Pleionea sp. HL-JVS1: Q9312_18990
Help
Entry
Q9312_18990 CDS
T09336
Name
(GenBank) Ig-like domain-containing protein
Organism
plei
Pleionea sp. HL-JVS1
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Big_12
Big_9
He_PIG
NPCBM_assoc
Cadherin_4
OmpA_membrane
Cadherin_3
Big_3_3
TSP3_bac
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WMS87295
UniProt:
A0AA51X7N6
LinkDB
All DBs
Position
4269281..4276513
Genome browser
AA seq
2410 aa
AA seq
DB search
MDFHSAGKQSRRFLKSLILLSSAGISGALWAVPPSFSTSFNSSTIGPGNESTLTYTITNG
DSFAITDLAFSNTLPAGVTISANPNASSTCLNGSFSAPANGTTISIADYAVEPNSSCNVT
VAVTASAAGSYSNVTDDLTSSEGNSGTASATLTVDTGRPNIELSITPSSMSRGDIAQVQV
VFDNSLNGSLEYNFQSTISLPGGLAVADFPDVQTTCTNTSVTANSGSDVATITPTGTMTL
GAGASCTSTFNAVATGVGSYLATSSLTYLDSNTFTNTVAGFSSASVDIATSAALISFLNN
PVAPGSSTDLEITLANTDRSNSVTNAAFTIDLDAALSGLVATGLPLSDICGSGSSVSGTS
VLSFTGGAISAGSTCTFTVPVTVPGGAAVGTYTGTSSDITWDIGGSGEVKSGANFSLSIT
QAPTLAINFVDSDAVGGGSTNVEFTITNTDSANAATAITFRASISDLVSGSSFSSLPASG
YCGAGSTASQAVITDELYLLVSNAQLAAGASCTFTVGINIPQGAPAGVSTLQSSDFSATV
NGSTLTGETASDSINIVGGPSLKLALSELSINPGDTTTATFTLAHSASASANATSMAFTL
DLDAAISGLTAVGLPSVDVCGTGSQISGTSTLTFTGGSLAPNETCSFDVTLQTPGSVSSN
IYTLTTSSLDAQVSGLSTSSIAGSASLQVSNLEAAMAFTNLPVAPGGTANLEVTLTNASA
TEALSAVVFTSSISSTLSGMTVTGLPANDICGAGSQATGTTTLIVNNGSLAAGGSCTFTL
SLSVPGGASDGTYPLVTSNIGFTENAVNININKISTTLIVETDVAPNVTLTSSASPSTSV
SPIPVSMVFNEDVTGFDVSDLTGSVTNGSLSNFQAISASEYSVDITPAAAGDVTLQVPAS
SAIDSGTNGNNVSDVLTITYDPVAFILPTAVIGAPDQSLTNTGPVNFAVTYSNADQVSLD
DVEVVLVTTGTATGDVSVANGNTTTPTVTLSNITGEGSIAISLTSGTARNSFGNADAVGT
SAAFNVDNTAPDVSISSAAPDPTNAAFDVTFTFTEAVNDFVNTDVTASNASVSTLSGGPV
VYTATITPDTDGTVTLDVLNSVASDSAGNGNTAATQYSVLYDATAPSGYDINIDQSFINA
ANDTAMSFSYTGAEVGADYNYSVSDGSSQVSGVGTIASASDSVTGIDVSGLAEGTLTLTF
VLTDPVGNMGVAITDTVIKQYNDAPVITEGATITVNMSEDSTPTAFNLTLNATDPENESL
TWSVISSAINGVADATGTGNSQVVSYTPLANYNGSDSFVVEVTDNNALEPLTDSITVTVQ
ITAVNDAPTFTSSAPVVVAEDALYTYSITTNDIDAGDTLAITASVIPSWLSLVDNGNGTA
TLAGSPTNDDVGVHSVTLLVTDSSGASDNSATQSFSVAVSNTNDAPTFTSTPVTVATEDQ
AYSYAVTAADIDVGDSIAITATVLPSWLTLVDNGNGAAVLSGTPLNEHVGNHSVTLVVTD
DSGDVNDTAAQSFVVAVANTNDSPSGLPVITGTLLRNETLTADTSGISDDDGLGTFSYQW
LRNSNPIAGASSATYTPGVDDVWQILSVTVSYTDLGGNPESLTSAPTGAISDLDSDGDGI
YDLEEGTGDSDGDGTPDYLDPDSDNDGIPDSEEGTGDSDGDGTPDYLDTSLDEDSDGIPD
IIESESNRDTDGDGLRDFEDPDSDNDGLTDLEESGVSGIDTDGDGIDDYYDVDQTGGVDA
NGDGIDDAVMPLDSDNDGIPDYIDRDSDNDGIPDALENEFAFRTVSLSKAMSYQRMMAID
TDGDGILNHVDPDSDNDGLSDAIEAQIVMVDTDGDQIIDQFDVDVTGGVDANQDGVDDNA
TLVNSDNDNTPDLLDLDSDNDGRFDIVEAGLIDSDFDALIDNPTDAVVIAPDTDNDGTPD
YLDLDSNDDSTWDIESTGAATLDLNGDGQIDDASSDPDNDGIVDPLDDEPNQFGTQPDRD
GDGVPGRIDRDDDNDGISDVAEGLLDSDGDGLIDALDSDSDNDGLNDAFETDRPRLSGID
IDRDGIDDAVDVDFVGGNDSDNDGVADQFRLADTDGDGTPDYLDTDSDNDGISDQEEQLT
