Pleionea litopenaei: Q9312_01300
Help
Entry
Q9312_01300 CDS
T09336
Name
(GenBank) PilC/PilY family type IV pilus protein
KO
K02674
type IV pilus assembly protein PilY1
Organism
plei
Pleionea litopenaei
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
plei00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02044 Secretion system [BR:
plei02044
]
Q9312_01300
02035 Bacterial motility proteins [BR:
plei02035
]
Q9312_01300
Secretion system [BR:
plei02044
]
Type II secretion system
Pilin secretion/fimbrial assembly protein
Q9312_01300
Bacterial motility proteins [BR:
plei02035
]
Pilus system
Pilus assembly proteins
Q9312_01300
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PQQ
PQQ_2
VWA_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WMS87575
UniProt:
A0AA51RU60
LinkDB
All DBs
Position
318133..322263
Genome browser
AA seq
1376 aa
AA seq
DB search
MFKKQFFKVAACTGMYALACMNSVYADDTEIFFNGTNAGGATPNVLFIFDTSGSMNRNAS
GSNESRIDVMRDVMYEFITDIEGLNIGMARFSVPGGPILNAVFNVDAATDPVAISQVNSN
DDDATENFAGNKMAYNAAILEFNEEKATDLMGLRFTDLDIPQGAIITSATITVSSYNTIT
GSPVFEILGEKVGNADTFTGDKLSDRLTSNPTANSVKWAPGDWIAPSPLYDADGLVPPSS
YSTVDLAPLVQEIVNQGDWCGSNSMAFFIRAGQTQAALRDAIAHDGNPLYAPRIRIEFDA
DPQKIQDNTEAVNNAKALGNPVGCYVNQANRQISDGAYDIEYPSTGGYYDSGTILDFNST
GNGRRNRGIGLHFDNILVPQGAEIEEAYIEIVADNPDNGNAQAVIKFIDAVNAPATANGI
FSSPKLGGVSWTLPNFESNITYESPSLVSQIESLTGNAGWVAGNGMSVYIETNSGNRDVI
SFESSAVRAPRLVIKYRGSYDGTGYTKRDEMKQVVQDFQASGNTPISDTLLEAGLYYRGE
EVLYGKVRGTPSSRNNRISNPNSFDPTGVVYTPSGCDGSDPNANACKDERVDNDPNYVTP
IVDGCQKNHIVLLTDGEPTSHDYRTQQTYSRWSGGWCSGNRSGRDCAIKIAGFLANNDQN
NKIAGDQTVKTHVIGFDYDSEFLEDVANAGGGFYFTANDKAGLLAKLKEIANSILKTNTT
FVSAGLTVNQYNRLTHNDQLYYSLFQPGETKSWVGNMKRYRLSDGLVVDVNGNPAVDVLN
GEFTDTARSWWSDSVDGNEVGTGGVAGEQQIGRTLYTNVTGDSTTAASNRIDATNLFITK
ELLKADDDADALSIKRWALGYDVSDASLLTPHQIIGDPLHSRPTLLSYNRNGNEYTAVFV
GTNNGYLHAFEAESGKELWSFVPKDLLPLLKEKKENNPISAGTAHPYGVDGEITIYLDDK
NSNSAADSGESVYLFVGLRRGGKSYYAFDITNPLQPNLLYKINPDENPDFAKLGQSWSKP
VIGKMNIGGQTERLVMIFGAGYDPVHDTAGVASQNVGQGNAVYIADAKTGKYLWDSSKAG
SIPGNGGSVSSMNSVPSNVKAFDLDDDGLLDHFYVSDNAGQIFRFDIDNDSGSIKGGRLA
KLQSGATAQENRRFFTSPDVALVRDTVSGETFVSVSIGSGYRAHPLDTELVEHMYSLRDK
GVLSKQIVKDIGLVDLIKQTFADSDGDGTYDTTETLGDVTADKHGWYYDFPTEGEKVMAD
SLTFNNALLFTTYTPPPLVNNSGSCVPAAGSSRIYALAVSDGTPYVDINYDGTIDENDLY
IDLPGAGIAPEPQVILTEEGNGVRGNLCVGRKCDLDELLPTPPKRMVPIKWRHILN
NT seq
4131 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtttaagaagcagttttttaaagtagcagcctgtactggcatgtatgcattagcctgc
atgaattcagtatacgcagacgataccgaaatattctttaatggaaccaatgctggcggt
gccacaccgaacgtattgtttatatttgatacgtcgggaagtatgaaccgtaatgcatct
ggctcaaacgagtctcgtatcgatgtaatgcgtgacgttatgtatgagttcattacagat
atcgaaggattaaacatcggtatggcacgtttcagtgtacctggtggtcctatcttaaat
gcggtatttaacgttgatgcagcaaccgatccagtagctatttcgcaagtcaacagcaat
gacgatgatgcgaccgaaaactttgctggcaataaaatggcttataatgcggccattctt
gagttcaatgaagaaaaagcaaccgatttaatggggctgcgttttactgacttagacatt
cctcaaggtgcaatcataactagcgcgaccattaccgtgtcgagctacaacaccatcact
ggtagtccggtctttgagattcttggcgagaaagtcggaaacgcagacacctttactggc
gacaagttatcggatcgattaaccagtaatccaaccgctaatagtgtgaaatgggcacca
ggtgactggattgctccttctccgctgtacgatgctgatggtttagtgcctccaagcagt
tactcaacggtcgaccttgctcctttggtacaagaaattgtcaatcagggcgattggtgt
ggcagtaacagcatggcatttttcattcgtgctggacaaactcaagcagcacttcgtgat
gcaattgcccatgacggtaatcctttgtatgcgccgcgaattcgcattgagttcgatgcc
gacccgcaaaaaattcaagacaacactgaagcggttaataacgcaaaagcgttaggtaat
