Pseudoalteromonas maricaloris DSM 15914: R5H13_15810
Help
Entry
R5H13_15810 CDS
T09524
Name
(GenBank) PAS-domain containing protein
Organism
pmaz
Pseudoalteromonas maricaloris DSM 15914
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PAS_7
HATPase_c
Response_reg
HisKA
HATPase_c_2
PAS_4
PAS_8
PAS
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WOX28084
LinkDB
All DBs
Position
1:3535972..3539397
Genome browser
AA seq
1141 aa
AA seq
DB search
MTAILLLVAAAYIGVLFWLANWGDKTTPRALKISHHPFVYAFSLGIYCTSWTYYGSVGTA
ATSSWHYFPILLGPILLFLFGQGFLRKLILVSKKQNITTIADFISARYGKRQTTAVMVTM
IALLATIPYIALQLKALSSSFLLLQQDEQVSGTALALAGTLIMALFAIFFGTRKVDVTEY
RSGLMLAVAFESIVKLLALGIVAVLAWQSLAQVPDSFEALSEHWQSFDFFNFNFVGQTLM
AAAAIVCLPRQFHVVVVDNHNTSHLKTARWAFTLYLLLIAAMIIPIATAAIHPDIGYGAA
PDSFVLALPIMMEHPILATFVFIGGLSAATAMIVVATLTLSTMLSNDVVLPLLFKRKFKK
NILNSSFKSQILLVRRFVIAAILLLSYMYQQWFGHGEALANMGLVAFSLVTQLLPAIVGG
LYWRKGHAYGVYAGLIAGFICWMLFLMFPILEAGGLLDYEMRQTLITRGTLLALLANISC
YISFSIGAQERLIDRIQAAAFVNPKDQAALSKRLNKQVRATVYDFKVLLQTFLGVQRSQQ
LLGHYAQNNILEDNDAYPAPEFISFCERALTGVLGASSAQALIRTVSSGRQMAFEEVVNF
FDETTQALQFNQNLLYTSLENLSHGISVVDKDLKLVAWNRRYHEMFAYPDGFLEVGQPIE
EVIRFNAERGECGPGEIDKHVDKRVQHLKNGTPHHFIRHRRNGQVFEMTGNPLPEGGFVT
SFSDITTHIATQNALEEINMDLENRIEARTQEIRTINMDLKAEIANRHETEQALMAAKKE
AEQANESKTRFLALASHDILQPLNAARLYLAAIDTHNLISKDQGNFEKLTDSLDSTVHLM
SALLDIAKLEQGAMKPTPRHFNIDDILLPLANEYAIISKEKGLELKVRSSHSIVHSDTTY
LRRIIQNLVSNAVKYTDNGKVLIACRRRKHSLRLEVWDTGPGISNHEQNKIFNDFYRIQA
GDNKGIGLGLGVVKRLCDLLSITISVNSVVNQGSRFAIDIPYGNVDLLQVKEDISQKPQS
KTQLNVIAVDDDPKNLEAMASLLDKWHCHYQLFYKVEDALAYAKHNSAPDVILMDYQLND
NCDGISLIKSLRTVWQDTVPAILITAVRDEEVKIAAKSEQIHYLSKPVKPAKLKALLNHG
R
NT seq
3426 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgactgccattttactcctcgttgccgctgcttatattggtgtacttttttggctcgcc
aactggggagataaaaccaccccccgcgcactcaaaattagtcatcatccgtttgtttat
gccttttccttagggatttattgtacctcttggacttattacggctcggtaggtactgcg
gccaccagtagctggcattacttccctattctattggggcccattttactgtttttgttc
ggtcaggggtttttgcgcaaactcatattggtcagtaaaaagcagaatatcaccaccatt
gcagacttcatttcggcacgatacggtaaacgccaaactacggccgtcatggtaacgatg
atagccctattggcaaccattccatatattgcactccagctcaaagccttgagtagtagc
ttcctgctattacagcaggatgagcaagtgtcaggcactgcgctcgcattagctggcacc
ttgatcatggcattatttgcgattttctttggcaccagaaaggtagatgtgactgagtat
cgctcagggttgatgttggccgttgcttttgaatctatcgttaaactactcgcactcggt
attgttgccgtgcttgcatggcaatctttagctcaagttccagactcatttgaagcattg
agcgaacattggcaatcttttgacttctttaacttcaacttcgttggacaaacgcttatg
gcagcggctgccatcgtctgtttgccccgacaatttcatgttgtagtagtagataaccac
aatacttcacacttaaaaaccgcacgctgggcatttacgctttacttgttattgatagca
gctatgatcatcccaatcgctaccgccgctatccaccccgatattggctatggcgccgca
