Paenibacillus macerans: LMZ02_14345
Help
Entry
LMZ02_14345 CDS
T09394
Name
(GenBank) toxin C-terminal domain-containing protein
Organism
pmae
Paenibacillus macerans
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RHS_repeat
Ntox21
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UMV50450
LinkDB
All DBs
Position
3265728..3270986
Genome browser
AA seq
1752 aa
AA seq
DB search
MDFHLPGNIIPTMPNFMGSTLIDVSEAKQNYYVEFNVIEKPIIRQYKVSYNEKKWIQEDT
DGDGIVDRNTYDLPATTKVVGTYSTLEEANQAASQKITYTVPAESKIVTDYITASKLELF
PQSIRYNQDGFVGSLEPRGQAIVISGSYTPPDFKMVSTRCTYRRDGMYNGTGYWSPFYVT
DNCSEPYMTYNDGLYSGTTTKFGQTAFSTCPSPDYSRRNTYCTAAASVDYSGMVYSKGTP
DTRVWGLNYRGMVTKPSYTSDTGYDPWVDNGQGGRIRYAYTADGLPWIDKLESEGNGSKV
LKQTQLYSTLEEAEVWKEFIGSNPGLEITGSEEGAEPNYRYYIAEGAHPVIGAVTVEYQP
KFIYQNTTNTPLNEQLFPLGKGWAWNLPYVETKDDKQYIHLPEGGSYEIEGDQLKNYDWK
GLTFAADESVNVNGEVSAYVLKSTNAQPKYYFSKDGRLLQISDAYNNFIRFYYEQNATYN
RKLLSKIEDAIGNTIEISYSATEVTVIKGNETVVYKKHTEQGVELLDSITDAAGRKTTYS
YTLAPAKFNLNASEPGRQLSNPYALLTKVYHPTGAATVYTYDDQPVRRYIGANSVNEAYR
AVSRVDQIIYSNDLVEEFNRETIHYTSDMAATYNDNTSFSTLINNGLTNSTYKYNKKYVD
NKVGSKYYLEQAVVQAVDNEKVTSYQYNKQVEGKSYSAPVPTVTTSSNNQNSDVYTSSAV
YDDYGNVTESTDDRGSKSYYTFDDNHLVKTAIEPLDSNTNGYVEFVRNGQGDIVQTTVRE
NNASGKLLQKVEYADRDSYGNVTKQIITNDDKTVTTLSEFSSQYGNAFPTLQSVQVTNAD
GDISTVSKKISYNKETGLVSASTDGNGHETAYEYDALGRVIKVTYPDGNNIGASYDDQEN
TVTVTNELGVKSRTRWNALGWNIETGLYNGTEYQVKTKSAYDHNGRLVSSEDALGNLTRY
TYDGLDRLTSTTYPDGSTATSTYNDALRQIIQADGEGNKQINTYDKWNRIEITEEQPVNQ
DQSTVVAKFEYDRVNDQVLKDYDALNNTTSYKYNSSGKVISVTDPNGDITKYDYDMLGNL
IQTTYPDGNVKSKSYDELGRVIQNKDEVGQSEKQYFDPSGNVIRVVDRNGNSTVFEYDSR
NRLKTRKSNSETVSYTYDAAGKRLSMTDGTGTTSYEYDKYTELLKTMTYPDGLTLSNQYD
AGNNRIHMAGPFGAETFYTYDNLNQVKTVGSVEKQPDTTYQYYKNGLVQGAVSSNGYETQ
NRYTGSKLTELNHALAENVTHHFEYGYDDNKNIRERLQNGINDSFTYDELNRINTSTENN
ETYTYDSRGNRLTLMTVQELKTKPREYSYDDQNQLTRVSLNGQTVEYRYNGDGLLVERIQ
GGVHTRYYYDSNSEQIIAEATVENGKANLVANYTRGLKLEAIEYADQTKAYPLYNGHGDL
IELRDSAGTLLNQYQYDIWGNIISEQEKVHNPFRYSGELWDDEVELQYLRARWYDPSVGR
FINEDTYQGQLTDPLSLNLYTYVQNNPLIYLDPTGHRHEQGAGFTVTPDITTLTLAELRQ
QLPNFKFVDHKEMFYEAQQYQSLWYNGSKAFDRLDAASLSHSSYVVVKLYFLRKDGQDLS
ELTVGQLDKMSFDLSSAGFKIDSIALGLYGASYGVKETSEPTQSGNKLKLHLQQFGGMTT
KEATAAAKKLGYTKTNFTSHGQPVFKKGNKYITPDVDGHNGGIWKMADSVKNLGSKSTRM
GTYDENLTWIGD
NT seq
5259 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttggattttcacttacccggcaatataattccaacgatgcccaattttatgggatctaca
ttaattgatgtaagcgaagcaaagcaaaattactacgtcgaatttaatgtcattgagaag
cctatcataagacaatataaggtgagctataacgagaaaaaatggatccaggaagatacc
gatggagacgggattgttgaccgcaatacctatgatctccctgccacaaccaaagttgta
ggaacctattcaacattggaagaggcaaatcaggcggcaagccaaaagataacgtacacg
