Plasmodium malariae: PMUG01_05039100
Help
Entry
PMUG01_05039100 CDS
T09444
Name
(RefSeq) pre-mRNA-splicing helicase BRR2, putative
KO
K12854
pre-mRNA-splicing helicase BRR2 [EC:
5.6.2.6
]
Organism
pmal
Plasmodium malariae
Pathway
pmal03040
Spliceosome
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pmal00001
]
09120 Genetic Information Processing
09121 Transcription
03040 Spliceosome
PMUG01_05039100
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03041 Spliceosome [BR:
pmal03041
]
PMUG01_05039100
Enzymes [BR:
pmal01000
]
5. Isomerases
5.6 Isomerases altering macromolecular conformation
5.6.2 Enzymes altering nucleic acid conformation
5.6.2.6 RNA 3'-5' helicase
PMUG01_05039100
Spliceosome [BR:
pmal03041
]
Complex B
U4/U6.U5 tri-snRNP components
U5 snRNP specific factors
PMUG01_05039100
Complex C
U5 SnRNP specific factors
PMUG01_05039100
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Sec63
SNRNP200_wHTH
DEAD
Helicase_PWI
ResIII
BRR2_plug
Helicase_C
AAA_25
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
39867434
NCBI-ProteinID:
XP_028860538
UniProt:
A0A1D3JM21
LinkDB
All DBs
Position
5:1565101..1573531
Genome browser
AA seq
2805 aa
AA seq
DB search
MAEEYEKFKRFEYRMNSNLVLQREGPVPNHNEPTGESESLVGKLKYKMGDKVEYSKPNDL
KNKENYRRANNKRKDEFFEKTSKKLKRESGRNRSNNNNMKERSVLSMNIEDIFLYRPTTK
YTEQILSKILSSIRNMIGDNTGDIINSTCNEILYILKDDSLNNEEKKRLVDSSLQVTITD
EMFIELNNLSKEIYDFNKKEEIEEMDNEEEGVAVVFEEDDDYFNHKNRRDVNRKNDDNYS
DIMDELSDDYLDEDEDEDEDEEEEDEDEAEDEEDEDEKEEGEDENEYEDDTADEDDSEKT
SDSNKISGRDDEKGKEDSNKKEKKLKQKRRKKKNEEEDEEEEEKEKQKVREKTTNVKELN
HLKRKKKKYENHLSLKNVNKDFKYKNKNTENYDLDTNSIDAHWLQRELNKVFTDPSLCLE
KEKEVLNILKIYDIQECENKLVNILKYENFSMAKLLIKNRWKIYYCTLLGQAQTEKEKKY
IMENMKKTEEGEEILEDLSNFKNFKKNKQSEFVKTMRKEADNLFNKEKYEHSTNEFLPEQ
RFIHDDDEMRAKGKDDEDEDENEVDTSVNDGTDISGDSGDGNVSGDSHDEEGEGRSSKGN
KKSNSREQTSRRGNAGKVNITLDGNKKKKGEKSSYIIGENFKGKYIDLEKMDLLKKNNDF
LNKEVILPSDSKRIEKKEYDEIIIRSMKDRNSSNSSSSISNKKIGNKCNYFTSPDEIRLI
PVTELPEWSQEVFSCVNITKLNAIQSKVYDTAFNKYEENMLICAPTGSGKTNIALLCILN
VINSNRLTSGNIDKKNFKVIYISPMKALVNEQVQSFNLRLKCMNLKVSELTGDVHLSSKE
IDDSQIIVMTPEKLEIISRKWNEKILLQKVKLIIFDEIHLLNEVRGNVLESIITRINRYI
DNTLIYDGSTTSTEETARFGKDKISSMVSSDNHVVNKNETIINMNKKKIRLVGLSATLPN
YEDVGLFLRADLQKGVFYFDYSFRPVQLEQYYIGIKEKKGIKKYALMNDITYEKVLEEAG
KNQILIFVHSRKETYRTAKILIDRFMKSDNLSKFLIDKKISTEILLSEKEAIVNDELKEI
LPFGFGIHHAGLKRTDRKLVEDLFSDKHLQVLVSTSTLAWGINLPAHTVIIKGTSVYNIN
IGDFDELSAMDVLQMIGRSGRPQYDKNGKAIIITDHKNLQLYLSLNNEQLFIESTLLNNI
VNIINAEIVLKNIQNLKDAINWFNYTYMYIRMMKNPSLYGIQMGENFGDIQEFLSYKENY
DLFRQKVNKRIYNIIYSSFLILEKYDLIKYNKKLNTVSSTYMGKISSYYYVDYKSIDMYN
