Paenibacillus lutimineralis: EI981_28500
Help
Entry
EI981_28500 CDS
T06479
Name
(GenBank) 6-bladed beta-propeller
Organism
plut
Paenibacillus lutimineralis
Brite
Ubiquitin system [BR:
plut04121
]
Ubiquitin ligases (E3)
Single Ring-finger type E3
TRIM/RBCC proteins
EI981_28500
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
NHL
SLH
DUF5128
SGL
TEN_NHL
SBBP
fn3
Vgb_lyase
CBM_X2
Phytase-like
Mala_s_1-like
CHB_HEX_C_1
Fn3_assoc
Pur_ac_phosph_N
Trypan_PARP
Ig_J_second
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AZS17982
UniProt:
A0A3Q9IFP9
LinkDB
All DBs
Position
6413118..6416741
Genome browser
AA seq
1207 aa
AA seq
DB search
MMKNRSHHRRILFHFILIMVLLLNAFPVVAASEESDFIPWLPNKHYTFDRPVDSTIDNEG
NVYIVDPINNRIVKVDRNGMYLNDWGDYGSGEGMFNYPSGIAIDNNGNVYVADRGNNRIQ
KFDSSGNYLTAWGASGTGNGQFRAPVNLAIDYNGNIYVADRDNYRIQVLDPNGNFLTKWG
SVGTGNGQFNLIYGIAVDQTGNVYTTESENHRVQKFTSGGTYITQWGSLGTGNGQFKYPF
SIDADSSGHVYVTDAQNNRIQKFDSNGVYMDQWGSFGTGSGQLSFPNSVTVDPDGNIYVT
EASNNRLQTFDPNGESLAVLTSASAIVWFNDPSGIAFDSSGSVYVIERGSHQIQKSDSSG
AYLASWGGRGNANGQFDHPTDVAINSASHVYVTDTGNHRIQRFDRDGSFLGQWGGQGSGD
GQFVDPTGIAVNLNGDVYVVDSGNHRIQRFDAAGNYISQWGTQGGGNGQFESPSRIAIDS
SDHIYVTDSGNHRIQKFDRDGSFLGQWGSLGHDNGQLDHPQGIVIDSQGQVYVADSNNDR
VQSFNVDGAYVDQWGSTGNGEGQFNNPTDIAIDPSGKVYAVDTGNQRIQWKVAKVDTPTS
YPFSGASIANNSVVTLSTATAGATIYYTTDGSVPTRNSASGTEVTIAGGPGESVHVQAFA
VRTDMEDSPLLSVTYTLAAPVITPPIGFYDKNVDSAQNQNIEFMLNSNGYPLSDIRNDTV
SLIRGQDYELVGSTVIVFSHYLTTLPIGQTVLTFDFGSLSSLSLTIQISDSTPVPGAPQL
QPAVPGDRQASLTWRPVAGAANYHIYQSSTPSVSGTKVATVVGSVYDYTATELTNGTTYY
FTIQGENHQGTSPFSNIISATPFTLPDAPTNVLAVAGDSQATITFNAPAFDGGSPITGYE
VIANPGGLTAAATASPFTFRGLTNGISYTFTVKAINAGGSGTESAPSNAVMPRSMSTPTP
TPTPTPMPSPMPTPTPTPTPTPTPTPMPETSKPGIFKSDIIDLEKLNYEIKEKLQSTASV
QSFTDISNNWAITSINKLVKLDAIQGYPDRSFKPNQVITRAEFVSMLARLLVIDVKHAGE
TKFPDVQQHWAKDAIEALAYYGIVTGDGDGRFKPDEAITREDMVVMIVRLLNEGALPQSG
SVNFIDLMSAGNYATESIEAAQRARIVTGYADQTFKPKGLTTRAETATILIRLLALDATL
KELLEHE
NT seq
3624 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatgaaaaacagaagtcatcacaggagaattttgtttcatttcatactaatcatggtg
ctgctactgaacgcattcccggttgttgccgcaagtgaagagagcgattttattccatgg
cttcctaataaacactacacttttgatcgtccagtcgattcaacgatagacaacgaagga
aatgtatacattgtagatccaataaacaatcgaattgttaaggtagatcgtaatggaatg
taccttaatgattggggggactacggcagtggagaaggcatgtttaattatcctagtggg
atcgcaattgataacaatggcaatgtttacgtagcggaccgcggtaataatcggattcaa
aaatttgattcgagtggaaattatctcaccgcatggggagcatctggaaccggcaatgga
cagttccgcgctccggttaatttagcaatcgactacaacggcaatatttatgtagcggat
agggataattacagaattcaagtattggatcccaatgggaactttctcaccaaatgggga
agtgtgggcaccggtaatgggcagtttaatttgatttacggcattgcggtcgaccagacc
ggtaatgtatatacaacagagagtgaaaaccatcgagtacaaaaattcacttcgggtggt
acctatataacgcaatggggaagcctgggcaccggtaatgggcagtttaaatatcccttt
tcaatcgatgccgacagtagcggccatgtttatgtaacggatgcccaaaataatcggatt
cagaagtttgattcgaatggcgtctatatggaccaatggggaagctttggcaccggtagc
ggacaattgagtttccccaatagtgtaacagtagatcccgatggcaacatttatgtaaca
