Prochlorococcus marinus MIT 9515: P9515_11941
Help
Entry
P9515_11941 CDS
T00465
Symbol
recB
Name
(GenBank) possible UvrD/REP helicase subunit B
KO
K03582
exodeoxyribonuclease V beta subunit [EC:
3.1.11.5
]
Organism
pmc
Prochlorococcus marinus MIT 9515
Pathway
pmc03440
Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
pmc00001
]
09120 Genetic Information Processing
09124 Replication and repair
03440 Homologous recombination
P9515_11941 (recB)
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03400 DNA repair and recombination proteins [BR:
pmc03400
]
P9515_11941 (recB)
Enzymes [BR:
pmc01000
]
3. Hydrolases
3.1 Acting on ester bonds
3.1.11 Exodeoxyribonucleases producing 5'-phosphomonoesters
3.1.11.5 exodeoxyribonuclease V
P9515_11941 (recB)
DNA repair and recombination proteins [BR:
pmc03400
]
Prokaryotic type
DSBR (double strand breaks repair)
HR (homologous recombination)
RecBC pathway proteins
P9515_11941 (recB)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
UvrD-helicase
UvrD_C
AAA_19
UvrD_C_2
AAA_12
AAA_30
Viral_helicase1
ResIII
IML1_N_fung
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ABM72401
UniProt:
A2BX90
LinkDB
All DBs
Position
complement(1051123..1054761)
Genome browser
AA seq
1212 aa
AA seq
DB search
MNINQIKLDNNFKLVEASAGTGKSFTLAHLVLRNVLEKKIKPEEILLLSFTKNTCSELKD
KILSRFNKLKSFLQNHDDTEIDDTLLEWYDKYHKEEKYPENIIFEIDNFVNAFYKLKVTT
FHAFCNNILEEYSIDIGSPQDPFIENNIDNVYQDIVNDLWIEEFLNLDPEIISAVSQKKI
SSIYGSKINKSFFVDILKNLDQENICKIQITNKYKNINISNYLKEFLVVEWREFCNEWNN
EGEELFLQLIELGKLIKGIGGKSQIYSSKPRNNKFTQINEWIEQINLRLDSEDISQLLYD
ISKEDLLFKYFYNKNINKEINKFNLSLDFSRFKLLQDKIYKIKEGIYTEFVRIFVQLAYL
NLITTKKSLSIFNFNDLIKTVEYKYLSSDICNDRSFSDIQNKFKCVLVDEFQDTDNVQWN
IINKFFNNKNHFLLCVGDPKQAIYKFRGGDIETYLDAKSSAKEVFSLINNYRSSNDLLDF
INNLYKNGLKESNLNYKKLNSRIKNCINYKFDFESPFEIVQFSNKEIDIEQFVTEYIVDF
LLNNQEIDINKISILTLYNSQCLELKNKLLKFNIPCQIKNKQNIFDTEASSLLLLFIETL
LSPRLFRNISLLATSKFIEIDVEELIDHQISKKIKNLTDQCILWSLELREKGFLTVVNEL
IINYKSSSIKNEVDLYANLFQLSEIIEIELINNNFNLNKVFKWYQNQLDDSLRICTGEDY
MAKDYNLQNGINLSTIHNSKGLEYDVVVCPYLSIISNKSKKTKGPIWKSNLDRSIYINIS
NNYSKVEGLKLIEERDLFKESERLIYVALTRSKYKLIIFNDIENTDNILNNDLLPNLKNI
HIINSKREDKVVKMNIKEISSKFNLSSLNNNLWKINKVNTKEIRKSSPEDVISFSSYSSW
IRKDKKTESSSSLYKDYEDNISILKTIEETQLVKSDNNPKYLNLPNPLSDFPKGTVAGTC
LHKILERFDFQNDTPEKLLELIIEELNFFQIDSSFALKVREGIFRIINVSFGKKLLNKRL
IDISSNNILKEVKYDLPLSYNGKSINSNDIAKSFLLDQEFEFGKEYATKINDLQILNKGF
HSGCIDCVIPLGNTLEDSKWWVIDWKSNFISSKENSDCFPKNYHYENMKKEMIKHHYPLQ
AHLYLLALHRLLKWRLKNYQPNLHLGGYIYLFLKGLPDINLFEKSVETDNTPGLFISQAP
INRISYLDNIFK
NT seq
3639 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaatattaatcaaattaagttagataataattttaaattagtagaagcaagtgctggg
actggtaaaagttttactttagctcatcttgttttaagaaatgttttggagaaaaaaatt
aaacctgaggaaatacttttattaagtttcacaaaaaacacatgctcagaattaaaggat
aaaatactctcaagatttaataaactaaaatcgtttttacagaatcatgatgatactgaa
atagatgatactcttttagaatggtatgataaataccataaggaagaaaaatatccagaa
aatataatatttgagattgataattttgttaatgcattttataaattaaaagtaactaca
tttcatgctttttgtaataatattttagaagaatatagtatagatattggttcccctcaa
gatccatttattgaaaataatatagataatgtatatcaagatatagtaaatgatttgtgg
attgaggaatttttaaatcttgatccagaaataatttctgcagttagtcaaaagaaaata
agttctatatacggtagtaaaatcaacaaatcattttttgttgatattttaaaaaatctc