VILGGTDVDNDGLDDVVDATQTAGDDANGDGQVDRSIDSSDLDGDGLLAFRDSDTDGDGI
ADGDENGDFNNDGINDRLQTDPGVSVDSGSGSVGWMMLGLLALFPLRKRKKGKTDLKLPF
ARIWLGSFVSFIALSVPSLVSADDQCLREQSSCWYLGWGIGRAQHDIKDGQSAWKVSDND
GQYGTVFVGVDFSSHLYWELAYEQLGRVQLRNQNPAINVPGSVRFDSLSTSLGVWLRPHS
ADWNLGLSAGISVRDEKPQNVQFNSGDDSMVMYGVAVKWSVTETTDIKTKFTYYDNDTNV
FGVYLIQRFD
NT seq
7233 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtggattttcattcagcaggaaagcagtctcgcaggtttttaaaatcattaatcttatta
tcatcagcaggcatcagtggcgctttatgggcggttcccccaagcttctccaccagcttt
aactcctccaccattggcccgggcaacgagtcaaccttgacttacaccattactaacggt
gatagcttcgcaattactgatttagcgttttccaatacgctgcctgcaggggtgactatt
tcggctaacccaaatgcgagttcgacgtgtttaaatggatcgttttctgctcctgccaac
ggaacgaccatatcgatcgccgactatgccgtcgaacctaactcaagctgcaatgtaacg
gtcgctgtcaccgcgagtgccgccggcagttacagcaatgtgacggatgatttgacgtcg
agcgaaggcaatagtggaacagcctcagcgacgttaacggttgatactggacgccctaat
attgagctatcgatcacacctagttcaatgagtcgtggtgacatcgcccaagtacaggtg
gttttcgataattcactcaacggttcgttagaatataactttcagtcgaccatcagttta
cctggcggattagccgttgcagattttcctgacgtgcaaacaacttgtaccaacacttcc
gtgacggctaactcaggttcagacgtagcaaccattacccccaccggaaccatgacgctg
ggcgcaggagcgagttgtacatcaacgtttaatgcagtcgccactggggttggaagttac
ctggcaaccagcagtttaacctatctcgattcaaatacttttacgaataccgtcgcgggc
ttttcatctgccagcgttgatattgcgacgtcagctgcattaatttcatttttgaataat
ccggtcgctccgggaagttcgaccgacctagaaattaccttggccaatactgaccggtcg
aactcagtgaccaatgccgcttttacgattgatttagatgccgcgctctcaggcttagtc
gcaactggtttaccgctttccgatatctgcggcagtggctcgtcagtatctggcacgtct
gttttatcgtttacgggaggagcgatctctgcgggcagcacttgtacctttactgtcccc
gttactgtgccgggtggagcggccgtcggcacctatactggcactagttcagacattacc
tgggatattggtggtagcggtgaagtgaaaagtggtgccaatttttcattgagtattacg
caagcaccaactttagcgattaattttgttgatagcgatgcagtcgggggcggctcgacc
aacgtcgaatttaccattaccaatacagactctgctaatgcggcgacggcgatcacattt
cgagcgagcatcagtgacttagtttccggctcgtcattttcaagtttaccggcgagtggc
tattgtggggctggctctacggccagccaggcggttattaccgatgagctatacttgctt
gtctcaaacgcacagttagcggctggagcaagttgtactttcaccgtaggtataaacatt
cctcaaggcgcgccagccggagtctcaacgcttcagtcgtcggacttttctgccacagtg
aatggctcgacattaaccggagaaacggcaagtgacagtattaatattgtgggtggacca
tcactcaagttagcattaagtgaactatcgattaatccaggcgatacaacgacggcaacc
tttactctggctcacagcgccagcgcttcagcgaacgcaacaagcatggctttcacgctt
gatcttgatgcggccatctcaggtttaacagcggttggtctgccttctgtagatgtgtgt
ggtacgggctcgcagatcagcggtacgagtactttaacgtttaccggtggaagtcttgct
cccaatgaaacctgtagttttgatgtcacattacaaacccccggcagtgttagttcgaat
atatatacgcttacgactagcagccttgacgctcaagtctcagggctatcaacgtcttcg
atagcgggctcagcgtctttgcaggtgtcgaacctcgaggctgccatggcgtttactaat
ctgccggtcgcgcctggtggaaccgcgaatttagaagtaactttaactaatgctagtgcg
