Plasmodium malariae: PMUG01_07016600
Help
Entry
PMUG01_07016600 CDS
T09444
Name
(RefSeq) nucleoporin NUP100/NSP100, putative
Organism
pmal
Plasmodium malariae
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Nucleoporin_FG
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
39867730
NCBI-ProteinID:
XP_028860637
UniProt:
A0A1D3JM16
LinkDB
All DBs
Position
7:complement(400505..406943)
Genome browser
AA seq
1996 aa
AA seq
DB search
MQNSSSNNLFGSFNNQGNNTNKGIFGNANVQSNLANTDHSSIFGASKTQQSNNALVNKNI
FNMSGNSTGLGGSKSIYDNTSSHSNLGNKNIFGSSNVNSISSSQGNMGGNNLFMNSSNQN
NLNMKNIFGGTSNINTQGSNLSNKSIFGGLQQNAQNTTSNNLFGNLSSSQTNSGSMFGNL
SPGSQNKGNSLFGTSPSSNQTSATSNMFGNASTMNQNKSGGLFGNLQSSNQGTTSSSMFG
GLSSSQGKTTAGGNLFGAMSAGVGTGGNTGTNNLFGNSSTVSQNKPGGIFGNLQSPTQSP
AGGNIFGNSSTLNQNKGNSLFSAFSTTNQASSTSNMFGNASTMNQNKSGGLFGNLQSSNQ
GTTNSSMFGGLSSSQGKTTDGSNLFGGMSTSASTPSSNIFGSTSTMNQNKAGGVFGTLQS
PTNQSTTSSSSMFGGLSSSQTQLTTGSSLFGGMNTNNTTSSNNIFGNAVGGNQSKTSSNL
FGSLSTSTQPASTNLFGGTTSSSQGMTTSSVFSSSVASGATQNKFNNIFGQVSSPNQNTA
IPGGTTGIGTSSGSGTTSTLGGVNTTTGTSNIFGNVSSAGSNINNIGDNKNILGTSSGFS
VSPTTTSVNPSTIGGGIGLGSNLSTALSQSLNTNLSSVGNATNASGASMFGTLGGGLNAT
VGANMFDNGNLGTGLTVGTVSPSSTLFLGDKNISGMNMITQETLLVDGKIKDGDLLTQHM
NIVKEDVGGRGNLDKLDEDLTIIKRKESIFDKAYDDDIGNEKEQGGVFYNHINLIINDNI
NDIQKTTFSLLNDYDSYMWDNFKSSIFKNFVDYIVNFKQKKNQKLIKSNVLDLDQHEFQI
LIWLYNVNSYKIDFIPFKSFYYLLLSDTNLNYSKMLIGNSDNNILFGNFVEINDHYYMNS
QSHFFKTQINKHHHDSVLLSRDKNGLAKRNSLLDIDSIYKQNLKDILNSLLNMNLSIMKE
NFKKREKEEYYENNENSNNESNNNFGNNNINGVGSINSINNINNISGVNNIGNNKDKFIC
MSNYTYENLLLNYLFGTLQHLHDKFYKIEITNYVSKDLNQVDDYFVDAKSNAIFSYCYDN
FYKNEMDKEYCTIHFFFYLTNIMFRCGNYIGLIQIIKNEEFVKNLCIDRYLYDFVILLIR
ILLLLYNKNNEISILENMNAEIDCCDILKKKINMSNLINFFHSIIYLCVSNIYAYDLLCI
LFSDIFYKKGNMYINRERKIEMKNIFHYTKKKKRRHVKNYEQDMEVDNSYMKRGRGSKTS
EDYYSDDIVSNDNYSGNRNGSRGIRNYSNSNRNSSSNSNRNSSRIRNSSHNINNSNINNH
SSINRNSSNNSILNRDVIYQSDSRNCQNDDSNYDKEDSSEYNSEEERETPKSKGKAFFFD
MFTNILQKPKKPKEDPFGNIELNEEIDKINRDSMLISNIEILGITNRYAYNFEYCNIETS
IWIELTLFVSKNFDLSGSKFQENFDIFDTNLSFYNYDDDNNAFLNDTKYRREKINNKIEK
LFTCISSCIIHENKEYFSICSKLKVDDVINNFIVEDGKISEKVKGNISKVLNNNFLLYIK
LFYYLLLVGNLYITVAFLSCISNNVQRILLVLTIFLHKNNIFENAQLNNIKTKTLSFLKF
QNENTSILDNSHDINDDLQSRSDKMNLVLLSMNNHDIPFDYFLLQNNNINILLKITYLLN
LKTNISIKLLKSIVQQNQDILLHENIIGQINNDGNIYYGKLHDFLFLFKNKIKIRKDVKC
FFLMYYILYKKKSFHNNMLSKKKSEIDEEYHYKCRNFKFVQNKNINTLNRITIDNSIISV
HASILYKISQFYAILAYFANQRKNYIISFICYYILKDEQSAINSLIRIYNDELIYYYHNS
DKEYSYIRKCAFRFYHLAKNMWPSNIKLESVESKSYLVMSILLMKRKMYEEAYIIFSSTL
IPDNMLEKLSTADYYNIDLSSNFLMTLRELCRKNYRINELVGPTTLHAVVKFLLPIKDKL
DAQVIESINYLGKLSF
NT seq
5991 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcaaaattcttcgtcgaataacctttttggatcctttaacaatcaaggaaataacaca
aataagggtatatttggcaatgcaaatgttcaatcaaatttggcaaatactgatcattct
tcaatttttggagcatcaaaaacacagcaatcaaataatgcgctagtaaacaaaaatata
tttaatatgagtggtaattccactggtttaggtggaagtaaaagtatatatgacaacaca
agtagtcattcgaacttaggtaacaaaaatatttttggtagttcaaatgtaaatagtatt
agtagtagtcaaggaaatatgggtggaaataatttatttatgaattcaagtaatcaaaat
