KEGG   Polaribacter litorisediminis: K8354_08410
Entry
K8354_08410       CDS       T07786                                 
Name
(GenBank) choice-of-anchor D domain-containing protein
Organism
plit  Polaribacter litorisediminis
SSDB
Motif
Pfam: ASH DUF1573 TMEM131_like_N MOV-10_Ig-like Por_Secre_tail He_PIG G8 fn3 Cadherin_5
Other DBs
NCBI-ProteinID: UAM99807
LinkDB
Position
1954421..1961701
AA seq 2426 aa
MMKSRDLKIKNQSSKFKFTLILLLLGTFLTVKAQQSITYTPNPLNFQSTDVGQFSGMELT
PTSSDGASIYEITNITITGSNASEFDASGNNIPFYVDPEFPLPIMIGFGPTSAGNKTAVL
TIVSNAPDSPHIINLSGSSEVALVPEISYNATIDFGGIDINTTTSQNLIIENKGNSPLTI
SNITMLEDYFDKTQFSLPTDLNLPIIVPAFSTADAISVSFSPEMTGAISGNNNRMARIEI
SSNDTSSPNIVNLQGAVLQPNLEINFLPEPYAFGDVNLGETSTQNITINNTGAGTLVVSN
LSITPIVGSDFSHPEDYTLISPTTFPFNIAPNSSQDISIAFTPRDMGFRYARLSIETVNA
TNEIINITANGVNSNFTSSTSNLTFSELRVGQDETLSFSITNNGNRNLNLSSGIISGADA
SSFSIVSVNEIKTVGQGESNAVTVFVRYTPAESKTHQAKITYTSDAPNSPHEITLTGSAI
DSDLQISTDNIDFGDVNIGLTKTQTITLSNTNGTDAVTIDDIRIRVSPDWLKFSLSEIDF
PLIIDAGAETSFQVNFLSTSGGNKTAQIEIVSNDTNSPQSINLTGNTLTPGLLVSSPMLD
FLDTQAVVQSRTKLFQITNDGDGDLLLTDMTINGANAADFQFEDITLPLTIAASNSKTVR
VIFSPQTAGTRVATLTVKGDFVEDKIIGLLGKGNTPLISATNSGVFGQVRHNRTQTKVIT
LANSGTTDLVITEATITNTANAIFSLQDVTLPITISPGKTYDIEVLIDPTSTEIDRSSEA
NLQIVHNDTTKESLFTIALTATPTDFKIPTFTVASNLLELPTTEAGETSATNLPITNNGT
GDLIITSGFWGIGSSGAMSLHTNTFPITIPAGSTSNIEISFSPLEGDTHQSRLQLVMNDT
DFPYSLYHKSNTAEIIVTGGVSAPGFQVTNEEQNPITFLDTSLGRTSKQTIHITNVGTEN
LDIFKASADGNQGMFRITSSNFPQTNIAPGETVALTVTFTPTGEVGLKQENIIINTNIPR
APFFSTTSFEIPVAGLAVKAEEVIVGGMHFRADNLTIESDIATLEGNVSAGNSLEFDSVV
TINLNTNEITGNGDIYVTNIPKIGPFGGEKVLLQKGAYSFVANIDIPEIDLTSDADTTNF
VFEMVGIPLEITKIKILANGDGVELGGKIPLPAAVFGVDQGVNMEAIQISKTNGVNVTGS
VGISPYIDIFGTFALKDANITFDTFTNSYSGAATVGFDLLGKEIGIGAEIEIINGGLNKV
ALEIEVTPGIPIAQTGFALSGGNGFISGLQEPPVSFGLGVDISPSVPGLTDAMRFNNMTI
AYTIGTSLDASGGLQVLGADVAEAGLKMTSKSLSVAAYVDLFTIFVGNLDAKIENIGNQL
FLEANAKLAVTIPQAPCFVCGPINSVLPFTVGEAEAHLDNFGMDATVDVLEILRMNVAMN
QVGKVTLGANFISANDKLGKVAGKSQLKSASNLVFENDQIAQAKDHLEGQSLIIEAKKNL
FAKSASSSALSDIPFSLTQSHENVIVRVEGTTSTPSYTLILPDGTEVTPENAESLGVFYS
TFDAEKKAYYILKNTPVGTYYYRIDDADTYQFDVVTSEFAPQLSNININHNTTTNDILIS
WEDTDQDSDATIAFYYDTDDEGGDGLLIQSGISENDDTDQITWNANDLKNGTYYVYGRID
DGTNTATIVYATDTFTINNPSSVPTTTLVAEKFEDTIALSWTSVPEADQYIVYIDESALT
LFSPSQGVGANTSFDFKDILPGRTYNFAVTALFDDGTELIESNLSNIETINFISAKSNNI
PKIETEDLPAISTSMSEYPTKIEVSDPDTADVLSLTMIEFPEGMTLTGNMLNWFPTKDQK
GKHQVILEVSDGNGGTDTKSYTVTVFEAPINTFLGTTNNLWSEASNWSFGTVPTTAENTM
ISAGVSAVVDEVANVNELIIDGTLIISPEYAITINDILTQNGTLTVQSNATHSGSLILKE
NYTGIEKVTYQRYVTSDWHLISSPVNMFEISNFKDIVDTNGNKYALSTYDNSLASNRYIY
FTDETGSEDINLPSRYLLEGKGYSVKKSVAGTINFSGYLNTNFETNFTLSDNSSGVGNKW
NLVGNPYTSSIALNDDADATNNLLTVNAGNLDPTRVAVYQWNAVTASYDIINHSDEVAKY