KKLNKYTNEIDLLKIFTMSEEFRNIYIREEEKVELSIIMEKLPIPVKESINIPYTKINIL
LQLYLSNITLSGYIINADLVYIHQNALRIFRSFFEISLRKNSYSLIALTLKFSKMIERRM
WSTMTPLRQFGLLSNELIRVVEKKNISFKNYITMNINEYITIFKNKKIAKNIYKLVHHFP
KIDLNAYIQPINHKILKVELNITPDFIYNPKYHGYSMLFWVFVFDISNENILHYDLFTLK
KNYKTTSIFESEKDEEENKMMKKNKKDVYSSSDTLDDHLLTFFLPINENPYYIVKVISDK
WLECECTVNLYLNDLILPSKNFYSTQLLDLQPLPLNSLKYEIAKKFFLSRNIKLFSPIYT
QVFSSIYENNGNVIICSSSSKYYLIPAELAIIKIVKCLHDLNSYMRKYIKNEKDLYKIMN
DKKLADMIYNNPLELMKVVYIAPLEEIVLKTYKNWIVFKNMFHLNMCILSGDVQVDMKLL
QKSNIILSTPNIYDNISKKWRRKKILQNVNLYIFDHMELLDTTNGAIMEVVISRIRYIST
QLQLNKSNKKGSRKSVGNSASLLLPILDMNLVPDTDNNNSNNSNTNNSNSNTNNSNTNNS
NSNTNNSNTNNSNSNTNNSNTNNSSSKENFITYNINKLQNLQIEHIYESIGLNRILCLSS
CSLYNCKDFSEWIGCKKNDYYNFLSSVRNIPIEIYLHAVNIMNKQNRYMSMQRQVYQNIR
KLNKKKNVIIFVTEQKLCKTLALDLILSAYNDNTHFYSIFENYVVERGRSSNVGTAVGSN
GTYDQESKFVGMRNEFETAHTAFEGNAHKNFKKDGINLTIERLIDSNMVQMGINRKESYM
VSGNGGCNASSSGDSSGSSSTRRNGNSRKGRGKARNSEMEDERRDDLPSNEDSIFDYIND
KMLVQLMKNGLCYLHSNMTEVERKIVEMLFDKKAIQILIVAYDYIYSLNVYGNTIIILDT
IITHFDNKEEDYSIQNVLEMISYAGRQGEDVKSFVYIYTYITKKEYYKNFIYEPLTVESN
IEDYLPNFLNNEIVMSTIENYQDAIDWLTWSFFYRRIKKNPNYYGLKGISNEHITDYLSE
LIENNIEIISFANCINIEEESTNMISLKPCNLGIISSFYNLDYHVVHFFNEYILSLKNLK
KNKILEIICLSNVFIDLLKINNYDIYLCLKISKSCNIEVTYEFLKLSLNYEKNLLKNDQE
GLNIKNDLNKSGENGKKDQYIINLLNFITVPTYFTAHLKALIILQAHINRYSIPINYIEE
TKKVLLKIFKLINALVDVISSNNILNFCLFVMEVSQMITQSVTNTNNESSLLQLPHFDSQ
LIKKANEMEIMDVYDLINADDDKREFLLKHLNEKQKSQIANVCNIFPIIEVQYEIDLNKT
YKVNEIATLNLTIERDLTDEDISSFAHSLYLPFEKEEMWWIVIGIKKMNLLLSIKKLSLL
KPVNNVKINFELPSKPNTYQVVIYVINDCYVGCDQEYEFRITVEG
NT seq
8418 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggcggaggaatatgaaaagttcaagagatttgagtatcgcatgaactcaaacctggtg
ctgcaaagggagggaccagtaccaaaccacaatgaaccgacgggggaaagtgaaagttta
gtaggtaagttgaagtataagatgggggataaagtagaatatagtaaacctaatgattta
aaaaataaagaaaattatcgaagagctaataataaaagaaaagatgagttttttgaaaaa
acaagtaaaaaattaaaaagggagagtggtagaaataggagtaataacaataatatgaag
gaaagaagtgtgttgagtatgaatattgaagatatatttttatataggccaactacgaaa
tatacagaacaaatactaagtaaaattttgagtagtattcgaaatatgataggtgacaat
acaggggatattattaacagtacatgtaatgaaatattatatattttaaaagatgatagc
ttaaataatgaagagaaaaaaagattagtcgacagttctcttcaagttaccataactgat
gagatgtttattgaactaaataatttatcaaaagaaatatatgattttaacaaaaaagaa
gaaattgaggaaatggacaatgaggaggaaggagttgcggtagtgtttgaggaagacgat
gattattttaatcataaaaataggagagatgtgaatagaaaaaatgatgacaactatagt
gacataatggatgaactaagtgatgactacttggatgaggatgaggatgaggatgaggat
gaggaggaagaagatgaagatgaagctgaggatgaggaagatgaagacgaaaaagaagag
ggggaagatgaaaatgaatatgaagacgatacagcggatgaggatgatagcgaaaagacg
agtgacagtaacaagatcagtgggagggatgatgaaaaagggaaggaggattcaaacaag
