Pristimantibacillus lignocellulolyticus: NAG76_16870
Help
Entry
NAG76_16870 CDS
T09890
Name
(GenBank) DUF6531 domain-containing protein
Organism
plig
Pristimantibacillus lignocellulolyticus
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
RHS_repeat
TEN_YD-shell
DUF6531
FlgD_ig
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
URN93491
UniProt:
A0A9J6ZBP0
LinkDB
All DBs
Position
3951397..3958263
Genome browser
AA seq
2288 aa
AA seq
DB search
MKYRLKQAISILLIAMLLISGIPLYPGNNEFLTPKAEASTNMRIEPSEINVNKGEKANIL
FSFNAADSNQDEHDIVIMVCTPQLDGGAPIPGSVIKEGTYKTKENEQYVTHKVEWDGKIN
GQPLAEGRYTICVSPANYTGIGVYYGQMASFEIVESDWLDAPTAISVKPSTTTGKVTVAG
TAPVGTSVKLELTETGSEEAEQAGTATPNSQGKWSQAVTLPANKLVSLSALAEQDELTSS
YSELVNVMRYQLPTFPITWEELTAYFYKTDSMSSTVQQAKQIAEWNNLSISACSEARCPE
RISNVSSLVLIDPEMETVPAQSDLTAFQADDINNRLTIVNPSGMEPIDLARGDFVYYAPS
LNLQALMPLDFNLQYLSRNVEEGAHGLGWRHSYEWSLTAIEDKIELIEPDGSRFEFIPLA
DGKYMSPRGTNLSLERLANGTHVLRTLDGEQYTFSAQGVLQSIADLNGNTIQLSYSGQTL
QSITTLGASLTLLYNPEGKLSSAADQTGRKLQYNYNAAGDLIEIVDVDGSTIELTYDNNH
RVNSVTTPAKDGKMSVVYDDNGRVTSLTDYYGEQTETAYEGKIAPVVRGEDEEEGSQGPI
SIHPDNAKDIAESDEVILSGTMHNLANAPAYRNVNGLKPVISNYIESQANKFKQEINTYT
SSAIACSSCDIAGLKAAIQSSSANPVIIKVGQLNVEESVTFGSASKPVVVIADGMNTNKD
ITVEIYGTLVVQNGLNANTKLKLIANEVGGKYGSILSNGRIHLNNDSTVNVSNTLYTTGL
TYNSGLLSITADRIVVTDELHINTRVEMDIASEMSLGGLVSNNELAQLTIIGGDLFVRDN
VSVNNQLSISTGGVFAIGGDMTPNRKPTLLTGIGTGKTILKYPADAIAARSATNAINSSN
EWKLNEVATSTAPAGKTVQKDALGRQTSFEWSDRFLLRSKKLPDGTTNEFEYDNGNRVKR
MVDGNKNSNRLKYDARGNLLQAIGGMGQSIVYRYNSLNRIVAVTDSQGSKESYVYDQAGN
VTKHTDPLGATISIERDSTGVPTKSVDAEGAVTTYVNDSNKFTSVIVDAAGYETSVERDE
LHRITKMDDGQGTVEEYVYDDKDRIIRATDALTQATSVEFDLNGNLKSTTDEAGNTEHYS
YHIDRIVSEKDSIGNETTYAYDNVGNVTSTTDADGATTSDSFDSMDRVKATTDALGNITT
YTYDDSGNVLTVTDPEGGITRNTYNKDNQLLTVTDPLGAVTTNKYDSEGQLIKTTNAIGN
STWYEYDEVGHMVKVIDALGGVTEYNYDGNGNLTSTIMPNGAEWQTKFDERGYEVGQIDP
LLNETKIERDLLGRMTASIDAEGNKTSYDYDNLGRNTKITNALGHQTSYQYDELGNVVNI
TDGNGHVTIFDYDALGRLITVTNAEGDTTAYTYNETGQVIKQLNANGHATTYEYNALGQL
TQRINPLGENKSYQYDGKGNLIEFTEPDGVKANYTYDATGRVVSIVYSDGEKVEYTYDLI
GRRLEMLDSNGLTRYTSDALNRPTEIIDAQGYNIRYEWDSVNNRSRVIYPDNSSVRYSYD
ELNRMTEVKENQQQPTVYSYDKNSRLQQKTLPNQGKSIYQYDALGQLLELAHYGSNAQLV
EKLNYSYDAAGNMLSATRQQSGSDEDNPTGVQSPAEVTQYAYDALNQLMEAQKLGGTKTN
YSYDAFGNRTSKTIIENGSWTEESYTYDAANKLTLWQSGSDSRSYNYDQRGNLLQVQGTG
SGASTMEQMLTMQDPAEIVEESLPSSDIEVDPAVTENEEVVSDTVEALNADTEQELVESS
EQDVAIEEVKASDLEAEQHTDEVTEERTVSELSTDSMNSLNAALLEQYEWNDANRLTRHT
NETGDVTTYRYDGDHNRVYMGTELGSLDAASAYPDGHPLGDRTGWEPQYKKEQTAIYFAN
DTTLNYAEPLMAISEDKNWKQNYTYGALGERISMSYLPSEDPSNDWEPTPGASGANSGNA