AAPGQGFFVESVDGGAILSIPESIQKHQTANLFSKTTSTTPEIVLSISKENTTKSTKIKY
LENTTTGLDPGYDAGVFSGESSSFSIFTELVSDNTGVPFALQCLPNTNLETMVIPVGVLS
EANKTITISAESVNLPSGIYTYLEDTKTGAFINLNEEDYMLTTQTALEGAERFFLHTKSN
ALTTDNEVFSAVIKIYKKDNNTLRITGMYNEQSKIIVYDILGKEVFTTNFVAKGSNDIAL
PNLKSAVYIVSLISEKGTKTQKIIIE
NT seq 7281 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgatgaagagcagagatttaaaaataaaaaatcaatcaagtaaatttaaatttacgttg
attctattactgttaggaacatttcttacggtaaaagcacaacaatcgattacttataca
ccaaaccctctaaattttcagagtacagatgtagggcaatttagtggtatggaacttact
ccaacctctagcgatggagcgagcatttatgaaataactaacatcaccattacagggtct
aatgcaagtgagtttgatgcatctggtaataatataccattttatgtagatccagaattt
ccattaccaattatgataggttttggtcctacttcagcaggaaataaaacagcagtttta
accattgtttcaaatgccccagatagtccacacattattaatttaagtggtagtagtgaa
gtggcattagtcccagaaattagctacaatgctactattgattttggaggtattgatatt
aacacaacaacttctcaaaatttaataatagaaaataaaggtaattctcctttaaccatt
tcgaacataacgatgctagaagattactttgataaaacacagttttcattacctacagat
ttaaatttgccaataatagtgccagcttttagcacagcagatgcaatttccgttagtttt
tctccagaaatgacaggagcaattagtggcaataataacagaatggcaagaattgaaatt
agtagtaatgataccagtagcccaaatattgtaaacttgcaaggagctgtattacagcca
aatttagaaattaactttttacctgaaccttatgcttttggagatgttaatttaggtgaa
acgtctacacagaatattaccattaacaatacaggagctggtactttagttgtctctaac
ttaagtattacgcctatcgttggtagcgatttttcgcatcctgaagattatacgttaatc
tcgccaactacatttccatttaacattgctccaaatagttcgcaagatattagcatagca
tttacaccaagagatatgggttttagatatgctagactaagtatagaaacggtaaatgct
acaaacgaaattattaatattacggcaaatggtgttaattctaatttcacatcctctacg
tctaatttaacatttagcgaattaagagttggtcaagatgaaacgttaagttttagcatc
accaataatgggaatcgtaatttaaatttatcaagtggtatcattagtggcgcagatgct
agttcatttagtattgtatcagtcaatgaaattaaaaccgttggtcaaggagaatcgaat
gctgttactgtttttgttagatatactcctgcagaaagcaaaacacaccaagcaaaaatt
acgtacacgagtgatgctccaaacagtccgcatgaaattacattaaccggtagtgccata
gattcagatttacaaatttctacagataatattgattttggtgatgtaaacatagggcta
acaaaaacacaaaccattacactttctaatacaaatggaacagatgctgtaactattgac
gacataaggattcgtgttagtcctgactggttaaagtttagcctttctgaaattgatttt
cctttaattattgatgcaggtgcagagacctcttttcaagttaattttttatctacttca
ggtgggaataaaactgctcaaatagagattgttagtaacgatactaactcaccacaaagc
ataaatttaacaggaaacaccttaactccaggattgcttgtaagtagtccaatgttagat
tttttagatacacaagcagtggtgcaatcaagaaccaaattgtttcagattaccaatgat
ggtgatggagatttattgcttacagatatgactattaatggcgctaatgctgctgatttt
caatttgaagacattactcttcctctaacaattgcggcatccaatagcaaaaccgttcgt
gtaatttttagcccacaaactgcaggtacaagagtagcaactttaacagttaaaggagat
tttgtagaagataaaatcattggcttattaggaaaaggcaatacccctttaattagtgca
accaacagtggtgtctttggacaagtaagacataatcgtacccaaactaaagtcataact
ttagcaaattcaggcacaacagatttagtgattacagaggcaacgattacaaatacggct