gttcctgcagagtctaagatagtaactgattacatcacagccagcaaactggaattgttt
ccacaatctattcgttataatcaagatggctttgttggaagtcttgagcctagaggacag
gcaatagtaatttcaggatcgtatacgccaccagattttaagatggtttccactaggtgc
acctatcgccgagatggaatgtataatggcactggatactggtctccgttctatgtaaca
gataattgtagtgagccatatatgacttacaatgacggtctatatagcggaacaactaca
aaattcggtcaaacggctttttccacttgcccttccccagattatagcaggaggaacacc
tattgtactgcagcagcttctgtcgactatagtggcatggtctattcaaaggggactccg
gacactagagtttggggactgaactataggggaatggttacaaaaccatcttacaccagt
gacaccggctacgatccctgggtcgacaatgggcagggaggaaggataaggtacgcatat
actgctgacggcctgccatggatcgataagcttgagtctgaaggaaatggaagtaaggtt
ctgaaacaaacacagctttactctacactggaagaagccgaagtgtggaaagagtttatc
ggcagcaatcccggtttagagattaccggctcggaagaaggcgccgaacctaactatcgg
tattatattgcagaaggtgctcatcccgttattggtgcagtaaccgttgaatatcaaccc
aaatttatctatcagaatacgactaatacgccgctaaacgagcagctttttccattaggc
aaagggtgggcctggaatctcccttatgtagaaaccaaagatgataaacaatatattcat
cttcctgagggtggaagttatgaaattgagggagaccaactcaaaaattatgattggaag
ggacttacctttgcagcggacgaaagcgtaaacgtaaacggtgaagtgtcagcttacgtg
ctaaagtcaacgaatgcccagcccaaatactatttttcaaaagatggcagattactgcag
atttcggatgcatataacaattttattcgcttttactatgaacaaaatgctacttataat
cgtaaattgttgagcaaaattgaggatgccattgggaacacaatagaaatttcgtattcc
gcgactgaggttacagttattaaaggaaatgagacagttgtttataaaaagcatacggag
caaggagttgaacttctcgattcgataacagatgcagccggaaggaaaacgacgtattca
tatactttggctcctgctaaatttaatctaaacgcctcagagccaggaagacaattgtcg
aatccatacgcgcttctgaccaaagtgtaccatcctaccggggctgccaccgtctacacc
tacgatgatcagccggtacggcgatatattggtgcgaattctgttaacgaagcttaccga
gccgtctcgcgagtggatcaaattatttacagtaatgaccttgttgaggagtttaatcgc
gaaacgatacactatacctctgacatggcagcgacctataatgacaatacaagcttttca
acccttattaataacgggttaactaattcgacttataagtacaataaaaaatatgtcgat
aataaagtcggttccaaatattacctggaacaggccgttgttcaagcagtggataacgag
aaggtaaccagctatcagtataataaacaggtagagggcaagtcgtattcggcgccggtt
ccaacggttactacatcgagtaataatcaaaattcagatgtatatacttcaagtgcggtg
tatgacgattacgggaatgttacggaatcaacggatgatcggggctcaaaatcgtactat
acgttcgatgacaatcacctcgttaaaacagcgatagaacctctagactccaacaccaat
ggctatgttgaatttgtacgaaatgggcaaggagatattgttcaaactactgttcgcgag
aacaatgcaagcggtaaattactgcagaaggtggagtatgcggatagagactcgtacggg
aatgtcaccaagcaaatcattactaatgatgataagacggttactactctgagcgagttc
agcagtcagtatggtaatgcattccctactttgcaaagtgtacaagtgacgaatgcggat
ggagatatttcaacagtcagcaaaaaaatcagttataacaaagaaacgggactagtcagt
gcttcgacggatggaaatggccatgaaaccgcttatgagtatgatgcacttgggcgtgtg
attaaggtaacctatcccgatggaaacaacataggcgcatcttacgacgatcaggaaaat
acggtaaccgtaacgaatgaactgggagtaaagtctagaacgcgttggaatgctctagga
tggaacattgagactggcttgtataatggcacagagtatcaagttaaaacaaaatcggct
