatcaagaccaatggcagcaaa
gggacggcaactattgttgacggcaagttggtttataccccaaatgcgggtgaagtgggc
acggataccatcacgtaccaagtgttcgataagaacggtaatgtctccaatgaagcgacg
gtgacagtcgatatcgacgcggcgccagtggcagttgatgactcagcaaaagccaacaaa
gcgacacctgttgagattgatgtactcggtaatgatactgacttagataatgatatcgat
ccaaatacgttagcagttgttgagcagccatcacaaggcactgtgagtattgtgaacggc
aagctggtgtacacaccgaatgcggatgcgaagggtacggacaccatcacttacacagtg
aaggatgctaacggtaatgtttccaataaagcgaccgtgaccattgtaatcaatgaaccc
cccgttgctggtgatgaccatggtcaaactaagcaaggtgttccgacaattattgatgtg
ttgattaatgacaaagatcctgatggagagttggataaatcaaccctgcatattgaaaag
aatggcagcaaaggtaccgcgacgtttgatgcagatggcaaactgatttatacaccaaaa
ccaggtgctacaggccaagataccatcacttataccgtgaaagataaggatggcagcatc
tcaaatacagcgactgtcactattgatattacaccaacgcaaacgacaccgacggaagtc
ttcgagaaaggcttaagaacggatggaactgcgggtgataaatcgcctgtgactgtgcat
ggcgttattgagttatctaatccaacagataaaccaacaactccaagcgatattaagatc
attgagccgacaactaagctgacttcaggtggagaacctatttcatgggaatctactgac
aatggttttgtgggtaaaacaccaaatggaaaagaagtgatttccgttaaagtgacagat
accccaaccgcagatggcagcacaaaggttaattatgaagttaatctcaaaggccttgtt
gatcatccagcaggcaaagactctctgaatattgattttggtgtgaaaaatggcaccgat
gaagtgaaaactgaaatcgtggttcatgatgataagcctgaagcctcgaatgttgagtta
tcagtagaaccaccagttgaaaataccttttatgctaacttgattatctcgttagatttg
tccagtagcatgggtagagatgatagtggtattcaaggcggtaacactgcatcaggaatg
aaaacgcgatatgacgctgcgttagattcaattgatagcgtgttaagtagttatgaagag
cgtctaaacagcgctaatgcaggagaagtgcgcgttagcattaatggttttgctaagcaa
gcatcggcaattggtggggcgccgggttacccaatggatcaaccatactggtgtaccatc
tctgaggcaaaacaaattattgaaggtttacgtggcgctcaaacgctacgcccagactgg
catgttatcggtgtagatactaactatgatgcagcattgcagcaggtgatcagtattttc
caaaaaacatccagtagtggcatggaaccgattgatgcaaaagatattaatggaaaacta
gataatacattgtttgtgattactgatggtattccgaactatggtaaccaaagcaatagt
caggatcctgttgctggaaatggtatagcaccaacatcaccaaatggttttgtcccagga
agcccaaatactgatattggtgaagatagctggaaggctttcttaacagaaaaaggtatt
cgctctgtggctattggtattggtcaagatatgctcaatagcgtgggtggtaaaacaggt
gaagagtttattcagcctatcgcttttgatggtcaaaaaggccaaaacaacgatgctaac
gacgttatcgttctgaaagatatgagctctttaggtaacatcctgagcaaatatgtccct
aatgaaaacaccatcgaaagtagcttctcaaaagcgaatgatggcaaggaaaccctgagc
ttcggcgcggatggcatgaaatctatcagcattgaagtggatggccacacttacaaatac
gatccaaaaaccaagggaatcacgtcggataaccttgataagagcatgtgggttgatttt
ggtcagggtgaattagccgttaaaaccgatgcgggcggtttactctctatctctttaggt
gagaaaaactttggtcacttaacctatcgtccgggggctacacgcccaacgggaatggag
aaagagacctttacgctgacgttaaccgataacgacggtaccaacggtaagtcatcaatt
tcagtggatatcagtaagttaaaagagtcaggtaacacaggcttgaatgatactgattta
acagccctgaaactattctcaccagaaagtgcaatggagttacatggagtagacaccgat
gtcaatgcaacatcaagtcactctactggtttcatgaactcatcgttagatgcgttacaa
gaaactcagagcgccattatttaa
DBGET
integrated database retrieval system