Pseudoalteromonas marina: CPA52_07255
Help
Entry
CPA52_07255 CDS
T06578
Name
(GenBank) hypothetical protein
Organism
pmaa
Pseudoalteromonas marina
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Big_1
Invasin_D3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ATG58044
LinkDB
All DBs
Position
1557425..1560775
Genome browser
AA seq
1116 aa
AA seq
DB search
MPLMRLLGILLLSLLLTACGGGGSIEKSGTVGDTDTDTDTTTYTLTLQGYSQADATKSNS
VTNTAALDLRATLKDNDGAVVAGKRITFTLADDIGVLNPDSALTQNDGIATIELSAGSEA
GAGEVTATYNGDDETYTATFAFQSTGGQGDDTGVSGSTTLEVQIVDQNGDKFNSANPVTA
DNVGVVVATLKSDGVAVADKLISFNTNFTGVITPELGTAITDDSGEARVTLGSGVATGAG
QVVASYAPASGTSVSNTAVFYSSGDGAAQDEAQFSVSIKLLTGCTADWDDNRSNVKLDPL
SAASGCTVTNSISSSELGELFVEVTNEQSGEGSKNALVNIETNLGTILPSSGTALTDNFG
IALLKLQPGNTGGAGTVTATALDESASLNFAVGIANLTLSVDNGLNSNDDGSVIPLKAGG
STVIEVTLTDEDGNLYLTATDVEFSSTCAIAGESVIDDSVKSSNGIATATYRATGCNIDD
DVTITVETGGQNFTESTVIPVESSAVQSIQFVDVSETFIALPPGEGGLPTQSIVTFKLLD
ADNIASSQQRIDFKLTDSVGAANLTLTSGNTDNEGLVQTTVTSGIVPGPLVVKACYVSKD
DVKALPEGDDLTCWVDDFQLCQTDPSNEICPEGTLNLIPLSEQISSVSAQLTLASGVTDQ
NSFDLSPTTFNTNSLYYNGIITDLTVFFGDQFNNYNGDGVEATVLSEAGVVGSSSNEETC
KTTDATCVVTWRSQGDRPFEDYKWGNRIGDIDGNASTTEGINPKTGEINCDPYFGAAAPC
INGITRAKNDENGVVMGGRVSVLAVTKGQENFVDEQSTDDIKRTNGLFDIGEYYASYDLP
EAFIDHNENNSFDKADCSDARGDDYDPVSDACSELNSRGGHNETWRDLDNDGIYDAADGL
YNGLLCSEAANAAGECSRELVEVRKNIELVMSGDEPYVRFSVVKTDALPAPFEVFVPADC
SSSVSGNRTFVELEESDVTERCDVAAIDLSVNNVEIANPDFDPNDPDETDPETLTVDIGL
TSMAVRIHYTDEFGNPLPANTVVSLTTSNGDLSIISHSETIPNTNTDKPMYSDVLISRET
DGNDQTSGVLSITFEFENQLGASKTVSTGITIFDDV
NT seq
3351 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcctttaatgcgactactcggcattttattgctcagtttattactcacagcctgtggt
ggcggtggatcaattgaaaaaagcggtacagttggtgacactgatacggacacagataca
acaacttacacgttaacgctacaagggtactctcaagcagacgcaactaaatcaaatagc
gtgacgaatactgcggcattagatttacgtgcaaccctaaaagacaatgatggagctgtt
gttgctggtaaacgcattacctttacgttggctgacgatataggggttttaaaccctgat
tcagccctgacacaaaacgatggcatagcaacaatcgagttaagtgcaggctctgaggca
ggcgctggtgaagttactgccacctacaatggcgatgatgaaacgtatacagccacgttt
gcatttcaatcaacaggtggccaaggtgacgacacgggtgtgagtggctcaacaacttta
gaagtccaaattgttgaccaaaatggtgataaatttaacagtgctaaccctgtaactgcg
gataacgttggtgttgttgttgctacacttaaatcagatggtgttgctgttgcggataaa
cttatttcttttaataccaattttacgggcgttataacgccagagcttggcacggcaatt
actgatgattcaggcgaagctcgcgtcacattggggagtggtgtagcaacgggtgctggc
caagttgtagcaagttacgctccagcaagtggtacgagcgttagcaacacggctgtcttt
tactcatcgggtgatggtgcagcgcaagatgaagcgcaattttcggtatctattaaacta
ctaacaggctgtactgctgattgggatgataaccgaagcaatgttaaattagacccttta