tacgatcacaatggccgactggtatcgagtgaagatgcattaggaaatctcaccagatat
acctacgatggtttggatcgtctgacatcaacaacttacccggatggttctacggctaca
tcgacttacaacgatgctcttcgccaaataatacaagctgatggagaaggcaataaacaa
attaacacttacgacaagtggaacagaattgagataacggaagaacagcctgttaatcaa
gatcaaagtacggttgtggcgaagttcgaatacgatcgggtcaacgaccaggttctaaaa
gattatgatgctctgaataacaccacttcttacaagtataattcatcaggcaaagttatt
tcggttacagatcctaacggagacatcaccaagtatgactatgatatgcttggaaatcta
attcaaactacctatcctgatggtaacgttaagtcgaagagttacgatgagcttggacgc
gttattcagaacaaagacgaagtcggccagtccgaaaaacagtattttgatcctagtgga
aatgtaattcgtgtggtagatcgaaacgggaactcgacggtttttgaatatgacagccgc
aatcgtttgaaaacacggaaaagcaacagtgaaacggtaagttatacctatgatgcagcc
ggtaaacgtctgtcgatgacggatggaaccggaacaacttcttacgagtatgataagtac
acggaactgttgaagacgatgacttacccggatggattaacccttagcaatcaatatgat
gcaggaaataatcgaatacacatggcaggtccattcggagccgaaacattctatacttat
gacaacctgaaccaagtgaaaacggtaggaagtgtagaaaagcaaccggacacaacgtat
cagtattataaaaatggactggttcaaggcgcagtttccagcaatggttacgaaactcaa
aatcggtatacaggctcaaaattgacggagttaaatcatgcgctggcagaaaatgttacc
catcatttcgagtatggttatgatgataataaaaatatcagagagcgcctgcaaaacgga
attaatgattcatttacgtatgatgagctaaatcgaataaacacctcgacagaaaataac
gagacttacacctatgactcccgaggcaaccgtcttaccttgatgacggttcaagaatta
aagacgaaaccaagagaatatagctatgatgatcaaaatcagttaacaagggttagtctg
aatggtcaaaccgtcgaataccggtataatggagacggtctgctggttgaaagaattcaa
ggcggagtacacacgcgctattattatgacagcaacagtgaacaaattatagccgaagca
accgtagaaaacggaaaggccaatttggtcgcaaattacacaagaggactgaagctggaa
gctatagaatatgcagatcaaaccaaagcctatccgttatataatggacacggggattta
atagagctgagagattcagcagggacgttactgaaccagtatcaatatgatatatgggga
aatatcatttccgaacaggagaaagtccataatccattccgttattccggtgagttgtgg
gatgatgaggttgagttacaatacctgagagcccgctggtatgatccgtcggttggtcga
tttataaatgaagatacgtatcaggggcagcttactgatccgctaagtttgaatttgtat
acgtatgtgcagaataatccattaatttatttagacccgacggggcatagacatgagcaa
ggagccggatttacggtcaccccggatataacaacacttacacttgccgaattaagacaa
cagcttcctaattttaaatttgtggatcataaagagatgttttatgaggcgcagcaatac
caatctttgtggtataacggaagtaaagcatttgatcgtcttgacgctgcgtccttaagc
catagttcgtatgttgtcgtcaagctatacttcttacggaaagatggccaggatttatct
gagctaacggtagggcagctagataaaatgagctttgacctatccagcgccgggtttaaa
attgattcaattgctctaggtttatatggcgcgtcttatggggttaaggagacgagtgaa
ccaacacagagtgggaataagctgaagttgcatttgcagcagtttggtggtatgacaacc
aaagaagctacggcggcagcaaaaaaacttgggtatacaaaaaccaactttacatctcat
ggccaacctgtctttaagaaaggaaataaatatattacccctgatgtagatggacacaat
ggtgggatatggaaaatggctgattctgtgaaaaacttaggcagtaaaagtactaggatg
ggtacttacgatgaaaacttaacttggattggagattaa
DBGET
integrated database retrieval system
