Polaribacter litorisediminis: K8354_16550
Help
Entry
K8354_16550 CDS
T07786
Name
(GenBank) BspA family leucine-rich repeat surface protein
Organism
plit
Polaribacter litorisediminis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DUF285
LRR_4
PKD
Por_Secre_tail
PKD_4
G8
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UAM97877
LinkDB
All DBs
Position
3855488..3860830
Genome browser
AA seq
1780 aa
AA seq
DB search
MQKKLLTLIFTFSILLSFGQNEFITKWRTNLGVQTITIPTIGSGYNYTVDWGDGTIENGF
TGDATHNYGVAGEFIVSITGDFPRIYFKPSSSAVNNTLVEIMQWGSNTWTSMEDAFNSCI
SLEITATDSPNLNNVTSLKSMFNSCIALTGNSSINDWDVSTIQNFEEMFRSADNFNAPLN
NWDVGAALNMKGMFFRTKEFNQNLNSWDVSKVENMDAMFSQTDSFNGDITSWDIGSVTNV
SSMFSDSSFNQDISSWGVGHLTNMTSMFSDSSFNQDISSWDVSNVTDMTSMFSGSSFNQD
ISSWNVSSVTNMSFMFAYGSFNQDISSWNFGNVTNMSSMFEGDDSFKQDMSAWDVSNVTN
MSFMFAFGSFNQDISSWDVGKVTNMEAMFRSNSQFNQDISSWNVSSVNSMRSMFRGADRF
DQNIGTWDVSNVTDMALMFLSFEGGLSSRNYDLILQGWSNLPNLSQNVSINADYISYCNA
EAARTKLINDYNWNISDAGKDCSGEAFITKWKTTTANESITIPTTGAGYNYTVDWGDGTI
ENGFTGNATHSYTIAGEYEVSITGDFPRIYFNNAGSKFKIIDIVQWGSNPWVSMFAAFQN
CPNLIVSAIDTPNLENVTDMGYMFYAATSLNQDLSSWDVSNVTYMSSMFTEATSFNQDLS
SWDVSNVTDMLGMFFSSGFDVNNYDKALIAWSNLPTLKQNVSFGAQGVSYCNGEAARTKL
INDYNWNITDEGKDCSDVYISIPDTNFEQALIDLGYDTNGLNGNILTSDAVAVTSLSLPS
AISAAITDLTGIEGFTQLTSLTIVGSKITSIDVSKNVNLLSLSLADNSALTALDVSKNED
LRSLNIGLTDLRSSGKIGLISVLDVSNNINLVSINARAQSLTSLDISNNVALESLDLEKN
NITSLDVSNNTKLYRLDVTQTNLTTLDVSNLADLGELYAPFNSLISLDVSNNLKLARLDC
NSNNTITTISLGNNDVLSYLNISGNLLTTLDTSQNNGLLDLECGFNNLTSLIVNDELKTL
SCDDNNLTSLDVTNATNLEELRCTENSFSALDVTKNTKLTGIHADYNSLTSIDLSKNTNL
ETLGISNNALTTLEISNNTKLESLDCSANNLTDIDFGTNINLGSISAYENALATIDVSKL
TNLTRLSAYNNSLTSLDLSENLLLERLDVSNNHIDSLNLSLNNSLLTLDVRDNSLEYLNV
KNGNNMNMIIQGTYALDVAGNPNLTCIQVDDIAYANANFNKDATASFNLGCGVNTAATNG
NWSDPSSWSTGVVPTSNDNVTIPAGTTLQIGSNISEINSLVNEGSIVIGPTFSLKSNTTL
VNNGSIVMDSESNNSSVLFVQGASSGTITYKRGGLKANAWSLVAPPVSGQKIEEFALNAD
NDIRINTSVSPNRYAIAYHDDTAIEGEKWKYYTTDIASSLTFTAGESYSMSRGTDGSVSF
TGTLTTADVSKSLNAGAWSAIGNPFTTYYPANKNSENSFLNQNFAALDDEFKAVYLWSTT
QNKFVSVTEIDINNRSLTPGQGFLIKLKPSATSVQFNEDKRTLKPNDATNTFAKNNDLYA
ELALENDNYNVTTAIKFYPNATLGFDVGYDIRNFDGASFDVFTHLADQSSENNFSIQSVP
STDMENTIVPLGVNLPNEEKVKFTLSAVNLPEGIHVVIEDRMLNTFNNMSTDNTYVPDFS
QNKNLKDRFFVHFKTASALSTNTPTLNEINIFVKERVLFVEGIKNEKALKVFNMLGQELL
TVNLEADSNQINLPNHIKSGIYLISIKADTQTHTQRILLK
NT seq
5343 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcaaaagaaattacttacactcatttttactttttctattttattgtctttcggacaa
aatgagtttattaccaaatggagaacgaatttaggcgttcagacaataacaatacctaca
attggttctggttataattatactgtagattggggagatggtacaatagaaaatggtttt
acaggagatgcaacacacaattatggagttgctggagaatttatcgtcagtattactgga
gatttccctagaatttattttaaaccttctagtagtgctgtgaataatacgcttgtcgaa
