Photorhabdus laumondii subsp. laumondii DSPV002N: A4R40_13070
Help
Entry
A4R40_13070 CDS
T05478
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K26063
(R)-2-hydroxyglutarate dehydrogenase [EC:1.1.-.-]
Organism
plum
Photorhabdus laumondii subsp. laumondii DSPV002N
Pathway
plum00310
Lysine degradation
plum01100
Metabolic pathways
plum01120
Microbial metabolism in diverse environments
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
plum00001
]
09100 Metabolism
09105 Amino acid metabolism
00310 Lysine degradation
A4R40_13070
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
FAD-oxidase_C
FAD_binding_4
Fer4_8
BBE
Fer4_20
BBS7_pf
Fer4_10
Fer4_17
Fer4_18
Fer4_21
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AWK42364
UniProt:
A0A6L9JFB9
LinkDB
All DBs
Position
complement(3071411..3074470)
Genome browser
AA seq
1019 aa
AA seq
DB search
MIPRISQAPHVSEVAQKFLDTLKEQGFTGDVASSYADRLTMATDNSIYQLLPQAIVFPRS
SADVVLLARVAGEKEYQNLTFTPRGGGTGTNGQALNDGIVVDMSRYMNRILEINPAQGWV
RVEAGVIKDQLNQYLRPYGYFFSPELSTSNRATLGGMINTDASGQGSLVYGKTSDHVLSL
RAVLLGGELLDTRAMDIVQAESIAQEDSVTGRIYNTVLSRCREQRELIVEKFPKLNRFLT
GYDLRHVFSDDMRKFDLGRILTGSEGTLAFITEAVLDITPLPKVRRLVNVKYDSFDSALR
NAPFMVEAKALSVETVDSKVLNLAREDIVWHSVKELITDIPNKDMQGLNIVEFSGDDQPL
IDRQVETLCQRLDELMDGNQAGIIGYQICRELADIERIYAMRKKAVGLLGNSKGAAKPIP
FVEDTCVPPQYLADYIVEFRQLLDSHHLNYGMFGHVDAGVLHVRPALDMCDPQQEILMKQ
ISDEIVSLTARYGGLLWGEHGKGFRAEYSPAFFGSILYEELRRIKAAFDPDNRLNPGKIC
PPMGVDAPMMKVDAVKRGTYDRTIPINVRNTFRGAMECNGNGLCFNFDVKSPMCPSMKVS
QQRIHSPKGRATLVREWLRLLTEQGVDPTLLKQGLEQKRPSLRGLIEKTHNSWQAWRGEY
DFSHEVKEAMSGCLACKACSTQCPIKIDVPSFRARFLELYHGRYFRPLRDHIVASAESST
PLMAKVPRVFNFFLKQPWIQELSRRTIGMVDLPLLSSPTLPQQLAGHYALSTTLEQLEKM
EQAHRDEHVLIVQDPFTSYYDAKVVADFAYLVEKLGYKPVLLPFSPNGKAQHIKGFLSRF
TKTAKKTSDFLNRVAELGIPMVGVDPALVLCYRDEYKEILGEQRGKFEVQLVHEWLINTL
PEKSDHEEKSGDKWYLFGHCTEVTMLPGSSQQWGKIFHRLGSKLDNISVGCCGMAGTYGH
ENKNIEHSIGIYKLSWQPALQKLPLERCLSSGYSCRSQVKRIEGQVLKHPLQALLEIIP
NT seq
3060 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatcccacgcatatcacaagcaccgcacgtcagtgaggtggcgcagaagttcttggat
acattgaaggaacaaggatttaccggagatgttgccagtagttatgccgatcgtctgaca
atggcgacagataacagtatctatcaactcttaccacaggctatcgttttccctcgatcc
agtgcagatgtggttttactggctcgtgtcgcaggtgaaaaagagtatcagaatttgaca
tttacgccacgcggtggcggtacaggcacaaacggccaggcgcttaatgacggcattgtg
gtggatatgtcccgttatatgaatcgcattcttgagattaacccggcgcaaggttgggtc
agagttgaggcgggggtgattaaagaccaactgaatcaatatttgcgtccatatggttat
ttcttttcaccggagctttcaaccagtaaccgtgcaacattgggcggcatgattaatact
gacgcatccggtcagggttcattagtctatggtaaaacttctgatcatgttcttagccta
cgggcagttctattagggggggaattacttgacacccgcgctatggatatagtccaggcg