aatgctatttttagtttgcaagatgttacgctacctataacaattagcccaggaaaaacg
tatgatattgaggttcttatagatcctacatcaacagaaatagatcgtagtagtgaagca
aacttacaaattgtgcataatgatactacaaaagaaagtcttttcacaatagcattaaca
gcaactccaaccgattttaaaataccaacgtttacggtagcttcaaatcttttagaatta
ccaacaacggaagctggcgaaacttctgctacaaacttaccgattaccaataatggtact
ggagatttaattattactagtgggttttggggtataggtagctcaggtgctatgtcactg
cataccaatacatttccaattacaatccctgctggaagtacaagtaatatagagatatcg
tttagtcctttagaaggtgatacacatcaatctagattacaattagtaatgaatgataca
gattttccatattcattatatcataaatctaatactgctgaaattattgtaacaggaggt
gtttcggccccaggatttcaggtaacaaatgaagaacaaaatccgataacgtttttagat
acgagtcttggtagaacaagcaaacaaaccatacatattacaaatgttggtactgagaat
ttagatatatttaaagctagtgcagacggtaatcaaggaatgtttcgaataacaagttct
aattttccgcaaactaatatcgctccaggagaaactgtagcattaacagtaacctttaca
ccaactggagaagtagggctaaaacaagaaaatattataataaatacaaatataccaaga
gcgccatttttttcaactacatcttttgaaattccagtagctggtcttgctgtaaaagct
gaagaggtaattgtaggaggtatgcattttagagcagataatttaacaatcgaatcagat
attgcaactttagaaggtaatgtatcagcagggaatagtttagagtttgatagtgttgta
actattaatttaaacacgaatgaaattacaggtaatggagatatttatgtaacaaacatt
ccgaaaattggcccttttggaggagaaaaagtgcttttacaaaaaggtgcatatagtttt
gtagctaatattgatatacctgaaattgatttaacaagcgatgcagatactacaaacttt
gtttttgagatggtgggtattcctctagaaattactaaaataaaaatattagcaaacggt
gacggggtagaacttggtggtaaaataccattgccagctgccgtatttggtgtagaccaa
ggtgttaatatggaagctatacaaatctctaaaaccaatggagtaaatgttacaggttca
gtaggtattagtccttatatagatatttttggcacctttgctttaaaagatgcaaacatt
acttttgatacgtttacaaactcctatagtggagcagctacagtaggttttgatttatta
ggcaaagaaatagggattggtgcagaaattgaaattattaatggaggtttaaataaagtt
gctttagaaatagaagtaactccaggaataccaattgcacaaacaggttttgctttgtcc
ggtggaaatggttttattagtggtttgcaagaaccccccgtttcctttggtttaggagta
gatatctctccttcagttccaggtttaacagatgcaatgcgttttaataatatgacaatt
gcctatactattggtacgtctttagacgcgagtggagggctacaggttttaggagcagat
gttgctgaggcaggtttaaaaatgacatctaaaagtctttcagtagcggcttatgtagat
ttatttaccattttcgtgggtaatttagatgcgaaaatagaaaatattggtaatcaactt
ttcttagaagcaaatgcaaaacttgcagtaacaataccacaagcaccttgttttgtttgc
ggaccaattaattcagttttaccatttacagttggtgaagcagaagcgcatttagataat
tttggtatggatgcaacagtagacgtattagaaatactaagaatgaatgttgctatgaat
caagtaggtaaggtaactttgggtgcaaattttattagtgctaatgataaattagggaaa
gttgcagggaagtctcagctaaaaagtgcttctaacttagtttttgaaaacgatcaaatt
gcccaagcaaaagatcatttagagggtcaaagtttaattatagaagcaaaaaagaatttg
tttgcaaagtcagcatcgtcatctgcgttatcagatataccttttagtttaacacaaagt
catgaaaatgttattgtaagagtagagggtacaacaagcacaccaagttacacacttatt
ttacctgatggaacagaagtgactcccgaaaatgctgaaagtttaggggtgttttacagt
actttcgacgcagaaaaaaaagcatattatattctaaaaaacacacctgttggcacgtat
tactatagaatagatgatgctgatacttatcaatttgatgtagtaacttctgaatttgcc
