Candidatus Pristimantibacillus lignocellulolyticus: NAG76_02855
Help
Entry
NAG76_02855 CDS
T09890
Name
(GenBank) glycoside hydrolase family 15 protein
Organism
plig
Candidatus Pristimantibacillus lignocellulolyticus
Motif
Pfam:
Glyco_hydro_15
Glucodextran_N
Bac_rhamnosid6H
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
URN95217
LinkDB
All DBs
Position
697386..699320
Genome browser
AA seq
644 aa
AA seq
DB search
MNNKKPYLVDAVIGNSRMLATLGRTGKMYRLWWPNIDTPQHVDAMRVGIQVDGSNVNWFD
EEGNGWNHDINYANRSNVLHINASNESQALTVNSRHFAVPSTDLLVREYAFVNSSNESKQ
FSFVVHSSFVISENGLYNTTMFNNLADSLIHFRHQYFFGVSSAIVCTKYQAGISWEDAQS
GQFNGGNIDMRPDGALSYELTVEAGETVIVPIYVAAGNNEQQVIELLEQARKKTSAQWAD
ETNAYWNQYLNNAVPCPVEDEEIKDLYERSILMFKLMSDEKTGTIIAAPEFDETYSRCGG
YSYCWGRDAAFITTALDKVGLKDLTNAFYDWTLSAQSPDGSWQQRHYHDGQLAPSWGLQI
DEGASIIWGMWQHYLVNEDRDFAARVWPAVSKGAQFLESFIDPATGLPKPSIDLWEEREA
SHTYSSAAVYGGLTAAAGFAELAGETALRDQWNTIATGIQAGIETYCFNNELRSFYRGID
LKVSAHKFNTDTANGSEGYVVDLDKGYQKHVMKYDPIVDISLLGISVPFNAVAAESNRMR
STADAIEKLLTVEGVGGIKRYEDDNYIGGNPWILTTLWLAHYRFANGEVSSARQLMQWTL
DHRTETGLLPEQVDKNTGETAWVVPLTWSHAMFILAVFMLAESK
NT seq
1935 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaataataaaaaaccgtatttagttgatgctgtaattggtaattcacgtatgctcgct
acacttggacgcactggtaaaatgtatcgtctatggtggcccaatattgatacgcctcaa
catgtcgatgctatgcgtgttggtattcaagtggatggctcaaatgttaattggtttgat
gaagaaggtaatggttggaatcatgacattaactatgctaatcgtagtaatgtgttgcat
attaatgcctctaatgaatcacaagcccttactgtaaacagccgtcatttcgctgttcct
agtacagatttattagttcgtgaatacgcatttgttaactcaagcaatgaatctaaacaa
ttctctttcgtcgttcattcttctttcgtcattagtgagaatggattatataatacaacg
atgtttaataatttggctgattcgttaatccatttccgtcatcagtatttctttggagtt
tcgagtgcaatcgtatgcacaaaataccaagcaggtatatcatgggaagatgctcaatct
gggcagtttaatggtggaaatatagatatgcgtcctgacggtgctttatcttatgaatta
actgtagaagctggtgaaacagttatcgtaccaatctatgtcgctgcgggtaataatgag
caacaagttattgagctattagaacaagctcgtaaaaaaactagtgcgcaatgggctgat
gaaacaaatgcctattggaatcaatatttaaataatgctgttccttgcccagtagaagac
gaagaaattaaagatttgtatgagcgttcaattctaatgttcaaactaatgtcagacgaa
aaaacaggtacaatcattgctgcgcctgaattcgacgaaacttatagccgttgtggtgga
tactcttattgctggggtcgtgatgcagctttcatcactacagcgcttgataaagtaggc
ttaaaagatcttactaacgctttctatgactggacactatcagcgcaatcacccgatggt
tcatggcaacaacgtcactatcatgatggtcaattagctccatcttggggattacaaatc
gatgaaggtgcatcaatcatttggggaatgtggcaacattatttagttaatgaagatcgt
gattttgctgctcgtgtatggccagcagtatccaaaggtgctcaattcctagaatcattt
atcgatccggctactggacttccaaaaccaagtattgatctttgggaagaacgtgaagct
tctcatacgtactcctctgctgcggtatatggtggtctaactgctgctgctggttttgca
gagcttgctggtgagactgctctaagagatcagtggaatacaatagctacaggcattcaa
gcaggaatcgaaacttactgctttaacaatgaacttcgtagtttctaccgtggtattgat
ctgaaagtatctgctcataagtttaatacagatacagctaatggttcagaaggttatgtt
gttgaccttgacaaaggctatcaaaaacatgtgatgaaatacgatccgattgtagatatt
agtttgttaggcattagtgttccgttcaatgctgtagctgcagaatccaatcgtatgcgc
tcaactgctgatgcgattgaaaaacttctaacggttgaaggtgttggcggaattaagcgt
tacgaagatgataactacattggtggcaacccatggatcttaacaactctttggttagct
cactaccgtttcgcgaatggcgaagtatcctctgcacgtcaacttatgcaatggacactt
gatcatcgtacggaaactggtcttctaccagagcaagttgataaaaacacaggcgaaaca
gcatgggtagtacctcttacatggtcacatgctatgttcatacttgcagtatttatgctt
gctgaaagcaagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