gaatcgattgcgcaagaggattcggttaccggtcgcatttataacacggtgcttagccgc
tgccgtgaacaacgtgaacttatcgttgaaaaattccccaaacttaatcgctttttgacc
ggttatgatttgcgccatgtgttcagtgatgacatgcggaaatttgatttaggtcgtatc
ttaactggttcagaaggaacgctagcttttattaccgaagcggttttggatattaccccg
ttgccaaaagtcaggcgattggtgaatgtgaaatatgattcatttgattctgcactgcgt
aatgctccttttatggtggaggcaaaggcattatcggttgagaccgtggattccaaagtg
ctgaatttggcgcgtgaggatatcgtctggcactcagttaaggaattgataacggatatt
cctaacaaagatatgcaggggttgaatattgttgaattcagtggcgatgatcagcctttg
atagaccggcaagtagaaacactttgccagcgccttgatgaactgatggatggcaatcaa
gctgggattattggttatcaaatttgccgagagttagctgatattgagcgtatttatgca
atgcgcaagaaagcagttggcttgttgggtaacagtaaaggtgcggcgaaacccattcct
tttgtagaagatacgtgtgtaccgccacagtatctcgctgattatattgtggaattccgg
cagctattggatagccatcatcttaattacggtatgtttggtcatgtggatgcgggggtg
ctgcatgttcggccggcgctggatatgtgtgatcctcagcaagagatactgatgaaacag
atttctgatgaaattgtcagtctcaccgcacgttatggtggtttgttgtggggagagcat
ggtaaaggatttcgagctgaatacagcccggcatttttcggtagcatcttgtatgaagaa
ttacgccgaattaaggctgcctttgacccggataaccgtttgaatccgggcaaaatttgt
ccgccgatgggggttgatgcccctatgatgaaagtcgatgctgttaagcgaggaacgtat
gatcggacaattccgataaatgtcaggaatacattccgtggtgctatggagtgtaatggg
aatgggctctgttttaatttcgatgtaaaaagcccgatgtgtccatcaatgaaagtgagt
cagcaacgtatccattcaccgaaaggacgcgcgacactggtgcgtgaatggctgcgtctt
ttaactgaacagggggtagatccgacgttactgaaacagggattagaacaaaaacgacca
agtttgcgtgggttgattgagaagactcacaatagttggcaggcatggcgtggggagtat
gacttttctcacgaagtgaaagaggcaatgtcgggttgtctggcatgcaaagcttgctca
acgcagtgcccgattaaaattgatgttccgtcatttcgtgcacgttttcttgagttatat
catggccgctattttcgccctttacgtgatcatattgtggcgagtgcggaaagcagtaca
ccattaatggctaaggtccctcgggtcttcaatttcttcctgaaacaaccgtggatacaa
gaattgagtcgccggactatcggcatggtggatttacccttgttatccagcccgacgctg
ccccaacaactggcgggtcattatgcactttcgaccacactggaacagcttgaaaaaatg
gaacaggctcatcgtgacgaacatgtgttgattgttcaggacccgttcacgagctattac
gatgctaaagttgtggctgattttgcctatttggtagaaaaattgggatataaacccgta
ttgctgccattttctccaaacggtaaagcacaacatatcaaaggcttcttatcccgtttt
actaaaacggccaaaaagacgtcagactttctgaaccgggttgcggagttgggtattcca
atggtgggtgttgatccagcgctggtgctgtgctaccgggacgaatataaagaaattttg
ggagaacagcgtggaaagtttgaggttcagcttgttcatgaatggttgattaatacctta
ccggagaaaagtgaccatgaagaaaaatccggtgataaatggtatctatttggacattgt
accgaagtgactatgctaccgggcagtagtcaacaatggggaaaaattttccatcggttg
ggtagcaagctggataatatcagtgtaggctgctgtggcatggccggaacctatggtcat
gaaaacaaaaacatagaacactctattggtatctataagttatcctggcaacctgccttg
cagaaattaccattggagcgttgtttaagctccggttattcctgccgaagtcaggttaag
cggatagaagggcaagtacttaagcatccgttgcaagctttattggagataatcccatga
DBGET
integrated database retrieval system