LTTLYYLSDVRGSAIGLMDPEGAIAARYHYDEFGIALDDEKFDMNWAGPDNLFGYTGLGY
DYTSGLNNARSRYFDASIGRFISEDTVEGDNKNPLSLNLYTYVQNNPNKYVDPSGNIPVL
IALLGKVIVNYAIDVMIGVGFDYLSYVKSGSTSKFNMTASLKKNAKESAVPGLGFIKKFK
RGLKLADEIKAAQKAAKAKKVKIANSGFIKAKEVRFSQNSISRKFSDGKSVEDLIKGLKN
GTIKSKDLPEIRIFEKNGNLFSLDNRRLYAAQQAGVKVRYRMATPKEINKEIGKKMTTQN
NGTSIRVR
NT seq
6867 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgaagtacagattgaagcaagccatatctattctattaatagcaatgctacttatatcg
ggcattccattatatccaggtaataatgaatttctaacaccaaaggccgaagcctctaca
aatatgcgaatcgagcctagtgaaattaatgttaacaaaggtgaaaaggctaatatttta
ttcagtttcaacgctgccgatagcaatcaagatgagcatgacattgttattatggtctgt
acgcctcagctagatggtggcgcgccgatccctggtagtgtcattaaagagggaacgtat
aagaccaaagaaaatgaacaatatgttactcataaagtagaatgggatggcaaaattaat
ggtcaaccactagcagagggacgctataccatttgtgtatctcctgcaaattatacaggt
ataggtgtatactacggccagatggcaagttttgaaattgtcgagtcagactggctggac
gctccaacagcaataagtgttaagccgtctactactactggcaaggtaacggtagcaggc
actgcaccagtaggcacaagcgtaaagctagagcttactgagactggtagcgaggaagca
gaacaagcaggtacagcgactccaaacagtcaaggtaaatggagtcaggcagttacactc
ccagctaataagcttgtaagtctatctgctctagcagagcaagatgagctaacttccagt
tactctgaacttgttaatgtgatgcgctaccagttaccgacattcccaattacttgggaa
gagcttacggcgtatttctacaagacagacagtatgtctagtactgttcagcaagctaag
caaatagcggagtggaataacttaagtatatcagcatgtagtgaagcaagatgccctgag
cgtataagtaatgttagctcattagtgctgattgatccggagatggagactgttcctgct
cagtcagatcttacagcattccaagctgatgatattaataatcgtctaacgattgtaaat
ccttctggaatggagccgatagatctagcaaggggtgactttgtatattacgctccgtcc
ttaaatttgcaagcattaatgcctcttgatttcaacttacaatatttgagtcgaaatgtg
gaagagggagcacatggattaggttggagacattcctatgaatggtcgctgacagcgatt
gaggataagattgaactgattgaacctgatggttctcgctttgaattcattccacttgca
gacggtaaatatatgagtccgcgtggaacaaacttgagcttagagcgtttagcaaatggt
acgcatgttctacgcacgctagatggtgagcaatatacatttagcgctcaaggcgtattg
caatctattgcagacttgaatggaaatacgattcagttatcctacagtggacaaaccctt
cagtcgattacaacactaggtgcaagtctaacgttgctctacaatccagaaggtaaatta
agttcggctgctgatcagactggacgcaaactgcaatacaattataatgcagctggagat
ttgatcgagatcgtagatgttgatggttctacgattgagctaacttatgataataatcat
cgagtgaattctgttactacacctgcgaaagacggtaagatgagcgttgtctatgacgac
aatggtcgcgtgacatcattgacagattattacggtgagcaaactgagacagcctatgaa
ggtaagatcgcacctgttgtacgtggtgaagatgaagaagaaggttcacaaggtcctatc
agtattcatccagacaatgcgaaagatattgctgagtcagatgaggttatattatctggt
acgatgcacaacttggccaatgcaccagcatatcgcaacgtaaacggccttaagccggtt
atttccaattatattgagagtcaagcaaacaaatttaagcaagaaattaatacgtacact
tcatcagcaattgcttgcagtagttgcgatatagctgggttgaaagcggctattcaaagc
