Photorhabdus laumondii subsp. laumondii DSPV002N: A4R40_16020
Help
Entry
A4R40_16020 CDS
T05478
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K10953
RTX toxin RtxA
Organism
plum
Photorhabdus laumondii subsp. laumondii DSPV002N
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
plum00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02042 Bacterial toxins [BR:
plum02042
]
A4R40_16020
Bacterial toxins [BR:
plum02042
]
Type II toxins: Membrane damaging toxins
Pore-forming toxins, RTX
A4R40_16020
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RtxA_C
Peptidase_C80
DUF3060
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AWK42902
LinkDB
All DBs
Position
complement(3774754..3777645)
Genome browser
AA seq
963 aa
AA seq
DB search
MISDDKRDGFARRFITALDKQGIRSHVSARRSEVAIDATGRKLTRDANNQWVNNLPDNKI
VFEWNKQGELTPRTERVIRGITESDITLAKVGYTGADVVTRGAVADYRYPFTAPKKRENT
IQIDANNKSNNQLSYSGNIQVNVGEGEFTALNWGTSNVGIKVGNGGFKSLAFGDNNVMVH
LGDGDSKHSFDIRGYQALEGAQMFIGNRNVSFNQGSSNDLIVMMDKSMPTPPLVNPFDGV
MHVTGVLQSIAHFGEERDGLIAQDQQWTLTGASKFVRDMSGLDQTSSVNYKTLVELDLQH
ERSSRGVKRDIETTLNKKYHQWLTCNVTDMGTMSRANRFRQANEKLAFNFAVGGQGADIQ
VTAGNWNFMFGDHIQSILDTNLGSLFGLMTQQYSATGMVKTTFTYHPQDLPRQLKNKLLG
RLASVNAETTLADIFGVNYTAEGQMVSRTGEPVDGEAILREMLAVIAEFSGDQLKAFTNP
KKLLDGLKAGMDMGADGIRSFAESHGLQGKAPDENHTPESPVSVDGKRAQADDKAKPAFG
FNSLNLPNLFATMFSKDKQTEMHSLVTHLKENLTADLLNMEEKTFDFLRNSGHLHDDGDI
HISLGNYNFNWGGDGKDLGAYLGDNNNFWGGRGDDVYYSIGTSNLFTGGEGDDLGVLMGR
ENWMFGGHGDDTAVVAGRINHVFMGEGNDQAFVFGEGGFIEAGNGQDYVVASGNYNRVDS
GEGQDYVVTIGNNNQIELGEGNDFARVFGNDNRIDGYFGNDAIKLMGYHAVINGGEGDDH
LIAAAISKFSEFNGGDGQDLLVLGGYQNRFHGGSGADSFMVSGEVIDTSVNDISAEDMIL
LNNVDWRNLWLQRSGYDLVLSVKRQTRDNDAQGVFESVGSVTFDNYFNGNRAKLVTQIGD
KNALGKREFTALSDNVVDSLIQAMSSFAPTVGDNGFIEGLESQAKVAITTAWTDVTIGKG
KFA
NT seq
2892 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgatcagtgatgataagcgggacggttttgctcgtcgctttatcacagcgttagataag
caaggtattcgcagtcatgtttctgcccgccgtagcgaagtcgcgattgatgcaacaggc
cgtaaattgacccgtgatgcaaacaaccaatgggttaataacttgcctgataacaaaatt
gtattcgaatggaataaacagggtgaattgacgccccgtacagaaagggtgattcgcgga
attactgaaagtgacatcacccttgccaaagtgggatataccggtgctgatgtggtgacg
agaggggcagttgcagattatcgttatccttttactgcgccaaagaaacgtgaaaatacc
attcagattgacgccaataataaatcgaataatcagcttagctactccggcaacattcag
gttaatgtgggtgaaggggagtttactgcgctcaattggggaacatcaaatgtcggtatt
aaagtgggtaacggaggctttaaatcgctggccttcggtgacaataatgtgatggttcat
ctcggtgacggagatagcaaacacagcttcgatatcaggggttatcaggcgcttgaaggg