cctgttggctgttacgttaaccaagcgaatcgccaaatctctgatggcgcttacgatatc
gagtacccaagcacgggtggttactacgactctggcacgattctagattttaactcgacc
ggtaatggtcgtcgcaatcgaggtattggcttacattttgacaacatcttagtgcctcaa
ggcgcagaaatcgaagaagcttacatcgaaatcgttgccgataatccagataatggtaac
gctcaagccgtgattaagtttattgatgctgtgaacgcacctgcaacggcaaatggcatt
ttctcatcgccgaaacttggcggtgtcagttggacattaccgaattttgaatcaaacatt
acttatgagtctccttcattagtgagtcagattgagtcgttgaccggaaatgcgggttgg
gtcgcaggtaacggcatgtcagtgtacattgagaccaattcaggtaaccgtgacgttatc
agctttgagagcagtgcggtacgtgcaccccgattggtgatcaaataccgcggatcgtat
gacggtacagggtacaccaagcgtgatgaaatgaagcaggttgtgcaagacttccaagcc
agcggtaacacgcccatcagtgataccttattagaggctggtttgtactatcgtggcgaa
gaagtgctttatggtaaagtccgtggaacaccttcaagtagaaacaatcgtatcagtaat
cccaacagttttgatccaacgggggttgtctatactccgtcaggttgtgatggctcagac
cctaacgctaatgcgtgtaaagacgagcgtgttgataacgatcctaactatgtgacgcca
atcgttgatggttgtcagaagaatcacatcgtattgttaaccgatggtgagcctaccagt
catgactatcgtactcaacagacttacagccgttggtccggtggctggtgtagtggtaat
cgtagtggccgtgactgtgcgattaaaatcgccgggttcctagcgaacaacgaccaaaac
aataagattgctggagatcaaaccgtgaaaactcacgtgattggtttcgactatgactct
gaatttcttgaagatgtcgccaacgcgggtggtggtttctactttactgccaacgataaa
gccggcttgttggcgaagttgaaagaaattgctaactcaattttaaaaactaacacgacc
ttcgtatcggcaggcttaacggtcaaccaatacaaccgtttaacgcataacgatcagttg
tattactcattgttccaacccggtgaaactaagtcttgggtcggtaatatgaagcgttac
cgtttgagcgatggtctcgttgttgatgttaatggtaatcctgccgtcgatgtattgaat
ggtgagtttaccgataccgcacgaagctggtggtctgacagtgttgacggcaatgaggtt
ggtaccggtggtgttgccggtgaacagcaaattggtcgtactttgtacactaatgtcacc
ggtgactcgacaaccgctgcgtctaatcgcatcgatgcaaccaatttattcatcaccaaa
gaactattgaaagccgatgatgatgctgatgctttaagcattaaacgttgggcgctcggt
tacgatgtgagtgatgcaagtttattgacgccacaccaaatcatcggtgatccactgcat
tctcgaccaacgctattgagttacaaccgtaatggcaatgaatacacagcggtatttgta
ggaaccaacaacggttacttgcacgcgtttgaagccgaatcgggtaaagagctgtggtcc
tttgtgccgaaagatttgttgccactattaaaagagaaaaaggaaaataatccgatttct
gctggcaccgcacacccttatggcgtcgatggtgagatcactatttatctcgacgacaaa
aacagtaacagtgcggccgatagtggtgaaagtgtttacttattcgttggtcttcgccgc
ggtggtaagtcttactatgcgtttgatatcaccaacccgttgcagcctaacctactgtat
aagatcaaccctgatgaaaatcctgactttgcgaagttagggcagtcttggtctaagccg
gtcattggtaaaatgaacattggcggccaaactgagcgattagtgatgatcttcggtgcc
ggttatgatccggtgcatgatacagcgggtgttgcttctcagaatgttggtcagggtaat
gcggtttatattgctgacgcgaaaaccggtaaatacttatgggattcaagcaaagctggc
tcgattcctggtaacggcggatcggtttcgagtatgaactcggttccttcgaacgtgaaa
gcctttgacttagatgacgatggcttactggatcacttctacgtatctgacaatgcgggc
caaatcttccgtttcgatattgataatgacagcggttcaatcaaaggtggacgtcttgct
aaattgcaaagtggtgcaacggctcaagaaaaccgtcgcttctttacctcacccgatgtt
gcgttagttcgtgatactgtgtcaggtgaaacctttgtttcggtctctattggctcgggt
tatcgagcgcatcctttagacacagagctggtagaacatatgtattcacttcgtgataaa
ggtgtcttgtcgaaacaaatcgtcaaagacattggcttggtcgatttgatcaaacaaacc
tttgccgacagtgatggtgatggaacctatgatacgaccgaaaccttaggtgatgtcacc
gccgacaaacatggttggtactatgacttcccaaccgaaggtgagaaggtaatggcagat
tcattgacctttaacaatgcgctgttgtttactacttatacgcctccaccgttagtgaat
aactctggctcttgtgtgccagcggcaggtagttcacgcatttacgcactagctgtctca
gatggcacgccatatgttgacattaactatgacggcacgattgacgaaaacgatctctat
atcgacttacctggtgccggtattgcccctgagcctcaagtcatcttgactgaagaaggg
aatggcgtacgtggtaatctgtgtgttggtcgtaaatgtgacttagatgagttgcttccg
actccgccgaagcgtatggtgccgattaagtggcgacacattctaaactaa
DBGET
integrated database retrieval system