agcagtgctaaccctgttatcattaaagtaggtcagctgaacgttgaggaaagtgttacg
ttcggaagtgctagcaaaccagtcgtcgtaatcgctgacggcatgaatacgaacaaagat
ataactgtagaaatttacggaacattagttgttcaaaatggcttgaacgcaaatacaaag
cttaagctcattgctaatgaggttggtggtaaatacggaagtattttgtctaatggacgc
attcatctgaacaatgattctacagtgaatgtttccaatacattgtacacaacaggatta
acttacaatagtgggttactcagcattactgcagatcgcattgttgtaacggatgagctt
catattaatacacgagtggagatggatattgctagcgagatgtcgctaggaggtctagtt
tccaataatgagcttgcgcagcttacgattattggaggcgatctattcgttcgtgataac
gtaagtgttaacaatcagttaagcatctctacgggcggtgtattcgctataggcggtgat
atgacgccgaatcgtaaacctactctattgacaggaataggaaccggaaaaacgatattg
aaatatccggccgatgctatagctgcacgaagtgcaacaaatgctataaactcctcgaat
gagtggaagctcaatgaagttgcaacatcaacagctccagcaggaaaaacggtgcagaag
gatgcacttggcagacagacaagcttcgaatggagcgatcgcttcctgctgagaagcaag
aagctacctgatggaacaacgaatgaatttgaatacgacaatggtaaccgtgtgaagcga
atggtagatggtaataaaaattcgaaccggttgaaatatgatgcaagaggtaatttactt
caagccattggcggaatgggtcaatctatcgtataccgatacaatagtctaaatcgtatc
gttgctgtaactgactcacagggaagcaaggaaagctatgtatatgatcaagctggaaat
gtaacaaagcatactgatccacttggtgcaacaatctcaattgaacgtgacagtactggt
gtaccgacaaaatcagtagatgctgaaggtgcggtaacgacttatgttaatgatagcaac
aaatttacttctgttattgtagatgcagcaggttatgagacatcagtcgaaagagatgaa
cttcatcgcattacgaaaatggatgatggtcaaggaacagttgaagaatatgtatacgat
gataaggatcgtatcattcgtgcaacggatgcactaactcaggccacatcagttgaattt
gatctcaatggtaacctgaagagtacaacggatgaagcgggaaataccgaacattatagc
tatcatattgatcgaatagttagtgaaaaggattcaataggtaatgagactacttatgcc
tatgataatgtcggtaatgtaactagtacgaccgatgcggatggagctactacatcagat
agctttgatagtatggatcgcgtgaaggcaacaacggatgcacttggtaatataacgaca
tacacctatgacgacagtggaaatgtactaacagtgacagatccagaaggcggtattacc
agaaatacgtataataaggataatcaattgctcacagtgactgatccacttggagcggtt
acgactaacaagtatgacagtgaaggtcaacttattaagacaacgaatgccattggtaac
agtacgtggtatgagtatgatgaagttggccatatggtgaaagtgattgatgctctaggt
ggagtgacggaatataactatgatggcaatgggaatttaacgtctactattatgcctaat
ggagcagaatggcaaacaaagtttgatgaaagaggttatgaagttggtcagattgacccg
ctgttgaatgaaactaagattgaacgtgatttgcttggtcgcatgacagcaagtatagac
gccgaaggcaataagaccagttacgattatgataatcttggtcgcaatacgaagattacg
aatgcattgggacatcagacaagctatcagtatgatgagttaggcaatgtagtgaatatt
accgatggcaacggtcatgtgacaatttttgattacgatgcacttggacgattaattact
gtaaccaatgcagaaggcgacacaaccgcatatacctacaatgaaacaggtcaagtcatt
aaacagttgaatgcgaatggtcatgcgacaacttatgaatataacgctctaggtcaatta
actcagcggattaatccacttggagagaacaaatcgtatcaatatgacggaaaaggcaat
cttattgaatttacagagcctgatggtgtgaaggctaactacacttatgatgctacaggg
cgagttgtgtcaatagtgtactctgacggtgagaaggtagaatatacgtatgaccttatt