ataatgcaatggggatctaatacttggacatctatggaagatgcttttaattcttgtata
agtttagaaattacagcaaccgattcacctaatttaaataatgtaactagtttaaaatca
atgtttaattcatgtattgccttaacaggtaattcatcaataaatgattgggatgttagt
acaattcaaaattttgaagagatgtttcgcagtgctgataattttaatgcaccattaaat
aattgggatgttggtgctgcactaaatatgaaaggtatgttttttaggactaaagaattc
aatcaaaacttaaatagttgggatgttagcaaagtggagaatatggatgcgatgtttagt
caaactgatagttttaatggagatataacttcttgggatattggtagtgttaccaatgta
agttctatgttttcagatagcagctttaatcaagatataagttcttggggtgttggtcat
ctcaccaatatgacttctatgttttcagatagcagctttaatcaagatataagttcttgg
gatgttagtaatgttaccgatatgacttctatgttttcaggtagtagctttaatcaagat
ataagttcttggaatgttagtagtgttaccaatatgagttttatgtttgcatacggtagt
tttaatcaagatataagttcttggaattttggtaatgttaccaatatgagttctatgttt
gaaggagatgatagttttaagcaagatatgagtgcttgggatgttagtaatgttaccaat
atgagttttatgtttgcattcggtagttttaatcaagatataagttcttgggatgttggt
aaggttaccaacatggaagcaatgtttaggtctaactctcaatttaatcaagatataagt
tcttggaacgttagcagtgttaatagtatgcgttctatgtttagaggagctgacaggttt
gatcaaaatataggtacatgggatgttagtaacgtaacagatatggctttaatgtttctt
tcttttgaaggtgggttatcttcaaggaattatgatttaattttgcaaggttggtctaat
ttacctaatcttagccaaaatgtatctattaatgctgactacattagttattgtaatgca
gaagctgcgagaacaaaattaattaatgattataactggaatatctctgatgcaggtaaa
gattgttcaggtgaagcttttattaccaaatggaaaacaaccacagcaaatgaatctata
acaataccaacaacgggtgctggttataattataccgtagactggggagatggtactatt
gaaaacgggtttacaggcaatgcaacacatagttataccattgctggtgaatatgaagtt
agtattactggagatttccctagaatttattttaataatgctggaagcaaatttaaaata
atagatattgtacaatggggatcaaatccttgggtttccatgtttgcggcttttcaaaat
tgtccaaatctaattgtttctgctatagatacaccgaatttagagaatgtaactgatatg
ggatacatgttttatgctgcaacatccctaaaccaagatcttagctcatgggatgtaagt
aatgtaacttatatgagtagcatgtttactgaagcaacatcctttaaccaagaccttagt
tcttgggatgtaagtaatgtaactgatatgttaggcatgttttttagttcaggttttgac
gtaaataattacgataaagctttaattgcttggtctaatttacctactcttaaacaaaat
gtatcttttggtgctcaaggcgttagttattgtaatggagaggctgcaagaacaaaatta
ataaatgattataactggaacatcacggatgaaggaaaagattgtagtgatgtatatatt
tctatcccagatacaaacttcgagcaagcattaatcgatttaggttatgataccaatggt
ttaaacggtaacatattaacatcagatgctgtggctgtaacaagtttatctttaccaagt
gctattagcgctgctataactgacttaacgggcattgaaggttttacacaattaacatct
ttaacaattgttggtagtaaaataacttcgatagatgtaagtaaaaatgttaatttatta
agtttgtccttagcagataatagtgctttaactgctttagatgtatctaaaaatgaagat
ttacggtcattaaatattggattaacggatttaagatcatctggaaaaattggattaata
tcagttttagatgtcagtaacaatattaatttggtttctataaatgctagagcacaaagt
ttaacttccttagatatatctaataatgtagcattagaaagcttagatttagaaaaaaat
aatatcactagtttagatgtgtctaataatacaaaactatataggcttgatgttacacaa
accaatttaacaactttagatgtaagtaatctagccgatttaggcgagttgtatgcaccg
