Paenibacillus lautus: D5F53_09135
Help
Entry
D5F53_09135 CDS
T05701
Name
(GenBank) collagen-like protein
Organism
plw
Paenibacillus lautus
Brite
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
plw00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
D5F53_09135
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Collagen
C1q
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AYB47766
UniProt:
A0A385TVC7
LinkDB
All DBs
Position
1926294..1930805
Genome browser
AA seq
1503 aa
AA seq
DB search
MRVGRNQAARFVTLIRQLTSLIRAFVEQPVNENFTLIKIQLQSLNDLVSGMRFSLRERRG
LRQVVQQIARISNADNLEGIFIRLNEVLTLLQSYGERMGVGGEIGSDIMVLQNSIQTRLE
NALPGADAAPLVNLMNNLPYYIMNATTNPGAGSRQQLADVLQGINQQAASLGSSGPQLSR
LQAAAAGIISLLVNGASPELLNEQLTNYTNALSGTVATLHFPETVQHAAVLSLAAAARTS
AESVQGLTIQETLESVPGNGQPGVTGATGPTGEAGATGAIGPTGATGSTGLPGVPGATGP
TGAMGATGPTGPEGPPGAPGGITGATGATGVTGATGGTGATGVTGATGITGVTGATGATG
PTGATGATGETGVTGATGVTGATGVAGAAGVTGATGATGATGIAGATGVTGATGAMGLTG
ATGETGGTGATGATGVTGVTGATGATGATGAAGATGETGATGATGVTGAAGATGATGVTG
ATGVTGPTGATGETGETGETGVTGATGVTGATGATGATGATGATGATGVTGATGVTGATG
ITGVTGATGATGDTGPTGAAGATGATGVTGATGGTGATGATGATGVTGATGATGETGVTG
ATGAAGVTGATGATGATGETGATGVTGETGATGPTGATGVTGATGVTGATGVTGVTGATG
VTGETGATGATGATGATGATGETGVTGATGAAGVTGATGATGETGATGVTGATGATGATG
ATGVTGATGATGATGATGETGVTGATGATGETGATGVTGETGATGPTGATGVTGATGVTG
ATGSTGATGVTGGTGATGVTGATGVTGATGATGATGVTGVTGETGATGATGATGETGATG
VTGATGATGETGATGVTGATGVTGATGVTGATGGTGATGATGVTGSTGVTGATGATGSTG
VTGATGVTGVTGATGPTGATGVTGATGVTGATGATGETGVTGETGVTGATGVTGATGATG
PTGATGATGETGATGVTGETGATGPTGATGATGATGVTGAAGATGATGATGETGATGAAG
VAGETGATGPTGATGATGSTGATGVTGAIGATGATGAIGETGVTGATGATGVTGATGETG
VTGATGATGGTGATGETGVTGATGATGGTGATGETGVTGATGATGPTGATGETGVTGATG
QAGATGAIGVTGATGVTGATGATGVTGATGGTGATGATGATGVTGATGVTGATGVTGATG
ATGATGVTGATGVTGGTGATGATGAAGATGATGETGATGVTGATGVTGATGETGATGATG
ATGGTGATGVTGATGATGATGSTGATGVTGAIGATGVTGATGATGVTGATGATGATGATG
VAGATGATGATGATGAVGATGVRGATGATGVTGATGATGPAGPTGPTGSTTLVGGSVIYA
SNGATQNVATNSPITFSTSTLQGVTFNGTTTLTIVTAGFYYFDWQVSIANGQTAPNTFGI
VVNGNTTNTANMNSNSTNAEVSGSAVINLSAGNTVELYNLSPVTKSITAPQTAARISIFR
IGS
NT seq
4512 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
attcgtgtcggaaggaaccaagccgctcgcttcgttacattgattcgtcaactgacatcg
ttgattcgggcattcgtagagcagccggttaacgaaaatttcacgcttatcaaaatacaa
ttgcagagccttaacgatttggtctctggcatgaggttttcgctgcgggaaagacggggg
ctaaggcaggtcgtacagcaaattgccaggatctccaatgcggacaatcttgaagggatc
ttcataagattgaacgaagttttgacgttgcttcaatcgtatggagaacgaatgggcgta
ggtggcgagatcggttcggatatcatggttttacaaaatagtattcaaacaaggctggag
aatgcgttgccgggtgcggatgctgcccccctagtcaatttaatgaacaatctgccatat
tacattatgaatgcaacgacgaatccaggggccgggtcgcgccagcagcttgctgatgta
ctccaaggcatcaaccaacaggctgcgagcttggggagttccggaccacagttaagtagg
ctgcaagcagcagcggctggtattatttctttactggtaaatggagcgtcccccgagctt
ttgaatgaacagttgaccaattataccaatgctctttcaggaacggtagcgacgttacat
tttccagagactgtccaacatgctgccgtcctatctctggcggctgcagcaaggacgagc
gctgagagcgttcaggggcttacaatccaggaaaccttagaaagcgtgccgggtaacggt
cagccgggcgtgacgggagcgacaggacctacgggagaagcaggagcgacgggagctatt
ggaccgacaggtgcaaccggatcgaccgggttgcctggcgtgccgggggcaaccggacca
acaggcgccatgggtgctacgggaccaacaggtccggaaggaccaccgggggcgcctggc
gggattacgggagcgaccggagcgacaggtgttacgggtgcgacaggaggaacgggagcg
acaggtgttacaggagcaaccgggatcaccggagtaacaggagctacaggagcaacaggt
ccgaccggtgctacgggagcaacaggtgaaactggtgtaacgggagcaacaggtgtgaca
ggagcaactggggtagctggagcagcaggagttacgggagcaacaggtgccacgggggca
acgggaatagcaggagcaacgggtgtgacaggagccaccggagcaatgggtctgacggga
