Planctobacterium marinum: MACH26_25970
Help
Entry
MACH26_25970 CDS
T09721
Name
(GenBank) DUF490 domain-containing protein
KO
K09800
translocation and assembly module TamB
Organism
pmaw
Planctobacterium marinum
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pmaw00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
pmaw02000
]
MACH26_25970
Transporters [BR:
pmaw02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
MACH26_25970
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TamB
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BDX07076
UniProt:
A0AA48HLN9
LinkDB
All DBs
Position
complement(2937337..2941050)
Genome browser
AA seq
1237 aa
AA seq
DB search
MLVFAVLIYTSLGAKFVATLATKAYAPLSIEKAHGGLAESLIFEQIRLHEASLNGQVERV
QLRLDLRCLWRFKVCVEQLIVQDSRLNLVAAQSQVSDISSDNSTTSTWPFSLPLPVQVKQ
LKLIRFSVSENDEPLFKLQTLSSSFDFYTLLNLSQLELDGVQVFLPVQAAKEPLSVEQQL
QQLANIHYSPIELPRFNAPLLLKAEALSITDFSLYQAQNIRLKIPEVKLSAELNENFAAL
QLVELNAFNARTKASLKIDENYQLEMQLQSNAEQAELQVSANGKPSNLKLQTSVESRYHE
LSLKGDFRLQTDLTSALLPITLSGQVHHLRTPDTGAISNANLAVTGELQDLQIKLDGLAT
TPWWSDTHIDLTLTGSPQQLEVKQLELNSVDGRVNLVGSINPQQHPQLLLDVDAKNISTK
RYVPTDIGLINLITDVSLSIVESDWQVNSKQLNLDTIWNQQTATLTSGLRYQNSGQLALT
DLKVVLAENSITGNLQFDEAGKLQANGDLQLGNLTQIHPKANGSLQAKFNVDGPLQQPQI
LFKGQGSQLSFEQYGIAQWQSDIALAWTSESPFRIQFSAEQLKVADDISLDVSINSTGNS
ARHDIDFNILSQWLQVDASLQGGLQNARWNGQLLTSEVTRNNITFQLMEAMSASLDWLEQ
QYHLGAGCWENHSAASFCVKQLSFEQGHYKGDLRGRDLPLGQWLRGSHSQLKQLQTDTVF
NFSVDLEGNQLGVNSLLAQGGFSPGNWQFLDEDQEFYLNTLGFETRFQQGQLVAKLQLQS
ETLGQVQLNSSLPLASDFSQIDMQELQMAAQISSLELSPWVFLVPQVETLNGTINGNVNA
QFSHEKLAMYGNVILSDAALVSKELGLDISALSQQVSFDGHELLTKGQFNMGDGSATLTG
NASWFDGGMASLKIQGQKLTYNDHLMAKLSVSPDLDITLSETEVKVTGILKVPEAAIKLQ
SIPDSALRPTADIRAPDELTRTVAKGPVIELDLKLLLDPDKNKTVNLDAFGLTTALTGNL
NIQGKGNVSANGEVSLLDGIYEAYGQNLQIRQGDLLFNGPLEFPSLQIEAIREPQVTSDG
VIAGLRVTGPARQPTVSVFSSPEMAQSQALSYLLTGRALGARSNDSQETVLTNALISYGL
NQSENVVSKLGENFGINDLSLGMEGQGDSSKVAVSGTIAPNVKLTYGVGVFDAVSEVALR
YQMLPQLYLEAVSGLSNALDIFYEFTYEPEEKADETQ
NT seq
3714 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgttggtttttgctgtactgatttatacctcccttggggcaaaatttgttgcaactctc
gcaaccaaggcctatgcaccgttgagtatcgaaaaagcgcacggcggcttggctgaatct
ttgatatttgagcaaattagattgcacgaagcctcgttgaatgggcaagttgagcgtgtg
cagttgcgccttgatttgcgttgtttgtggcgttttaaagtgtgtgttgagcagcttatt
gttcaggacagccgtttgaatttagttgctgctcaatcgcaggtttctgatatcagcagt
gataattctactacatccacttggcccttttcgctgccactacctgtgcaagtgaagcaa
ctgaagctcatcaggttttctgtctctgaaaatgacgaaccactatttaagttacagacc
ttatcctcgtcttttgatttttatactctgcttaatctctctcaacttgagctcgatggc
gtgcaggtttttctgcctgtacaagcagcgaaagagcctctgtctgtggagcagcaactg
cagcaactggccaacattcattatagcccaatagaactcccccgatttaatgctccgctg
ttattgaaagcagaggcactcagtattaccgattttagtctttatcaggcacaaaatatt
aggttaaagatcccagaggtaaagctctcagctgagctcaatgaaaactttgctgcgctg
caattagttgaactcaatgccttcaatgctcgcacaaaggcaagtcttaaaattgatgag
aattaccagcttgaaatgcagttgcaaagcaacgctgaacaggcagaattgcaggtaagc
gctaacggcaaaccttcaaacctgaagttacaaacgagtgtcgaaagtcgttaccatgag
