Pseudoalteromonas marina: CPA52_07365
Help
Entry
CPA52_07365 CDS
T06578
Name
(GenBank) ABC transporter ATP-binding protein/permease
KO
K24821
ATP-binding cassette, subfamily B, heavy metal transporter
Organism
pmaa
Pseudoalteromonas marina
Pathway
pmaa02010
ABC transporters
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pmaa00001
]
09130 Environmental Information Processing
09131 Membrane transport
02010 ABC transporters
CPA52_07365
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
pmaa02000
]
CPA52_07365
Transporters [BR:
pmaa02000
]
ABC transporters, eukaryotic type
ABCB (MDR/TAP) subfamily
ABCB-BAC subgroup
CPA52_07365
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
ABC_membrane
ABC_tran
SMC_N
pAdhesive_15
AAA_22
RsgA_GTPase
AAA_21
nSTAND1
AAA_16
AAA_29
ABC_ATPase
AAA_15
Sigma54_activat
MMR_HSR1
Zeta_toxin
AAA_24
AAA_28
AAA_18
nSTAND3
DUF87
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ATG58065
LinkDB
All DBs
Position
complement(1596918..1598696)
Genome browser
AA seq
592 aa
AA seq
DB search
MRSRQNVEKRADAMNLKQSVKTLWPYITKFKGRVFIALLALIGAKGATLLMPWALKEIID
SVDKSINPVLVIPALLLIMYGGLRFASVFLGEVRDAVFSRVTEHSMRNIGLKVFKHLHSL
ELAFHLDRQTGGISRDIERGTSGLSFLMRFLMFNIVPTLFEILTVAIIFGSLFSIWFALI
TLLAVGVYIFFTVTVTQWRNRFIRESNAADNLSNTRAIDSLLNYETVKYFNNEQFEAKTY
DSFLANWETARLKNRMSLLALNSGQALIIASAITALMWLGSSEVVTGSLSIGELVMINAY
MIQLFLPLNFLGFVYREIRRALTDLENMLGLLNKKPQVTNAPNANTLNVKNGEIAFNNVS
FSYNANRPILNNISFKVKAGSKVAIVGASGAGKSSLARLLYRFYDVTSGSITIDNQAINS
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KTRVGERGLKVSGGEKQRIAIARAILKQSPILIFDEATSALDSQAEQAILKAMHEVASEH
TSIVIAHRLSTITDAHTIIVLKSGQIVEQGQHNELLALGGEYAHMWALQQQD
NT seq
1779 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
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cttaagtcaggccaaattgtcgaacaagggcaacataacgaattgctggccttgggcggt
gaatatgcacatatgtgggcattacaacaacaagattaa
DBGET
integrated database retrieval system
