Candidatus Portiera aleyrodidarum AF-CAI: PLF_035
Help
Entry
PLF_035 CDS
T03738
Name
(GenBank) Putative transmembrane secretion effector
Organism
pli
Candidatus Portiera aleyrodidarum AF-CAI
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
MFS_3
MFS_1
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
CEL12295
LinkDB
All DBs
Position
I:37231..38886
Genome browser
AA seq
551 aa
AA seq
DB search
MLISTPQAFKAKNKLSNKKNSLFTPLTFKPFRIIWFADLIANLGTWAQSVASVWILTEYH
ANSRTLAMIQVVTALPLVLLSIISGVWADNYDRRKIMLMGMVLEFTGGALITSFAFLGYL
TSTKLILSILGMSIGASLAVPAWQAAINEQVSKNQVTNAVILNSVNYNFARAVGPVIGGL
LIKTFGTAWVFLLNCLCYLGLIWAVWKWKQIYPKRILPPEDISEGVISALKFAKYSKVMR
FVMLRSFVFGLSASALWALLPVLAHNNTHLVAQKTKTASIYGYMLGALGTGAIIGSAIVK
KYCKIVDTNKMISFASILLSIVMLLIGILNIKLLMFGALMVGGSCWITVLASYNSSVQML
VPDWVKARALALYQTTLYAGLAIGSFCWGHLAGIINVKIGLVIAGFLLLISTLALLNLRL
PKVDEKNKSIRHIEPKYNKKKLEFYKYKESIILSIEYCIPVNKKNEFINLIMKLRNVRLR
NGAKSWALYQNVEDKEVWQEIFLIRNWLQYLRMLSRITIADKIIIDKVNKMHRGLKPPRT
YQGIQQIKPKK
NT seq
1656 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcttatctcaacaccccaagcttttaaagccaaaaataaattatcaaataaaaaaaat
agtttatttaccccattaacttttaaaccttttagaataatatggtttgcagatttaata
gcaaatttaggtacatgggctcaatcagtcgcgtcggtttggatattaactgaatatcat
gcgaactccagaacgttagcaatgatacaagtagttacagctttacctttagtattgtta
tctattatttctggagtatgggcagataattatgataggcgtaaaattatgttaatggga
atggttttagaatttactggtggtgctttaataacttctttcgcttttcttggttattta
acttctacaaaattaatattatctatattaggaatgtcaattggtgcttctttagcagtc
ccagcatggcaagcagcaataaatgaacaagtttctaaaaatcaagttacaaatgctgta
attttaaatagtgttaattataattttgcaagagcagtgggtccagtaataggtgggctt
cttataaagacatttggtactgcatgggtttttttactaaattgtttatgttatttagga
ttaatttgggctgtttggaaatggaaacaaatttaccctaaacgaattttaccacctgaa
gatatatctgaaggtgtaatttcagcattaaaatttgctaaatattctaaagttatgaga
tttgttatgttaagatcttttgtttttggtctttcagctagtgcattatgggctttactt
cctgtattagctcataataatactcatttagtagctcagaagactaaaacagcttcaata
tatggctatatgttaggagctttaggtacaggagcgattattgggagtgctatagtaaag
aaatactgtaaaatagtagatactaataaaatgattagttttgcttctatattattaagt
atagtaatgttattaattggaattttaaatataaaattgttaatgtttggggctctaatg
gtaggaggtagttgttggataacagtattagcaagttataattcctctgttcaaatgtta
gtaccagattgggtaaaagctagagctttagcactttatcaaactacattatatgcaggt
ttagcaattggttctttttgttggggtcatctagctgggattataaatgttaaaattgga
ttagtaatagcaggtttcttattattaatatctactctagctttattaaatttaagatta
ccaaaagtagatgagaaaaataagagtataagacatatagaacctaaatataataaaaag
aaattagaattttataaatataaagaatcaataatcttatcaattgaatattgtatacct
gtaaataaaaaaaatgaatttattaatcttataatgaaattaagaaatgttagattacgt
aatggtgcaaaatcttgggcattatatcagaatgttgaagataaagaagtgtggcaagaa
atatttttaatacggaattggttacaatatttaagaatgttaagtagaataacaattgca
gataaaataattatagataaagttaataaaatgcatagaggtttaaaaccacctagaaca
tatcaaggaatacaacaaataaaaccaaagaaataa
DBGET
integrated database retrieval system