tttaattcattgatttctttagatgtatcaaataatctcaaattagcaaggctagactgt
aatagtaataacacaattacaacgatatctttagggaataatgatgttttaagttattta
aatatatcgggtaatttactaactacgttagatacttctcaaaataatggactgttggat
ttagaatgtggtttcaataaccttacaagtttaattgtaaatgatgagttaaaaacactt
tcttgcgacgataataatcttacaagcttagatgtaactaacgcaactaatttagaagaa
cttcggtgtactgaaaattctttttctgctttagatgttaccaagaatacaaaattaaca
ggtatacacgcagattataatagtttaacaagtattgatctaagtaaaaacacaaattta
gagacgttaggtatatctaataatgcgctaacaacactagaaataagtaataatactaaa
ttagaatctttggattgttctgcaaataatttaacagacatagatttcggtacaaatatt
aatttaggatctatatctgcgtatgaaaacgcattagctacaatagacgttagtaaatta
acaaacttaactcgtttatctgcatataataatagcttaacatctttagatcttagtgaa
aatttacttttagagagacttgatgtttcaaataatcacattgactccttaaatttatct
ttaaataactcgcttcttactttagatgttagggataattcactagagtacctaaatgtg
aaaaatggcaataatatgaatatgataattcaaggaacttacgcattggatgtagctgga
aatccaaatttgacttgtatccaagtagatgatattgcttatgcaaatgcaaacttcaat
aaagatgcaacagcaagttttaatttaggatgtggtgttaacactgcagcaactaatggt
aattggagtgatccatctagttggagtacaggcgttgtgccaacatcaaatgataacgta
accatacctgcaggaaccactttacaaattggttctaatatttctgaaataaactcttta
gtgaacgagggtagtattgtaattgggcctaccttttctttaaaatcaaatacaacttta
gtaaataatggctcgattgttatggattccgaaagtaacaacagttctgtattgtttgta
caaggtgcctcttcaggaacaattacgtataagcgaggtggtcttaaagcaaatgcctgg
agtttggtagcaccaccagtttcaggtcaaaaaattgaagagtttgctttaaatgcggat
aatgatattagaataaataccagtgtatctccaaatagatatgctattgcttatcatgat
gataccgcaatagaaggagaaaaatggaaatattacaccacagatatcgcctcttcttta
acttttacggctggtgaaagttattcaatgtctagaggtacagatggatctgttagtttt
acaggtactttaacgactgcagacgttagtaaatcattaaatgcaggagcctggagcgca
atagggaatccttttacaacctactatcctgcaaataaaaatagtgagaatagtttttta
aatcaaaatttcgctgcattagatgatgagtttaaagcggtatatctgtggagtaccact
cagaataaatttgttagtgttacagaaatagatatcaataatcgctctttaacaccgggc
caagggtttttaataaaattaaaaccaagcgcaacaagtgttcaatttaatgaagacaaa
agaaccttaaaacctaatgatgctacaaatacctttgcgaaaaacaacgatttgtacgca
gaacttgccttagaaaatgataattataatgttacaactgcgataaagttttatccaaat
gctacattagggtttgatgtagggtatgatatcagaaattttgatggtgctagtttcgat
gtatttacgcaccttgccgaccaaagctcagagaacaattttagcattcagtcagtgcct
tctacagatatggaaaacacgatagttcctttaggagtaaacttaccgaatgaagagaag
gtgaaatttacattaagcgctgtgaaccttccagaaggaatacatgttgttattgaagat
agaatgctaaacacctttaacaatatgagtacagacaatacgtatgtacctgattttagt
caaaacaaaaatttaaaagatcgattctttgttcattttaaaactgcttcggccttatca
acgaatactccaacgctcaatgagattaacatttttgtaaaagagagagttttgtttgta
gaaggtattaaaaatgagaaagcattgaaagtatttaatatgctggggcaagagcttctt
acagtaaacttagaggcagatagcaatcaaataaatttaccaaaccacataaaaagcggt
atttatttgatttctataaaagcagatactcaaacacatacgcaaagaatattattaaaa
taa
DBGET
integrated database retrieval system
