KEGG   Prochlorococcus marinus MIT 9515: P9515_11961
Entry
P9515_11961       CDS       T00465                                 
Symbol
recC
Name
(GenBank) possible exodeoxyribonuclease V subunit C 125 kD polypeptide
  KO
K03583  exodeoxyribonuclease V gamma subunit [EC:3.1.11.5]
Organism
pmc  Prochlorococcus marinus MIT 9515
Pathway
pmc03440  Homologous recombination
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:pmc00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09124 Replication and repair
   03440 Homologous recombination
    P9515_11961 (recC)
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:pmc03400]
    P9515_11961 (recC)
Enzymes [BR:pmc01000]
 3. Hydrolases
  3.1  Acting on ester bonds
   3.1.11  Exodeoxyribonucleases producing 5'-phosphomonoesters
    3.1.11.5  exodeoxyribonuclease V
     P9515_11961 (recC)
DNA repair and recombination proteins [BR:pmc03400]
 Prokaryotic type
  DSBR (double strand breaks repair)
   HR (homologous recombination)
    RecBC pathway proteins
     P9515_11961 (recC)
SSDB
Motif
Pfam: Exonuc_V_gamma RecC_C
Other DBs
NCBI-ProteinID: ABM72403
UniProt: A2BX92
LinkDB
Position
complement(1055247..1058429)
AA seq 1060 aa
MLNIYNSNKIEVISQLLAKELIISPPLITEKLDIAVPNYFLGKWLWNEITVSNQISALYE
LKTISNYTETLLTNLFPEIDMGVWNFESIKWGIIDSFEELDSYKESLPIRNWINKFLNNK
KIIDGDIYNLTKKIANNFIDYLIFRPEMISNWHKYDLNSQNLFNNLNSNEYWQPILFKLL
QKKMPEKPSCLYMIEVIKNIKKLQNYKNKIPKCIYIISDNNLSRLHVDFYSKLAEFTKVN
LYLLSVGDNLWNRINSIEGEVDFGGIENKLYLNNASIEGIFGKFGANYQKLIEETSNIED
INLNTKSIYIDPTINSSRKKDVPLINQIQKRLIDNKKYDFIINERDDSIIFRGHFNQLSQ
LEFVRNKIIEILETCEEIKYSDIAIVSPQTGLIKPFLKYIFNNELINGQKLPYFFIEGDY
EDSSNIYNFLLNITQLAGEKITLEKIEYFLSQDFTQNIFNFDMKEKEEIILLLNQVGFHW
GLDSNERLGEEKNSLEWCINRIILGLIYDKEFNFINNNLKSFSPKNISLDLNKWVKILIK
LKEYINLLRGSFSYSVWVKKIKYILNDVNDFHQNFYLEICDLYRVMNNYSISYQSDQIIV
LNVFREILISCINNSKYKNESYINKILVSDIEKIRLIPRNTIFLINMNNVYYPRLTIKEN
INILNKKYSLGDPSVFDREKYFFLELLISCRKQLIVSWVNNDKDNKKLDISYPIKELINY
FESFLTIKQRKSIIKYFDYDKQQFSKTEENTFTSHYTLIDKIDWEEKKFDCKNFKLSELI
YWFKTPQLYWLNKNNISPKGIFIHHPDDEYVTNFQKSQLVNNLIQKIEIDNHNCIDELKN
LNIREQFIENGIIAPKKSIFSKEKEIKDLVLSLATNLSQNNNIDRTYIKSNSNKLEYFIA
GEVVIELIHSKLTLKRLSEAWIKLLFISSLDKKIAKTKVIFRKENLYKSEILQSPDPYYA
RKILEEYINIFKNFSEKCLPLPPESTYKYVEAKMQSKNEKKAFSDRWIGNKSFTKGERDN
TEIQLCFGNKKEPNFFFENDKFDDLSLRLYAPLFEALRNK
NT seq 3183 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
ttgcttaatatttataattcaaataaaattgaagttattagtcagcttttagctaaagaa
ttaataattagtcctcctttaataacagaaaaacttgatatagctgttcctaattatttt
ttaggaaagtggttgtggaatgaaataactgtaagtaatcaaataagtgctctttatgaa
ttaaagacgatatcaaattatactgaaactttattaacaaatttattccctgagattgat
atgggggtatggaattttgagtccataaagtggggaattatagattcatttgaagaatta
gatagctataaagaatcattaccaatacgtaattggattaataaatttttgaacaataaa
aagataattgatggagatatctataatttgacaaaaaagattgcaaataattttattgat
tatcttatttttagacctgaaatgatatctaattggcataaatatgatttgaattcccaa