acagaagcgctaagcgctgtcgtgtttacttcgagcatttcgagtacgctaagtggaatg
acggtcaccggattacccgccaacgatatctgtggtgctggttcacaagcgactggaaca
actactttgatagtaaacaatggcagcctagcggcgggcggaagctgtacttttaccttg
agcttaagtgttcctggcggagccagcgatggtacttatccattggtaaccagcaatatt
ggctttactgaaaatgcggtcaatatcaatatcaacaaaatcagtacgactttgatcgta
gaaacggatgttgcgcccaatgtcactttaacatcatccgcttcacccagtaccagtgtc
agtccgattcctgtctcgatggtgttcaacgaagatgtgacgggatttgatgtttccgat
ttaaccggcagcgtcaccaatggttccttgagtaattttcaagcaatttcagcgtctgaa
tactcggtcgatataaccccggcagcagctggagacgttacgctgcaagttccggcgagc
tctgctatcgacagtggaaccaatggtaacaatgtatctgatgtacttacgattacctat
gatcccgttgcatttattcttccgacggctgtcattggcgctccggatcaatcattgacc
aatacaggaccggttaattttgcggttacttattctaatgctgatcaggtgagtcttgat
gatgtcgaagtggttctggtgaccacaggcacggcaaccggtgatgtctcggtagcgaat
ggaaatacgacaacgccaaccgttaccttgtcaaatattacaggagaaggaagcattgcc
attagcctgacgtcaggcaccgctcgaaacagttttggaaatgcggatgcggttggcaca
agcgcggcatttaatgttgataatacggctccggatgtgtcgatctcttcggcagcacct
gatcccaccaatgctgcttttgatgtgacgtttacctttactgaagcggttaatgatttt
gtaaataccgatgttacagcatcaaacgcgtcggtttcgaccttatccggtggcccggtt
gtttataccgcaacaataacgccagacacggacggaaccgtgacattggatgtactcaac
tctgttgcttcagatagcgcaggaaatggcaacaccgccgcaacccaatatagcgttctg
tacgatgcaacggcacccagcgggtatgatatcaacattgaccaatcgtttattaatgcg
gccaatgatacggcgatgagttttagttacaccggagccgaagttggcgctgattataat
tattcggtctctgacggatcgtcccaagtttctggcgttggtaccatcgcgagcgcgagt
gatagcgtcacgggtatcgatgtgagtgggttggctgaaggaaccttgacattaaccttt
gtgttaacggaccccgttggaaacatgggtgttgcgattaccgataccgtaatcaagcaa
tacaatgatgcacccgtgatcaccgagggagccaccatcacggttaacatgagtgaagat
agcactcctaccgcatttaatttaacgttgaatgcaacggatccagaaaatgaaagttta
acttggagcgtgatttcatcggcgatcaatggtgtagcggatgcgacgggcacaggcaac
agccaagtggtcagctatacgcctcttgcgaactacaacggcagcgatagctttgtggtt
gaagtgactgacaataatgcgcttgaacctttgaccgatagtattaccgttaccgtacaa
atcacggcggtcaatgatgctccgacatttacgtccagtgctccagtcgtagtggctgaa
gacgcactttatacgtattcaataacgacaaacgatatcgatgctggtgatacattagcg
attactgcgagtgttatcccttcgtggttgagtttagtcgataatggtaatggcacggca
accttagctggctctccaaccaacgatgatgtcggtgtgcactcagttactcttttggta
actgatagcagtggtgcatcggacaattccgcgacacaaagttttagtgtggcggtttct
aataccaatgatgcaccgacctttacttcaactccggtgacggtcgcgacggaagatcag
gcctacagttacgctgtcactgccgctgatatcgatgtgggtgatagcatcgcgatcacc
gcgacagtattaccaagttggttgacattagtcgacaatggaaatggagcagcggtctta
tcgggtacgccactcaatgaacacgttggaaatcactcggttaccttagtcgtgaccgat
gatagcggtgatgtaaacgataccgcggctcagtcatttgttgttgcggtggccaatacc
aatgattctccctcgggcttgccagttataacggggactttgctacggaatgaaacatta
accgcagacacctctgggatcagtgatgacgatggtttgggaacctttagttatcagtgg
ttgcgaaatagcaacccaatcgcgggtgcttcatccgcaacatacacgccgggcgttgat