gcaactggtgaaactggtggtacaggtgcaacaggagcgactggagtaactggtgtaaca
ggagccacaggagccacaggagccactggagcagcaggagcaactggagagactggtgca
acgggagccaccggagtcacgggagcagcaggagccacgggggcaacgggtgttacggga
gcgacaggcgtgacaggaccaacgggagcaacaggagaaaccggagaaaccggagaaacc
ggagtaactggagcgaccggagtaactggagccacaggtgccacgggagcaacgggggca
acaggtgccacgggagcaacgggagttacgggagcgacaggtgttacaggagcaaccggg
atcaccggagtaacaggagccaccggagcaacaggagatacaggaccaacgggagcagca
ggggcaacgggtgcgacgggagtaactggtgcaactggtggtacaggggcaaccggagca
acgggagcgacgggtgtaacgggagccacaggtgccactggtgaaacaggagtcacggga
gcaacaggtgcagctggtgtgacaggagccacaggagcaactggagctactggagagact
ggtgcaacgggagtaacgggtgaaacaggagctacaggaccaacgggagcgacgggagta
actggagccacaggtgtaacgggagccacaggtgtaactggtgtaacaggagccaccgga
gtaacaggagaaactggtgcaacaggagcaacaggtgccacgggagcaacgggggcaact
ggtgaaacaggagtcacgggagcaacaggtgcagctggtgtgacaggagccaccggagca
acaggagaaactggtgcaactggcgtaacgggggcaaccggagcaaccggagcaacggga
gcgacgggtgtaacgggagccacaggtgccacgggagcaacgggggcaactggtgaaaca
ggagtcacaggagccacgggagcaacaggagaaaccggagcaacgggagtaacgggtgaa
acaggagctacaggaccaacgggagcgaccggagtaactggagccaccggagtcacggga
gcaacaggttcgactggtgctacgggagtaactggtggtacaggggcaaccggggtcacg
ggagcgacaggagtaaccggagcaactggagcaactggagcaacgggtgttacgggagta
actggtgaaacaggagccaccggagcaacgggggcgacaggagagactggcgcaacagga
gttacgggagcaacgggggcgacaggagagactggcgcaacaggagttacgggagctacc
ggggtcacgggagcaacgggagtaactggtgcaactggcggtacaggggcaaccggagcc
acaggagttacgggatcgacaggagtgacaggagcaaccggagccacaggatcgacagga
gtgacaggagcaaccggggtcaccggagtaacaggagcgacaggaccaacgggagcgacg
ggagtaactggagcgacaggtgttacgggagcaacgggagcaactggtgaaacaggagtc
acaggagaaacgggagtaaccggagcaacaggggttacaggagcaactggtgcaacaggt
ccgaccggtgctacgggagcaacaggagaaaccggagcaacgggagtaacgggtgaaaca
ggagctacaggaccaacgggagcgacgggagcaactggagccaccggagtcacgggagca
gcaggtgccacgggagcaacgggggcaacaggcgaaacgggcgcaacaggagcagccggg
gtcgcgggagagacaggtgcaacaggaccaacgggtgcaaccggagctacaggttcgacg
ggcgcaacgggagtaactggtgctataggggcaaccggagcaacgggcgcaattggtgaa
actggtgttacgggagcaacaggggctacaggagtcacgggagcaactggtgaaacagga
gtcacaggggcaactggggctactggagggacaggagcaactggtgaaacaggagtcaca
ggggcaactggggctactggagggacaggagcaactggtgaaacaggagtcacaggagca
acgggagcaacaggtccgactggtgctacgggagaaactggcgtcacaggagccacaggt
caggctggtgcaactggagctatcggggtcacgggagcaacgggagtaactggagcgaca
ggtgctacgggagtaactggtgcaactggtggtacaggggcaaccggagcaacgggagcg
acgggagtaacgggagccacaggtgtaacgggagccacaggtgtaacaggagccactgga
gccacgggggctacgggagtaacgggagcaactggtgtaactggcggtactggtgcaacc
ggagccacgggagccgcaggagcaacgggggcgactggagagactggtgcaacaggagtt
acgggagcgacaggtgtgacaggagcaactggagagactggtgcaactggcgctacgggc
gcaacaggaggaacaggtgccacaggggttacaggagcgacaggagcgacaggagcaaca
ggttcgacaggcgctacgggagtaacgggtgcaattggagcaaccggagtaactggcgct
acgggagcaacgggagtaactggtgcgacaggagcaacaggagcaacgggagccacagga
gtagcaggagcaacaggagcaacaggagcaacaggagcaaccggtgcagtaggtgctaca
ggtgtaaggggagccaccggagcaacaggggtcacaggagcaaccggagccacaggtccg
gcaggcccgacgggtccaaccggctctactacccttgtgggtggaagtgttatctatgct
agcaatggagccactcaaaatgtggccaccaactcaccgattactttttcaaccagtacg
cttcaaggcgtaaccttcaatggtacaacgacgctgactatagtgacagcaggcttttac
tattttgattggcaagtttctattgctaatggtcagacagctccgaacacattcgggatc
gttgtgaatggaaatactacgaatacggcgaacatgaactcgaattcaaccaacgccgaa
gtttcaggctctgccgtcatcaatttaagtgcaggtaataccgttgagctttataattta
tcgccggtcactaaatcgataacggcaccgcaaaccgctgcaagaatttctatctttaga
atcggctcatag
DBGET
integrated database retrieval system