aatctttttaataatttaaattcaaatgagtattggcaaccaattttatttaagttactt
cagaagaaaatgccggaaaaaccgtcatgtttatacatgattgaggtaatcaaaaatata
aaaaaattacaaaattataaaaataaaatacctaaatgtatttatattatctctgataat
aatttatctagattacatgttgatttttattcaaagttagctgaatttactaaagtaaat
ttatatttactatctgtaggagataatttatggaacagaataaattctattgaaggagaa
gttgattttggtgggattgaaaataaattatatttaaataatgcaagtattgaaggtata
tttggtaaatttggagctaattaccagaaattaattgaagaaacctctaatattgaagat
ataaatttgaacaccaaatcaatatatattgatccaactattaattcttctagaaagaaa
gacgttcctttaattaatcaaatacagaaaagattaattgataataaaaaatatgatttt
ataataaatgaaagagatgattctattatatttagaggtcattttaatcaattaagtcaa
ttagaatttgttaggaataaaatcattgagatactagaaacttgtgaagaaataaaatat
agtgatatcgcaatagtatctcctcaaactggtttaataaagcctttcctcaagtatatc
tttaataacgaattaataaatggtcaaaagctaccttatttttttattgagggagattat
gaagattcttcaaatatatataatttcttattaaatattactcaattagcaggcgaaaaa
attacacttgaaaaaatagaatattttctttctcaggactttactcagaatatttttaat
tttgatatgaaagagaaggaggagattattcttcttttaaatcaagttgggtttcattgg
ggcttagatagtaatgaaaggttaggtgaagaaaaaaattctcttgagtggtgtataaat
agaattatattaggccttatttatgataaagaatttaattttataaacaataatcttaaa
tcatttagtcctaagaatataagtttagatttgaataaatgggttaagatattaattaaa
ttgaaagaatatattaacttactaagaggatcatttagttactcagtttgggttaaaaag
attaagtacatattaaatgatgttaatgattttcatcaaaatttttatttagaaatatgt
gatttatatagagtaatgaataattactctatttcttatcaatcagatcaaataattgtt
ttgaatgtttttagagaaatattaatttcatgtataaataattctaagtataaaaatgaa
tcttatataaataagatattagttagcgatattgagaagattagactaatacctcgtaat
actattttcttaattaatatgaataatgtttattatccaagattaacaataaaagaaaat
ataaacattttaaataaaaaatactctcttggagatccatcagtttttgatagagaaaaa
tattttttccttgaattactaatttcatgcaggaaacaacttatagtttcttgggtcaat
aatgataaagataataaaaaattagatatttcttatccaataaaagagctcataaactat
tttgagagttttttaactattaaacaaagaaagtctattatcaaatattttgattatgat
aaacagcaatttagtaaaactgaagagaataccttcacaagtcattatacgttaattgac
aaaattgattgggaagaaaaaaaatttgattgtaagaattttaaattatccgaattgatt
tattggttcaagactcctcagctttattggctcaacaaaaacaatatttctcctaaagga
atatttattcatcatccagatgacgagtatgttactaatttccagaagtctcaattagtt
aacaatttaattcagaaaatagaaattgataaccataattgtattgatgaattaaaaaat
ttgaacataagagaacaatttattgaaaatggtataattgccccaaaaaaaagtattttt
tcaaaagaaaaagagataaaagatttggttttgagtcttgctacaaatttgagtcaaaac
aataatattgatagaacttatattaaatcaaattcaaataaactagaatattttattgca
ggtgaagtagttattgaattgattcattcaaaacttactttgaaacgtttgtcagaggct
tggattaaattgctctttatttcgtctttagataagaaaatagcaaagacaaaagtaatt
tttagaaaagaaaatctatataaatcagaaattcttcaatcacccgacccatattatgca
aggaaaatattagaagaatatataaatatttttaagaatttttctgaaaaatgccttcct
cttcctccagaaagcacatataaatatgttgaggcaaaaatgcaatcaaaaaatgagaaa
aaagctttttcagatagatggataggaaataaaagttttaccaaaggagaaagagacaat
actgaaatacaattgtgttttggaaataaaaaagaacctaatttcttttttgaaaatgat
aaatttgatgatttatcattgcgattatatgcccctttatttgaagcattaagaaataaa
taa

DBGET integrated database retrieval system