gatgtctggcaaatactgagtgtaacggtttcgtacactgatttaggtggcaatccagaa
tcgttaaccagtgctccaactggcgcaatttctgatctcgattcggatggtgatggaatt
tacgatttagaagagggaactggcgacagtgacggtgacggtactcctgactatttagat
cccgacagtgataatgatggtatccctgattctgaagagggaactggcgatagtgatggc
gatggcactccagactatttagacacgagcctcgatgaagacagtgatggtattccagac
attattgagtcggagagcaaccgcgataccgatggtgatggtttgcgagattttgaagat
cctgacagtgataatgacggactaactgacttagaagaatcgggagtttcaggtatcgat
accgatggtgacggtatcgatgattactatgatgttgatcaaaccggaggtgtcgacgct
aatggtgatggcattgatgacgcggtcatgccactcgactctgacaatgacggcattcct
gattacattgatcgcgacagcgataatgatggcattcccgacgctttagaaaatgagttt
gctttccgaaccgtgagtttgagtaaagctatgagctaccagagaatgatggccatcgat
accgacggtgatggaatcttaaatcatgttgatccagacagtgacaatgatggtttgagc
gacgcgattgaagcgcaaatcgttatggtggatacagacggtgatcaaatcattgatcag
ttcgatgttgacgtaaccggaggtgttgatgccaatcaagatggtgtcgatgacaacgca
acactcgtaaattctgataacgataatacacccgatttgttagacctagattccgacaac
gatggtcggtttgatatcgttgaagcgggattaattgatagtgactttgatgcgttgatt
gataacccaaccgatgcagttgttatcgcgcccgatacggataatgacggcacaccagat
tacctcgaccttgatagcaatgatgactcaacctgggatatcgagagcactggagcggcg
actctcgatctaaatggtgatgggcaaattgatgatgcatcgagtgacccagacaacgat
ggtattgtcgatccgctcgatgatgagcctaatcagtttggaactcagccagatcgcgat
ggtgatggtgttccgggtcgtatcgatcgagacgatgataacgacggtatttccgatgtt
gctgaaggcttgcttgatagtgatggagatggactgatcgatgcgttagacagtgacagc
gacaatgacggattgaatgatgcgtttgaaacggatcgtcctcggttaagtggcatagat
atcgatcgcgatggtattgacgacgctgttgatgttgattttgtgggcggaaatgacagc
gataatgacggtgtcgctgatcagtttaggcttgctgatacagacggagatggcacgcct
gattatcttgatactgatagtgataacgacgggatttcagaccaagaagagcaactgacg
gtaattcttggtggaactgatgtcgataatgatggactggatgatgtcgtcgatgcgacg
caaaccgcaggagatgacgcaaacggtgatggacaagttgatcgttcgattgactcgtca
gacttagatggcgatggtttacttgctttccgagacagcgacaccgacggcgatggtatt
gccgatggtgatgagaatggcgatttcaataatgatggtattaatgatcgcttacagacc
gatcccggagtatctgttgactcaggtagcggctctgttggatggatgatgttagggttg
ttggctctgtttccattgcgcaaacgcaaaaaaggtaagacagatttaaaactgcctttt
gctcgcatatggctgggttcatttgtgtcgtttattgcattgagtgttcctagtctcgtc
agtgccgatgaccaatgcttacgtgaacaaagttcatgttggtatcttgggtggggtatt
ggtcgcgcgcaacatgatatcaaagatgggcaaagtgcttggaaggtgagtgacaatgat
ggtcaatacggcacagtatttgtgggtgtcgactttagctctcacttatattgggaatta
gcgtatgaacagttagggcgtgttcaacttcgaaaccaaaatccagccattaatgtacct
ggcagtgttcgcttcgacagcttgagtacatcattgggtgtatggttaagaccgcactct
gcggactggaatttaggtctgtcggcgggtatttcggtgagagatgagaaacctcaaaat
gttcaatttaatagtggtgatgactctatggtaatgtacggagtagctgtgaaatggagc
gtgacagagaccaccgatattaaaaccaagtttacctattatgataacgatacaaatgtc
tttggcgtgtacctaattcaaagatttgactga
DBGET
integrated database retrieval system