KEGG   Polaribacter litorisediminis: K8354_14605
Entry
K8354_14605       CDS       T07786                                 
Name
(GenBank) PAS domain S-box protein
Organism
plit  Polaribacter litorisediminis
SSDB
Motif
Pfam: PAS_3 PAS_4 PAS_9 PAS PAS_8 HATPase_c PAS_10 HisKA PAS_11 HATPase_c_3 DsbC_N DUF7271
Other DBs
NCBI-ProteinID: UAM97526
LinkDB
Position
complement(3443020..3447840)
AA seq 1606 aa
MEQDTLDKSLFRLNPIPSWVYDYTSLEILDVNLCAIKHYGYSREEFLSMTLKDLRPSKEV
SKLINAHLDIENRAGSIYFGTFTHQKKNGTLIQVEINGHKVDFLGRKCHLVICQDVTQRL
EQEKQILQSEQRFKALVQEGGDMISIIDADGKYSYTSPTTTSILGITPEEFEGNTIFDFI
HPDDVQKSADYMKRITTEHKVKVKPFRLLDGNKNWRWIEMVLTNMLDNPAVNGIVANSRD
VTEQMNVKKQLEANEFFSRTVLESSPECVKVIDKQGRLQFMNYNGLRLMGFDDFEQVKNK
AWWLLWGKENEILVKESFDKALIGESSQFTVFCPTTKGAPKWWDVLVSPVHNPSESVQKI
IAVSRDITDRKKVESRLQNLSDNIPGAVFQYLFYPNDKDKFIYVSSGAKKILGYSSKKIT
QNPELVWNQIRAGGNFEAVQQSILNAVKNKSQWNIKFPIIQPNGEKRILHGMGTPEFMAD
NSVLFNSVILDVTEEVKNQELLDEVTKLSKIGSWEIDLVKNTIYWSDQVHQIYETDPATF
VPDIEKAINFYREDYRDIARSSFKECLITGEPYDIESVIVTASKKERWVRTTAKAEIVDG
VCVRIYGSFKDMHDRKESELRLKSIKDDLPGVSFQYMIAPDGKNSLHNVSKASIDVWKFS
PKECELNHDLIWNQIKAGGDFQLVKASIKESIANNKKWNVQWRNVLPNGDVRWHEGYGSP
NKQADGTIIFNSLIFDITEKYKAVELYDQASKMAKIGSWELNMVQQENTENMYWSPMVRK
ILEVDKDYKPSLSKSYDLYLREYKEIARKAAENLIDTGEAFDLELPINLGNNQIKWIRSI
GHAEFIDGECQRIFGSYQDIHKRRIAEIQLKTITDNLPGAVFQYVLKADGTDEILYVSKG
SSQIWGLTQEEARLYPEKIWDQVAAAGDMEHLAASIKESAENLSLWKAEWRSLNSSGELR
YLEGRGMPQRLNDGSILWNSLILDITERKTFEENYLVAQEDRVDILESISDAFYRIDENW
NFTYFNKEAENLLKRKSQDVLGNNFWEEFGPVQGTLLEKKYHKVAKTGKSETFEYWYPGD
NCWYEINAYPTKGGVSAFFKNIDERKRVAEELLKAFEEKNNILESIGDAFFAVDKNWIIT
YWNKETEELMGKKREDVLGHNLWILYPDAIESDFSRNYHKAMQTGENINFEEYYSSRDMW
CDVSVYPSEEGLSVYFKDITLKKQGDLRLAEANERFKKVTEATSDAIWDWDIRKDIFYRS
KNIQKFVGKATSKELNSDDFWEHTFHPEDKQEIKKSIHAAMMNPSKTNWEGKYRVFNENG
EIIYVSDRGLIIRNDQGEAIRMIGAMTDITKQKNHEKELLTLNQSLKTYTKELERSNEEL
EQFAFITSHDLQEPLRMVSSFMDQLKRKYGGQLDAKAHQYIYFATDGAKRMKHIILDLLE
YSRADKLSDPMEEVNLNDILSGFKQHHRKIISEKSATISAPELPIIYSYKSAMTKVIYAL
LDNAIKYSKEDLAPNIEINVKENDKEWTFSVKDNGIGIDALFFDKIFTLFQRLHNNQLFE
GTGVGLSIAKKYVKFLGGKIWLESSLGIGSIFYFTIPKKSMINELI
NT seq 4821 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggaacaagatacattagataagagtctttttagattaaacccaattccctcttgggta
tacgattatacctccttagaaatactagatgtaaatttatgtgccataaagcactacgga
tactcaagagaagaatttttgagtatgaccttaaaagacttgcggccatcaaaagaagtt
tcaaagcttatcaatgctcatcttgatatagaaaatagagcaggaagcatctattttggc
