KEGG   Polaribacter litorisediminis: K8354_14205
Entry
K8354_14205       CDS       T07786                                 
Name
(GenBank) T9SS type A sorting domain-containing protein
Organism
plit  Polaribacter litorisediminis
SSDB
Motif
Pfam: Por_Secre_tail LRR_4 LRR_EndoS EF-hand_1 EF-hand_5
Other DBs
NCBI-ProteinID: UAN00102
LinkDB
Position
complement(3331597..3335019)
AA seq 1140 aa
MSNFDIVSGAAPFTVEFTTRGAFVGNFFTSNPVEGVNPDDSTTWPQFVANASNVNAQFLN
DFLTTQNTVVYNIIITDANGCRQEKVYTLVVNPEENPDYEITTTDGNLVIIDISGNGDTL
TVSEEAGNIVFNATDRIYRSNGASIGSLPISIPMSGLTSIEINGAGGDDVIEFDSYFTNM
PSLTVNGGAGNDKVYLFGSSITFAENANLNIDLTDDASDGDEDWLDMQPVSNNIISGFYL
KGTGTATFKVSKNISLGERSSIATENGALYVEANATGLTPGNFKGVELVNISSIRSTGTG
QVTVKGTGGTTASNNWGVSVSGGSIYGGTTGTLLVEGTGGASAGNTNIGVYSGNLGGAIS
SLGAAVVVNGTGGGIEASTTNTGVVAGQSGGYSSAGTLTITGTGGSSLVTSDQNSSNNGI
SIQGGVGSLTSTGAIMLIGTKGANSSQGVDIYVTGAGSISNNGSISLTSLTGGFYPNYLG
LSVQNASANQVTKFETGSKLNFYIGGPTRTGATAGQYFPLQVSGLVDLNNVELTTIGGYT
PQAGNEFLVVVNDGTDAVQGKFTYQGVVLNQGDEVPNFKGSSATFYINYQGGDGNDVVIT
SNFTLIPDPNFEQALLDLDIDSDGIINGKVRTSDIAVVTELNIASKGISDLTGIEGFINL
ETLYCQFNTISALDFSTNLKLTYVQADNNNLASLNVTNNIELTTLGCGANQLTSLDVSKN
TKLILLTVDENNLSTINITNLVNLEHLGLRDNNFTSVNISKNINLIYVYIKNNSLTGLDV
TNNKNLQYLDASFNNFINFDINQNVNLKTLFLNNNNIERAYLRNGANTLITDFDIRNNPD
LTCIAVDDVAFSETNWINKDTSANYNTDCNAEWTIYTTDANLDAAVLAIPSLDIDGDGKV
TYEEAQAFTGDLNFSGQNIATITGLEAFTNAGSIDISNNVITSINSFLSASSVVLISKST
KQTKSLARAKNKVRKLNVSGNLITEINISNLTDITDLDARNNRLTTLNLKNANNAILIKL
DVTNNPNLGCIEVDNVEAALAKTGWEKDATATYSMSCNALSIDNFLKENVAAYPNPASSF
VEILLSNGLKLKKVEVFNATGKRLNTTNNTILNVEELSAGVYFIKITTDKGAINKRIVKD
NT seq 3423 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgtcaaattttgatattgtatcaggagcagcaccatttacagttgaattcactaccaga
ggagcttttgtaggaaactttttcacaagcaatccagtagaaggcgtaaatccagatgat
agcacaacatggccacaatttgtggcgaatgcgtcgaatgtgaatgcacaatttttaaat
gattttttaacaacacagaatactgtagtttataacattatcattaccgatgccaatgga
tgtagacaagagaaagtatacacgttagttgttaatccagaagagaatcctgattacgag
atcactaccacagatggcaacttagtaataatagatatttcaggcaatggagatactttg
acagtaagtgaagaagcaggtaatattgtgttcaatgctacagaccgcatatacaggtcg
aatggagcaagtattggttcattaccaataagtattccaatgtcaggattaacatcaata
gagatcaatggtgcaggcggcgatgatgtaatagaattcgatagttatttcacgaacatg
ccaagtttaacggtcaatggaggagcaggcaatgacaaggtatatttatttggttcctcg
attacgtttgccgaaaatgcaaatttaaatatcgatttaacagatgatgcatccgatggt
gatgaagattggttagatatgcaaccggtgagtaacaatattatatcaggtttttattta
aaggggacaggaaccgcaacatttaaagtaagtaaaaacatttcattaggagaacgcagt
agtatcgctaccgagaatggagctttatatgtagaggcgaatgcgacaggattaacccca
gggaatttcaaaggagtagaactggtaaatatctcaagtattcgttcaacaggcacaggt
caagtaacggtaaaaggtacaggaggaactacagccagtaataactggggagtttcggta
