KEGG   Candidatus Portiera aleyrodidarum AF-CAI: PLF_003
Entry
PLF_003           CDS       T03738                                 
Symbol
pnp
Name
(GenBank) Polyribonucleotide nucleotidyltransferase
  KO
K00962  polyribonucleotide nucleotidyltransferase [EC:2.7.7.8]
Organism
pli  Candidatus Portiera aleyrodidarum AF-CAI
Pathway
pli03018  RNA degradation
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:pli00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09123 Folding, sorting and degradation
   03018 RNA degradation
    PLF_003 (pnp)
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03019 Messenger RNA biogenesis [BR:pli03019]
    PLF_003 (pnp)
   03016 Transfer RNA biogenesis [BR:pli03016]
    PLF_003 (pnp)
Enzymes [BR:pli01000]
 2. Transferases
  2.7  Transferring phosphorus-containing groups
   2.7.7  Nucleotidyltransferases
    2.7.7.8  polyribonucleotide nucleotidyltransferase
     PLF_003 (pnp)
Messenger RNA biogenesis [BR:pli03019]
 Prokaryotic type
  Bacterial mRNA degradation factors
   RNA degradosome components
    Other RNA degradosome components
     PLF_003 (pnp)
Transfer RNA biogenesis [BR:pli03016]
 Prokaryotic type
  tRNA degradation factors
   PLF_003 (pnp)
SSDB
Motif
Pfam: RNase_PH S1 PNPase RNase_PH_C KH_1 KH_2 Spore-coat_CotD
Other DBs
NCBI-ProteinID: CEL12266
LinkDB
Position
I:complement(3011..5140)
AA seq 709 aa
MILYIKKFKYGGKNIILETGKIAKNTNGSVVITIENTVVLCTVVVNKNIKNQDYFPLSVY
YQEKTYAAGKIPGGFFKREGRPTEKEILTSRLIDRPIRPNINKNYKNEVQIICTVISAEK
KTNPDIAAMIGTYAAIGISDIPLIDTIGVARVGFNKEIGYWLNINNEINSELDIVVAGTK
KSVLMVEAEGKEKTELIILGAICYAHREMQFLIKNINEFTEEYKKKNNRLIKNNKKKENK
KNIYLENKLFNEFNYSIKDIFYIFDKIIRKEALNIIINQVLEKFLNNYFKYKYEIIYEKL
NVIIKKIFINKIFETNNRVDGRALKSIRSLSIQLGILPSAHGSALFTRGDTQALIAITLG
SLREAQLIEGLEEERYENLMFHYNFPAFSVGEIGFIGIPKRREIGHGNLAKRAISGVLSK
EDFPYSIRIVSEITESNGSSSMASVCGASLALMDAGVPLTYTVAGVAMGLITKQEKYLII
TDIVGDEDNFGDMDLKVAGTINGITALQMDIKTQKGINKEIIQLTLNQALEARKNIIYKM
NLVISKSRKKISNKAPINVILKIETQKIRDVIGKGGITIKKICESTKTIIDIKDDGKIHI
FANNKINSQKAIEAIKMITEEAKINKIYRGKVIRIMDFGAFVNFLPGTDGLVHISQISSG
HVKNIRDFINEGDIVPVKVLEKDNKGKIKLSIKEIDPIEKTEFEANFKS
NT seq 2130 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
ttgattttatatataaaaaaatttaagtatggtggaaaaaatattattttagaaacaggt
aaaatagctaaaaatacaaatgggagtgtcgttattactattgagaatactgtagtatta
tgtacagtagttgtaaataaaaatataaaaaatcaagattattttcctttgtcagtatat
tatcaagaaaaaacttatgctgcaggtaaaataccaggtggtttttttaaacgagaaggt
cgtcctactgaaaaagaaatattaacatcaagactaattgatagacctataagacctaat
ataaataaaaattataaaaatgaagtacaaattatatgtacagtaatttctgctgaaaag
aaaactaatccagatattgctgctatgattgggacatatgcagcaataggtatttcagat
atacctttaatagatactattggagttgctagagttgggtttaataaagaaattggttat
tggcttaatataaataatgaaataaattctgaattagatatagttgtagccggaacaaaa
aaatcagtattaatggttgaagctgaaggaaaagaaaaaacagaattaataattttaggt
gctatatgttatgcacatagagaaatgcaatttttaataaaaaatataaatgaatttact
gaagaatataagaaaaaaaataatcggttaataaaaaataataaaaaaaaagaaaataaa
aaaaatatatatttagaaaataaattatttaatgaatttaattatagtataaaagatata
ttttatatttttgataaaataataagaaaagaagcattaaatataattataaatcaagtt
cttgaaaaatttctaaataattattttaaatataaatacgaaataatttatgaaaaatta
aatgtaataataaaaaaaatatttataaataaaatttttgaaacaaacaaccgggttgat
ggtcgtgctttaaaatcaatacgttcattatccatacagttaggtattttgccaagtgca
catggttctgctttatttactaggggagatactcaagcacttattgctataactttaggt
agtttacgtgaagctcaattaatagaaggtttagaagaagaacgatatgagaatttaatg
tttcattataattttccagcttttagtgtaggagaaataggttttataggtatccccaaa
cgccgtgaaattggtcatggtaatcttgcaaaaagagctataagtggtgttttatctaaa
gaagattttccttattctataagaatagtttcagaaattactgagtctaatgggtcgagt
tctatggcttcagtatgtggtgcgtcattagccttaatggatgcaggggtcccattaact
tatacagtagctggggtggctatggggttaattaccaaacaagaaaaatatttaataatt
acagatatagtaggtgatgaagataattttggtgatatggatcttaaagtagctgggact
ataaatggtataactgcattacaaatggatataaaaacacaaaaaggtattaataaagaa
attatacaattaactttaaatcaagccttagaagctagaaaaaatattatttataaaatg
aatttagtaataagtaaaagtagaaaaaaaatttctaataaagcacctattaatgtaata
ttaaaaatagaaacccaaaagatacgtgatgttataggtaaagggggaataactataaaa
aaaatatgtgagagcactaagactattatagatattaaagatgatggaaaaatacatata
tttgctaataataaaattaattcacaaaaagctattgaagcgattaagatgattactgaa
gaagctaaaattaataaaatctatagagggaaagtaatacgtataatggattttggtgct
tttgttaattttctgcctggaacagatggactggttcatatttcacaaattagttcaggc
catgttaaaaatataagagattttattaatgaaggagatattgtaccagtaaaagtttta
gaaaaagataataaaggaaaaataaaattatcaattaaagaaattgatccaattgaaaaa
acagaatttgaagctaattttaaatcctaa

DBGET integrated database retrieval system