KEGG   Pseudoalteromonas marina: CPA52_10455
Entry
CPA52_10455       CDS       T06578                                 
Name
(GenBank) TonB-dependent receptor
  KO
K02014  iron complex outermembrane recepter protein
Organism
pmaa  Pseudoalteromonas marina
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:pmaa00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02000 Transporters [BR:pmaa02000]
    CPA52_10455
Transporters [BR:pmaa02000]
 Other transporters
  Pores ion channels [TC:1]
   CPA52_10455
SSDB
Motif
Pfam: TonB_dep_Rec_b-barrel OMP_b-brl_3 Plug
Other DBs
NCBI-ProteinID: ATG58640
LinkDB
Position
complement(2265921..2268878)
AA seq 985 aa
MNHNLSKITLAVISATAMNMSLSVHAQEETKNVKDDLEVIEVSGIRQSLTNALAEKRSAD
SLVEIIQSEDIGKLPDQNLAEVLENVTGIQITRQAGVGTGVQIRGTDANRTEINGVSTVG
SGSGRSGISFEDVSASIISSLEVIKSPEAKTIEGSVGGTINLKTIRPLQLGEQLATIRVQ
GENSSLSTDSGLQPRFSGTFADNWEGDFGEFGILVSGSYAEQDVTAFRPRADRDNIVTSD
SGVASAQSFDFLPIQFFVQDYDNYEYETKNFVGTLEWAPNDNTKFYFDAVVNDQERRQES
SRVQASGVSALNDISVPDEFETINLGSLGGTNLGSIQAALSGVIPVNLANDDDDPNLRFS
SDTNSRVTDSNIFRLGGEWQGDKWFVSAEVASSSSDTTTPSFNTTLNFINPNAPLDAGGG
NDNSVPFEYDLSGGALTFGIAQGAEYAPTVEQLLDPANVVLRDVNIGQDTVENSEDAFRI
DSTYYTDSIVTSVDFGYRYSKSASKQNEITSSVGLRSMADSPRGDLFADLLVAGPDNFNE
ADGRSLYIGDFLLIDPELVASDPDAVLATLQQALQTHGSSRTLNAPTSSSSGFFDIEEIT
HAFYAQANFEYDMFRGNFGLRYIQTDVESTGNSVTQDGGGNELVTRITNESDYNFILPRL
NLVADVSEDVVVRFGAGKDIRRPDYNDLSTSITYSTSPNDEVEFGNPALKPEEVLSYDLS
ADWYFTEASVFSVGIFHKTRKELHVNQLTSPVEDPVTGYRDLTDPCEGGGIFNPIADINV
FGPENGRGVCVGTETKVNDTGETTQKGIEFAFQYDLSSFEKDLGWASGFGVLANYTIQEF
SGGETVNKATSRASNVFAASTGTPGIEVSEIQGLLNLSENAYNFTLYYEKFGLSARMRYT
WREGYRSNDFGSTSSFPWGFPVVQEDRGQLNASISYDVNEQLNIGLEAVNITESEISQSC
VNEGSLLCFQGLTDRRITFGASYRF
NT seq 2958 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaatcataatttatcaaaaatcacactggcggttatctctgcaacggcaatgaatatg
tctttatctgttcatgcgcaggaagagacaaagaatgttaaggatgacctagaggtaatt
gaagtttctggtatacgtcagtctttaactaatgcgcttgctgaaaaacgttcagcagac
agccttgtagaaattattcagtcagaggatattggtaagttacctgatcaaaatttagct
gaagtacttgagaacgtaacgggtattcagatcacgcgtcaggctggtgtaggtacgggt
gttcaaattcgtggtaccgatgcaaaccgtactgaaataaatggcgtttcaactgtgggt
tcaggctctggacgcagcggcattagctttgaagatgtgtcggcttctattatctctagt
ttagaagttataaaatcgcctgaagccaaaacaattgaaggctcagtaggcggaacaata
aaccttaaaacaatacgtccactccaactaggtgaacaattagccacaattagagtacag
ggcgaaaatagtagtttaagcactgatagtggcttacaacctcgtttttctggtactttt
gcagataactgggaaggcgactttggtgagtttggtattttagtaagcggcagttatgcc
