Candidatus Portiera aleyrodidarum TV: PalTV_012
Help
Entry
PalTV_012 CDS
T02521
Symbol
carB
Name
(GenBank) carbamoyl-phosphate synthase, large subunit
KO
K01955
carbamoyl-phosphate synthase large subunit [EC:
6.3.5.5
]
Organism
pld
Candidatus Portiera aleyrodidarum TV
Pathway
pld00220
Arginine biosynthesis
pld00240
Pyrimidine metabolism
pld00250
Alanine, aspartate and glutamate metabolism
pld01100
Metabolic pathways
pld01110
Biosynthesis of secondary metabolites
pld01240
Biosynthesis of cofactors
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pld00001
]
09100 Metabolism
09104 Nucleotide metabolism
00240 Pyrimidine metabolism
PalTV_012 (carB)
09105 Amino acid metabolism
00250 Alanine, aspartate and glutamate metabolism
PalTV_012 (carB)
00220 Arginine biosynthesis
PalTV_012 (carB)
Enzymes [BR:
pld01000
]
6. Ligases
6.3 Forming carbon-nitrogen bonds
6.3.5 Carbon-nitrogen ligases with glutamine as amido-N-donor
6.3.5.5 carbamoyl-phosphate synthase (glutamine-hydrolysing)
PalTV_012 (carB)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
CPSase_L_D2
CPSase_L_D1
CPSase_L_D3
Dala_Dala_lig_C
ATP-grasp
ATP-grasp_4
MGS
ATPgrasp_Ter
ATP-grasp_3
ALA1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AGI27012
UniProt:
A0A8D4BUG1
LinkDB
All DBs
Position
complement(11869..15096)
Genome browser
AA seq
1075 aa
AA seq
DB search
MPKYTYIKKVLIIGSGPIIIGQACEFDYSGVQACKALREEGIYVILVNSNPATIMTDPQI
ANSTYIEPITWEILSKIIEKERPDALLPTMGGQTALNCALDLYKYGVLKKFNVKLIGVNI
STIKKAENRNKFIKLMNNIGLESPKSVIIRYIKDIYEIKTKIGFPCIIRPSYTMGGFGGG
IANNLEELKKICIRGLNIAPTKELLIDEYLIGWKEYEMELLRDKKGNCIIICSIENLDTM
GIHTGDSITVAPAQTLTDKEYQIMRNASITVLKEIGIDSGGSNVQFGINPKTGKMVVIEM
NPRVSRSSALASKATGFPIAKIAAKLAIGYTLDELKNDITQGKIPASFEPSIDYVVTKIP
IFNFEKFPKANDRLTTEMKSVGEVMAIGRSFKESLQKALRSLDIGINGLDNKILTFNQNS
LNIIKKELINPGYARIFYIADAFRVGLTIQEIFNYTKIDIWFLSQIKELINIENIFLNKN
IKNINYENLYLLKKQGFSDNRIANLLKVKEKNIRDLRTNLNIHPVYKRVDTCSAEFTTST
AYMYSTYDNECESNLKTTSEKIIIIGSGPNRIGQGIEFDYCCVHAAMAMRENGYETIMIN
CNPETVSTDYDMSDRLYFEPITLEDILEIIRKENPKGVIIQFGGQTPLKIIKNIKNQEIP
IIGTNKLAIDIAEDREKFKKLIKKIKLLQPDNEIAFTLEDALIKAKNIGYPLIVRPSYVI
GGRAMEIVYNVKELEKYIKKAFKLSKKNSILLDKYINKAIEIDIDALSDGKEVIICGIMQ
HIEQAGIHSGDSACSLPPFYLDIKIQNEIKKQIKKIAIELKIVGLMNCQLACKNNKIYIL
EVNPRASRTIPFVSKCIGFSLAKIAANCMIGKSLNYKKILKNIKPKFYGVKEAVLPFNKF
IGVDPVLSPEMKSTGEVMGIGSNFSEAFYKSQLSIGMPIIKIKEKKQLIAFLSVSKNDKN
KISKIAKILRNLGFNLMATIGTANIILKNGILVKSISKKNISLIFKKYKINYVINTINKK
NNLINKNYIIRNTAIIKKVPYTTTIAGAYAICMALKYCKKINKVRKIQNMHIGVI
NT seq
3228 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgccaaaatatacatatataaaaaaagtattaattattggctcaggacctattattatt
ggtcaagcatgtgaatttgattattctggtgtacaagcatgtaaagctttaagagaagaa
ggtatatatgttatattagttaattcaaatccagctacaattatgacagatccgcagata
gctaattcaacatatattgagccaataacttgggaaattttatctaaaattattgaaaaa
gaaagaccagatgcattattaccaacaatgggaggacaaacagctttaaattgtgcatta
gatttatataaatatggtgtattaaaaaaatttaatgtaaaacttattggtgttaatata
tctactataaaaaaagctgaaaatcgtaataaatttattaagttaatgaataatattggc
