Candidatus Portiera aleyrodidarum TV: PalTV_007
Help
Entry
PalTV_007 CDS
T02521
Symbol
nusA
Name
(GenBank) NusA antitermination factor
KO
K02600
transcription termination/antitermination protein NusA
Organism
pld
Candidatus Portiera aleyrodidarum TV
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pld00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03021 Transcription machinery [BR:
pld03021
]
PalTV_007 (nusA)
03009 Ribosome biogenesis [BR:
pld03009
]
PalTV_007 (nusA)
Transcription machinery [BR:
pld03021
]
Prokaryotic type
Bacterial type
Other transcription-related factors
RNA polymerase-associated proteins
PalTV_007 (nusA)
Ribosome biogenesis [BR:
pld03009
]
Prokaryotic type
rRNA transcription factors
PalTV_007 (nusA)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
NusA_N
KH_NusA_2nd
KH_NusA_1st
S1
KH_NusA_C
KH_2
Catalase_C
S1_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AGI27009
UniProt:
A0A8D3XAL7
LinkDB
All DBs
Position
complement(7830..9089)
Genome browser
AA seq
419 aa
AA seq
DB search
MSKDILLIIDSIYNEKGVSRHCIFKTVEEALSSATIKRFEGQKVNIIVKMNRINGNYDTF
RRWKVVKDENYTKSSIEIPYTAAKKLNKKFEINKYIEYKIENIKFCRIAVKIAKQIIVQK
VREAEHTEIIRNYSKKIGEIICGNIKKIIKEGIIIELDDKTEGFLPRKKMIPGERFNINE
RIRTLLFKVNPNSRNFKLILSRCCSKFLMELLKIEIPFILDELIEIKSVARDPGYKAKLA
VKTNDFNIDPVGYCVGRIQSISNELHNERIDIILWDENSTKFVINAMYPLEVSSIIVDEN
NHNMEIIVNEYNYYKAIGKCGQNIKLASSLTGWILNVVTKNEAKKEIKKKVKKLSLKLDI
NKKIALLLVDYGFTSLEEIVYVPCEEFLKIKKLNINVIKNLKARAKDVLLNLAMKNKFN
NT seq
1260 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtaaagatattttattaattattgattctatttataatgaaaaaggtgtttcacgt
cattgtatttttaaaacagttgaagaagctttatctagtgcaactattaaaagatttgaa
ggacaaaaggtaaatattatagttaaaatgaatcgcataaatggtaattatgatactttt
cgtagatggaaagtcgttaaagatgaaaattatactaaatcatctattgaaattccttat
actgctgctaaaaaactaaataaaaagtttgaaattaataaatatattgaatataaaatt
gagaatattaaattttgtagaatagctgttaaaattgcaaaacaaattattgtacaaaaa
gtacgtgaagctgaacatactgagataatacgtaattatagtaaaaaaataggtgaaata
atatgtggtaatataaaaaaaataattaaagaaggtataataattgaattagatgataaa
actgaaggttttttaccacgtaagaaaatgatacctggtgaacggtttaatattaatgaa
cgtatacgtactttattatttaaggtaaatcccaatagtcgtaattttaaattaatactt
tcaagatgttgttcaaaatttttaatggaattattaaaaatagaaataccattcatctta
gatgaattaatagaaataaaaagtgttgcaagagatccaggttataaagctaaacttgca
gttaaaactaatgattttaatattgatccagtaggttattgtgtaggtagaatacaatct
atttctaatgaattacataacgaacgtatagatattatactttgggatgagaattctaca
aaatttgttattaatgctatgtatccattagaggttagttctataattgttgatgaaaat
aatcataatatggaaattatagttaatgaatataattattataaagctataggaaaatgt
ggacaaaatattaaattagcatcttcactaacaggatggatattaaatgtagttactaaa
aatgaagctaaaaaagaaataaaaaagaaagttaaaaagttaagtttaaaacttgatatt
aataaaaaaatagcattattattagtagattatggttttacttctttagaagaaattgta
tatgtaccttgtgaagaatttttaaaaataaaaaaattaaatataaatgtaataaaaaat
ttaaaagcacgtgctaaagatgtattgctaaatttagcaatgaaaaataagtttaattaa
DBGET
integrated database retrieval system
