Paraphotobacterium marinum: CF386_07515
Help
Entry
CF386_07515 CDS
T05093
Name
(GenBank) YgiQ family radical SAM protein
Organism
pmai
Paraphotobacterium marinum
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Radical_SAM_N
DUF3362
Radical_SAM
Helitron_like_N
B12-binding
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ASK78908
UniProt:
A0A220VER8
LinkDB
All DBs
Position
small:69944..72061
Genome browser
AA seq
705 aa
AA seq
DB search
MIQAKTKIYDYPKYWAECYGSSPFLPTSKQEMDQLGWDSCDIILVTGDAYVDHPSFGMAV
IGRLLESQGFRVGIIDQPNWNSKDDFMKLGKPNLYFGITAGNMDSMINRYTADKKIRHDD
AYSPDNKGGKRPDRAVIVYSQKCREAFKDVPIVIGGIEASLRRIVHYDYWSESVRRSIIF
DSKADILLFGNAERALVEVSHRIARGEQVQNMLDVRGCAFNLQKYPSHYNEIDSSRIEKP
FKEFVPQNPYEYDKPCAGDKEQSTTSEVSVIQIKPSKHEVENTVVRLPSYEKLLNDKILY
AHASRIMHLETNPYSGRALVQKHGARELFVTQSPIPLTTEEMDFVFGLPYARVPHPKYTN
KKIPAYEMIKTSVNIMRGCFGGCSFCSITEHEGRIIQNRSKESILNEIKDIKEKVPGFTG
MISDLGGPTANMYRLGCKDPKAEANCRRPSCVFPSICKKLNTDHQYTIDLYKSARKIDGV
KKIMIASGVRYDLAVESPEYVKELVTHHVGGYLKIAPEHTEKRPLDLMMKPGIGTYDRFK
QMFEQYSKEAGKKQYLIPYFIAAHPGTEDEDMLNLALWLKKNNFRCDQVQNFYPSPMCNA
TTMYYSETNSLKKVKYKKRNIINTAKSEKKRKLHKAFLRYHDENNWDVLREAVKDMGKSH
LIGDKEGCLIPSVDSVKKNNFYQRKSGRHASKRFATKHTKNQFKS
NT seq
2118 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgattcaagcaaaaactaaaatatatgactaccccaaatactgggctgaatgttatggt
tcatcgccttttttaccaacttctaaacaagagatggatcaacttggatgggatagttgt
gatattattttagtaactggtgatgcttatgttgatcatccaagctttgggatggctgtt
atcggtaggttgcttgaatcacaaggttttagagttggtattattgatcagccaaactgg
aatagtaaagatgatttcatgaaattaggtaagcctaatttatattttggaattactgca
ggtaatatggattcaatgatcaatcgatatactgctgataaaaaaatacgtcatgatgac
gcatattcaccagacaataaaggtggaaaaagacctgatagagctgtaattgtttattct
caaaaatgtagagaagccttcaaagatgttcctattgtaattggtggtattgaagctagt
ttacgccgtattgttcattatgattactggtcagagagcgttaggcgatcaatcatcttt
gattccaaggcagatattttattgtttggtaacgctgaaagagctttagttgaagtctct
catcgtattgctcgaggtgaacaggtccaaaatatgttagatgtaagagggtgtgcattt
aatctccaaaaatatccttctcattataatgaaattgattcatctagaatagaaaaacca
tttaaagagtttgttccacaaaatccttatgagtatgataaaccctgcgcaggagataag
gaacaaagtactacgagtgaagtgagtgttattcaaataaaaccatccaaacatgaggtt
gaaaatacagttgttagactgccttcttatgagaagttacttaatgataaaattttgtat
gcacatgctagtaggataatgcatttggaaacaaatccttattctgggagagcgttggtt
caaaagcatggggctagggaactttttgttacacaatctcctattccgttgacaaccgaa
gaaatggactttgtttttgggttaccttatgcaagagtgccacacccaaagtatacgaat
aaaaaaattccagcttatgaaatgattaaaacatctgtaaatataatgagagggtgtttt
ggtggttgctctttttgcagtatcacggagcacgagggaagaattattcaaaatcgttct
aaagaatctattttaaacgaaataaaggatattaaagaaaaagttccagggttcacaggt
atgatttctgatttgggtggaccaactgctaatatgtatcgattggggtgtaaagatcct
aaagcagaagcaaattgtagaagaccttcatgtgtttttccttccatttgtaaaaaatta
aatacagatcatcaatataccattgatttatataagagtgctcggaagattgatggtgtc
aaaaaaataatgattgcttcgggagtaagatatgacttggctgttgagtctcctgaatat
gtgaaggaattagttacacatcatgttggtggttatttaaaaattgcgccagaacataca
gaaaaaagaccgcttgatttaatgatgaaaccaggtattggtacttatgatcgatttaag
caaatgtttgagcaatacagtaaagaggcaggtaaaaaacaatatttgataccctatttt
atcgcagcacatccaggtacagaagacgaagatatgttaaatttagcgctttggttgaaa
aagaataattttcgatgtgatcaggtgcagaacttctacccatcaccaatgtgtaatgca
actacaatgtattattcagaaaccaactcacttaaaaaagtgaaatataaaaaaaggaat
ataattaatacggcaaaatcagaaaagaaaagaaagttacacaaagcatttttaaggtat
catgatgaaaataattgggatgttttaagagaggcagtaaaggatatgggtaaaagtcat
cttattggtgataaagaaggttgtttaatcccatcagttgactcagttaagaagaataat
ttttatcaaagaaaatctggtcgccatgcatctaaacgttttgcaacaaaacatacaaaa
aaccaatttaaaagttaa
DBGET
integrated database retrieval system