aatttaaatatgaaaaatatttttggtggtacatcaaatataaatactcaaggatcaaat
ttatctaataaaagcatatttggaggtttacaacaaaatgctcagaatacaacatcaaat
aatctttttgggaatttatcatctagtcaaacaaattctggcagtatgtttggaaatttg
tcaccaggtagccaaaataagggaaatagtttatttggtacttctccatcttctaatcaa
acatcagctacaagtaatatgtttgggaatgcttcaacaatgaatcagaataaatcgggt
gggctttttggaaatttacaatcctccaatcaaggtacaacaagtagtagcatgtttgga
ggtttatcatcaagtcagggaaagacgactgcgggaggtaatctttttggagctatgtct
gcaggtgttgggactggtggaaacacaggaacaaataatttatttggaaattcatcaaca
gtgagtcagaataaacctggtgggatttttggtaatttacagtcgcctactcaaagtcca
gcaggtggtaatatatttggaaattcatcaacattgaatcaaaataaaggaaatagttta
ttcagtgcattttctacaacaaatcaggcatcatctacaagtaatatgtttgggaatgct
tcaacaatgaatcagaataaatcgggtggacttttcggaaatttacaatcctctaatcaa
ggtacaacaaatagtagcatgtttggaggtttatcgtcaagtcagggaaagaccacggat
ggaagtaaccttttcggaggaatgtctacaagtgcaagtacaccatcaagtaatatattt
ggaagtacatcaacaatgaatcaaaataaagcaggtggagtttttggaacactgcagtca
ccaacgaatcaaagtacaacaagtagtagtagcatgtttggaggtttatcatcaagtcaa
acacaacttacaactggaagtagtctttttggaggtatgaatacaaataatactacatca
tcaaataatatatttggaaatgcagtaggaggtaatcaaagtaaaacaagtagcaacctt
tttggatcattatcaacaagtactcaacctgcaagtacgaacttatttggtggaacaact
tcatcaagtcaaggtatgacgacaagtagtgttttttcctcctctgtggcctcaggagct
actcaaaataaatttaataatatattcggacaggtatcaagtccaaatcaaaatacagca
atacctggtggaacaacagggatagggacttcttctggaagtgggacaacttcaacatta
ggtggagtaaatactactacaggtacaagtaatatatttggaaatgtatcatctgcaggt
agtaatataaataatataggtgataataagaatatattgggaacatcatcaggtttttcc
gtaagcccaacaactaccagtgtaaatccaagtacaataggaggaggtataggtttagga
tcaaatttaagtacagcattaagtcaaagtttaaacacaaatttaagtagtgtagggaat
gctacaaatgcaagtggagctagtatgtttggtactttaggtgggggattaaatgctact
gttggtgcaaatatgtttgataacgggaatctaggtacaggtttaacggttggtacagta
agtccatcgagtaccctttttttaggtgataaaaatataagcggtatgaatatgattaca
caagaaacacttttagtggatggcaaaataaaagatggagatttactaacacagcacatg
aatatagttaaagaagatgttggaggtagagggaatttagataaattggatgaagattta
acaattattaaaaggaaagaaagtatattcgataaagcatatgatgatgatattggaaat
gaaaaggagcaaggaggagtattttataaccatattaacttaattattaatgataatata
aatgatatacagaaaacaacattttcactattaaacgactatgattcatatatgtgggat
aattttaaaagtagtatttttaagaattttgttgattatatagttaattttaagcagaaa
aaaaatcagaaacttataaaaagcaatgtgttagatttagatcaacatgaatttcaaata
ttaatatggttatataatgttaattcgtataaaatagactttataccttttaaaagtttt
tattatttattattaagtgatacaaatttaaattattcaaaaatgcttattggcaattct
gataacaatatcttatttgggaattttgttgaaattaatgatcattattatatgaactca
cagagtcattttttcaaaacacaaataaataagcaccaccatgatagtgtattattaagt
agggataagaatggattggcgaaaaggaatagtttgctagatatagactctatatacaag
caaaatttaaaggatattctaaatagtttactaaacatgaacctgtccataatgaaagaa
aattttaaaaaaagggaaaaagaggagtattatgagaataatgaaaacagcaacaatgaa
agtaataacaactttggtaataacaatattaacggtgtgggtagcattaacagtatcaac
aatattaacaatattagtggtgtgaacaacattggtaataataaggataaatttatctgc
atgagtaactatacgtatgaaaatttgttactgaactatctgtttgggaccttacaacat
ttgcatgataaattttacaaaatagaaataactaattatgtttcaaaagatctaaaccaa