gcgcagatgtttattggtaatcgtaatgtcagcttcaatcagggcagcagtaatgacctg
attgtgatgatggataaatccatgccaacgccgccgttggttaatccatttgatggcgtg
atgcatgtcaccggagtactacaaagtattgctcactttggcgaagaacgggatgggtta
atcgcgcaagatcagcaatggacactcaccggtgcgagcaaatttgtacgggatatgtcc
ggtttggatcaaaccagcagtgtgaactacaaaacgctggttgagctggatttacagcat
gaacgtagtagccgcggtgtgaagcgagatattgaaaccacattgaataaaaaatatcac
caatggctaacctgcaatgtgactgatatgggcacaatgagccgcgcaaatagattccgt
caggctaatgagaagttggcttttaactttgccgtcggggggcagggggcagatattcag
gtaacagccggtaactggaattttatgttcggtgaccatatccagtcgattctggatacc
aacctgggttcgttgtttggcctgatgacgcagcaatattcggcaacgggtatggtgaag
actacgtttacctatcatccgcaagatttgccgcgtcagcttaagaacaaattgcttggc
cggttagccagtgtaaacgcggagacgactttagcggacatttttggcgtcaattatacc
gcagagggccaaatggtttcccgtacaggagaaccggttgatggcgaagcgattctgcga
gaaatgctggccgtgattgcagagtttagtggggatcaactgaaagcgtttacaaatccg
aagaagttgcttgatggtttgaaagcgggcatggatatgggggcggatggcatcagatca
tttgcagaaagtcatggcctgcaagggaaagcgcctgacgaaaaccatacaccggaatct
ccagtgagtgtcgatggaaagcgtgctcaggccgatgataaagcaaaacctgcatttggc
tttaactcactgaatttgcctaatctgtttgcaacgatgttcagtaaagataagcagaca
gaaatgcactccttagtcacgcatctgaaagagaacttgacggctgatttgcttaatatg
gaggaaaaaacgtttgatttcctgcgtaacagcggccatttgcatgatgatggcgatatc
catatctcgttggggaactataacttcaactgggggggggacggtaaagatcttggtgct
tatctgggcgataacaacaacttctggggtggtcgcggtgatgatgtttattattcaatt
ggtacttccaacctctttacaggcggtgaaggagatgatctgggcgtcctgatgggacgt
gaaaactggatgtttggcggtcatggcgatgataccgcagtggtggctgggcgaattaac
catgtatttatgggtgaaggcaatgaccaggcatttgtttttggcgaaggtggttttatt
gaggcgggtaacggacaggattacgtcgtcgcctccggcaactataaccgggtggatagc
ggtgaaggtcaggattatgttgtcaccatcggcaataataaccagattgagttaggtgaa
ggcaatgattttgccagagtatttggtaatgacaaccggatcgacggctatttcggcaat
gatgcgataaaactgatgggctaccatgcggtaattaacggtggagaaggtgatgatcat
ctgatagccgcagcgatttcgaagttcagtgagtttaatggcggtgatggtcaggatctg
ctggtgctgggtgggtatcagaaccgcttccacggtggttcgggggcagacagttttatg
gttagcggagaggtgattgatacatcggtcaatgatatcagcgcagaagacatgatattg
cttaataacgttgactggcgaaacctgtggttgcagcgcagcggatatgatctggtgttg
tcggtgaagcgccaaactcgggacaacgatgctcagggggtgtttgagtcagtaggttcg
gtgacatttgataattactttaatggcaatcgtgccaaattggtgactcagataggtgat
aagaacgcattagggaagcgtgaatttactgcactgtcagataatgtggtggattctttg
atccaggcaatgagtagttttgctccgacagtcggtgataatggttttattgaggggctg
gagagtcaagcgaaagtggctattacaacggcatggaccgatgtcacgattggcaaaggg
aaatttgcctaa
DBGET
integrated database retrieval system
