Candidatus Portiera aleyrodidarum TV-BCN: PTV_255
Help
Entry
PTV_255 CDS
T03736
Symbol
gyrA
Name
(GenBank) DNA gyrase subunit A
KO
K02469
DNA gyrase subunit A [EC:
5.6.2.2
]
Organism
plb
Candidatus Portiera aleyrodidarum TV-BCN
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
plb00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03032 DNA replication proteins [BR:
plb03032
]
PTV_255 (gyrA)
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
plb03400
]
PTV_255 (gyrA)
Enzymes [BR:
plb01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.2 DNA topoisomerase (ATP-hydrolysing)
PTV_255 (gyrA)
DNA replication proteins [BR:
plb03032
]
Prokaryotic type
DNA Topoisomerases
PTV_255 (gyrA)
DNA repair and recombination proteins [BR:
plb03400
]
Prokaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
NHEJ (non-homologous end-joining)
SHIIR (short-homology-independent illegitimate recombination)
Facilitator
PTV_255 (gyrA)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_topoisoIV
DNA_gyraseA_C
Beta-prop_NUP159_NUP214
VipE
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CEI59214
LinkDB
All DBs
Position
I:complement(229795..232290)
Genome browser
AA seq
831 aa
AA seq
DB search
MFEKNKEILPITIEDEIKQSYLDYAMSVIIGRAIPDIRDGLKPVHRRVIFAMHELNNVWK
KTYLKSARVVGDVIGKYHPHGDSAVYDAIVRMAQFFSMRYVLIDGQGNFGSIDGDNAAAM
RYTEVRLSRITSEFLYDLEKSTVDWVDNYDGTEKLPEVLPSRIPNLLINGTSGIAVGMAT
NIPPHNIKEVINACLAFIDNKNISIEYLMKYIKGPDFPTSGIIHGSSGILEAYKTGKGSI
YIRAKHIIVKNNIKGNEFIIITELPYQVNKARLIEKIVDLVKHKRLSGINELRDESDKDG
LRIVIEIKRYESSEIILNNLFAHTQMEVIYSINMVAVDKGKPKTFNLKQIIEAFINQRIE
VIKRRTLYELKKFNKRKHIIEGLIIAISNIDIVIEIIKSASSFHEAKYKLSIIKWNNTHF
CKDFFLLSESQIKAIMDLRLHRLTCLEIHNSIDEYNNTLNTISQLKKILSSFEYLMEIIR
NELIEIRSKYGDNRKTTINAIRNELHTVDLINEEKMVVTVSRSGYAKIQPISVYQAQKRG
GRGKLVTSINDEDVIEHLLVASTHDTILLFSDKGKVYWLKVYEIPQNSRISRGRPLVNLL
SLDVKEKITAILAINDENRKKNNYIFFATALGKVKRTHMKQFARQRNCGILALNLEDGDS
LIGAAITYGKDNLIMLLASNGKSIYFKESEVRAMGRNAMGVMGMRLFYNNKVISLIIIKN
KKQSQKYYILTASEKGYGKRTILEEFNLRKRGGQGVIAMRSSKRNGKIVSAIKVKESDEI
ILITNRGNLIRTRVQEISCRSRNTQGVTLIRVNKKEKLVSVVRLGETIDLK
NT seq
2496 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtttgaaaaaaataaagaaattttaccaattactattgaagatgaaatcaaacaatcg
tatttagattatgctatgagtgtaattattggacgtgctattccagatatacgtgatggt
ttaaaacctgtacatcgtcgtgtaatctttgctatgcatgaattaaataatgtatggaag
aaaacttatttaaaatctgcacgtgtagtaggtgatgtcattggtaaatatcatccgcat
ggtgatagtgcggtttatgatgcaattgtaagaatggcccaatttttttctatgagatat
gtattaattgatggtcaaggaaattttggatcaatagatggtgataatgcagctgcaatg
agatatacagaagtaagattgtctcgtataactagtgaatttttatatgatcttgaaaaa
tctacagtagattgggttgataattatgatggtactgaaaaactacccgaagtcttacct
agccgtatacctaatttattaataaatggtacaagtggtattgctgttggtatggcaact
aatattcctcctcataatataaaagaagttataaatgcatgtttagcttttattgataat
aagaatatttcaatagaatatttaatgaaatatataaagggtccagattttcctacatca
ggtataattcatggaagttcgggaattttagaggcttacaagacaggtaaaggtagtatt
tatatacgtgcaaaacatataattgttaaaaataatattaaaggtaatgagtttatcatt
ataacagaattaccatatcaagttaataaagctaggttaattgaaaaaatagttgattta
gtaaaacacaaaaggttatctggtataaacgagcttagagatgaatcagataaagatggg
ttaaggattgttatagaaataaaacgttatgaatctagtgaaattatattaaataatctt
tttgcacatactcaaatggaagttatttatagtataaatatggtagctgtagataaaggt
aaacctaaaacctttaatcttaaacaaattattgaagcttttattaatcaacgtatagaa
gtaattaaacgacgtacattatatgaattaaaaaaatttaacaaacgtaaacatattatt
gaaggtttaataattgcaatatctaatattgatattgttatagaaattatcaaatcagct
tcttcatttcacgaagctaaatataaattaagtattataaaatggaacaatactcatttt
tgtaaagatttttttctattatctgaatctcaaattaaagcaattatggatttacgatta
catcgtttaacttgtttagaaattcacaattctattgatgaatataacaatactttgaac
acaatatctcaattaaaaaaaatattatcttcatttgaatatttaatggaaataattcgt
aatgaattaattgaaatccgttctaagtatggagataatagaaaaactacaattaatgct
attcgtaatgaactacatactgttgatcttattaatgaagaaaaaatggtagttacagtt
tctagatcaggatatgctaaaatacaacccatttcagtttatcaagcacagaaaagaggt
ggtcgaggtaagttagttacaagtataaatgatgaagatgtgattgaacatttattagta
gcatcaactcatgatacaattttattattttctgataaaggtaaagtatattggcttaaa
gtttatgaaattccacaaaatagtagaatctctagaggtagacctttagtgaatttactt
tctttagatgtaaaggaaaaaattactgcaatacttgcaataaatgatgaaaatagaaag
aaaaataattatatattttttgcaacggctttaggtaaagtaaaaagaactcatatgaaa
caatttgctagacaacgtaattgtggtattcttgcacttaatttagaagatggagatagt
ttaataggtgctgctattacttatgggaaagataatttaattatgttacttgcttctaat
gggaaatctatttattttaaagaaagtgaagtacgtgcaatgggacgtaatgctatgggt
gtaatggggatgcgtttattttataataataaagttattagtttaataattataaaaaat
aaaaaacaatcacaaaaatattatattttaacagcttcagaaaaaggatatggaaaacgt
actattttagaagaatttaatttaaggaaacgtggtggacaaggagtaatagcaatgcgt
tcttcaaaacgtaatggtaaaatagtatcagcaataaaagttaaagaaagtgatgaaatt
attttaataacaaataggggaaatttaatacgtacaagagttcaagaaatatcttgtaga
tcacgtaatactcaaggagttacattaatacgtgttaataaaaaagaaaaattagtatct
gttgtaaggttaggtgaaactattgatttaaagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