gtagatgattattttgttgatgctaaatcgaacgcaatattttcctactgttatgataac
ttttataaaaatgaaatggacaaggaatattgtactattcattttttcttttatctaacg
aatattatgtttcgttgtggaaattatatagggctaattcagataataaaaaatgaagaa
tttgtgaagaatctatgtattgatagatacctatacgattttgtaatattgttaataagg
atattacttttactttataataaaaacaatgaaataagtatacttgaaaatatgaatgct
gaaatagattgttgtgatattttaaagaaaaaaattaatatgtcgaatttaattaatttt
tttcattccattatttatttatgtgtgagtaatatatatgcatacgatttgttatgtatt
ttattttctgatattttttataagaaaggaaatatgtacatcaatagggaaaggaaaatt
gagatgaagaatatttttcattacaccaagaaaaaaaagaggcgccatgtaaaaaattat
gagcaggatatggaagtagataacagttacatgaagagaggtagaggtagcaaaacgagc
gaggattattacagtgatgatattgtttctaacgacaactacagtggtaacaggaacggt
agtaggggtatccgtaattatagcaacagtaacagaaatagcagtagcaatagcaataga
aatagcagcagaattcgtaatagtagtcataatattaacaacagtaatattaataaccac
agtagtattaaccgtaatagtagtaataacagcattcttaatcgtgatgttatctatcag
agtgatagtcgtaattgtcagaatgatgacagtaactatgataaagaggacagtagcgaa
tataacagtgaagaagaaagggaaacaccaaaaagtaaggggaaagcatttttttttgat
atgtttacaaatattcttcagaaaccaaaaaagcccaaagaggatccatttggaaatata
gaattaaatgaagaaattgataaaattaatagagattctatgcttataagtaatattgaa
attttaggaattacgaacagatatgcatacaattttgaatactgtaatattgaaacgagt
atatggattgaattaactttatttgtttcaaaaaattttgatttaagtggaagcaagttt
caagaaaattttgatatctttgataccaatttaagtttttacaattatgatgatgataat
aatgcatttttaaatgatacaaaatatagacgagaaaagataaataataaaatagaaaaa
ttatttacgtgtatttctagttgtattattcatgaaaataaggaatatttttcaatatgc
tcgaaacttaaagtagatgatgtaataaataattttattgtagaggacggaaaaatatcg
gaaaaagtcaaggggaatatatcaaaagtgttaaataataattttcttttatatattaaa
ttattttattatttattattagtaggtaatttgtatataactgttgcttttctatcatgt
atctctaacaatgttcaaagaatattgttagttttgactatatttttacacaaaaataat
atttttgaaaatgcgcaattaaataatataaaaacaaaaacattaagctttttaaaattt
caaaatgaaaatacatctattttggataactctcatgatattaatgatgatctgcagtca
agatcagataaaatgaatttagtccttttgagtatgaacaatcatgatataccctttgat
tattttttacttcaaaataataatattaatattttattaaaaataacctatttacttaat
ttaaaaacaaatataagtattaaattattaaaaagtatagtacaacaaaaccaagatatt
ttattacatgaaaacataataggccaaataaacaatgatgggaatatatattatggaaaa
ttgcatgattttttatttctttttaaaaataagataaaaataaggaaagatgtaaaatgt
ttctttttaatgtattatatattatataaaaagaaatcctttcataataatatgttaagc
aaaaaaaaaagtgaaattgatgaagaataccattacaagtgcagaaattttaaatttgta
cagaacaagaatattaatactttgaatcgaataactatagacaactcaattataagtgtg
catgcatctattttatataaaatatctcagttttacgctattctggcctactttgcaaat
caaagaaagaactatataatatcgtttatttgttattatatactaaaagatgaacaaagc
gcaataaattcattaatcagaatttataatgacgaacttatatattactatcacaatagt
gataaagagtatagctacatacgaaaatgcgcctttagattttaccacctggcgaagaac
atgtggccgtctaatattaaattagaatctgttgaaagtaagtcatatcttgttatgagc
attcttttaatgaaaaggaaaatgtatgaggaggcttatattattttttcatcaacctta
attccagataatatgttagaaaaactgtccactgcggattactacaatattgatttatcg
tccaactttttgatgacattgagagagttatgtagaaaaaattataggataaacgagtta
gttggaccaacgaccctacatgctgttgttaaatttttattgcctattaaagataaattg
gacgctcaagttattgagagtattaactatttaggtaaattaagcttttaa
DBGET
integrated database retrieval system