KEGG   Candidatus Portiera aleyrodidarum BT-B-HRs: C530_261
Entry
C530_261          CDS       T02267                                 
Name
(GenBank) DNA mismatch repair protein MutS
  KO
K03555  DNA mismatch repair protein MutS
Organism
ply  Candidatus Portiera aleyrodidarum BT-B-HRs
Pathway
ply03430  Mismatch repair
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:ply00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09124 Replication and repair
   03430 Mismatch repair
    C530_261
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:ply03400]
    C530_261
DNA repair and recombination proteins [BR:ply03400]
 Prokaryotic type
  SSBR (single strand breaks repair)
   MMR (mismatch excision repair)
    Mismatch and loop recognition factors
     C530_261
SSDB
Motif
Pfam: MutS_V MutS_III MutS_I MutS_IV MutS_II AAA_27 AAA_29 DUF4141
Other DBs
NCBI-ProteinID: AFT80899
LinkDB
Position
320446..322902
AA seq 818 aa
MYRMGDFYEFLFEDAHTASALLNIQLTSKGKYNNKRIPMAGIPCHSLRTYLKRIITAGIS
VAICEQIKTKKTKKSKLLERKVIRVITPGTLYEDSLLDESKDNLIISIIQKNNKWGISWL
EFTTGAFGVLEVDNIHDLRLELDRLNPVELLISRLHKKLPKLPVHKSIIKPISDINFDYN
NACKVLFKKLNIKNINKKLNAGVSAAGAIIQYINNNKIYNLAHINHLIFENKKDKLKIDR
ITKKHLELDVNVNGKQENTLFSVLNNTMTHMGSRLLKKWINNPITNYDLVFSRQKGVEIV
LTNNFIDILQKYIKKIGDIERIVTRISLKTAKPLDLIKFKIALNVFPKLKTLLKGLLIVN
KNSKSILNYIHKEIFTFPNIALLLDEALVDNPPNSFRYGYVIKSHFNKNLDKLRKIYTNS
EKFIKTFENKEKLRTGIIKLKVTYNKLHGLFIEIPKGRKHKYKIPKNYIRTKTLKNSERF
YTSELKYFEKRLIESKEKSIKYEKSIFKKLIKVLVGNIPYFIKTSKSLATLDVITTFAER
ALTLNYCKPIINKNKIGIKIMEGRHPVIESTTNHHFVPNNLFLNHNKSIHIITGPNMGGK
STFIRQIAIIVLLTYIGSYVPAKYAEIGPIDQIFTRIGGYDDLSAGKSTFMIEMHETAKI
LNTATFKSLVLMDEIGRGTNPTEGLCLAWACLERIIQIKALTLFSTHYFSLTQIAKKFKQ
ITNLHFSASIKSNKVSYIYNIQKGATNNSYSSSVASLANIAQGVINKSNNLIKHFQDHQK
SLNKRHTLMKYIKSFKYKDLTRYLKFIKSFFKNLKDMF
NT seq 2457 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgtatcgtatgggtgatttttatgaatttctttttgaagatgcgcacacagcctctgct
ttattaaatattcaattaactagcaaaggaaaatataataataaacgtattcctatggca
ggaataccttgtcatagtttaagaacatatttaaaacgtattatcacagcaggaatatcg
gttgctatttgtgaacaaataaaaacaaaaaaaacaaagaaaagtaaattgcttgaacga
aaagtaattcgagtaattacaccaggcactttatatgaagacagtttattagatgaaagt
aaagataatttgattatatcaataattcaaaaaaataataaatggggtatttcttggcta
gaattcacaacaggtgcttttggtgttttggaagttgataatatacacgatttacgtttg
gaattagatcgattaaaccctgttgagctcttaatttctagattacataaaaaattacct
aaacttcccgtacacaaatcaataattaaacctataagtgatattaatttcgattataac
aatgcttgtaaagttttgtttaaaaaactaaatataaaaaatataaataaaaaacttaat
gctggtgtttctgcagctggtgctataatacaatatataaataataataaaatttataat
ttagcacatattaaccatttaatttttgaaaataaaaaagataagttaaaaatagatcgt
attactaaaaaacatttagaacttgatgtaaatgttaatggcaaacaagaaaatactttg
tttagtgttttaaataatacaatgacacatatggggagtcgtttattaaaaaaatggatt
aataaccctattactaattatgatttagttttttctagacaaaaaggcgttgagattgtt
ttaacaaataatttcatagatattttacaaaaatatataaaaaaaattggagatatagaa
cgtattgttacgagaatatctttaaaaacagcaaagcccttagatttaatcaaatttaaa
attgctttaaacgtttttcctaaacttaaaactttgttaaagggactattaatagtaaat
aaaaacagcaagtctatactaaattatattcataaagagatttttacttttcccaatatt
gctttacttttagatgaagcattagtcgataatcctcctaactcctttagatatggatat
gtaataaagtcacattttaataaaaacttagataagttgcgtaaaatctatactaattca
gaaaagtttataaaaacgtttgaaaacaaagaaaaattacgtaccggaataataaaatta
aaagttacttataataagcttcatggtttgtttatagaaatacctaaaggtcgtaaacat
aaatacaaaattcctaaaaattatataagaacaaaaacattaaaaaattcagaaagattt
tatactagtgaattaaagtactttgaaaaacgtttaatagaatcaaaagaaaagtcaata
aaatatgaaaaaagtatttttaaaaaattaataaaggttcttgtaggtaatataccttat
tttataaaaacatcaaaatcactagccacgttggatgttattactacttttgctgaaaga
gctttaacactgaattattgcaaaccaataataaataaaaacaaaataggcataaaaatc
atggagggtagacatcctgtaattgaatctacaactaaccatcactttgtacctaataat
ttatttttaaatcataataaaagtatacacattattacaggaccgaacatgggtggaaag
tctacttttatcagacaaattgccattattgttttattaacatatattggaagttatgta
cctgctaaatatgctgaaatcggtcctattgatcaaatttttaccagaataggtggttat
gatgatttaagtgcaggaaaatcaacttttatgattgaaatgcatgaaactgctaaaata
ttaaacaccgcaacttttaaaagtttagtactaatggatgaaataggaagaggaactaat
cctacagagggtttatgtctcgcttgggcatgtttagaaagaataatacaaattaaagct
ttaacgttgttttctactcattattttagtttaactcaaatagcaaaaaaatttaaacaa
ataacaaacttacactttagtgcttccatcaaatctaataaagttagttatatttacaat
atacaaaaaggtgctacaaacaatagttacagttcgtcggttgctagtttggctaatata
gcacaaggcgttataaataaatccaacaatcttataaagcactttcaagatcatcaaaaa
agcctaaataaaagacatacgttaatgaaatatataaaatcttttaaatataaagactta
acacgttatctaaaatttataaaaagttttttcaaaaacctaaaagatatgttttaa

DBGET integrated database retrieval system