tctgcagcatctggttgtactgtgaccaacagtatttcatcttctgaattgggtgagcta
tttgtagaagtcactaatgaacaaagtggcgaaggcagtaaaaacgcactcgtaaatatt
gaaactaatttaggtacaattttaccttcatcgggcactgctttaactgataactttggt
attgcattattgaagctgcaaccgggcaatactggtggcgcaggaaccgttacagcaacg
gctctcgatgaaagtgcatctttaaactttgcagtgggtattgcaaatttaacgcttagc
gttgataacggcttgaacagcaatgatgacggtagtgtaataccacttaaagccggcggt
agtacggtaattgaagtaacgcttacagacgaagatggtaatttatacttaacggctact
gacgttgaatttagctctacctgtgcgattgctggtgagtcagtcattgatgacagcgta
aaatcgtcaaatggtattgctacagcaacttacagagcaacagggtgtaacattgacgat
gatgtaactatcactgttgaaacaggcggacaaaactttactgaatcaacggttataccc
gtggaaagttctgcagtacagtctattcaatttgtggatgtaagcgaaacatttattgcg
cttccaccaggcgaaggtggcctaccaactcaatcaattgttacttttaaacttttagat
gctgacaatatagcgtcttctcagcaacgaattgactttaaactaacagattcggtaggc
gctgcaaatttaacgcttaccagtggcaacacagataacgaaggtttggtacaaacgaca
gtaacgtcaggtattgtgcctgggcctttagttgtgaaagcgtgttatgtgtctaaagac
gatgttaaagcacttccagagggtgatgatttaacgtgttgggttgatgacttccaattg
tgccaaactgatcctagcaatgaaatttgcccagagggtacattaaacctgatcccactt
tctgagcaaattagttctgtttctgctcagcttacacttgcctcgggtgtaactgaccaa
aacagctttgatttaagcccaacaacatttaacactaactcgctttactacaacggtatt
ataaccgatttaactgtattttttggtgaccagtttaataattacaacggtgacggtgtt
gaagccacagtgctttcagaagccggtgtggttggctcttcaagcaacgaagaaacatgc
aaaacaaccgatgcaacctgtgttgttacatggcgctctcaaggtgaccgcccatttgaa
gattacaaatggggcaacagaataggcgatatcgacggtaatgcgtctacaactgagggt
atcaatcctaaaacaggcgaaattaactgtgacccttactttggcgcagctgcaccgtgt
attaatggtattacccgcgctaaaaatgacgaaaatggtgtagtaatgggcgggcgcgta
agtgtgcttgcagttactaaaggtcaagagaattttgttgatgagcaatcaactgatgat
ataaagcgtacgaatggtttatttgatattggcgagtactacgctagctacgatttacct
gaagcctttattgaccacaacgaaaataacagctttgataaagcggattgtagtgatgca
cgcggcgatgattacgaccctgtatcagatgcgtgttcagagttaaactcacgtggtggt
cataacgaaacgtggcgtgacttagacaacgacggtatctacgatgccgctgacggccta
tacaatgggttattatgtagcgaagctgcaaatgctgcaggcgagtgttcacgtgagttg
gttgaggttcgtaaaaacatagagctagttatgtcaggcgatgaaccatacgtacgtttc
tctgtggttaaaacggatgcattaccagcaccatttgaagtatttgttcctgcggattgt
tcaagttcagtatctggtaacagaacttttgtagagttagaagagtccgatgtaactgag
cgttgtgatgttgctgcaatagacctttctgtcaacaatgttgaaatcgctaacccagat
ttcgatcctaatgaccctgacgaaacagaccctgaaacacttaccgtggacattggttta
acatcaatggctgttcgtattcactacacagatgaatttggtaatccattacctgcaaac
acggtagtgtctttaacaacgagcaatggcgatctgtcaattattagtcacagtgaaaca
atacctaataccaacacagataaaccgatgtactcagatgtattaatttcacgagagact
gatggtaacgaccaaacaagtggggttttaagtattacttttgaatttgaaaaccaacta
ggggccagtaaaacggtctcgacaggcatcacaattttcgatgatgtttaa
DBGET
integrated database retrieval system