gaccaagaaaacatttgcaaaattcaaataactaataaatataaaaatattaatatatct
aattatttaaaagaatttttggttgttgaatggagagagttttgtaatgaatggaataat
gaaggcgaagaattatttctacagcttattgaattaggcaaattaataaagggaattgga
ggtaagagtcaaatatattcatccaaaccaagaaataataagtttactcagataaacgaa
tggatagaacagataaatctaaggcttgattcggaagatataagtcaacttttgtatgat
atttctaaagaagatcttttatttaaatatttttataataaaaatattaataaggaaatt
aataaatttaatcttagtttagattttagtagatttaaattactacaagataaaatttat
aaaataaaagaaggtatttataccgaatttgtaagaatatttgtccagttagcttatcta
aatctaattactacaaaaaaaagtttatctatatttaactttaatgatttgataaagact
gttgaatataaatatttatcttcagatatttgtaatgatagaagtttttctgatattcaa
aataaatttaaatgtgtcttagtagatgagtttcaagatactgataatgttcagtggaac
attataaataaattttttaataacaaaaatcactttttactatgtgttggagatccaaaa
caggcgatatataaatttagaggtggagatattgaaacttatttagacgctaaatctagt
gctaaagaggtttttagtcttataaataactatagatcatcaaatgatttacttgatttt
attaataacctatataaaaatggacttaaagaatcaaacctaaattacaagaaattaaat
tctagaattaagaattgtattaattataaatttgattttgagagtccatttgaaattgta
caattctctaataaagaaattgatattgaacaatttgtaactgaatatatagttgatttt
ctgttaaataatcaggaaattgatattaataaaatttcaatactaaccttatataattct
caatgtttagaattaaaaaacaaattattaaagttcaatatcccatgccaaattaaaaat
aaacaaaatatttttgatactgaggcaagtagtcttttattgctttttattgaaacattg
ttatcgccaaggctttttagaaatataagtttgttagctacatctaaatttatagaaata
gatgttgaagaattaattgatcatcaaattagtaaaaagataaaaaatttaactgatcaa
tgcattctatggtctctagaattaagagaaaaaggattcctaaccgtagttaatgaactc
attattaattacaagtcatcctcaattaaaaatgaagtggatttatatgcaaatttattt
caattgtctgaaataattgaaattgaattaataaataataactttaatttaaacaaagta
tttaagtggtatcaaaatcagttagatgattctttaagaatttgcactggagaagattat
atggcgaaagattataatctccaaaatggaattaacctttcgacaattcataacagcaag
ggactggaatatgacgttgttgtatgtccatacctttctattatttctaataagtcaaaa
aaaactaaaggtccaatatggaaatcaaatttggataggtctatatatatcaatatttct
aataattacagtaaggtggagggacttaagctgatagaggaaagagatttatttaaagag
agtgaaaggttaatttatgtggctcttacaagaagtaaatataagcttattatttttaat
gatattgagaatacagataatatccttaataatgatttactaccaaacttaaaaaatatt
catattattaattctaaaagagaagataaagtagtaaaaatgaatattaaagaaatttct
agtaaatttaatctttctagcttaaataataatctttggaagataaataaagttaataca
aaagaaataagaaagagttctcccgaagatgttatttctttttcaagttattcctcttgg
ataagaaaagataaaaaaacagaatcgtcttctagtctatacaaggattatgaagataac
atttcaattcttaagactatcgaggagactcaattagttaaatcagataataatcctaaa
tatttaaaccttcctaatcccttaagtgattttcctaaaggaactgttgctggtacttgt
ttgcataaaatattagagagatttgattttcaaaatgatacccctgagaaattacttgaa
ttaataattgaagaattaaatttctttcaaattgattcttcttttgcattaaaagtgaga
gaaggaatttttcgaatcataaatgtttcgtttggaaaaaaattacttaataaaagatta
attgatatctcttcaaataatattctgaaggaagttaagtatgatttaccactctcttat
aatgggaaaagtataaattcgaacgatattgcaaaaagttttttattagatcaagaattt
gaatttggtaaagagtatgcaactaaaatcaatgatcttcaaattctaaataaaggtttt
cattcaggttgtattgattgtgtaatacctttaggaaatacgttagaggatagtaaatgg
tgggtaattgattggaaaagtaattttatttctagtaaagaaaatagtgattgtttccct
aaaaattatcactatgaaaatatgaaaaaagaaatgattaaacatcattatccattacaa
gctcatctttatttattggctttacaccgattattaaagtggagattaaaaaattatcaa
cctaatcttcatctagggggatatatatacttgtttttaaaaggattaccagatatcaat
ttatttgaaaaatctgttgagacagataacactccaggtctttttataagccaagctcct
attaataggattagttatctggataatatttttaaatga
DBGET
integrated database retrieval system