cttgaaagtcctaaatcggtaatcattagatatataaaagatatatatgaaataaaaact
aaaataggttttccttgcattatacgtccttcttatactatgggagggtttggtggaggt
atagcaaataatttggaagaattaaaaaaaatttgtataagagggttaaatatagctcct
acaaaagaattattaatagatgaatatttaattggttggaaagaatatgaaatggagtta
ttacgtgataaaaaaggtaattgtattataatatgttcaatagaaaatttggatacaatg
ggtattcatacaggggattcaattacagtagcacctgcacaaactttaactgataaagaa
tatcaaataatgcggaatgcttctattactgtattaaaagaaattggaatagatagtgga
ggatctaatgtacaatttggtattaatccaaaaactggaaaaatggtagtaattgaaatg
aatcctagagtttctagatcatcagctttagcatctaaagctacaggttttcctatagct
aaaatagctgctaaattagcaataggttatactttagatgaattaaaaaatgatataaca
caaggtaaaatacctgcttcttttgaaccatctatagattatgtagttactaaaatacct
atttttaattttgaaaaatttcctaaagctaatgatagattaacaacagaaatgaaatct
gtaggtgaagtaatggctataggaagaagttttaaagaatcattacaaaaagccttacgg
agtttagatataggtattaatggtttagataataaaatattaacttttaatcaaaattct
ttaaatataataaaaaaagaattaattaatccaggttatgcacgtattttttatattgct
gatgcttttagagtaggattaacaatccaagaaatttttaattatacaaaaatagatatt
tggtttttaagccaaataaaagaattaataaatatagaaaatatttttttaaataaaaat
ataaagaatattaattatgaaaatttatatttattaaaaaaacaaggttttagtgataat
agaattgctaacttattaaaggttaaagaaaaaaacattagagatttacgtacaaactta
aatatacatccagtatataaaagagttgatacttgttcagccgaatttactacttcaact
gcttatatgtattctacttatgataatgaatgtgaatctaatcttaaaactacttcggag
aaaattattataataggtagtggccctaatagaataggacaaggtattgaatttgattat
tgttgtgtacatgcagcaatggctatgcgtgaaaatggttatgaaacaataatgattaat
tgtaatcctgaaaccgtttctactgattatgatatgagtgatagattgtattttgaacct
ataactttagaagatatattagaaattataagaaaagaaaatccgaaaggagttattatt
cagtttggtggtcaaacacctttaaaaataataaaaaatataaagaatcaagagatacct
attattggaactaataaattagctatagatatagctgaagatagagaaaaatttaaaaaa
ttaattaaaaaaattaaattattacaacctgacaatgaaattgcttttactttagaagat
gctttaattaaagctaaaaatataggctatcctttaattgttcgtccttcttatgttata
ggaggtagagcaatggaaattgtttataatgtaaaagaattagaaaaatatataaaaaaa
gcttttaaattatcaaaaaaaaattcgattttattagataaatatataaataaagcaata
gaaattgatattgatgctttatcagatggtaaagaagttataatttgtggaattatgcaa
catatagagcaagcaggtatacattcaggagattcggcttgttcattaccacctttttat
ttagatataaaaattcaaaatgaaataaaaaaacaaataaaaaaaatagctattgaatta
aaaattgtaggattaatgaattgtcaattagcttgtaaaaataataaaatttatatttta
gaagtaaatcctagagcttcacgtactataccttttgtttcaaaatgtataggtttttct
ttagctaaaatagctgcaaattgtatgataggtaaatctttaaattataaaaaaatatta
aaaaatataaaaccgaaattttatggtgtaaaagaagctgtattaccttttaataaattt
ataggtgtagatcctgtattatcacctgaaatgaaatctacaggtgaagtaatgggtata
ggtagtaattttagtgaagcattttataaatcacaattaagtataggaatgcctattata
aaaataaaagaaaagaaacaacttattgcttttctttcagtatctaaaaacgataaaaat
aaaatttcaaaaatagcaaaaattttaagaaatttaggttttaatttaatggctactatt
ggtactgctaacattatattaaaaaatggtattttagttaaaagtattagtaaaaaaaat
attagtttgatttttaaaaaatataaaataaattatgtaataaatacaataaataaaaaa
aataatttaataaataaaaattatataattcgtaataccgcgattataaaaaaagtacca
tatactactactattgcaggtgcatatgccatatgtatggctttaaaatattgtaagaaa
ataaataaagtaagaaaaattcaaaatatgcatataggagttatttaa
DBGET
integrated database retrieval system