acttttacgcaccaaaaaaagaatggtactcttattcaagtagaaattaatgggcacaaa
gttgattttcttggtcgtaaatgccaccttgtaatttgtcaagatgttacgcaaagatta
gaacaagaaaagcaaattcttcaaagtgagcaacgttttaaagcattagtgcaagaaggt
ggcgatatgattagtattatcgatgccgatggtaaatatagctatacaagtcctaccaca
acttccatattaggcattacaccagaagaatttgagggaaatacaatctttgattttatt
catccagatgatgtacaaaaatcggcggattatatgaaacgaattaccactgagcataaa
gtgaaagttaagccctttcgattgctagatggtaacaaaaattggcgttggattgaaatg
gtcttaaccaatatgcttgataatcctgcagtaaatggtattgttgccaattcaagagat
gtaaccgaacaaatgaatgttaaaaaacaacttgaggcaaatgaattctttagtcgtacc
gtattagaaagcagtcctgagtgtgtaaaagtaatcgataagcaaggtcgtcttcagttt
atgaattacaatgggcttcgtcttatgggttttgacgattttgaacaagttaaaaataag
gcatggtggcttctttggggcaaagaaaatgaaatcttagtaaaagaatcttttgataaa
gcgctgattggagaaagttctcagtttacggtattttgtcctacaactaaaggggctcca
aaatggtgggatgtgttagtttcgcctgttcataatccatctgaatctgtacaaaaaatc
attgcagtttctcgagatattactgatcgcaaaaaagtagaaagccgattacaaaatcta
tcagacaatataccaggtgcagtttttcaatacctattttacccaaatgataaagataaa
tttatctatgtaagtagtggagccaagaaaattttgggctatagttcgaaaaaaatcaca
caaaacccagaattggtttggaatcaaatcagagcaggcgggaattttgaagcagtacaa
caaagtatcttaaacgctgttaaaaacaaatctcaatggaacataaagtttccaataata
caaccaaatggagaaaaacgtatacttcatggaatgggaacccccgaatttatggctgac
aactcggtgctatttaattctgtaatactagatgttaccgaggaagtcaaaaatcaagaa
ttattagacgaagtaacaaaattaagcaagattggtagttgggaaattgatttggtaaaa
aatacgatttattggtctgatcaagtgcaccaaatatatgaaaccgaccccgctacattt
gtgcccgatatcgaaaaggcgatcaatttttaccgagaggattaccgagatatagcgcga
tcaagttttaaggagtgtctgataacgggagaaccttatgacattgaatctgttattgtt
actgctagcaaaaaagaacgttgggtgcgtactactgcaaaagcagaaattgttgacggt
gtttgtgttcgtatttacggtagttttaaagacatgcatgatcgtaaggaaagtgaatta
agattaaaatctattaaagatgatcttcctggagtttcttttcaatatatgatagctcct
gacgggaaaaactccctgcataatgtgagcaaagcttctatagatgtatggaaatttagt
ccaaaagaatgtgaattgaatcatgatttgatatggaatcaaattaaagcgggtggtgat
tttcagcttgtaaaagcatccattaaagaatctattgcaaataataaaaaatggaatgta
caatggagaaacgtattacccaatggagatgttaggtggcatgaaggctatggaagcccc
aataaacaagcagatggaaccatcatttttaatagcttaatttttgatattacagaaaaa
tataaagctgtagaactgtatgatcaagcttctaaaatggctaaaattggtagttgggaa
ttaaatatggtacaacaagaaaataccgagaatatgtattggtcgcctatggtcagaaaa
atattagaggtagacaaagattataagccctcactaagcaaaagttatgatttatattta
agagaatacaaagaaatagcacgtaaggcagcagaaaacctgattgataccggcgaagct
tttgatttagagctcccaattaatctgggaaataatcaaattaaatggattagatccatt
ggtcacgcagaatttattgatggagaatgccagcgaatttttggtagttaccaagatatt