aaagaaaaaaaattaaaacagaaaaggagaaaaaaaaaaaatgaagaagaggatgaagag
gaggaagagaaagagaaacaaaaggtgagagagaagacaactaacgtcaaagaattgaac
catttgaaaaggaaaaaaaagaaatatgaaaatcatctgagtttaaaaaatgtaaataaa
gatttcaaatataaaaataaaaatacggaaaattatgacctggacacgaattccattgat
gcacactggttacaaagagaattgaataaagtttttactgacccatcactatgcttagaa
aaagaaaaagaagttttaaatattttaaaaatatatgatatccaagaatgtgaaaataaa
ctagttaatatattaaaatatgaaaatttttccatggctaaattgttaataaaaaataga
tggaaaatttattattgtaccttgcttggtcaggcacaaacagaaaaggaaaaaaaatac
ataatggaaaatatgaaaaaaacagaagaaggagaagaaattttagaagacttgtctaat
tttaaaaattttaaaaagaacaagcaaagtgagtttgtaaaaacgatgagaaaggaagca
gataatttatttaataaggaaaaatatgagcatagtacaaatgagtttttgcctgaacag
cgatttatacatgatgatgatgagatgcgggccaaggggaaggatgacgaggacgaggac
gagaacgaagtggacacgagcgtcaatgatggtactgatatcagcggtgatagcggcgat
ggaaatgttagtggtgatagccatgatgaggagggcgaaggtcgaagttcaaagggaaac
aaaaaatcgaattcaagggaacaaacgtcgaggcgagggaacgcaggaaaggtaaacata
acactagatggaaataaaaagaagaagggggaaaaatcaagttatataataggggaaaat
tttaaaggtaaatacatagacttagaaaaaatggaccttttaaagaagaataatgacttt
ttaaataaagaagtaattcttccatcggatagtaaaagaatagagaagaaagaatatgat
gaaattatcattagaagtatgaaggacagaaatagtagtaatagtagtagttccatctca
aataaaaaaataggtaataaatgtaattactttacatcaccagatgagattagattaata
ccagttacagaattacctgaatggagtcaggaagttttttcctgtgttaatataaccaaa
ttaaatgcaatacagtcaaaagtatacgatacagcttttaataaatatgaagagaatatg
ttaatatgtgctccaacagggtcaggtaaaacaaatattgcattattatgtatattaaat
gttatcaatagtaatagattaacaagtggaaatattgacaaaaagaattttaaggttatt
tatatatctcctatgaaagctttagttaatgaacaagtgcaatcatttaacttgagatta
aaatgtatgaatttgaaggtaagtgagttaacaggtgatgtacatctaagtagtaaagaa
atagatgatagccaaattattgttatgactccagaaaaattagaaataattagtcgtaaa
tggaatgaaaaaatattgttacagaaagtaaaactaattatttttgatgaaatacattta
cttaatgaagttaggggtaatgtattagagagtattataacgcgtattaacaggtacata
gataacacattgatatatgatggtagcactactagtacagaagaaactgcacgatttggt
aaggataaaatatcaagcatggttagtagtgacaatcatgtagttaacaaaaatgaaaca
ataataaatatgaataaaaagaaaattcgattggttggtttatcagctacattgcccaac
tatgaagatgtagggttattcctacgagcggatttacaaaaaggggtgttctattttgat
tattcctttagaccagtacagctggagcaatattacataggtataaaagaaaagaaaggc
ataaagaaatatgcactaatgaatgatattacatatgaaaaagtacttgaagaagcagga
aaaaatcaaattttaatttttgttcatagtagaaaagaaacatacagaacagcaaagata
ttaattgataggtttatgaaaagtgataacttgagcaaattcttaattgataagaagatt
tcgaccgaaatattactttccgagaaggaagctatcgttaatgatgagttgaaggagatt
cttccattcggttttggcatccatcatgcaggattaaaaagaacggataggaaattagtg
gaagatctattttcagataaacatttacaagtccttgtttctactagtacattagcatgg
ggtattaatttacctgcacacacagtaataattaaaggtacgagtgtttacaatattaat
ataggcgattttgatgaattatcagctatggatgttttacaaatgattggtagatctggt
