Polaribacter litorisediminis: K8354_01140
Help
Entry
K8354_01140 CDS
T07786
Name
(GenBank) T9SS type A sorting domain-containing protein
Organism
plit
Polaribacter litorisediminis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Por_Secre_tail
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UAM98463
LinkDB
All DBs
Position
complement(281817..285227)
Genome browser
AA seq
1136 aa
AA seq
DB search
MKQKNFFKIAIILFLVIIANNSFGQTTLYSQGFETDLNGYNHIPSQTPATNPGKQYFYRA
EPSDPSIYEIRSDGPYTNITDSWFFVGSNPKTISTVGILSTGPIHVTGYENFKLSIDFGA
VPNDWDANDNLSVEYSWNNTDWSMLYNFKATDTNFPLNLVNNAIGENNTNNGVVLTYALQ
TITSNNFVGTGNSMYIRVVCDSGANYEAFGLDNIILTGTAISSDPTLNFETETSSFNETD
IDVITSGIPVSLMNYMTSVTITPTVNALSTADPADYTINLTPLTFTANETLMIPLTIKDD
TDFLNETIIIDYTVTSGTANLGIHQHTVTIIDNEIPPSIGFNDTNSSETETNITFTSTNI
PISVNNYFGERIDINVAITGGTAEVSDYTFTSPTALSFFADETQNITVDIHDDADTDSET
LILTITETSSVTGLVIQQATHTLTIVDDEASEGALFNADFSYDNDGFADHSTSAPPIAGS
VKVGPFGVSPNTWFLSYNTPPSTDSTLNTFKIVSGKLETTDWGGEGIFESQDIDVTSIST
LDIAAFAVTLSDAVQNGSTEFFKYYYILDDGPPVETAIVLSGDTDGTPVNYAITNLDVSS
ATSLVVGFSFNCNGANDGYAISSFTVTETSSLPTTITWDGSDSPDWATAANWDTGTVPTA
FDNVVIPDVATAPIISSTTGAVTNNLTITEPESLNITAGGSLIVTGNSIGEVTYNIAVSN
QWHLVSSPVAGETYDDNWADNNNIVSGSGSNRGISTYQNGTPNETTGPWVYMQDGETSTF
SSGIGYSLKRTSSGTYSFTGTYPDGKVNPVISRNVNNWNLIGNPYPSYIDIAAFISENTS
THDNLADAFSAIYVWDPDSGTTGAYADLITGYIHPGQAFFVNAKVNGIASITEAMQSHQT
AIFYKNANTSIDLFISNGSSTKKTKINYLDDKTKGLDAGFDIGMFNGVSSNTTIYTHLIE
NNQGIAFARQALPNEDLESLVVPIGVKAYKNTEITFSAEALNLPTGIKILLEDRELHTFT
ILDEATSTYKLTLAESLNGIGRFYLHTKANNTLNITDTNSEDISMYKTNNSNLRIIGLTP
GTSNIKLFNMLGKELMNLDFISKRVQDISLPNLETGIYIIQIETASGKLNKKITSD
NT seq
3411 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgaaacagaaaaacttttttaaaattgctattattttatttttagtaataattgcaaac
aattcttttggacaaacaactttatattctcaaggtttcgaaacggatttaaatggctat
aaccacatacctagtcaaactcccgcaacgaatcctggaaaacaatatttttacagagca
gaacctagtgatcccagtatttatgaaattaggagtgatggtccctataccaacatcact
gattcttggttttttgttggctcaaatcctaaaacaatttctactgtaggcatcttatca
acaggcccgattcatgttactggatatgaaaactttaaattatcgatagattttggcgct
gttccaaatgattgggatgctaatgataacttaagtgtggagtattcttggaacaatacg
gattggtctatgctctataattttaaagcaacagacaccaattttccattaaacttagtt
aacaatgcaattggagagaataacaccaataacggggttgttttaacctatgcgctacaa
actattacaagtaataattttgtaggtacaggaaactcaatgtacataagagttgtttgc
gattccggcgcgaattatgaagcttttggtttagataatataatcctaacaggtacagca
atttcttcagacccaaccctaaatttcgaaactgaaactagttcttttaatgaaacagat
atagatgttattacatcaggaattcctgtttctctaatgaactacatgacaagcgttacc
attacaccaacagtgaatgctttaagtacagcagaccctgcagactatacaattaattta
acacctttaacttttacggcaaatgaaaccttaatgattcctttaaccataaaggatgat