gaagcttccaacaaccgattgcaaacatttgatccgaatggagagtccctcgccgtcctg
accagcgccagcgctattgtctggtttaacgatccgagtggaattgcattcgatagcagc
ggtagtgtctatgtaatcgagaggggaagccatcagatccaaaagtccgattctagtgga
gcctatctcgcaagctggggcggcagaggaaatgcgaatggtcagtttgatcacccaacc
gatgtagcgattaacagcgcaagccatgtctacgtaacggataccggcaaccatcgcatt
caaaggtttgatcgggatggcagttttcttggtcaatggggtggacaaggttccggtgat
ggtcagttcgttgaccctacaggcatagcggttaacttgaatggagatgtctatgtggtg
gatagcggcaaccaccgtattcaaaggttcgacgccgctggaaactatattagtcaatgg
ggaactcaaggtggaggtaatggccagttcgagtctccatccagaatagcgatcgatagt
agcgatcatatctatgtcacggatagcggcaatcatcgcattcagaaatttgatcgggac
ggcagctttcttggtcaatggggaagccttggccatgataacggtcaattggatcatcct
caaggcattgtaatcgacagccagggtcaagtctacgtagctgatagcaataatgaccgg
gttcagagcttcaacgttgacggagcttatgttgaccagtggggcagcacaggtaatgga
gaaggtcagtttaacaatccgacagatatagccattgatccaagcggcaaagtttatgct
gtagatacgggcaaccaacggattcagtggaaagtcgcaaaagtggatacgccgacttct
tatccgttcagcggggctagcattgcgaataatagcgtagtgacgttgagtacagctact
gcaggtgcaacgatttattatacgactgacggttctgtgccaacgcggaacagtgcaagc
ggaacggaagttacgattgccggggggccaggcgaatcggtgcatgtgcaggcttttgct
gtaaggacggatatggaagacagtccgctgttgagcgtgacttacacattagcagcacca
gtgattacacctccgattggattttatgataaaaatgtggatagtgcacaaaatcaaaat
atagagtttatgctgaattcgaacggttatccgttatcggatattcggaatgacacggtt
tcgctaatcagaggacaggattacgagcttgtaggcagcacggtaattgtgttctcacac
tatttgacgacattgcctatcgggcagacagtgcttacattcgattttggttccttatcc
tcactgtcattaaccattcaaattagcgattcaacacctgtgcccggggcgccgcaatta
caaccagcggttcctggcgataggcaagcgagtctgacatggagacccgtagcaggtgct
gcaaactatcatatctatcaaagctcgacgccttctgtaagtggaaccaaggttgcgacg
gtggtcggttctgtatatgactatacagcaacagagctgacaaatgggacaacctattac
ttcacgattcaaggagaaaatcatcaaggaacaagtcctttctccaatatcataagtgcg
actccattcacgttgccagatgcgcctactaatgtcctggcggtggccggtgatagccaa
gctacgattaccttcaatgccccggcgtttgacggaggcagtcccattaccgggtatgag
gtgatcgccaatcctggcggattgaccgctgctgcaacggcaagccccttcacattccgg
ggcttaaccaacgggatctcttacacattcactgtgaaagcgatcaatgctggaggcagc
ggcacagaatcggcaccttcgaatgcggtaatgccgaggtctatgtcaacgccgacgcca
acaccgacaccaacgcctatgccgtcgccgatgccaactccaactccaactccaacgccg
acgccgacgccgacgccgatgccggagacatccaagccgggaattttcaaatcagatata
atcgatctggagaagttgaattacgagattaaagagaagcttcaatcgacagcctctgtt
cagtcgtttacggatatttcgaacaactgggcaattacttcaatcaataagctagtcaag
cttgatgcgatacaagggtaccccgatagaagctttaaaccgaatcaagtaattacaaga
gcggagtttgtatccatgctggcaagattgctggtcattgacgttaagcatgctggcgag
accaagttccctgatgtacagcagcactgggccaaggatgcgatagaagcgttagcgtat
tatggaattgtgacaggcgatggagacggccgcttcaaaccggatgaggcaattacaagg
gaagacatggttgtcatgattgtcaggttgttgaacgaaggagctcttccacaatcaggc
agcgtgaattttatcgatttgatgagtgcggggaactatgcgacggaatcaattgaagcc
gcacagagggcaagaattgtgaccggctatgcggaccaaacctttaagcctaaaggtctg
acgacccgcgcagagacggcgacgattctgatccggttactggcgctggatgccactttg
aaggaattgctggagcatgaatag
DBGET
integrated database retrieval system