agaccacaatatgataaaaatggtaaagcaattattattactgatcataaaaatttacag
ctctatctttctcttaataatgaacaactttttattgaatctaccttactgaacaatatt
gttaatattataaatgcagaaattgttctaaaaaatatacaaaatttaaaagatgctata
aattggtttaattatacatatatgtatatacgtatgatgaaaaatccatctttatatggg
atccaaatgggtgaaaactttggtgatatacaagaatttttaagttataaggaaaattat
gacttgttcaggcaaaaagtgaataaacgaatttacaacataatatattcctctttttta
atattagaaaaatatgatttaataaaatataacaagaaattgaacacagtgagtagtaca
tatatgggtaagataagtagttactattatgtggattataaatcgatagatatgtataac
aaaaagttgaataagtatacaaatgaaattgatttattgaaaatatttacaatgagtgaa
gaatttaggaatatatatataagagaagaggaaaaggttgagttgtctataattatggaa
aagttacctatacctgttaaggagtccataaacattccatatactaagataaacatatta
ttacagttatatttgtcgaatataactctgagtgggtatataataaatgcagatttggtg
tatatacaccagaatgctttacgtatattccgctcgttctttgagatatcgttaagaaaa
aattcgtacagtcttattgcattgacgttaaaattttctaaaatgatagagagaaggatg
tggagtactatgacccccttgagacagttcggtttgttaagtaatgagttaattcgagtt
gtagaaaaaaaaaatatcagttttaagaattatattactatgaatataaatgaatatatt
accatttttaaaaataaaaaaattgctaaaaatatatataaattagttcatcattttcca
aaaattgatttaaatgcatatatacaaccaattaatcataaaattttaaaagtggaatta
aatataaccccagattttatatataaccctaaatatcatgggtactctatgttattttgg
gtattcgtgtttgatatatctaatgagaatatactccattatgatttgtttacattaaaa
aagaattataaaactactagtatatttgaaagtgaaaaggatgaagaagagaacaaaatg
atgaagaaaaataagaaagatgtatattcttcttcagatactctagatgaccatttgtta
accttctttttaccaataaatgaaaatccttattacattgttaaggtaatttcggataaa
tggttggaatgtgaatgtactgttaacttatatttaaatgatcttatcttaccctcaaaa
aatttttactcaacacagttattagatttacaaccactaccattgaactctttaaagtat
gaaatagctaaaaaattttttttaagtagaaatataaaattgtttagtcctatatatact
caagtcttttcttccatatatgaaaataatggaaatgttataatatgtagttcgtcgtca
aagtactatttaattccagcagaattggcaatcattaaaatagtgaaatgtttgcacgat
ttgaatagttacatgaggaaatatataaagaatgaaaaagatttgtataaaataatgaat
gataagaagctggccgatatgatttataacaatcctctcgagttgatgaaagttgtttat
atagctccattggaagaaattgtactaaaaacgtacaaaaattggattgtttttaaaaac
atgtttcacctgaacatgtgcatattaagtggagatgtgcaagtagatatgaaacttttg
caaaaaagtaatatcattttaagtacacctaatatatatgataatatatcaaaaaaatgg
agaaggaaaaaaattctgcaaaatgttaatttgtatatatttgatcatatggaattatta
gatactacaaatggtgctattatggaagtagttattagtagaataagatatatatcaaca
cagctgcaactgaataagtcaaacaagaagggaagtagaaaaagtgttggcaacagtgct
tctttgttgttaccaattctcgatatgaatctagtacctgacacagataataataatagt
aataatagtaatactaataatagtaatagtaatactaataatagtaatactaataatagt
aatagtaatactaataatagtaatactaataatagtaatagtaatactaataatagtaat
actaataatagtagtagcaaagaaaattttatcacgtataatataaataaattacagaat
ttacaaatcgagcatatatatgaaagtataggattaaatagaatcctatgtctatctagt