ctgtcgttgaagggcgattttcgattacaaaccgacctgacttcggcgctgttgcccatt
actttgagcggacaggtgcaccacctgagaaccccggatacaggcgctattagcaatgca
aatttagcggtgactggagagctacaagatttgcaaataaaactcgatgggcttgctaca
acaccttggtggtctgatacccacatcgatttaacactaacgggcagtccacaacagtta
gaggttaaacagcttgagctcaactctgtagatggtcgggtcaaccttgtgggaagtatt
aatccgcagcaacatccacaacttttacttgatgtagacgcaaagaacataagtaccaaa
cgttacgtccctacagatattggtttgataaaccttatcactgatgtatccctgtcaatc
gttgagtcagattggcaggttaatagtaaacagctcaatctggatactatctggaatcaa
caaacggccacattaacttcaggtttgcgctatcaaaatagcggccaactggcgttgacg
gatctgaaagttgtccttgcggagaattcaataacaggcaacttacaattcgatgaggct
ggtaagctgcaagctaatggagatcttcagcttggcaatttaacgcagatacatcccaaa
gcaaacggtagcctgcaggcaaaatttaacgttgatggcccgttgcaacagccacaaatc
ctgtttaaagggcagggcagtcagctctcctttgagcaatacggcattgcccaatggcag
tctgatatcgctttggcgtggacttcagaaagtccatttcgcatccaattctccgctgag
caactcaaagtggcagacgacatcagtttagatgtgagtattaattcaacgggcaactcg
gcccggcacgatattgattttaatattttatctcagtggttacaggtggatgcaagcctg
caaggaggtttgcaaaacgcacgctggaacggacagttgttaaccagtgaagtgactcgt
aataacattacctttcaattgatggaagcgatgagtgctagccttgattggctggagcag
caatatcacctgggagccgggtgttgggaaaatcattcggcagccagtttttgtgttaaa
cagctaagttttgagcaagggcactacaaaggtgatttacggggtcgggatctaccgctt
ggtcagtggcttagaggcagtcattcacaacttaagcaattgcaaaccgacacggttttt
aacttcagtgttgacctggagggtaatcaacttggcgtaaatagtttgctagcacaaggt
ggcttttcccccggtaattggcagtttttagatgaagatcaagaattttacctgaacact
ttgggttttgagacccgtttccagcaaggacaactggtggcgaaattgcagttgcagagc
gaaaccttaggacaagtacagcttaattccagtttgccactggcctctgatttctcacaa
attgatatgcaagagttacaaatggcggctcagatttccagcctggaattatcaccttgg
gtctttcttgtgcctcaagttgaaacactaaacggaacgataaatggcaatgtaaatgca
caatttagtcatgaaaagttggcgatgtatggcaatgtaatcctctctgatgccgcctta
gtaagtaaagagttagggctggacatcagtgctttaagccagcaagttagctttgacggc
catgaactgctcactaaagggcaatttaacatgggagatggctcggcaacactaactggc
aatgcgagttggtttgacggtggcatggccagcttaaagattcagggacaaaaattaact
tacaatgaccatttgatggcgaaactcagcgtctctccggacctggatatcacactttct
gaaacggaagtgaaagtgacaggtattttgaaggtgcctgaagcggcgataaaactacaa
tcaataccggattccgccttgagacccacagcagacataagagcacctgacgagttaacg
cgcaccgtagccaaaggtccggtgattgagcttgatctgaagttactactggatccagac
aaaaataaaacggtaaatctcgatgcttttgggctgactactgcgttaacaggcaattta
aacattcagggcaaaggcaatgttagtgcaaatggtgaagtttcgttgttagatggtatc
tatgaagcttacggtcaaaatttgcaaattcgacaaggggatctactttttaacggcccg
ttagagtttccatcattacaaatagaggcaattcgagaaccacaagtgacttctgatggc
gtaattgcaggtttgagagtaaccgggcccgcccgacaacctaccgttagtgttttctct
tccccggaaatggctcaatctcaagcgctgtcttatttattaaccggtcgagctttaggg
gcgagaagtaatgactcgcaagagacggtactaaccaatgcgttgatcagttacggatta
aaccaatcagaaaacgttgtctctaaattgggcgaaaacttcggcatcaatgatttaagt
ttgggtatggaaggccagggagacagttcaaaagtagcggtaagtggtactatcgcaccc
aacgtaaaactaacttatggtgtaggggtatttgatgctgtgtcagaagttgctttgcgt
tatcagatgttgccacaactatatctcgaagccgtcagtggcttgtctaatgcgctggat
atcttttatgagtttacttacgagccagaagaaaaagctgatgagacacaataa
DBGET
integrated database retrieval system