accgattttctgaatgaaactattatcatcgattatacagtaactagcggaactgctaat
ttaggcattcatcaacatacggttactattatcgataatgaaataccaccttcaataggt
tttaatgacactaatagttcagaaacagagacaaatatcacttttacaagcacgaacatt
ccgatctctgtaaataattattttggtgaaagaatagatataaatgtagcgattacagga
ggcacggcagaagttagcgattatacatttacatcaccaacagccttatctttttttgct
gatgaaacacaaaatattaccgtagatattcatgatgatgcagacacagattctgaaact
cttattttaaccattacagaaactagctcggttactggtttggttattcagcaagctaca
cacactttaaccattgtagatgatgaagcctcagaaggtgcattatttaatgccgacttt
tcttatgataacgatggttttgcagatcattcaactagcgcaccaccaatagctggatct
gtaaaggtaggaccatttggtgtatcgccgaatacatggtttttgtcttacaacacacca
ccctctacagatagcactttaaatacttttaaaattgtttcaggtaaattggaaacaact
gattggggtggtgaagggatttttgaaagtcaggatatcgatgttactagtatctcaacc
ctagatatagctgcattcgcagttacgctttctgatgcggtacaaaatggtagcactgaa
ttcttcaaatattattatattttggatgatggtcctcctgtagaaacagcgattgttcta
tctggagatacggatggaactcctgtaaattatgctatcactaatttagatgtttcctcg
gcaactagcttagttgttggcttttcgtttaattgtaatggtgctaatgatggctatgct
atttcttcttttaccgtaactgaaactagttctttaccaactactattacttgggatggt
agtgatagccctgattgggcaactgctgcgaactgggacacaggcacagtgcctacagcg
tttgataatgttgtaattcctgatgttgctactgcaccaattattagttctaccactgga
gctgtaacgaataatttaacaattacagaaccagaaagcctaaacattactgcaggaggt
tctttaattgtaactggaaattcgataggagaagttacgtacaacattgctgtttctaat
caatggcatttagtttcttctcctgttgctggagaaacctatgacgataattgggcagac
aataataatattgtaagcggatctggatcaaatagaggaatatctacttatcaaaatgga
acaccaaatgaaactacaggtccttgggtctatatgcaagatggagaaacaagcactttt
agttctggcatagggtattccttaaaaaggacgagctctggaacttactcttttactggc
acatatcctgatggcaaagtaaatcctgtaatttcaagaaatgtaaacaactggaatttg
attggaaacccttacccttcctatatagatattgctgcatttataagtgaaaacacctca
actcatgataatttggcagatgccttttcagctatttatgtttgggatcctgattccgga
acaacgggtgcttatgccgatttaataacagggtatattcatccaggacaagcattcttt
gtaaacgctaaagttaatggtatcgcttcaattacggaagctatgcaaagtcatcagact
gctattttttacaagaacgctaatacttctatagatttattcatttctaatggctccagc
actaaaaaaacaaaaattaattatttagatgacaaaacgaaaggtttagatgctggtttt
gatatcggaatgtttaatggagtttcctcaaatacaacaatctatacccatttaatagaa
aataaccaaggaattgcatttgcaagacaagcattacccaatgaagatttagaatcttta
gtagttcccatcggagtaaaagcttataaaaatactgaaattacattttctgccgaagct
ttaaatttaccaactggtattaaaatacttttagaagatagagaactgcatacttttacc
atactagatgaagctactagtacttataaacttaccctagcagaatctttaaatggaatt
ggaaggttttatttacatacaaaagctaacaacacattaaatataaccgataccaattca
gaggacattagtatgtacaaaactaataattctaacttaagaattatcggtcttactcca
ggaacctcaaatattaaattatttaacatgctcggaaaagagttaatgaatctagacttt
atctcaaaacgagtgcaagatatttctttaccaaatttagaaactggaatctatattata
caaatcgagacagcttcaggcaaactaaataaaaaaatcacttcagactaa
DBGET
integrated database retrieval system