cataaacgtagaattgcagaaattcaattaaaaaccatcactgataacctaccaggggcc
gtttttcaatatgtactaaaagctgatggtacagatgaaatattatatgtgagtaaagga
tcttctcaaatatggggacttactcaggaagaagctaggttatatcctgaaaaaatatgg
gatcaagttgccgctgccggagatatggaacacttagcagcttctattaaagaatctgcc
gaaaatctctcgctatggaaagcagaatggcgcagcttaaattctagcggagagctccgc
tatttggaaggacgaggcatgccccaaagattaaatgatggaagcattttatggaattca
ttgatactagatattacagaacgcaaaactttcgaggaaaattatttggtagcacaagaa
gatcgggttgatattttagaaagtatttctgatgcattttatcgcatagatgaaaactgg
aattttacctattttaataaggaagcagaaaacttattaaaaagaaaaagccaagacgtt
ttaggaaataatttttgggaagagtttggccctgttcaaggaaccttattagaaaagaaa
tatcataaagttgccaagacaggaaaatcagaaacttttgagtattggtatcctggtgat
aattgctggtacgaaatcaacgcctaccccactaaaggaggtgtttctgccttttttaag
aatatagatgaacgaaaaagagtggcagaagaattattaaaagcttttgaagaaaagaat
aatattctagaaagtattggagatgccttttttgccgtagataaaaattggattattacc
tactggaataaagagacagaagaattgatggggaaaaagcgagaagatgttttaggacat
aatttgtggatattatatcctgatgctattgaaagtgatttttctagaaactatcataaa
gcaatgcaaacaggtgaaaatataaattttgaggaatattactcgtcacgtgatatgtgg
tgtgatgtttctgtttatccttctgaagaaggattatctgtttattttaaggatataacc
ctaaaaaaacaaggtgatctccgactagctgaagccaatgaacggtttaaaaaagttaca
gaagctacttctgatgctatttgggattgggatattcgtaaagatatcttttacagatct
aaaaatattcaaaagtttgttggtaaggctacttctaaagaactaaatagtgatgatttt
tgggagcatacatttcaccctgaagataaacaagagattaagaaaagtatacatgctgcc
atgatgaacccttcaaaaactaattgggaaggtaaatacagggtttttaatgagaacggt
gaaattatatacgttagtgatcgaggtttaattatccgtaacgatcaaggagaggctatc
agaatgattggagcaatgacagatattacaaaacagaaaaaccatgaaaaagagttattg
actttaaaccaatccttaaaaacttatacgaaagaattagaacgatctaacgaagaatta
gagcaatttgcttttattacttctcatgacttgcaagagcctttaaggatggtctctagc
tttatggatcaattaaagcgaaaatatggaggccaattagacgctaaggcgcatcaatat
atttattttgcaacagatggggcaaagcgaatgaagcatattattttagatttattagag
tattcaagagcagacaaactttcggaccctatggaagaagtaaatttgaatgatatacta
tcaggatttaagcaacatcaccgaaaaataatttcggaaaagtcggcaactatttctgct
ccagaactacctattatttattcttacaagtcggcaatgaccaaagtgatttatgcactc
ttagacaatgcaataaagtattcaaaagaagatttggctcctaatattgaaataaacgta
aaagaaaatgacaaggaatggacgttttctgtaaaagacaatggtattggaattgatgca
ttattttttgataaaatatttaccttgtttcaaagactgcacaataatcaactatttgaa
ggtaccggagtaggactttcaattgctaaaaaatatgtgaaatttctcggaggtaaaatt
tggctggagtcttctttaggaataggttctatattttattttacaatacctaaaaaatca
atgatcaatgagttgatataa

DBGET integrated database retrieval system