Polaribacter litorisediminis: K8354_14360
Help
Entry
K8354_14360 CDS
T07786
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
KO
K02014
iron complex outermembrane recepter protein
Organism
plit
Polaribacter litorisediminis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
plit00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
plit02000
]
K8354_14360
Transporters [BR:
plit02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
K8354_14360
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TonB_dep_Rec_b-barrel
CarbopepD_reg_2
Plug
CarboxypepD_reg
OMP_b-brl_3
Big_1
TTR_TEN1-4
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UAM97479
LinkDB
All DBs
Position
3369303..3371705
Genome browser
AA seq
800 aa
AA seq
DB search
MKNLILTLFCITSLMVFGQNTKDIGGKVLDATGNPLPGATVIEKENPQNGTTTDFDGEFI
LKVSQNASELVISYISYESKTVKITGNYINVVLKPKENQLDEVTIKGFPSVASKARVRSQ
AIQSLPETTVAINAATIEASGIDNIQSFTSQISNVTFTQAQQPGVNFLTVRGISQIRNAE
SPVAVVIDGMTLPDASAMNMSLYDIELLEFVKGPQGTLYGKNAIAGAVNIITKDPTNNNK
TKVMLNTGNGGLLGAGISSSGAFVKNKFYYSLNGRYSSFDGLINNTFLNQKVDFSKEYNF
RAKLKYKFNPRWSATFVQDNFKVEAGGNYYVTKTDLFDATIPVLADDDYSSEPFGDVLGD
SDLSNALSSLKIEGSLENAKFQSVTSYNATRRYYIGENDYSQYAFSKVSQQSDSDTFSQE
FRLTSNAAEETKLNYTFGTLFQNSKRYLNTSTFLNNTYYEGGFVDASAANANYSATGLVG
NDDDNTIQTIAAFGFIDYKITDKFTLSAGMRVDYDKLTNESRISNTSIENDITVWQPKFS
LAYEFSDAVLGYANYGRGYRSGGFNSDATVKFNKTYEAEFTNNYEIGLKTSFLNNRIIFN
NAFYIIDFKNQQQYTFIPVTPAVLGIYNFDESRISGFETEIKFKASNTLDFFAGLGLNNG
EIKKGTYNRLTNAAAFDYTTSEVVDVSGNTSPFTIESTFQIGTNANFKLSETSKLGFHLN
VDSRGTQYWDPLEEYKQDPYTLVNARVNLKLSKIDVSLWANNIFDTKFNTEFFPTAEFGF
NNLRFPNTPTTVGVDLSYTF
NT seq
2403 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaatctaattttaacccttttttgtatcacttcattgatggtatttgggcaaaac
acaaaagatattggcggtaaagttttagatgcaacaggcaaccccctgcctggagcaacc
gttatagaaaaagaaaacccacaaaacggaacaacaactgattttgacggtgagtttatc
cttaaagttagtcaaaacgctagcgaactcgtaatttcttacattagctatgaaagtaaa
actgtaaaaattactggcaattacataaacgttgtattaaagccaaaagaaaatcagctt
gatgaagtcactattaaaggttttccatccgtagcgagtaaggcacgtgttagatcacaa
gccattcagagtttaccagaaactactgtggccataaatgcagctactattgaagctagt
ggtattgataatattcaatcctttacatcacaaatctctaatgtaacttttacgcaagca
cagcaaccaggtgtaaattttttaacagtacgtggtatatcccaaattagaaatgctgaa
tcgccagtagcggtggttattgatggaatgactttaccagatgcaagtgcaatgaacatg
tctctgtatgacattgaattattagaatttgtaaaaggtcctcaaggaacactttacggt
aaaaatgcgattgcaggcgctgtaaacatcataacgaaagaccctacaaataataataaa
actaaagtaatgctcaatacgggtaatggtggtttgttaggtgctggtatttctagttct
ggagcttttgtaaaaaacaagttttattacagtttaaatggtcgatactcttcttttgat
ggtttaataaacaatacatttttaaatcaaaaagtagacttttcaaaagaatacaatttt
cgtgcaaagttaaaatacaagttcaatccacgttggtcagcaacctttgtacaagataat
tttaaagtggaagcaggtggtaattactatgtgactaaaacagatctttttgatgcaaca
atacctgtactggccgatgatgactattctagtgaaccttttggagatgttttaggagat
tccgatttatctaatgccttaagcagtttaaaaatcgaaggttccttggagaatgcaaag
tttcaatcggttacttcttataatgccacaagacgttattacatcggagaaaatgattac
tctcaatacgcctttagcaaagtttctcaacaatcagattcagatacgtttagtcaagaa
tttagactaacatcaaatgctgccgaagaaacaaaattaaattatacttttggtacccta
tttcaaaatagtaaacgctatttaaatacctctacgtttttaaataatacctactacgaa
ggtggttttgtagatgcatctgctgcaaacgcaaattatagtgcaacaggtttagtgggt
aatgacgatgacaacaccatacaaacgatcgctgcttttggttttatagattataaaatt
acagataagtttacattatctgcaggaatgcgtgtagattatgataaattaacaaacgag
tctcgtatttcaaatacttccatagaaaatgacattaccgtatggcaacctaaattctct
ttagcttatgaattttctgacgctgtattgggatatgcaaattatggacgtggctataga
agcggtggatttaactctgatgcaactgtaaaatttaataaaacctatgaagcagaattt
actaacaactatgagattggtttaaaaacaagtttcttaaacaatagaattatttttaac
aacgcattttatatcatcgattttaaaaaccaacaacaatacacatttatacctgtaacg
ccagctgtattaggaatatataatttcgatgaatctagaatatcaggttttgaaacggaa
ataaaatttaaagcaagtaataccttagacttttttgcaggtttaggattaaataacggt
gaaataaaaaaaggtacttacaacagattaactaacgctgctgcattcgattataccaca
agtgaagtagtagatgttagcggaaatacctctccttttaccatagaaagtacctttcaa
attgggactaatgccaactttaaactatcagaaacttctaaattagggtttcatttaaat
gtggatagcagaggtacacaatattgggatcctttagaagagtacaaacaagatccatac
acattagtaaacgccagagtaaatttaaagttgagtaaaattgatgtgagcttgtgggca
aataatatttttgacactaaattcaataccgagtttttcccaacagcagagtttggtttt
aataacttaagatttccaaacaccccaacaacggtaggtgtagatttatcttacacattc
taa
DBGET
integrated database retrieval system