gagcaagacgtgacagcatttcgccctcgtgcagacagagacaacattgtaacctctgat
agtggagtagccagtgcacagtcttttgactttttacctattcaattttttgtccaagat
tacgataactacgaatacgaaacaaagaacttcgtaggtacgcttgagtgggcaccaaat
gacaatactaagttttattttgatgcggttgtaaacgatcaggaacgtcgtcaagagagc
tctcgtgttcaagcgtcgggtgtcagtgcattgaatgacatttcggttcctgatgaattt
gaaacaattaatctaggttctttaggtggaactaatttaggttcaattcaagcggcttta
agcggtgtaatcccagttaatttagcaaatgatgatgacgatccaaatttacgtttttcg
agtgatacaaattctcgtgttaccgacagtaatatttttaggctaggtggtgaatggcaa
ggtgataaatggtttgtaagcgctgaagttgcgtcgtcatcttctgatacaacaacacca
agctttaatactacacttaacttcattaaccctaatgcacctttagatgctggtggcggt
aatgataacagtgtgccttttgaatacgacctgtcaggtggagcacttacttttggtatt
gcacaaggtgctgaatatgcgcctacggttgagcaattacttgaccctgcaaatgtagta
ctacgtgatgtaaacattggtcaagataccgttgagaactctgaagatgcgttccgtata
gattcaacatattacacagactcaatagttacctctgttgattttggttaccgttatagc
aaatcggcgagtaagcagaacgaaatcacatcaagtgttggtctgcgctctatggcagat
agcccaagaggtgatttattcgctgatcttttagttgcgggtcctgataactttaatgag
gctgatggtcgttcgttatacataggcgattttttactgatagacccagaactcgtggca
tcagacccagatgcagtacttgcaacacttcagcaagcattacaaactcatggctctagc
cgtacgctaaatgcaccaacgtcaagttcttcaggcttttttgatattgaagaaattaca
cacgctttttatgcacaagctaactttgaatacgacatgttccgcggtaactttggttta
cgttatattcaaactgatgttgaatcgacaggtaactctgtaacgcaagacggcggtggc
aatgagctagtaacgcgtattacaaatgagtcagactacaactttatcctaccgcgttta
aacttagttgccgacgtgtcagaagatgtagtggttcgctttggtgcaggtaaagacatt
cgtcgtccagattataacgacttatctacttctattacttatagcacgagcccaaatgat
gaagttgaatttggtaacccagcactaaaaccagaagaagtattatcttatgatttatca
gcagattggtactttactgaggcgagcgtatttagtgtaggtattttccacaaaacgcgt
aaagagcttcatgttaatcagttaacatcgccggtagaagacccagtaacaggctatcgt
gatttaacagacccatgtgaagggggtggcatatttaacccaattgcagacattaacgtg
tttggtcctgaaaatggtcgtggtgtatgtgtaggtactgagacaaaagtaaatgacact
ggcgaaacaacccaaaaagggattgagtttgcgttccagtatgacctatctagctttgaa
aaagatttaggatgggcgtcgggttttggtgttttagctaattacacaattcaagagttc
tcgggcggggaaacagtcaataaggctacttcaagagcgagtaacgtatttgctgcaagc
accggtacaccgggtattgaagtaagcgaaatacaaggtttgcttaacttatcagaaaat
gcgtataactttactctatactacgaaaagttcggtttatcggcacgtatgcgttacaca
tggcgtgaaggttaccgctcaaacgattttggtagcacgtcaagcttcccatgggggttc
cctgtagtgcaagaggaccgtggtcagcttaatgcaagtattagctacgatgtaaatgag
cagcttaatattggcttagaagccgtaaatattactgagtctgaaattagccagtcttgt
gttaacgaagggtcgttattgtgtttccaaggccttacagaccgtcgtattacgtttggt
gctagttaccgtttttaa

DBGET integrated database retrieval system