ccacaattaagcaacataaatattaatcataatactacaacaaatgatatccttatatct
tgggaagatacagaccaagattctgatgcaaccatagcgttttattatgatacagatgat
gaaggaggcgatggcttattaatacaaagtggtattagtgaaaatgatgacacagatcaa
attacttggaatgcaaacgatttaaaaaacggaacctattatgtttatggcagaatagat
gatggtacaaataccgcaacaattgtgtatgcaactgatacttttacaatcaacaatcca
tcctcagtgccaaccacaacattagtcgcagaaaaatttgaagatactattgcactttct
tggaccagtgttccagaagcagaccaatatattgtttatatcgatgaaagtgcgttaaca
ctttttagcccaagtcaaggcgttggcgcaaatacatcatttgattttaaagatattttg
ccaggtagaacatacaactttgcagtaacagctctttttgatgatggtacagaattgata
gaatctaacctatctaatattgaaactattaattttattagtgcaaaaagtaataatata
ccaaaaatagagacagaagatttaccagcgatatcaacttctatgagtgaatacccaacc
aaaattgaagtttctgacccagatacagcagacgtattaagtttaacaatgatagaattt
cctgaagggatgacattaacaggaaacatgttaaactggtttccaacaaaagatcaaaaa
gggaaacaccaagtaattttagaagtaagtgatggtaatggaggcacagatacaaaaagc
tatacagtaactgtttttgaggctcctataaatacttttttaggtaccacaaataattta
tggagcgaagctagtaattggtcttttggtacagtaccaactacagcagaaaacactatg
ataagtgcaggagtaagtgcagttgtagatgaggtagcaaatgtaaatgaattaatcata
gatggtactttaataatatcaccagaatacgctattacgataaacgatatattgacgcaa
aatggaacgctaactgtacaatctaacgctacacatagtggttctttaatattaaaagaa
aattatactggaattgaaaaagtaacctatcaaaggtatgtaacttctgattggcattta
atttcatctccagttaatatgttcgaaataagtaactttaaagatattgtagacactaat
ggaaacaaatatgcattatcaacatatgacaatagtttagcatctaataggtatatttat
tttaccgatgaaaccggtagtgaagacattaatttgccttctagatacttacttgaggga
aaaggctattcagtaaagaaatctgttgcaggaaccattaatttttctggttatttaaat
actaattttgaaactaactttacactttcagacaacagttctggcgtaggtaacaaatgg
aatttagttggaaacccctacacatcatcaatagctttaaatgatgatgcagatgctacc
aataaccttttaacagtaaatgcaggtaatttagatcctacaagagtagctgtttatcaa
tggaatgcagttacagcttcttatgacattattaaccattcagatgaagttgctaaatat
gcagcacctggtcaaggcttttttgtagaatctgtagatggaggtgcaattcttagtatt
ccagaatctatacaaaaacatcaaacagctaatttattttctaaaacaacatcaacaaca
ccagaaatagtactttctatttctaaagaaaatacaacaaaaagtactaaaattaaatat
ttagaaaataccacaacaggtttagatcctggttatgatgcaggagttttctctggagaa
tctagttcttttagtatttttacggagttagtaagtgataatacaggtgtgccttttgcc
ctacaatgtttaccaaatacaaatttagaaactatggttattcctgtaggtgttttatct
gaagcaaacaaaacaataactatttctgcggaaagtgtaaacttaccatcaggtatttac
acctatttagaagacacaaaaacaggtgcttttatcaatttaaatgaagaagattatatg
ctaactacccaaacagctttagaaggagcagaacgattctttttacatacaaaatcgaat
gctttaactacagacaatgaagtatttagtgcagtcatcaaaatttataaaaaagataac
aatactttaagaattacaggaatgtacaatgagcaatcaaaaataatagtgtacgatatt
ttagggaaagaagtttttacaacaaattttgtagctaaaggaagtaatgatattgcgttg
ccaaacttaaaatcggcagtttatatagtctccttaatatctgaaaaaggcaccaaaact
caaaaaataataatagaataa

DBGET integrated database retrieval system