ggtcgtagattagaaatgctagatagtaatgggttaactcgctatactagcgatgcactt
aaccgtcctactgaaattatcgatgctcaaggctacaatatccgctatgaatgggatagt
gtaaataatcgtagtagagtcatctatccagacaactcttctgtgagatatagctacgat
gagcttaatcgaatgacagaggtaaaagagaatcagcaacaaccaacggtatatagttac
gataaaaatagtagattgcagcagaaaactttaccgaatcaaggtaagtctatttatcag
tatgatgcactaggacagctactagagctagcacattatggttcgaatgctcaattagta
gagaagctaaactactcttacgatgcagcaggcaatatgctaagtgcaactcgtcagcag
tccggaagtgatgaagacaatcctactggcgtacaaagtcctgctgaagttacgcaatat
gcctatgatgcgttaaatcagctgatggaggcacagaagctaggcggtacgaaaacaaac
tatagctatgatgcattcggtaatcgaacgagcaagacgataatagaaaatggtagctgg
acagaggaatcttacacgtacgatgctgctaataagttgacattatggcagtctggtagt
gattctagaagttataactatgatcaacgtggtaatctactacaagtacaaggaacaggt
agtggagcaagcacgatggagcaaatgcttactatgcaggatccagcagagatcgtagag
gagagcttgccaagcagtgacattgaagttgatcctgcagtaactgagaatgaagaagtt
gtctcagatacagtagaggcgttaaatgctgatactgagcaagagttggtagagtcaagt
gagcaagatgtagctatcgaagaagtaaaagcaagtgatcttgaagctgaacaacataca
gatgaggtaacggaagaacgaactgtttctgagctatctactgactctatgaacagcttg
aatgcagcattgctagagcaatatgaatggaatgacgcgaatcgtttgactcgtcatacg
aatgaaacgggagatgtaacgacctaccgttatgatggcgatcataatcgtgtctatatg
gggacagagctaggcagcttggatgcggcaagcgcttatccagatggtcatccacttggt
gacagaacaggctgggagccacagtataagaaggagcagacagcgatctacttcgctaat
gatacgacattaaactatgcggaacctttaatggctattagtgaggataaaaactggaag
caaaactatacgtacggtgcattaggcgaacggattagtatgagctatctaccaagtgaa
gatccaagcaatgattgggagccaacacctggggcaagcggtgctaattcaggtaatgct
cttactacgttatactatttgtcagatgtacgtggaagcgcaataggcttgatggatcca
gagggtgcaattgccgctcgttaccactatgatgagtttggtattgcattagacgatgag
aaattcgacatgaactgggcaggaccagataatctattcggatacacaggattaggttat
gattatacaagtggactgaataatgcacgttcccgatattttgatgctagtattggtaga
tttattagtgaggataccgttgaaggtgacaataaaaatccactgagtttgaatctatat
acgtatgtgcaaaataatccgaataagtatgtagatccaagtggtaatatcccagtacta
attgcgctccttggtaaagtcattgttaattatgcgattgatgtcatgattggagtagga
tttgattatttatcctatgttaaatcaggttctactagtaaattcaatatgacagcttcg
ctgaaaaagaatgcgaaggaaagtgctgttccaggtttaggttttatcaagaaatttaaa
cgaggattaaagttagcggatgagattaaggcagcacagaaggctgcaaaggctaagaaa
gtcaaaattgccaatagtggatttattaaagctaaagaagttagattttctcaaaacagc
atttcacgcaagttttcagatggtaaatccgttgaggatttgataaaaggtttaaaaaat
ggcactataaaatctaaagacttaccagagataaggattttcgaaaaaaatgggaattta
ttttctttagataatcgtcgtctatatgctgcacaacaagcaggggtcaaagtcaggtac
agaatggctactccaaaggaaattaataaagagattggaaaaaagatgacgacccaaaat
aatggtacatcaattagggtaagatag
DBGET
integrated database retrieval system