tccggcgggagtatttatggaggaaccacaggaacattattagtggaaggaacaggagga
gcttctgcagggaacacgaatataggagtatattcagggaacttaggaggagctatttca
agtttaggagccgcagtagtagtcaatggaactggaggaggaatagaagcatcaacgaca
aatacaggagttgtggcaggtcaatcaggaggttattcatcagcaggtactcttacgatt
acaggaactggaggaagcagtctagttacaagcgatcaaaactcatcaaataatggaatt
agtatccaaggcggagttggttcattaacatcaacaggcgctattatgttaataggaacc
aaaggagcaaacagtagtcaaggagttgatatttatgtaacaggcgctggttcaatctcg
aataatggatcgattagtttgacaagtttaacaggcggattttatccaaactatttaggc
ttgagtgtacaaaatgcatcagcgaatcaagtaacgaagtttgagacgggatcaaagttg
aatttttatataggcggtccaaccagaacaggggcaacagcaggacagtactttccattg
caagtatccggtttggttgatttaaacaatgtagaattaacgaccataggcggttacacg
ccacaagctgggaatgagtttctagtagttgtgaacgatggcacagatgccgttcaagga
aaattcacctaccaaggtgttgtattaaaccaaggcgatgaagtaccaaactttaaagga
tcatcagctacgttctatatcaattatcaaggaggagatggcaatgatgtggtgattaca
tcgaatttcaccttaatccctgatccaaattttgaacaagctttattagatttggatatt
gattctgatggaattattaacggaaaagtaagaacatcagatattgctgttgttactgag
ttaaatattgcttctaaaggaatttcggatttaacaggaatagaagggtttataaattta
gaaacgttgtattgtcaattcaataccatttcagctttagatttttctactaatttaaaa
ctaacatacgttcaagccgataataacaacttagctagtttaaatgttacgaataatata
gaattaacgactttgggttgtggtgcaaatcagcttacaagtttagatgtttctaaaaac
acaaaactgattcttttaacggttgatgaaaataatttatcaactataaatattaccaat
cttgttaatttagagcatttaggattaagggataataactttacatcagtaaatatttct
aaaaatatcaatttgatatatgtatatattaaaaacaattctttaacaggtttagatgtt
acaaacaacaaaaatctacagtatttagatgctagttttaataactttatcaattttgat
atcaatcaaaatgtaaatcttaaaaccttgtttttaaacaataataatattgaaagagca
tatttaagaaacggagcaaatactttaattacagattttgatattagaaacaatccagat
ttaacttgtattgcagttgatgatgtagctttttctgaaacaaattggatcaataaagac
acatcagcaaattataacacagattgtaacgcagaatggactatttatactactgatgcc
aatcttgatgctgctgtgttagcaatccctagtttagatatagatggcgatggaaaggtt
acatacgaagaagctcaagcttttactggagatttaaattttagtggtcaaaatatcgca
acaattactggtttagaagcttttacaaatgcaggtagtatagatatttctaacaatgta
attacaagtataaattcatttttatcagcgtcatctgtggttttaatatctaaatctacc
aaacaaacaaaaagtttagcaagagctaaaaataaagttagaaaattaaatgtttcaggc
aatttaataacagagattaatatttctaatttaacagacattacagatttagatgcaaga
aacaataggttaacaactttaaatttaaaaaacgctaacaacgctattttaataaaatta
gacgttacaaacaaccctaatttaggctgtattgaagttgataacgtagaagctgcttta
gcaaaaaccggatgggaaaaagatgcaacagcaacttatagtatgtcttgtaacgcatta
tctattgataatttcttaaaagaaaatgttgcagcatatccaaacccagcaagttctttc
gttgaaattttattatccaatggtttaaaattaaaaaaggtagaagtttttaatgcaaca
ggtaaaagattaaatactactaataacaccattttaaatgttgaagaattatcggcagga
gtttattttattaaaattactacagataaaggagcaataaataaaagaattgtaaaggat
taa

DBGET integrated database retrieval system