tgttccttatataattgtaaagatttttccgaatggattggatgtaaaaaaaatgattac
tataattttctttcatcagtccgaaatatacctattgaaatatatttgcatgctgtcaat
attatgaacaagcaaaatagatatatgtccatgcaaaggcaggtatatcaaaatataaga
aaattaaataaaaagaaaaatgttatcatatttgtaactgaacagaaattatgtaaaacc
ctagcacttgatttgatactctctgcctataatgataacacgcatttttattccattttt
gaaaactatgttgttgagagggggagatctagcaacgttggcactgcggtagggagtaat
ggcacctatgaccaagagagcaagtttgtaggaatgagaaacgagttcgaaactgcacac
actgcttttgaagggaacgcgcataagaactttaagaaagacggcatcaacttaactatc
gaacgacttatagatagtaacatggtgcaaatgggcatcaacagaaaggaaagttacatg
gttagcgggaatggtggttgtaatgctagcagtagtggtgatagtagtggtagtagtagt
actaggcgtaatggtaattcccggaaggggaggggaaaggcaagaaattcggaaatggaa
gatgaaagaagggatgatttgccgtcaaatgaggattccatttttgattatataaacgac
aaaatgctggtgcaactgatgaagaatggattgtgttatctacacagtaatatgacggaa
gtagaaaggaaaatagtggagatgctatttgataaaaaagcaatacaaattttgatagtc
gcttatgattatatatacagtttgaatgtatatggaaatactataataatattggacaca
ataataacccattttgataacaaagaagaagactactctattcagaacgttttagaaatg
attagttatgctggtagacaaggggaagatgttaaatcttttgtatatatatatacatat
ataactaagaaagagtattataaaaattttatatatgaacctttaacagttgagtctaat
attgaagattatttacccaattttttaaacaatgaaatagttatgagtactattgaaaat
tatcaagatgctattgattggttaacatggtcctttttttatagacgaattaagaaaaac
ccaaattattatggattaaaaggaatttcaaatgaacacataactgattatctttcggaa
ttgattgaaaataatatagaaattatatcatttgctaattgcataaatatagaagaagaa
agtacaaatatgattagtttaaaaccatgtaatttaggtataatatcctctttctataac
ttggattatcatgttgttcatttttttaatgaatatattttatccttaaaaaatttaaaa
aaaaataaaattttggaaattatttgtctatccaatgtttttattgatttactcaaaatt
aataattatgatatttatttatgtttaaaaatttccaaaagttgtaatatcgaagtaaca
tatgaatttttaaagctctccttaaattatgaaaaaaatttattaaaaaatgaccaagaa
ggattaaatatcaaaaatgacctgaacaagtcaggagaaaatggaaaaaaagatcaatat
ataattaatttgctcaattttattactgtaccaacatattttacagctcatttaaaagca
ttaataattttacaagcacatataaataggtatagtataccaatcaattatatagaagaa
acgaaaaaagttttgttgaaaatttttaaattaataaatgcattggtggacgtcataagt
agcaataatatattaaatttctgtctttttgtaatggaagtatcacaaatgataactcaa
agtgtaacaaatacaaataatgagtcaagcttattgcagttaccccattttgatagtcaa
ttaattaaaaaagccaatgaaatggaaataatggatgtatatgacttaattaatgcagat
gatgataaaagagaatttttattaaaacatttaaatgaaaaacaaaagagccaaattgca
aatgtatgtaatattttcccaataatagaagtacaatatgaaatagatttaaataaaaca
tataaagttaatgaaattgctactttaaatttaactattgaaagagacttgacggatgag
gatatctcctcttttgctcactccctttatcttccattcgaaaaggaagaaatgtggtgg
atagttatcggaattaaaaaaatgaatctactcttgtcaattaaaaaattatctttgcta
aaaccagttaataatgtaaagattaattttgagttgcccagtaaacccaatacataccaa
gtcgttatatacgtcataaacgactgctatgttgggtgtgaccaggagtacgaatttagg
attacagtggaggggtag
DBGET
integrated database retrieval system