ccggatagtttcgtacttgctttacctatcatgatggagcatccgatcctcgctacattt
gtctttatcggcggtttatcagcggcaacggccatgatagtcgttgcgactctcacactt
agcaccatgttatcaaacgatgtggtattgcctttgttgttcaagcgtaaatttaagaag
aacattctaaacagcagttttaagagtcaaatactcttagttcgacgctttgttatcgcc
gccatcttattactttcgtatatgtaccagcaatggtttggtcatggtgaagctctcgcg
aatatggggttagttgccttctcattagttactcagctattgcctgcgattgtcggtgga
ctttattggcgtaaaggccatgcgtatggcgtatatgcggggctcatcgcgggttttatc
tgctggatgctatttcttatgtttccaattctggaagctggaggattacttgattatgaa
atgcgtcagacccttatcacccgaggaactttacttgcactgctcgctaacattagctgc
tatattagcttttctatcggtgcacaggagcgcctaatcgaccgtattcaggccgcggca
ttcgtaaaccctaaagatcaggctgctctctctaaacgcttgaataaacaagttcgcgct
accgtgtatgactttaaagtgctactacaaaccttcttgggcgttcagcgtagtcagcaa
ctgctcgggcactatgctcaaaataatattttagaagataatgacgcgtacccagctcct
gaatttatctcattctgcgagcgcgcactcacgggagtgctcggtgcttcatctgcccaa
gctctgatccgtaccgtgtcatcgggtcgccaaatggcatttgaagaggtggttaacttt
tttgatgaaaccacacaagcactacagttcaaccaaaacctactttatacctcattagaa
aatctaagccatgggatttcggttgttgataaagatctaaaacttgttgcatggaacagg
cgttatcacgagatgttcgcctacccagacggtttcttagaagtcggacaaccgatagag
gaagtgatccgctttaacgccgagcgcggtgaatgcggacctggtgaaattgataaacac
gtcgataaacgagttcaacatctgaaaaatggcacccctcaccactttattcgccaccgt
cgtaatggccaagtatttgagatgacggggaacccgctgcctgaaggcgggtttgtgacg
agtttttcagatatcactacgcatattgcgacgcaaaacgcactggaagaaatcaatatg
gatctagagaaccgtattgaagccagaacccaagagatccgcactattaatatggatctt
aaagcggaaatagccaatcgtcacgaaacagagcaggcgttaatggccgctaaaaaagaa
gctgaacaagcgaatgagagtaaaacccgcttcttagcgcttgccagtcatgatattttg
cagccactcaatgccgcacgcctgtacttagcagcgattgatacccacaatctaataagt
aaagatcagggtaactttgaaaaactcaccgatagcctagactccaccgtacatctgatg
agtgcgcttttggatattgcaaaacttgaacaaggtgcaatgaaaccaacccctaggcat
ttcaacattgacgatatcttactaccactggcaaatgagtatgccatcatttcaaaagag
aaaggtctagaacttaaggtgagaagctcccacagcattgtgcacagtgacaccacttac
ctgcgccggatcattcaaaacctggtttccaatgccgttaaatataccgacaatggcaaa
gtgctcatcgcctgtcgacgccgtaaacatagtttaaggcttgaagtgtgggataccggt
cctggtatttcaaaccatgagcagaataagatctttaacgatttttatcgtattcaagca
ggcgataataaaggtattgggcttgggcttggtgttgtaaaacgtctatgcgatctatta
tccatcacaatttcagtgaactcggttgttaatcaaggcagccgctttgccatagacata
ccctatggcaatgtggatttactccaagtaaaagaagatattagccaaaaaccgcaaagc
aaaactcaacttaatgtcatcgcggttgatgacgatccgaaaaacctagaagccatggcg
agcctgctagataaatggcattgccattatcagctgttttacaaagtagaagatgcgctt
gcttacgcaaaacataattccgcaccagatgttattttaatggattaccaacttaacgat
aactgtgatgggatctctttgatcaaatcgctacgcaccgtgtggcaagatacggttcct
gctatcttaattaccgccgtgagggatgaagaagtaaaaatcgccgctaaaagtgagcag
atccattacctgtctaagccagtaaagccagcaaaactcaaagctcttctcaaccatggg
cggtga
DBGET
integrated database retrieval system
